BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007I12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 76,534,585 - 76,655,124
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041800, EG384639, Arrdc4, LOC384741
Downstream geneEG665410, Nr2f2, LOC100042833, B130024G19Rik, LOC100042838, LOC665486
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007I12.bB6Ng01-007I12.g
ACCDH844071DH844072
length1,1321,028
definitionDH844071|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007I12, 5' end.DH844072|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007I12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,653,975 - 76,655,124)(76,534,585 - 76,535,628)
sequence
gaattcctctgtccagtctagagctggcgggaagacattgctatgaagta
agctcatataagtccaagcttgctggctatggaaaacaattgcctataga
gagtgcgaatgattctctcatgtggccacctcagatagaacttacacctg
tattctctacttttgagaagcacatttaccattttaagagtttaaaaatt
cttatttgacgatgagtactttttttgacagcttaaccacaatctaccaa
ttggactcttggggccaactcaaactgtaaaaatgtataaggcttgttaa
taacatttagatcctgtatgctcatattacagcgtattaggtgatatcca
gaaacagaagagatgcttttgaagagctcattttaacatggaacaaactt
tgaaggacagttttatgacttgtaaatcattagtattcacagacacttct
tgtttgacattacaattaaatgcacaggtgctacacaaacgtctaactgc
ttcagtgtcctaatcagtaagaacatatattatgcttagggaatgaaaga
ccctcaaacagaaatgagtcccttcctgtccatttccacctccatttttc
tactgaaataattttgagtctgtaaaattcttagacgaggaagtgggaaa
atccagtaaggtggtctgagtaaatggtgctggattccaatacggtatgc
ctctttctcacttgtttatttgcgcttgtgtgagatcctttcacattaaa
atggaaagttactgcatcaccatggattttaggcaagagtgtatgcatgg
tgccctgcataggatttgtccaagaattcacacattcagtttgtcttttc
tgttgcttgtagcattatgatatattttactcaaatactataaaaccatg
tgtttaattgatacactcatagagacactctcaaagacacacacctggct
tttatttctatgggtgtgcactcacacatacctagatgtttggaatacct
ctgtttgactgctgcctttccccctatatctacccttactaaagagatct
gctcatcccataagggaatttcttgatccagtttatttatggaagtaaaa
ctggtgagttagtagatctcaagtgaacatga
gaattcccttagctgccagtttaaataaattcagttcactatgtgcaaag
agtactttattttaattcatttgtactttttccctaaaatctatactgtg
aggtcaaaggcagaaatgaagtaggtattgaggaacaaagcctcaacact
ctgctcatcttttggagcactgagaaggctagagtggaatggacattttg
acagggtgtgttaacaaattggcctgttgttgaacaatcagtgtgtcttt
attttgagttgccacctacaaaaccaaaaaaccaaactaccaaagcaaaa
cccccccaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaacccaaaaaacaaaacaaaaca
aaaaaacccacaaaaaaacaaaaccaaaccaaccaaccaaacaaacaaaa
ataccaaaaaataaaaaacaaaacactaaactaaattaaactaggaaaag
ggatgcaaccctcaaagagtggggagtggagaaatataactaaggagtcc
cttctagcgtatccacttctagaaattcaaaggtagactctgcttcttga
ggaggtaagccatccattaacaccacaccatccatgtctgcagtagtgat
gcctataccacataccttatgaatagcaagtagcaatcttcttttcagca
acgtgtcttgaaaaattagacaaaatgtgattccagtaatttgctccagg
gtaagtgatgcctctccctcccctgaaacaggcactcccattcttacttt
tcaaatagcataaagtaatcaatgtgctacgctcaggtcggccagactgc
tttggtatctaaacatgcatatgtgtgagcacctgacagcagtggtttgg
tgtctgctttacaaatacaattggacaaaggacccttgagtacatggtta
tacttaacaattagaatgaactgggtgaccatgattcacaggatggtctt
gattgggctgggagaggcattcttgtgttagtgattgctaaagtgcaccc
tcagtagtaaagtatcctttctgactga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_76653975_76655124
seq2: B6Ng01-007I12.b_43_1174 (reverse)

seq1  TCATAGTTCTACTTGAGATCTACTAAAACTCACCAAAGTTTATTTACTTT  50
      |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||   ||||||| 
seq2  TCAT-GTTC-ACTTGAGATCTACT--AACTCACC--AGT---TTTACTTC  41

seq1  CATTAAAATAAAACTAGATCAAAGAAAATTCACCTTATGGGATTGAAGCA  100
      |||  |||| ||||| ||||||   |||||| |||||||||||   ||||
seq2  CAT--AAAT-AAACTGGATCAA--GAAATTC-CCTTATGGGAT--GAGCA  83

seq1  GATCTCTTTAGTAAGGGTAGATATAGGGGGGAAAGCAGCAGTCAAAACAG  150
      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||
seq2  GATCTCTTTAGTAAGGGTAGATATAGGGGGAAAGGCAGCAGTC-AAACAG  132

seq1  AGGAATTCCAAACATCTAGGTATGTGTGAGTGCACACCCATAGAAATAAA  200
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATTCCAAACATCTAGGTATGTGTGAGTGCACACCCATAGAAATAAA  182

seq1  AGCCAGGTGTGTGTCTTTGAGAGTGTCTCTATGAGTGTATCAATTAAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGTGTGTGTCTTTGAGAGTGTCTCTATGAGTGTATCAATTAAACA  232

seq1  CATGGTTTTATAGTATTTGAGTAAAATATATCATAATGCTACAAGCAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTTTATAGTATTTGAGTAAAATATATCATAATGCTACAAGCAACA  282

seq1  GAAAAGACAAACTGAATGTGTGAATTCTTGGACAAATCCTATGCAGGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGACAAACTGAATGTGTGAATTCTTGGACAAATCCTATGCAGGGCA  332

seq1  CCATGCATACACTCTTGCCTAAAATCCATGGTGATGCAGTAACCTTCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCATGCATACACTCTTGCCTAAAATCCATGGTGATGCAGTAACTTTCCAT  382

seq1  TTTAATGTGAAAGGATCTCACACAAGCGCAAATAAACAAGTGAGAAAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGTGAAAGGATCTCACACAAGCGCAAATAAACAAGTGAGAAAGAG  432

seq1  GCATACCGTATTGGAATCCAGCACCATTTACTCAGACCACCTTACTGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACCGTATTGGAATCCAGCACCATTTACTCAGACCACCTTACTGGAT  482

seq1  TTTCCCACTTCCTCGTCTAAGAATTTTACAGACTCAAAATTATTTCAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCACTTCCTCGTCTAAGAATTTTACAGACTCAAAATTATTTCAGTA  532

seq1  GAAAAATGGAGGTGGAAATGGACAGGAAGGGACTCATTTCTGTTTGAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATGGAGGTGGAAATGGACAGGAAGGGACTCATTTCTGTTTGAGGG  582

seq1  TCTTTCATTCCCTAAGCATAATATATGTTCTTACTGATTAGGACACTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCATTCCCTAAGCATAATATATGTTCTTACTGATTAGGACACTGAA  632

seq1  GCAGTTAGACGTTTGTGTAGCACCTGTGCATTTAATTGTAATGTCAAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTAGACGTTTGTGTAGCACCTGTGCATTTAATTGTAATGTCAAACA  682

seq1  AGAAGTGTCTGTGAATACTAATGATTTACAAGTCATAAAACTGTCCTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGTCTGTGAATACTAATGATTTACAAGTCATAAAACTGTCCTTCA  732

seq1  AAGTTTGTTCCATGTTAAAATGAGCTCTTCAAAAGCATCTCTTCTGTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTGTTCCATGTTAAAATGAGCTCTTCAAAAGCATCTCTTCTGTTTC  782

seq1  TGGATATCACCTAATACGCTGTAATATGAGCATACAGGATCTAAATGTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATATCACCTAATACGCTGTAATATGAGCATACAGGATCTAAATGTTA  832

seq1  TTAACAAGCCTTATACATTTTTACAGTTTGAGTTGGCCCCAAGAGTCCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAAGCCTTATACATTTTTACAGTTTGAGTTGGCCCCAAGAGTCCAA  882

seq1  TTGGTAGATTGTGGTTAAGCTGTCAAAAAAAGTACTCATCGTCAAATAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAGATTGTGGTTAAGCTGTCAAAAAAAGTACTCATCGTCAAATAAG  932

seq1  AATTTTTAAACTCTTAAAATGGTAAATGTGCTTCTCAAAAGTAGAGAATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTAAACTCTTAAAATGGTAAATGTGCTTCTCAAAAGTAGAGAATA  982

seq1  CAGGTGTAAGTTCTATCTGAGGTGGCCACATGAGAGAATCATTCGCACTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTAAGTTCTATCTGAGGTGGCCACATGAGAGAATCATTCGCACTC  1032

seq1  TCTATAGGCAATTGTTTTCCATAGCCAGCAAGCTTGGACTTATATGAGCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGGCAATTGTTTTCCATAGCCAGCAAGCTTGGACTTATATGAGCT  1082

seq1  TACTTCATAGCAATGTCTTCCCGCCAGCTCTAGACTGGACAGAGGAATTC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCATAGCAATGTCTTCCCGCCAGCTCTAGACTGGACAGAGGAATTC  1132

seq1: chr7_76534585_76535628
seq2: B6Ng01-007I12.g_66_1093

seq1  GAATTCCCTTAGCTGCCAGTTTAAATAAATTCAGTTCACTATGTGCAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTTAGCTGCCAGTTTAAATAAATTCAGTTCACTATGTGCAAAG  50

seq1  AGTACTTTATTTTAATTCATTTGTACTTTTTCCCTAAAATCTATACTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTTATTTTAATTCATTTGTACTTTTTCCCTAAAATCTATACTGTG  100

seq1  AGGTCAAAGGCAGAAATGAAGTAGGTATTGAGGAACAAAGCCTCAACACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAAAGGCAGAAATGAAGTAGGTATTGAGGAACAAAGCCTCAACACT  150

seq1  CTGCTCATCTTTTGGAGCACTGAGAAGGCTAGAGTGGAATGGACATTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCATCTTTTGGAGCACTGAGAAGGCTAGAGTGGAATGGACATTTTG  200

seq1  ACAGGGTGTGTTAACAAATTGGCCTGTTGTTGAACAATCAGTGTGTCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGTGTGTTAACAAATTGGCCTGTTGTTGAACAATCAGTGTGTCTTT  250

seq1  ATTTTGAGTTGCCACCTACAAAACCAAAAAACCAAACTACCAAAGCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAGTTGCCACCTACAAAACCAAAAAACCAAACTACCAAAGCAAAA  300

seq1  CCCCCCCAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACCCAAAAAACAAAACAAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACCCAAAAAACAAAACAAAACA  350

seq1  AAAAAACCCACAAAAAAACAAAACCAAACCAACCAACCAAACAAACAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCCACAAAAAAACAAAACCAAACCAACCAACCAAACAAACAAAA  400

seq1  ATACCAAAAAATAAAAAACAAAACACTAAACTAAATTAAACTAGGAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAAAAAATAAAAAACAAAACACTAAACTAAATTAAACTAGGAAAAG  450

seq1  GGATGCAACCCTCAAAGAGTGGGGAGTGGAGAAATATAACTAAGGAGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCAACCCTCAAAGAGTGGGGAGTGGAGAAATATAACTAAGGAGTCC  500

seq1  CTTCTAGCGTATCCACTTCTAGAAATTCAAAGGTAGACTCTGCTTCTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGCGTATCCACTTCTAGAAATTCAAAGGTAGACTCTGCTTCTTGA  550

seq1  GGAGGTAAGCCATCCATTAACACCACACCATCCATGTCTGCAGTAGTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTAAGCCATCCATTAACACCACACCATCCATGTCTGCAGTAGTGAT  600

seq1  GCCTATACCACATACCTTATGAATAGCAAGTAGCAATCTTCTTTTCAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATACCACATACCTTATGAATAGCAAGTAGCAATCTTCTTTTCAGCA  650

seq1  ACGTGTCTTGAAAAATTAGACAAAATGTGATTCCAGTAATTTGCTCCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGTCTTGAAAAATTAGACAAAATGTGATTCCAGTAATTTGCTCCAGG  700

seq1  GTAAGTGATGCCTCTCCCTCCCCTGAAACAGGCACTCCCATTCTTACTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTGATGCCTCTCCCTCCCCTGAAACAGGCACTCCCATTCTTACTTT  750

seq1  TCAAATAGCATAAAGTAATCAATGTGCTACGCTCAGGTCGGCCAGACTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAGCATAAAGTAATCAATGTGCTACGCTCAGGTCGGCCAGACTGC  800

seq1  TTTGGTATCTAAACATGCATATGTGTGAGCACCTGACAGCAGTGGTTTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTATCTAAACATGCATATGTGTGAGCACCTGACAGCAGTGGTTTGG  850

seq1  TGTCTGCTTTACAAATACAATTGGACAAAGGACCCTTGAGTAACATGGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGTCTGCTTTACAAATACAATTGGACAAAGGACCCTTGAGT-ACATGGTT  899

seq1  ATAACTTAACAATTAGAATGAACTGGGTTGACACATGGATTCACAGGGAT  950
      || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||
seq2  AT-ACTTAACAATTAGAATGAACTGGG-TGAC-CAT-GATTCACA-GGAT  944

seq1  GGTCTTGATTGGGCTGGGAGAGGGCAGTCTGTGGTCTAAGTGAATTGGTT  1000
      ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || | |||| |||| | 
seq2  GGTCTTGATTGGGCTGGGAGA-GGCATTC--TTGTGTTAGTG-ATTGCT-  989

seq1  AAAAGTGCA-CCTCAGTAGTATAAGTTATCCCCTTTCTGGACTGA  1044
       |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||
seq2  -AAAGTGCACCCTCAGTAGTA-AAG-TAT--CCTTTCT-GACTGA  1028