BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007H02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 120,914,644 - 121,105,663
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpon1
Upstream geneTead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228
Downstream geneRras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc, EG627967
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007H02.bB6Ng01-007H02.g
ACCDH844009DH844010
length948880
definitionDH844009|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007H02, 5' end.DH844010|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007H02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,914,644 - 120,915,598)(121,104,782 - 121,105,663)
sequence
gaattcaaaagttgcctcaagtccaatgtttaaagattataaaggttgct
tatggctttgtgtttcaggcagtgaggaaacatcaaaacatataaagcaa
ggcatatctaatttaagtttttcaaagtttacaacctgagcgctttctca
agcccaggtaagcccatcccagccgactcttttaaccggaaccataggct
agcaggagatacaggtgcccgggaagtttactaccacatcactcatttac
agtctttacagaatagacataaccaagctaagagacccccaaacaaatga
tttcagctgagatcaatggaaagccagccgagacttcacagtgtcaggca
ggaacccaggctccttctgcctcattgctcttccctcttctaggtctctg
ctaaccaacaggtagctgctaccacagcaagaccattacataccgtatgt
atgatagtctgagataagatatgctggaatgttattgaaggggtcatgtg
aattcgtgcatggctcttattaacaactttcaagtggatcctatattaaa
atgaaatatatatatatatatatatacatatatatatatatatatatata
tatcagtcaagttaaagagcatatgttgctaacattaatttcacccattt
tacatatgtgtctttctattggatgctagccaacacaactgagcttcagg
ttgctttattggacctctctctccaaggatcattgtagccaacttgctct
cacatccaagctccatgtagcatatcgtgttgaggagaggggtttatttt
attttttttttaagattaagaaaaatagattcgggggaacaatcagtaga
atagtgttatcaatctgtggttgcaaccctttggggtcaaatgacccttt
cacatggtcacctagaccagcagaaaaccagacatttacttcaattcg
ggattaagatagcatcaagtgacattcctggatgctttcccctgtctaac
tgcccatgtttccagagagacagctgctggtttttgaaaggatgtcattt
cataaatttcagtcctctcttgtggaagttcacaaagcatttaaggcctc
aagactcggtgtctaagtgggcttcaaaaatcagcttaaacatcaaactg
ttccttcccattatgttcacttgatcagacaaattctagacatctgagaa
gatgtgctctctgacttagaaggatttaatggattgaggtggcaatagca
aggaaggggctggaagtaggatggcagcagggatgggaggtggggccaga
gctgagaagatgccaggaagcctctggaggcagagagctgagccaaggac
acccaggcttggagagatactcagcctctgcagagggcttaggcagcagg
gtagaaagctaggtctgtggcagtgggcttaggcacaaggccaacgggaa
ttgcccagatggcaggactctgagtggatatgatctctagcaggagagag
cacgtgggaaaccatgcagaagaaaggggctggagacttgacagagaaga
caatgttttgctccttgattcaccttccatgtcagctctgtttgacgtag
gggctaaagcattttttagatccttaacaagattgcagagggactctata
gtcatctcatggacgtgcaggctgcctctaatttctattaggaccatcca
cacagcaaccttcctgtgcattggactcttcctgtattgaaggacgattt
ctaaagaatagattctgagagtgaacactgggtcaaaggaaaggacatat
tttatggtgtcttaatatacagtggagagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120914644_120915598
seq2: B6Ng01-007H02.b_44_991

seq1  GAATTCAAAAGTTGCCTCAAGTCCAATGTTTAAAGATTATAAAGGTTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAGTTGCCTCAAGTCCAATGTTTAAAGATTATAAAGGTTGCT  50

seq1  TATGGCTTTGTGTTTCAGGCAGTGAGGAAACATCAAAACATATAAAGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTTTGTGTTTCAGGCAGTGAGGAAACATCAAAACATATAAAGCAA  100

seq1  GGCATATCTAATTTAAGTTTTTCAAAGTTTACAACCTGAGCGCTTTCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATATCTAATTTAAGTTTTTCAAAGTTTACAACCTGAGCGCTTTCTCA  150

seq1  AGCCCAGGTAAGCCCATCCCAGCCGACTCTTTTAACCGGAACCATAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGGTAAGCCCATCCCAGCCGACTCTTTTAACCGGAACCATAGGCT  200

seq1  AGCAGGAGATACAGGTGCCCGGGAAGTTTACTACCACATCACTCATTTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAGATACAGGTGCCCGGGAAGTTTACTACCACATCACTCATTTAC  250

seq1  AGTCTTTACAGAATAGACATAACCAAGCTAAGAGACCCCCAAACAAATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTACAGAATAGACATAACCAAGCTAAGAGACCCCCAAACAAATGA  300

seq1  TTTCAGCTGAGATCAATGGAAAGCCAGCCGAGACTTCACAGTGTCAGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGCTGAGATCAATGGAAAGCCAGCCGAGACTTCACAGTGTCAGGCA  350

seq1  GGAACCCAGGCTCCTTCTGCCTCATTGCTCTTCCCTCTTCTAGGTCTCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCAGGCTCCTTCTGCCTCATTGCTCTTCCCTCTTCTAGGTCTCTG  400

seq1  CTAACCAACAGGTAGCTGCTACCACAGCAAGACCATTACATACCGTATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCAACAGGTAGCTGCTACCACAGCAAGACCATTACATACCGTATGT  450

seq1  ATGATAGTCTGAGATAAGATATGCTGGAATGTTATTGAAGGGGTCATGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAGTCTGAGATAAGATATGCTGGAATGTTATTGAAGGGGTCATGTG  500

seq1  AATTCGTGCATGGCTCTTATTAACAACTTTCAAGTGGATCCTATATTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCGTGCATGGCTCTTATTAACAACTTTCAAGTGGATCCTATATTAAA  550

seq1  ATGAAATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATATATA  600

seq1  TATCAGTCAAGTTAAAGAGCATATGTTGCTAACATTAATTTCACCCATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGTCAAGTTAAAGAGCATATGTTGCTAACATTAATTTCACCCATTT  650

seq1  TACATATGTGTCTTTCTATTGGATGCTAGCCAACACAACTGAGCTTCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATGTGTCTTTCTATTGGATGCTAGCCAACACAACTGAGCTTCAGG  700

seq1  TTGCTTTATTGGACCTCTCTCTCCAAGGATCATTGTAGCCAACTTGCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTATTGGACCTCTCTCTCCAAGGATCATTGTAGCCAACTTGCTCT  750

seq1  CACATCCAAGCTCCATGTAGCATATCGTGTTGAGGAGAGGGGTTTATTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCCAAGCTCCATGTAGCATATCGTGTTGAGGAGAGGGGTTTATTTT  800

seq1  A-TTTTTTTTTAAGATTAAGGAAAAATAGATTCGGGGGAACAATCAGTAG  849
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTTTTTAAGATTAA-GAAAAATAGATTCGGGGGAACAATCAGTAG  849

seq1  AATAGTGTTTATCAATCTGTGGGTTGCAACCCCTTTGGTGTCAAATGACC  899
      ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  AATAGTG-TTATCAATCTGT-GGTTGCAA-CCCTTTGGGGTCAAATGACC  896

seq1  CTTTCACATGGGTCACCTAAGACCAGCAGAAAACACAGACATTTACATTC  949
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  CTTTCACAT-GGTCACCT-AGACCAGCAGAAAAC-CAGACATTTAC-TTC  942

seq1  AATTCG  955
      ||||||
seq2  AATTCG  948

seq1: chr7_121104782_121105663
seq2: B6Ng01-007H02.g_79_958 (reverse)

seq1  GCTCTCCACTGTATATTAAGACA-CATAAAATATGTTCCTTTCCTTTGAC  49
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTCTCCACTGTATATTAAGACACCATAAAATATG-TCCTTTCCTTTGAC  49

seq1  CCAGTTGTTCCACTTCTCAGAATCTATTCTTAGGAAATCGTCC-TCAATA  98
      |||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||
seq2  CCAG-TGTT-CAC-TCTCAGAATCTATTCTTTAGAAATCGTCCTTCAATA  96

seq1  CAGGAAGAGTCCAATGCACAGGAAGGTTTGCTGTGTGGATGGTCCTAATA  148
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGAGTCCAATGCACAGGAAGG-TTGCTGTGTGGATGGTCCTAATA  145

seq1  GAAATTAGAGGCAGCCTGCACGTCCATGAGATGACTATAGAGTCCCTCTG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAGAGGCAGCCTGCACGTCCATGAGATGACTATAGAGTCCCTCTG  195

seq1  CAATCTTGTTAAGGATCTAAAAAATGCTTTAGCCCCTACGTCAAACAGAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTGTTAAGGATCTAAAAAATGCTTTAGCCCCTACGTCAAACAGAG  245

seq1  CTGACATGGAAGGTGAATCAAGGAGC-AAACATTGTCTTCTCTGTCAAGT  297
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACATGGAAGGTGAATCAAGGAGCAAAACATTGTCTTCTCTGTCAAGT  295

seq1  CTCCAGCCCCTTTCTTCTGCATGGTTTCCCACGTGCTCTCTCCTGCTAGA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGCCCCTTTCTTCTGCATGGTTTCCCACGTGCTCTCTCCTGCTAGA  345

seq1  GATCATATCCACTCAGAGTCCTGCCATCTGGGCAATTCCCGTTGGCCTTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATATCCACTCAGAGTCCTGCCATCTGGGCAATTCCCGTTGGCCTTG  395

seq1  TGCCTAAGCCCACTGCCACAGACCTAGCTTTCTACCCTGCTGCCTAAGCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAAGCCCACTGCCACAGACCTAGCTTTCTACCCTGCTGCCTAAGCC  445

seq1  CTCTGCAGAGGCTGAGTATCTCTCCAAGCCTGGGTGTCCTTGGCTCAGCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCAGAGGCTGAGTATCTCTCCAAGCCTGGGTGTCCTTGGCTCAGCT  495

seq1  CTCTGCCTCCAGAGGCTTCCTGGCATCTTCTCAGCTCTGGCCCCACCTCC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCTCCAGAGGCTTCCTGGCATCTTCTCAGCTCTGGCCCCACCTCC  545

seq1  CATCCCTGCTGCCATCCTACTTCCAGCCCCTTCCTTGCTATTGCCACCTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTGCTGCCATCCTACTTCCAGCCCCTTCCTTGCTATTGCCACCTC  595

seq1  AATCCATTAAATCCTTCTAAGTCAGAGAGCACATCTTCTCAGATGTCTAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATTAAATCCTTCTAAGTCAGAGAGCACATCTTCTCAGATGTCTAG  645

seq1  AATTTGTCTGATCAAGTGAACATAATGGGAAGGAACAGTTTGATGTTTAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTCTGATCAAGTGAACATAATGGGAAGGAACAGTTTGATGTTTAA  695

seq1  GCTGATTTTTGAAGCCCACTTAGACACCGAGTCTTGAGGCCTTAAATGCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTTTTGAAGCCCACTTAGACACCGAGTCTTGAGGCCTTAAATGCT  745

seq1  TTGTGAACTTCCACAAGAGAGGACTGAAATTTATGAAATGACATCCTTTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAACTTCCACAAGAGAGGACTGAAATTTATGAAATGACATCCTTTC  795

seq1  AAAAACCAGCAGCTGTCTCTCTGGAAACATGGGCAGTTAGACAGGGGAAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCAGCAGCTGTCTCTCTGGAAACATGGGCAGTTAGACAGGGGAAA  845

seq1  GCATCCAGGAATGTCACTTGATGCTATCTTAATCC  882
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCAGGAATGTCACTTGATGCTATCTTAATCC  880