BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-008K11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 75,973,084 - 76,106,652
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC665319, LOC100041771, Igf1r, C330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639, Arrdc4
Downstream geneLOC384741, EG665410
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-008K11.bB6Ng01-008K11.g
ACCDH844839DH844840
length617974
definitionDH844839|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008K11, 5' end.DH844840|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008K11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,106,037 - 76,106,652)(75,973,084 - 75,974,053)
sequence
gaattcctggagaggaagtttttccaaatctcaactgataatcagcttgc
acctttcatacaaacacctttcaaaacatgataatatggggaaagatctt
tggtatgcataatagttggtgtgtgagcctctgtgtggtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtggtacatgcacatttgtagtattggggatcaaagtcacaatct
tagggatcccaacaaataatctgtactactgagatacctccacaaatgca
gatatttgaaaaaaaatatttcaccaaaagtctaataaatgacaattaag
acaagaaaagttgtctgactttaatagtcatcaaatatgtgcatctttat
attacacctaaaaagtacccatgcatcttgtcaactggatacatttaaag
gctcactacgccaagtacaggcccaactgtgggtcttccatacctctgat
gggaaggtgagaggctagaaatactttgaagaaatgatttgtcaatcaat
attttgaaaaggaaaatatcaaaccatagtatgatccagtaagtctactc
tttggtgattccttgagatagatgacaaaaaatatccattcacagaccta
agtgaagtgtaaggttg
gaattcagtttctcttgtttgcaaggcaggcatcttactgagtgagcgat
ttgttcagtagttctggatgataggcaatgaagtcctggcccctggccct
ggtcctgaacacaataggtaaactgtatgcctatggttggtactgtgaca
tcaggagtggataatatgcactaattcattcagtgtgaggttgtaatgat
gatgaccaggtcctgtccaagagtctccagtggagccatagtaagcgacc
tgtgagagcctcatgtgccctaccaggtaggaaaagggcaatgctgggtg
gagacagagctaccaagagcagccgtgcttaaacatgctttctctgcact
gcagggcaaagagctttattcattcctcattatttttatgtgactaataa
attacaaataattctggtgcatcttcctaatagcaattagaataaacaaa
aggcatcacttcagctgcttggcaattaaggttctaatgactgcggtgga
ggcccgatgacggggatttggacaattcattagttggaagcataagcact
taaaacacaactaatgaagtatttagctaaattattcaaaacaaaacaaa
aaaaattaggcgggagggacagatgctacaaagaggccatattcttcaca
tccgagggaaaacgtgtcgagacgaaatcttcttgaaggatgtgaacata
gtaggcgagctgtttgcaagcctagctctgctataaagcttttttagctc
tgtgaatattacacatctccacacatgggtgtctatttctcacttaagag
agctatttccagaaagttttttgtcttttgtaccaaatgcatcttcatgg
agcccaatatccacaccggctttattgctaataagttatttgcattattt
gcaaattttcgtttgctctctcttattaagttatgctcatggttgcatgc
catgaatgcatatgtgaagtgtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_76106037_76106652
seq2: B6Ng01-008K11.b_44_660 (reverse)

seq1  CAACCTTACACTTCACTTAGGTCTGTGAATGGATA-TTTTTGTCATCTAT  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAACCTTACACTTCACTTAGGTCTGTGAATGGATATTTTTTGTCATCTAT  50

seq1  CTCAAGGAATCACCAAAGAGTAGACTTACTGGATCATACTATGGTTTGAT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGAATCACCAAAGAGTAGACTTACTGGATCATACTATGGTTTGAT  100

seq1  ATTTTCCTTTTCAAAATATTGATTGACAAATCATTTCTTCAAAGTATTTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTTTTCAAAATATTGATTGACAAATCATTTCTTCAAAGTATTTC  150

seq1  TAGCCTCTCACCTTCCCATCAGAGGTATGGAAGACCCACAGTTGGGCCTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTCTCACCTTCCCATCAGAGGTATGGAAGACCCACAGTTGGGCCTG  200

seq1  TACTTGGCGTAGTGAGCCTTTAAATGTATCCAGTTGACAAGATGCATGGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGCGTAGTGAGCCTTTAAATGTATCCAGTTGACAAGATGCATGGG  250

seq1  TACTTTTTAGGTGTAATATAAAGATGCACATATTTGATGACTATTAAAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTTAGGTGTAATATAAAGATGCACATATTTGATGACTATTAAAGT  300

seq1  CAGACAACTTTTCTTGTCTTAATTGTCATTTATTAGACTTTTGGTGAAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAACTTTTCTTGTCTTAATTGTCATTTATTAGACTTTTGGTGAAAT  350

seq1  ATTTTTTTTCAAATATCTGCATTTGTGGAGGTATCTCAGTAGTACAGATT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTTTCAAATATCTGCATTTGTGGAGGTATCTCAGTAGTACAGATT  400

seq1  ATTTGTTGGGATCCCTAAGATTGTGACTTTGATCCCCAATACTACAAATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTGGGATCCCTAAGATTGTGACTTTGATCCCCAATACTACAAATG  450

seq1  TGCATGTACCACACACACACACACACACACCACACAGAGGCTCACACACC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTACCACACACACACACACACACACCACACAGAGGCTCACACACC  500

seq1  AACTATTATGCATACCAAAGATCTTTCCCCATATTATCATGTTTTGAAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTATGCATACCAAAGATCTTTCCCCATATTATCATGTTTTGAAAG  550

seq1  GTGTTTGTATGAAAGGTGCAAGCTGATTATCAGTTGAGATTTGGAAAAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGTATGAAAGGTGCAAGCTGATTATCAGTTGAGATTTGGAAAAAC  600

seq1  TTCCTCTCCAGGAATTC  616
      |||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTCCAGGAATTC  617

seq1: chr7_75973084_75974053
seq2: B6Ng01-008K11.g_69_1042

seq1  GAATTCAGTTTCTCTTGTTTGCAAGGCAGGCATCTTACTGAGTGAGCGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTCTCTTGTTTGCAAGGCAGGCATCTTACTGAGTGAGCGAT  50

seq1  TTGTTCAGTAGTTCTGGATGATAGGCAATGAAGTCCTGGCCCCTGGCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCAGTAGTTCTGGATGATAGGCAATGAAGTCCTGGCCCCTGGCCCT  100

seq1  GGTCCTGAACACAATAGGTAAACTGTATGCCTATGGTTGGTACTGTGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGAACACAATAGGTAAACTGTATGCCTATGGTTGGTACTGTGACA  150

seq1  TCAGGAGTGGATAATATGCACTAATTCATTCAGTGTGAGGTTGTAATGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGTGGATAATATGCACTAATTCATTCAGTGTGAGGTTGTAATGAT  200

seq1  GATGACCAGGTCCTGTCCAAGAGTCTCCAGTGGAGCCATAGTAAGCGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACCAGGTCCTGTCCAAGAGTCTCCAGTGGAGCCATAGTAAGCGACC  250

seq1  TGTGAGAGCCTCATGTGCCCTACCAGGTAGGAAAAGGGCAATGCTGGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAGCCTCATGTGCCCTACCAGGTAGGAAAAGGGCAATGCTGGGTG  300

seq1  GAGACAGAGCTACCAAGAGCAGCCGTGCTTAAACATGCTTTCTCTGCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGAGCTACCAAGAGCAGCCGTGCTTAAACATGCTTTCTCTGCACT  350

seq1  GCAGGGCAAAGAGCTTTATTCATTCCTCATTATTTTTATGTGACTAATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGCAAAGAGCTTTATTCATTCCTCATTATTTTTATGTGACTAATAA  400

seq1  ATTACAAATAATTCTGGTGCATCTTCCTAATAGCAATTAGAATAAACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAAATAATTCTGGTGCATCTTCCTAATAGCAATTAGAATAAACAAA  450

seq1  AGGCATCACTTCAGCTGCTTGGCAATTAAGGTTCTAATGACTGCGGTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCACTTCAGCTGCTTGGCAATTAAGGTTCTAATGACTGCGGTGGA  500

seq1  GGCCCGATGACGGGGATTTGGACAATTCATTAGTTGGAAGCATAAGCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCGATGACGGGGATTTGGACAATTCATTAGTTGGAAGCATAAGCACT  550

seq1  TAAAACACAACTAATGAAGTATTTAGCTAAATTATTCAAAACAAAACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACACAACTAATGAAGTATTTAGCTAAATTATTCAAAACAAAACAAA  600

seq1  AAAAATTAGGCGGGAGGGACAGATGCTACAAAGAGGCCATATTCTTCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAGGCGGGAGGGACAGATGCTACAAAGAGGCCATATTCTTCACA  650

seq1  TCCGAGGGAAAACGTGTCGAGACG-AATCTTCTTGAAGGATGTGAACATA  699
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGGGAAAACGTGTCGAGACGAAATCTTCTTGAAGGATGTGAACATA  700

seq1  GTAGGCGAGCTGTTTGCAAGCCTAGCTCTGCTATAAAGCTTTTTCAGCTC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTAGGCGAGCTGTTTGCAAGCCTAGCTCTGCTATAAAGCTTTTTTAGCTC  750

seq1  TGTGAATATTTCCACATCTCCACACATGGGTGTCTA-TTCTCACTTAAGT  798
      |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  TGTGAATA-TTACACATCTCCACACATGGGTGTCTATTTCTCACTTAAG-  798

seq1  AGAGCTA-TTCCAGAAAGTTTTTTGTCTTTTGTACCAGATGCATC-TCAT  846
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  AGAGCTATTTCCAGAAAGTTTTTTGTCTTTTGTACCAAATGCATCTTCAT  848

seq1  GGAGCCCAATATCCACACC-GCTTTATTGCTAATAGAGTTATTTGCATTA  895
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGAGCCCAATATCCACACCGGCTTTATTGCTAATA-AGTTATTTGCATTA  897

seq1  TTTGCAAA-TTTCGTTTGCTCTCTCTTATTAAGTTATGCTCATGTGTGCA  944
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
seq2  TTTGCAAATTTTCGTTTGCTCTCTCTTATTAAGTTATGCTCATGGTTGCA  947

seq1  TGCCATGAATGCATATGTG-AGTGTGG  970
      ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGCCATGAATGCATATGTGAAGTGTGG  974