BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-001D09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 98,512,981 - 98,638,553
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream geneSytl2, Ccdc89, Crebzf, Tmem126a, Tmem126b, B230218P12Rik, LOC666689, LOC621816, LOC100039943
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-001D09.bB6Ng01-001D09.g
ACCDH839598DH839599
length1,1561,053
definitionDH839598|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001D09, 5' end.DH839599|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001D09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,637,364 - 98,638,553)(98,512,981 - 98,514,039)
sequence
gaattcttgaagttgtttgtggtctcttctttttttacccaaatacaata
cactttcatcttttttggatcttttttatgacttccttcatgtgtgcctt
ctcttctacacccatcccactatcaaaaatttaagggacataagtagcta
gcaagctataaggttttgtgatttttaatatggcatggagagtaataaga
tggatttcaagcaatttattaagagcaataaaattaaatttgggcataaa
ttaactttaaaataaattaggatagtttaggcttatgttatcagtatggg
atgttagttcaatgtgtctctatgagcaagctttactgagataagagaaa
tggatggtgctctagctatcaagctaagggtgataaattacctggttaca
aatcctgacttgtatagagacaagtgttaactttatgttcgattgtggtt
aaaaacaaggcttgacaaagggcacaaactatcattttcccagttttctg
ttaaggtatctcactctatctgtgggtgaatgatcacctttcttaatcaa
tagttttttggttatggcttccatgttgaaagaccacagctttccacaac
agtagtaaattcacactcatcacattagcatgctaggattttctcagtgt
gtcctcatttccttgaccaaagcataggttcctattgattatactaatca
agtatttttgcaaccaaacaaaacttcattagcctccgttcatagcatta
tatgctgtcatagtgcttgtatttcaattatttattctttctgattattg
tgcatggacttttccatatatctagggttcaacttgacctttaattctct
tctccttccctaaccattcatataaacgttgttgtctcctgaaaattagc
atattttatcctctgagattaatttatttatgtattatttgatctgacac
agaagataaagtagggggcaaggggaaagaaagagaaagagaaaataaga
ggagagaagagagagcatgcagagtggagagatgtcaaacatagaagaaa
aaaaaacagtgagacagcagagaacgaacagaacggactgaagacgacga
gacctgaaagaagatctcgagtgttaaatatgctagaaattttagcccaa
gaaata
gaattctttgcagtgtttagcttcattagaattctcattttgtacccttc
tactctaataaaatagataaaacaaaacatgtgtggttttgtattagaaa
tccttctagaaccaatcagaatcctgcaacagacaagcaaatcatagtgt
cattctgaatggttggcattgagtttcagataaagaaaggctgtgactgt
ggttggtaaacaggtaaagctgagtagacagacagattgacatgggagca
aaagagctttatgtcctcactcttataagcaattgctagagcatgcagaa
tccagacactgaaaataaatatactaaagtggattttaatggaagaacat
ttcaaaatacaccattcaatgaagaaaagcagatgagacagtgtgaatgg
gatcagattattcctaaggaaataaatgtgtcatggctgttcttgaatga
caagtaatgaatttgttttttaaaccaatctttaccattaagttcttgca
acagttaccacagataaatggatgtgacatcgttagtgctatggcagatg
gtattaagaaagtaagtaacacagggtgtggtggcacagatctctaatcc
cagcactcaggaggcagaagcaggtggctttttatgaggtctgggccaat
cagtctacatagaaggattgatcccacctgatgctaccttgtgagactct
gcctcaaaaaagaatgataaaaggaaagaatgtgagggccaatgtaacca
cactaacaaaataaagcgacaactacatatacataggtttacaataagac
tgtgggaagaagcaatcataatagcactatataaaaaataaatcttgaac
ataatctcagaactcagaagaaggatagcataacttccccaaacaggttt
cattggtttttgtttgtttggttggttggtttttatgtgtgcatgggttt
tccttgtttctatgcttttgagacagtatctctctaagatctagctctgg
ctgtctggagcaataagaattctaacttctggagccattccttcagccct
aaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_98637364_98638553
seq2: B6Ng01-001D09.b_47_1202 (reverse)

seq1  TATTTCTTGGCCCTTAAAAAATTTTCTAGCATTATTTTAAACACTTCTGA  50
      |||||||||| |  |||||   ||||||||| |||||  ||||   ||  
seq2  TATTTCTTGGGC--TAAAA---TTTCTAGCA-TATTT--AACA---CTCG  39

seq1  AGATCTCTCTTTTTCTGTGTCTCTGTCTGTCTCTCTGTCTGTCTCTGTCT  100
      ||||||   | |||| | ||||| ||| |||| || ||| || ||||| |
seq2  AGATCT---TCTTTCAG-GTCTC-GTC-GTCT-TCAGTCCGT-TCTGT-T  80

seq1  CGTTCTCTGGCTGTCCTCACTGTTTTTTTTCTCTCCTATGTTTGACATTC  150
      |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||
seq2  CGTTCTCT-GCTGT-CTCACTGTTTTTTTT-TCTTCTATGTTTGACA-TC  126

seq1  TTCCTCCACCTCTGCATGCTC-CTCTTCTTTCTCCTCCTCTTTATTTTCT  199
      |  ||||| |||||||||||| |||||||     |||||| |||||||| 
seq2  T--CTCCA-CTCTGCATGCTCTCTCTTCT-----CTCCTC-TTATTTTC-  166

seq1  TCTTTCTCTTTCTTTCCCCCTTGCCCCCTACTTTATCTTCTGTGTCAGAT  249
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTCTTTCTTT-CCCCTTGCCCCCTACTTTATCTTCTGTGTCAGAT  215

seq1  CAAATAAATACATAAATAAATTAATCTCAGAGGATAAAATATGCTAATTT  299
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAT-AATACATAAATAAATTAATCTCAGAGGATAAAATATGCTAATTT  264

seq1  TCAGGAGACAACAACGTTTATATGAATGGTTAGGGAAGGAGAAGAGAATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGACAACAACGTTTATATGAATGGTTAGGGAAGGAGAAGAGAATT  314

seq1  AAAGGTCAAGTTGAA-CCTAGATATATGGAAAAGTCCATGCACAATAATC  398
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCAAGTTGAACCCTAGATATATGGAAAAGTCCATGCACAATAATC  364

seq1  AGAAAGAATAAATAATTGAAATACAAGCACTATGACAGCATATAATGCTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAATAAATAATTGAAATACAAGCACTATGACAGCATATAATGCTA  414

seq1  TGAACGGAGGCTAATGAAGTTTTGTTTGGTTGCAAAAATACTTGATTAGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACGGAGGCTAATGAAGTTTTGTTTGGTTGCAAAAATACTTGATTAGT  464

seq1  ATAATCAATAGGAACCTATGCTTTGGTCAAGGAAATGAGGACACACTGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCAATAGGAACCTATGCTTTGGTCAAGGAAATGAGGACACACTGAG  514

seq1  AAAATCCTAGCATGCTAATGTGATGAGTGTGAATTTACTACTGTTGTGGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCTAGCATGCTAATGTGATGAGTGTGAATTTACTACTGTTGTGGA  564

seq1  AAGCTGTGGTCTTTCAACATGGAAGCCATAACCAAAAAACTATTGATTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTGGTCTTTCAACATGGAAGCCATAACCAAAAAACTATTGATTAA  614

seq1  GAAAGGTGATCATTCACCCACAGATAGAGTGAGATACCTTAACAGAAAAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGTGATCATTCACCCACAGATAGAGTGAGATACCTTAACAGAAAAC  664

seq1  TGGGAAAATGATAGTTTGTGCCCTTTGTCAAGCCTTGTTTTTAACCACAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAAATGATAGTTTGTGCCCTTTGTCAAGCCTTGTTTTTAACCACAA  714

seq1  TCGAACATAAAGTTAACACTTGTCTCTATACAAGTCAGGATTTGTAACCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAACATAAAGTTAACACTTGTCTCTATACAAGTCAGGATTTGTAACCA  764

seq1  GGTAATTTATCACCCTTAGCTTGATAGCTAGAGCACCATCCATTTCTCTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATTTATCACCCTTAGCTTGATAGCTAGAGCACCATCCATTTCTCTT  814

seq1  ATCTCAGTAAAGCTTGCTCATAGAGACACATTGAACTAACATCCCATACT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGTAAAGCTTGCTCATAGAGACACATTGAACTAACATCCCATACT  864

seq1  GATAACATAAGCCTAAACTATCCTAATTTATTTTAAAGTTAATTTATGCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACATAAGCCTAAACTATCCTAATTTATTTTAAAGTTAATTTATGCC  914

seq1  CAAATTTAATTTTATTGCTCTTAATAAATTGCTTGAAATCCATCTTATTA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTAATTTTATTGCTCTTAATAAATTGCTTGAAATCCATCTTATTA  964

seq1  CTCTCCATGCCATATTAAAAATCACAAAACCTTATAGCTTGCTAGCTACT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCATGCCATATTAAAAATCACAAAACCTTATAGCTTGCTAGCTACT  1014

seq1  TATGTCCCTTAAATTTTTGATAGTGGGATGGGTGTAGAAGAGAAGGCACA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCCTTAAATTTTTGATAGTGGGATGGGTGTAGAAGAGAAGGCACA  1064

seq1  CATGAAGGAAGTCATAAAAAAGATCCAAAAAAGATGAAAGTGTATTGTAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAGGAAGTCATAAAAAAGATCCAAAAAAGATGAAAGTGTATTGTAT  1114

seq1  TTGGGTAAAAAAAGAAGAGACCACAAACAACTTCAAGAATTC  1190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTAAAAAAAGAAGAGACCACAAACAACTTCAAGAATTC  1156

seq1: chr7_98512981_98514039
seq2: B6Ng01-001D09.g_67_1119

seq1  GAATTCTTTGCAGTGTTTAGCTTCATTAGAATTCTCATTTTGTACCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCAGTGTTTAGCTTCATTAGAATTCTCATTTTGTACCCTTC  50

seq1  TACTCTAATAAAATAGATAAAACAAAACATGTGTGGTTTTGTATTAGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTAATAAAATAGATAAAACAAAACATGTGTGGTTTTGTATTAGAAA  100

seq1  TCCTTCTAGAACCAATCAGAATCCTGCAACAGACAAGCAAATCATAGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCTAGAACCAATCAGAATCCTGCAACAGACAAGCAAATCATAGTGT  150

seq1  CATTCTGAATGGTTGGCATTGAGTTTCAGATAAAGAAAGGCTGTGACTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTGAATGGTTGGCATTGAGTTTCAGATAAAGAAAGGCTGTGACTGT  200

seq1  GGTTGGTAAACAGGTAAAGCTGAGTAGACAGACAGATTGACATGGGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGTAAACAGGTAAAGCTGAGTAGACAGACAGATTGACATGGGAGCA  250

seq1  AAAGAGCTTTATGTCCTCACTCTTATAAGCAATTGCTAGAGCATGCAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGCTTTATGTCCTCACTCTTATAAGCAATTGCTAGAGCATGCAGAA  300

seq1  TCCAGACACTGAAAATAAATATACTAAAGTGGATTTTAATGGAAGAACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACACTGAAAATAAATATACTAAAGTGGATTTTAATGGAAGAACAT  350

seq1  TTCAAAATACACCATTCAATGAAGAAAAGCAGATGAGACAGTGTGAATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAATACACCATTCAATGAAGAAAAGCAGATGAGACAGTGTGAATGG  400

seq1  GATCAGATTATTCCTAAGGAAATAAATGTGTCATGGCTGTTCTTGAATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGATTATTCCTAAGGAAATAAATGTGTCATGGCTGTTCTTGAATGA  450

seq1  CAAGTAATGAATTTGTTTTTTAAACCAATCTTTACCATTAAGTTCTTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAATGAATTTGTTTTTTAAACCAATCTTTACCATTAAGTTCTTGCA  500

seq1  ACAGTTACCACAGATAAATGGATGTGACATCGTTAGTGCTATGGCAGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTACCACAGATAAATGGATGTGACATCGTTAGTGCTATGGCAGATG  550

seq1  GTATTAAGAAAGTAAGTAACACAGGGTGTGGTGGCACAGATCTCTAATCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAAGAAAGTAAGTAACACAGGGTGTGGTGGCACAGATCTCTAATCC  600

seq1  CAGCACTCAGGAGGCAGAAGCAGGTGGCTTTTTATGAGGTCTGGGCCAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACTCAGGAGGCAGAAGCAGGTGGCTTTTTATGAGGTCTGGGCCAAT  650

seq1  CAGTCTACATAGAAGGATTGATCCCACCTGATGCTACCTTGTGAGACTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTACATAGAAGGATTGATCCCACCTGATGCTACCTTGTGAGACTCT  700

seq1  GCCTCAAAAAAGAATGATAAAAGGAAAGAATGTGAGGGCCAATGTAACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAAAAAGAATGATAAAAGGAAAGAATGTGAGGGCCAATGTAACCA  750

seq1  CACTAACAAAATAAAGCGACAACTACATATACATAGGTTTACAATAAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACAAAATAAAGCGACAACTACATATACATAGGTTTACAATAAGAC  800

seq1  TGTGGGAAGAAGCAATCATAATAGCACTATATAAAAAATAAATCTTGAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGAAGAAGCAATCATAATAGCACTATATAAAAAATAAATCTTGAAC  850

seq1  ATAATCTCAGAACTCAGAAGAAGGATAGCATAACTTCCCCAAACAGGTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCTCAGAACTCAGAAGAAGGATAGCATAACTTCCCCAAACAGGTTT  900

seq1  CATTGGTTTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTTTTATTGTGTGCATGGGTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
seq2  CATTGGTTTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTTTTA-TGTGTGCATGGG-T  948

seq1  TTTCCTTTGTTTTCTATTGCTTTTGAGACAGTATCTCTCTAAGATCTAGC  1000
      |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTT--GTTTCTA-TGCTTTTGAGACAGTATCTCTCTAAGATCTAGC  995

seq1  TCTGGCTGTCTTGGAGCAATAAGAATTCTTAACTTCT-GAGCCATTCCTT  1049
      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  TCTGGCTGTC-TGGAGCAATAAGAATTC-TAACTTCTGGAGCCATTCCTT  1043

seq1  CAGCCCTAAA  1059
      ||||||||||
seq2  CAGCCCTAAA  1053