BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-485M10.T7 (MSMg01no485_m10.b1) | MSMg01-485M10.TJ (MSMg01no485_m10.g1) |
ACC | AG565140 | AG565141 |
length | 1,499 | 734 |
length of high quality (start - end) | --- | 579 (76 - 654) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no485_m10.b1 PHD_FILE: MSMg01no485_m10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:07:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no485_m10.g1 PHD_FILE: MSMg01no485_m10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:07:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCCGGATTTTTTAATTTNTATNATGNTTTTNTGTTGCTTTATATGTTCTT
GTATAGAGGTGTGTATATATCTCTCTTCTACACAGAGAGAAGCGAGACGT
AGAGACTACGAGCGCCACACANGTGTCTCTACATCTCGACATACGGATGA
NGTGAGCAGGAGGAGAGCGTGCTACGCCTGACTATTCGCACTATGACGAA
CACAGTAAGATTATTGATGATGACATTNCAACATAGAGATCAGCACAGTA
TAACTGATACATTGTATACTAAGACGTGTATGAGTGATAGCAACCTACGT
GTGTCGCTGAGCGCCAGGCGTCTATCATGCGATGTATTGCGCTATCTGAT
AGCGCATACTCGACGCCGANCACACTCTTGTCACGCGCGCTGCCAGTATT
AATCAGACGCGCNCCTTACCTCTAGAGTCTGCTGTTTTCTATGCGTATTA
TATTGTGTAGCGGATCATGTGTCGTGTGTATGTGTGAGTGCGCCGGTCAC
TTAGTAGTGTCTTAAATAGGCACTGAGAGAGGAGGTGTATGTAGAATCGT
ATAGTATGCCTGCAGTATAANTCATACAATCANGACTGCTGTATTGTCAC
TCGACCGCACGTGATCAGACTTCTATAAATCACTGCGTTATTGTGTTGCG
CGGCGGTCGCGTACGTGATCATTCATGCTCCNNCCTACGCCGCGCTCGTG
TTATATGTCTATGTGACGTGCCGGCCTCTCGCCGTACTTCATCGGACCGT
TTCGTGGTTTTGCTGTGCTGCAAGCAGAGCTGGTCGGTAGTTTATAGTAG
TCTTGTATACTCCTATAACACACACAGTACTGCCATATGTCATATAATAC
TAGTTGCGCACGTGGATCTGCCGACGACGAGTAGNTCATACGTATGCGTT
GCATACTGCTAGTACGAGGTATTATTGAGTCAGTAATCATCATACTGCTC
ATGATCCCGAGCATATGCGTGTAGTACTCATCTATACTTATTACGCATAC
TAATGTAACGACGCCTCTGTATGCGCCATCACACCATTACGACGTATATC
TGAGATGCTCGCACGCGACTGCTGTTAACGCCAACGTCGTATAGATAGTG
ATGTGTTGTATGATGGCGTTTGTTGTGACAGCACTATGTGACCTAGCATT
GATGATGACGCATACTTGCCGCGCGATGTACATTCTCCATAGCGTGCTAC
GTATATGAAATCCTAGCCNCTGCTCTCATCGTTTATATTATTACCGTAGC
TAAACGACCTAACCATACGATAGGCATATCGACGCCGCACGTGAAGCATA
CGTGAAGTGGTCGCTGTGTATTACTCACTTAACGAATTCGTCGTCATGCT
CAGTCGAGTGAACATATTACCGGTACAGCGCGCGCAGTTAGACGTGANTA
TATTAGTAACAAAGCGGAGCGTGCGGATCACGCTCTTAGTTATATCACGT
GTCGCTTACTACANATCATACTCCAATCCACCTAGTAGTCTTGCTTCTN
| GCACGATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGCTCTGTTTTGAGGGAAGGAAGG
GAAGATCTGTGCATTGAATAAGTTCCAGAACCTGATATAACTCTTCATAT
TCCTCAGCCTGTCTTTGATAGGAGTGAGAAATATCCAGGATCTTTTGAGA
GAAACTTGGCTGTGATATTTCCCATTCTTGAAGCTTCTGGATTTTGTTTG
TTTATTTGTTTGCTTTTGTTTTATATTTATAATTAGTATTGTTAATAAGT
AAAAATTAAATGCAATCCTTATTGTACACACTTTTTAAAAAGAATAACTG
ATGATAAATTAGTGCTAGTACTGAAAGAATGTAGTTATACAACTGGTTCA
AAGTTATCTGAGGGAAATATTTTCTTACTCTCAACAGGTATTTTTTGTGA
CTGTATCTAATAGCTGTAGAGAACATCTTGTTTTTGACACTAATCCACAA
GTGGGGTAGTCATGCAGTCCTGGGGTAGGGATAAAGAAGTGGAGATTTAA
GACTACAATAGATTTTGAGAAGGATATTAATGCTCACCACTTACTTTAGG
ATCCAAAAGCTAATACTTTGCTTTGTCCAAGTTTTAGTCAAACTTAATTC
TAAGATATTAGATGTTGCACCAGCGTCTGCCTTTTTTCCCCCCTGCATCC
TCACAAGACAAATAGCCGATAGGCTTTTCAGAAA
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 12 11 11 9 9 9 6 6 8 6 6 6 3 0 3 8 3 0 3 9 3 0 3 8 8 3 0 3 6 8 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 13 8 8 6 6
6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 10 11 12 12 13 15 15 9 8 8 8 8 7 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 7 7 7 3
0 3 11 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 7 8 10 11 10 12 8 7 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6 9 6 6 6 6 7 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 11 11 10 10 8 8 8 8
10 7 6 6 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 11 11 11 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8
9 9 10 10 10 10 11 11 11 11 8 8 8 6 6 9 9 9 6 8 6 8 8 8 11 11 11 10 11 11 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6
8 8 8 8 10 10 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 9 9 9 9 10 12 10 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 8 8 7 7 6 6 8 10 6 7 6 6 7 7 10 6 8
6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 8 6 8 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 8 11 11 8 9 9 9 9 9 9 9 10 11 11 11 11 13 10 10 10 10 10
10 11 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 11 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 7 7 3 0 3 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 9
9 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 12 10 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 10 6 8 8
9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 11 11 9 6 6 3 0 0 3 8 7 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 8
8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 9 9 12 12 9 9 9 7 10 8 10 10 10 11 9 12 9 12 11 11 8 6 6 6 6 6 10 11 11 11 8 6 6 6 8 6 8
8 8 8 8 7 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 7 6 8 6 8 8 8 8 6 7 8 8 8 9 10 10 7 7 7 8 14 10 10 8 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 8 10 10 12 10 12 7 7 6 6 8 10 8 11 11 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 10 11 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 11 11 11 3 0 3 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8
8 8 8 13 13 11 9 9 8 8 6 6 8 6 6 8 7 6 8 8 7 7 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 7 7 6
6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 7 7 9 11 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8
8 8 8 8 8 10 13 12 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 11 13 10 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 10 10 8 13 10 9 9 7 10 8 6 6 6 6 8 6 10 13 10 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 12 10 6 8 6 6 10 8 8 8 8
11 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 7 7 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 7 7 6 9 9 6 8 8 8 6
6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 15 8 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 8 9 8 10 10 12 9 6 7 6 10 8 10 10 11
7 6 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 3 0 3 8 8 9 8 8 8 6 6 8 6 7 6 6 8 8 8 8 6 6 7 6 6 6 8 8 10 9 8 6 6
7 7 6 6 8 7 6 8 8 8 7 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 10 8 8 8 6 6 8 7 6 8
6 8 8 8 7 6 8 6 6 8 10 8 8 10 12 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 7 7 6
8 8 6 9 9 6 8 8 7 10 8 6 6 6 6 8 10 8 6 6 7 7 8 6 9 10 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 6 8 10 10 8 8 6 6 3 0 3 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 15 16 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 6 8 6 6 6 6 6 8 9 11 11 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 7 6 6 8 8 8 10 8 9 8 6 11 6 6 6 6 7 7 3 0 | Open.Hide. 6 8 6 6 8 10 10 10 10 9 10 17 17 28 28 12 10 8 8 11 19 21 39 40 40 41 41 41 47 47 27 27 9 6 6 6 6 6 6 8 9 13 13 15 17 18 19 18 16 12
11 11 25 25 59 46 43 23 23 9 9 9 9 9 9 9 11 12 18 16 19 17 17 22 22 23 28 28 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 53 53 50 38 36 36 50 33 33 37 37 30 25 19 17 15 13 12 12 28 26 37 37 37 37 41 53 53 53 53 42 42 42 43 43 50 53 53 57 57 57 53 53 53 50 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 59 41 44 43 43 43 48 48 48 48 41 39 39 46 57 57 57 57 57 57 51 51 50 50 50 51 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 59 41 30 21 14 10 10 10 10 10 20 15 12 22 18 34 34 48 48 50 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 57 50 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 59 43 47 47 57 57 57 57 59 59 57 54 54 54 57 57 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 48 48 48 43 41 46 46 43 43 39 41 37 37 43 39 39 39 37 37 39 39 39 41 41 59 59 47 44 39 39 37 37 37 37 37 37 37 37 46 48
47 47 43 34 34 25 25 25 34 34 41 41 37 37 44 59 59 43 43 43 41 24 24 21 21 25 27 34 23 23 23 32 32 37 30 30 25 28 33 37 37 37 37 37 36 34 35 31 25 29
34 37 37 37 31 29 31 28 30 35 47 47 39 37 37 39 26 30 28 23 24 30 25 27 27 20 21 11 11 11 21 21 37 36 19 16 12 10 10 13 18 31 30 32 28 25 25 30 29 37
34 34 19 19 12 16 16 17 23 11 11 11 17 11 15 15 25 26 32 18 15 15 23 23 25 30 21 25 14 14 12 10 11 8 8 8 18 17 23 37 28 32 27 30 28 28 28 28 25 20
23 16 16 14 10 10 16 15 17 16 17 14 16 14 11 11 12 11 17 15 15 15 15 23 24 36 30 14 15 10 10 10 16 16 |