BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006C24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 118,532,324 - 118,693,022
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalntl4
Upstream geneSbf2, LOC668246, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658
Downstream geneLOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl, Parva
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006C24.bB6Ng01-006C24.g
ACCDH843118DH843119
length926694
definitionDH843118|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006C24, 5' end.DH843119|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006C24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,692,095 - 118,693,022)(118,532,324 - 118,533,017)
sequence
gaattctctatgtagctaataatgattctgaacttatgatactcccgcct
ctgagtgctgggatggaagaaatacactgccatgcctagtttatacaacg
gtggggacaaaacccaggcagtgtctcaggtatgcttgacagcattccac
tcactgagttagatcccagcttgcccaagtactcaaaaacaaaacaaaac
aaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacatacccattcactcttctgc
ttgaagtttgccacagacaagcctttacctatagatgaaatctatgcatt
ctttttctatgctattcaaagccttcaacaaacctggttgtcactaatct
aagtgaacagaggttgacatgtagagggataatgggaaagtccaaactgt
agcagtctgcccatgtggctcaaagtccaaagaagcaatctacaccaaca
gactgaatggcactgcctccccttactaatgcaccagcaagcatagtggg
gagcaatggctggtcatagaacaagagctgtcttcccactgtctcaaaca
acttccttggggtggctaaatgaagatgaacctaggaggataccaagaaa
tcaaagccccacggggtctggcagcagaggtgggaaccttgggattggaa
gctctttctcctcagatgactctcagaccagcctctgctcacagctggcc
atctctcccaccctgcaggagccctgccctcattggctgtttcattgtgg
accggcagtacttcgaggagattggcctgctggacgaaggcatggaggtc
tatggaggggagaatgtggagcttgggatcaggtgagtgagatttctcac
acagggctgagctcagctcccatgatggtaagtgagtaagtctagggtgt
agtgttgatgagcccttagtcacaat
gaattcactttttcttgatgaatgctgagacctgccagtaaagcctaaat
tttgcttggttctcccatcccttctcttaggagtcccacagagttcttct
gggtctcacttgttttggggattacataaacttgaagtcttcaatttttc
tgtttcttattttcatgttttgtattctttattcttcttattgctaatct
atatgaattctaaaaggaatagccccaaacagaatgaagctacatggtaa
acaaacaaataaacaataacaacaaaccctccccagtgatgttagtgtcc
aaagagtagatagctgtttaaaagaaaagcaagggaagggtaaacacaga
ttccagtgtaatgtttatctctggattcaaagagatttagaaggcaggga
aatgtaattgcaacagtagatgttcaaaggtattggtaatattttatttc
ctgtattgatattaaattcatagggattcccactattgcttaccacatat
aattgttacgattggaatattgcttaataaaaggcagtaaaatcctttat
gtaatcaagaaaaacattatttatttatttatttatttatttatttatta
cttattcactttatattctgctcactgccccactccagctcaccttgcca
caattcttcccccaccacctccccttctcctctgagggggtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_118692095_118693022
seq2: B6Ng01-006C24.b_44_969 (reverse)

seq1  ATTGTGAACTAAGGGCTCATCAACACTACACCCTAGACTTACTCACTTAC  50
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTG-ACTAAGGGCTCATCAACACTACACCCTAGACTTACTCACTTAC  49

seq1  CATCATGGGAGCTGAGCTCAGCCCTGTGTGAGAAATCTCACTCACCCTGA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CATCATGGGAGCTGAGCTCAGCCCTGTGTGAGAAATCTCACTCA-CCTGA  98

seq1  TCCCAAGCTCCACATTCTCCCCTCCATAGACCTCCATGCCTTCGTCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGCTCCACATTCTCCCCTCCATAGACCTCCATGCCTTCGTCCAGC  148

seq1  AGGCCAATCTCCTCGAAGTACTGCCGGTCCACAATGAAACAGCCAATGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAATCTCCTCGAAGTACTGCCGGTCCACAATGAAACAGCCAATGAG  198

seq1  GGCAGGGCTCCTGCAGGGTGGGAGAGATGGCCAGCTGTGAGCAGAGGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGGCTCCTGCAGGGTGGGAGAGATGGCCAGCTGTGAGCAGAGGCTG  248

seq1  GTCTGAGAGTCATCTGAGGAGAAAGAGCTTCCAATCCCAAGGTTCCCACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGAGAGTCATCTGAGGAGAAAGAGCTTCCAATCCCAAGGTTCCCACC  298

seq1  TCTGCTGCCAGACCCCGTGGGGCTTTGATTTCTTGGTATCCTCCTAGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGCCAGACCCCGTGGGGCTTTGATTTCTTGGTATCCTCCTAGGTT  348

seq1  CATCTTCATTTAGCCACCCCAAGGAAGTTGTTTGAGACAGTGGGAAGACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCATTTAGCCACCCCAAGGAAGTTGTTTGAGACAGTGGGAAGACA  398

seq1  GCTCTTGTTCTATGACCAGCCATTGCTCCCCACTATGCTTGCTGGTGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGTTCTATGACCAGCCATTGCTCCCCACTATGCTTGCTGGTGCAT  448

seq1  TAGTAAGGGGAGGCAGTGCCATTCAGTCTGTTGGTGTAGATTGCTTCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAAGGGGAGGCAGTGCCATTCAGTCTGTTGGTGTAGATTGCTTCTTT  498

seq1  GGACTTTGAGCCACATGGGCAGACTGCTACAGTTTGGACTTTCCCATTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTGAGCCACATGGGCAGACTGCTACAGTTTGGACTTTCCCATTAT  548

seq1  CCCTCTACATGTCAACCTCTGTTCACTTAGATTAGTGACAACCAGGTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTACATGTCAACCTCTGTTCACTTAGATTAGTGACAACCAGGTTTG  598

seq1  TTGAAGGCTTTGAATAGCATAGAAAAAGAATGCATAGATTTCATCTATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGCTTTGAATAGCATAGAAAAAGAATGCATAGATTTCATCTATAG  648

seq1  GTAAAGGCTTGTCTGTGGCAAACTTCAAGCAGAAGAGTGAATGGGTATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGGCTTGTCTGTGGCAAACTTCAAGCAGAAGAGTGAATGGGTATGT  698

seq1  TTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGTAC  748

seq1  TTGGGCAAGCTGGGATCTAACTCAGTGAGTGGAATGCTGTCAAGCATACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCAAGCTGGGATCTAACTCAGTGAGTGGAATGCTGTCAAGCATACC  798

seq1  TGAGACACTGCCTGGGTTTTGTCCCCACCGTTGTATAAACTAGGCATGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACACTGCCTGGGTTTTGTCCCCACCGTTGTATAAACTAGGCATGGC  848

seq1  AGTGTATTTCTTCCATCCCAGCACTCAGAGGCGGGAGTATCATAAGTTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATTTCTTCCATCCCAGCACTCAGAGGCGGGAGTATCATAAGTTCA  898

seq1  GAATCATTATTAGCTACATAGAGAATTC  928
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCATTATTAGCTACATAGAGAATTC  926

seq1: chr7_118532324_118533017
seq2: B6Ng01-006C24.g_65_758

seq1  GAATTCACTTTTTCTTGATGAATGCTGAGACCTGCCAGTAAAGCCTAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTTTCTTGATGAATGCTGAGACCTGCCAGTAAAGCCTAAAT  50

seq1  TTTGCTTGGTTCTCCCATCCCTTCTCTTAGGAGTCCCACAGAGTTCTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTGGTTCTCCCATCCCTTCTCTTAGGAGTCCCACAGAGTTCTTCT  100

seq1  GGGTCTCACTTGTTTTGGGGATTACATAAACTTGAAGTCTTCAATTTTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTCACTTGTTTTGGGGATTACATAAACTTGAAGTCTTCAATTTTTC  150

seq1  TGTTTCTTATTTTCATGTTTTGTATTCTTTATTCTTCTTATTGCTAATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTTATTTTCATGTTTTGTATTCTTTATTCTTCTTATTGCTAATCT  200

seq1  ATATGAATTCTAAAAGGAATAGCCCCAAACAGAATGAAGCTACATGGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAATTCTAAAAGGAATAGCCCCAAACAGAATGAAGCTACATGGTAA  250

seq1  ACAAACAAATAAACAATAACAACAAACCCTCCCCAGTGATGTTAGTGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAATAAACAATAACAACAAACCCTCCCCAGTGATGTTAGTGTCC  300

seq1  AAAGAGTAGATAGCTGTTTAAAAGAAAAGCAAGGGAAGGGTAAACACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTAGATAGCTGTTTAAAAGAAAAGCAAGGGAAGGGTAAACACAGA  350

seq1  TTCCAGTGTAATGTTTATCTCTGGATTCAAAGAGATTTAGAAGGCAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTGTAATGTTTATCTCTGGATTCAAAGAGATTTAGAAGGCAGGGA  400

seq1  AATGTAATTGCAACAGTAGATGTTCAAAGGTATTGGTAATATTTTATTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAATTGCAACAGTAGATGTTCAAAGGTATTGGTAATATTTTATTTC  450

seq1  CTGTATTGATATTAAATTCATAGGGATTCCCACTATTGCTTACCACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATTGATATTAAATTCATAGGGATTCCCACTATTGCTTACCACATAT  500

seq1  AATTGTTACGATTGGAATATTGCTTAATAAAAGGCAGTAAAATCCTTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTTACGATTGGAATATTGCTTAATAAAAGGCAGTAAAATCCTTTAT  550

seq1  GTAATCAAGAAAAACATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCAAGAAAAACATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTA  600

seq1  CTTATTCACTTTATATTCTGCTCACTGCCCCACTCCAGCTCACCTTGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTCACTTTATATTCTGCTCACTGCCCCACTCCAGCTCACCTTGCCA  650

seq1  CAATTCTTCCCCCACCACCTCCCCTTCTCCTCTGAGGGGGTGGG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTTCCCCCACCACCTCCCCTTCTCCTCTGAGGGGGTGGG  694