BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010D12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 105,762,799 - 105,924,340
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2210018M11Rik, LOC100040769, Prkrir
Upstream geneRsf1, LOC100040211, Clns1a, Aqp11, LOC100040594, Pak1, Gdpd4, Myo7a, Capn5, Omp, B3gnt6, Phca, Tsku, LOC100040269, Gucy2d, LOC100040721, EG434215, A630091E08Rik
Downstream geneWnt11, LOC666978, Uvrag, EG666529, Dgat2, Mogat2, Mtap6, Serpinh1, Gdpd5, 2810406K13Rik, Rps3, Rnu15-b, EG449630, Arrb1, EG245190, Slco2b1, Olfr520, Olfr521
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010D12.bB6Ng01-010D12.g
ACCDH845949DH845950
length1,1501,015
definitionDH845949|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D12, 5' end.DH845950|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(105,762,799 - 105,763,970)(105,923,317 - 105,924,340)
sequence
gaattcagatctaaatccaagttcaaaaattaataacctaactatcaact
acaactatccaaaagaaacaaagtgtctccaatcaagtctcacatattgt
ttgcaagcagcattctcagaaagatctgtgattgatcctgctgatctgta
aacagcttgtcagcctgttccaagcactgtgacccaaacaaagccagcct
gcagagtattatctgagaaagctcatgtgtggtggacctgcacaagatgc
aggtagggtataaatacacactatgtgtgttgaagaagatggtcccatag
gctgatctcattttactagcactgcctgctaaactactgctaaatatcta
ttagaaaaaattcacatgtgatctgagatctcccatagcagataacatcc
ttttataaatccaaatactacagaatcctagcttttctgttgacttacta
atgtgaattcagaaaaggcctaatctggaccactttcagcattataaaag
actgtgatacataagcgtttatctgtcttctagtgaggtcaggaaaggta
aggatgctactgagtctgagtgcttaaataccaagaacagtaagaaatca
atgactgagaacttctcatgtgttagacactgctttaagcactttcaaaa
cacctatcatcacccaatgtaggcatgaagaaataaaatattgcactggt
tagataagtcacccatagccaaactacaaagtgagacacaaagcctaagt
gtgtctacctctaacctcttaacaattgccatcagaacctaaaatgggaa
aataaaaaataaacaacaaactttaagtaacaaatccctatctataaatt
tattttaaactcaaatatttctcttttttccagcctaaatcaatgcttat
ctactaaccataagcagaacagaattcctccaagtcttcctgcagctaaa
ccagcggaattctccatttgaaggaactaaacacttgaatcttgttacaa
gcacctgctttgagcagctataagcaacatgcttcagcattactttttaa
attgcctcggtgatgataggctattctattgcagcagtacaagtcagcat
tcatccacttggggtctgtgcctttaaccgctaaggatactgagtgtttt

gaattcctctgcttcttggtgactcagggacaactgtaatgctcgcccag
gcagaataggtcctgatgtggccaggggcccccagagaccaccttcagtc
ttgctttccatgagcaccagggtgccagagaaataaactgatgctggggt
caaaactgttgctatacgtgatgatggcttcatactggcaatggaagtgg
taacctttttctcggacagtgacactggggtagtatataaagggggaatc
tccatgcttttctgtgcggtctgtgtatgctctaaatgatccacagtgaa
aggtttggaatgttcatctcaaatataaccagcactttgcagctttcagt
cagacttcaccaggagcccttcagctcatctaactttgcccacctcagac
aatctctagttgttccaacgtgcctaggactggcctcactccctggcaca
cccctccatgcttctggccccatgcttctagggatataacactaagatga
tagggccctcctctgtggcctctccttgctggctcccaccactctccctt
ctgttcctatcttgagtggcctgcggttgggctgaaccacaggtggcaaa
tatttgaatgtatcgtcaccaaagacacttggcaggtgttcgtatataca
cgctcaagaggtgaaacagggggcaggactggggaaggaacagcctgaag
ccctacacatgtcggggagcctaggcagtggtctcccatctccagctcca
actggggtcgtgttgaaaggctgaagaagtccagggacagatcagacgtg
agacatgaagacatcatcagagactagatggcagctccatagctataggg
aggcaagtagggatgcaggccagtctgcctcgcaggtgagggaccatgag
tctaggaaagacttagaggccaaggaaggtcgagtatgcttggttgaggc
tgcatagcatgatatggcatgctaaatcagtgaggagaggtagttgtata
gtgtgctagcagagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_105762799_105763970
seq2: B6Ng01-010D12.b_47_1196

seq1  GAATTCAGATCTAAATCCAAGTTCAAAAATTAATAACCTAACTATCAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATCTAAATCCAAGTTCAAAAATTAATAACCTAACTATCAACT  50

seq1  ACAACTATCCAAAAGAAACAAAGTGTCTCCAATCAAGTCTCACATATTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTATCCAAAAGAAACAAAGTGTCTCCAATCAAGTCTCACATATTGT  100

seq1  TTGCAAGCAGCATTCTCAGAAAGATCTGTGATTGATCCTGCTGATCTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAGCAGCATTCTCAGAAAGATCTGTGATTGATCCTGCTGATCTGTA  150

seq1  AACAGCTTGTCAGCCTGTTCCAAGCACTGTGACCCAAACAAAGCCAGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTTGTCAGCCTGTTCCAAGCACTGTGACCCAAACAAAGCCAGCCT  200

seq1  GCAGAGTATTATCTGAGAAAGCTCATGTGTGGTGGACCTGCACAAGATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGTATTATCTGAGAAAGCTCATGTGTGGTGGACCTGCACAAGATGC  250

seq1  AGGTAGGGTATAAATACACACTATGTGTGTTGAAGAAGATGGTCCCATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGGTATAAATACACACTATGTGTGTTGAAGAAGATGGTCCCATAG  300

seq1  GCTGATCTCATTTTACTAGCACTGCCTGCTAAACTACTGCTAAATATCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATCTCATTTTACTAGCACTGCCTGCTAAACTACTGCTAAATATCTA  350

seq1  TTAGAAAAAATTCACATGTGATCTGAGATCTCCCATAGCAGATAACATCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAAAAATTCACATGTGATCTGAGATCTCCCATAGCAGATAACATCC  400

seq1  TTTTATAAATCCAAATACTACAGAATCCTAGCTTTTCTGTTGACTTACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAAATCCAAATACTACAGAATCCTAGCTTTTCTGTTGACTTACTA  450

seq1  ATGTGAATTCAGAAAAGGCCTAATCTGGACCACTTTCAGCATTATAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAATTCAGAAAAGGCCTAATCTGGACCACTTTCAGCATTATAAAAG  500

seq1  ACTGTGATACATAAGCGTTTATCTGTCTTCTAGTGAGGTCAGGAAAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGATACATAAGCGTTTATCTGTCTTCTAGTGAGGTCAGGAAAGGTA  550

seq1  AGGATGCTACTGAGTCTGAGTGCTTAAATACCAAGAACAGTAAGAAATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCTACTGAGTCTGAGTGCTTAAATACCAAGAACAGTAAGAAATCA  600

seq1  ATGACTGAGAACTTCTCATGTGTTAGACACTGCTTTAAGCACTTTCAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGAGAACTTCTCATGTGTTAGACACTGCTTTAAGCACTTTCAAAA  650

seq1  CACCTATCATCACCCAATGTAGGCATGAAGAAATAAAATATTGCACTGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTATCATCACCCAATGTAGGCATGAAGAAATAAAATATTGCACTGGT  700

seq1  TAGATAAGTCACCCATAGCCAAACTACAAAGTGAGACACAAAGCCTAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAGTCACCCATAGCCAAACTACAAAGTGAGACACAAAGCCTAAGT  750

seq1  GTGTCTACCTCTAACCTCTTAACAATTGCCATCAGAACCTAAAATGGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTACCTCTAACCTCTTAACAATTGCCATCAGAACCTAAAATGGGAA  800

seq1  AATAAAAAATAAACAACAAACTTTAAGTAACAAATCCCTATCTATAAATT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AATAAAAAATAAACAACAAACTTTAAGTAACAAATCCCTATCTATAAA-T  849

seq1  TTATTTTAAACTCAAATATTTCTCTTTTTTCCAGCCTAAATCAATGCTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTAAACTCAAATATTTCTCTTTTTTCCAGCCTAAATCAATGCTTA  899

seq1  TCTACTAACCATAAGCAGGAACAGAATTCCTCCAAGTCTTCCTGCAGCTA  950
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTAACCATAAGCA-GAACAGAATTCCTCCAAGTCTTCCTGCAGCTA  948

seq1  AACCAGCGGAATTCTCCATTTGAAGGAAACTAAACACTTGAATCATGGTA  1000
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || 
seq2  AACCAGCGGAATTCTCCATTTGAAGG-AACTAAACACTTGAATC-TTGTT  996

seq1  ACAAGCCACCTGCTATGAGCAGCTATAAGCAACATGCTTTCAGCATTACT  1050
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACAAG-CACCTGCTTTGAGCAGCTATAAGCAACATGC-TTCAGCATTACT  1044

seq1  GTATAAAATGGCATCAGTTGATGATAAAGGCTATTCTATTGCAGCAGTAC  1100
       | | |||| || || | |||||||  |||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTTAAATTGCCTC-GGTGATGAT--AGGCTATTCTATTGCAGCAGTAC  1090

seq1  AGAGTCAAGCCATTCCATCCACTATGGGGTTCTGATGGCCTTTAAACCGC  1150
      | |||||   |||| |||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||
seq2  A-AGTCA--GCATT-CATCCACT-TGGGG-TCTG--TGCCTTT-AACCGC  1131

seq1  TTAGTGGATTACTGAGTGTTTT  1172
      | |  ||| |||||||||||||
seq2  TAA--GGA-TACTGAGTGTTTT  1150

seq1: chr7_105923317_105924340
seq2: B6Ng01-010D12.g_67_1081 (reverse)

seq1  GCTCTGCCTAGCACACTATACAACTACCCTCTCCTCAACTTGATTTTAGC  50
      |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||
seq2  GCTCTG-CTAGCACACTATACAACTA-CCTCTCCTCA--CTGA-TTTAGC  45

seq1  ATGCCATATCATGCTATGCAGCCTCCAACCAAGCATACTCGACCTTCCCT  100
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
seq2  ATGCCATATCATGCTATGCAGCCT-CAACCAAGCATACTCGACCTT-CCT  93

seq1  TGGCCTCTAAGTCTTTCCTAGACTCATGGTCCCTCACCCTGCGAGGCAGA  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGCCTCTAAGTCTTTCCTAGACTCATGGTCCCTCA-CCTGCGAGGCAGA  142

seq1  CCTGGCCTGCATCCCTACTTGCCTCCCTATAGCTATGGAGCTGCCATCTA  200
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CTGGCCTGCATCCCTACTTGCCTCCCTATAGCTATGGAGCTGCCATCTA  191

seq1  GTCTCTGATGATGTCTTCATGTCTCACGTCTGATCTGTCCCTGGACTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGATGATGTCTTCATGTCTCACGTCTGATCTGTCCCTGGACTTCT  241

seq1  TCAGCCTTTCAACACGACCCCAGTTGGAGCTGGAGATGGGAGACCACTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCTTTCAACACGACCCCAGTTGGAGCTGGAGATGGGAGACCACTGC  291

seq1  CTAGGCTCCCCGACATGTGTAGGGCTTCAGGCTGTTCCTTCCCCAGTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTCCCCGACATGTGTAGGGCTTCAGGCTGTTCCTTCCCCAGTCCT  341

seq1  GCCCCCTGTTTCACCTCTTGAGCGTGTATATACGAACACCTGCCAAGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTGTTTCACCTCTTGAGCGTGTATATACGAACACCTGCCAAGTGT  391

seq1  CTTTGGTGACGATACATTCAAATATTTGCCACCTGTGGTTCAGCCCAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTGACGATACATTCAAATATTTGCCACCTGTGGTTCAGCCCAACC  441

seq1  GCAGGCCACTCAAGATAGGAACAGAAGGGAGAGTGGTGGGAGCCAGCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCCACTCAAGATAGGAACAGAAGGGAGAGTGGTGGGAGCCAGCAAG  491

seq1  GAGAGGCCACAGAGGAGGGCCCTATCATCTTAGTGTTATATCCCTAGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGCCACAGAGGAGGGCCCTATCATCTTAGTGTTATATCCCTAGAAG  541

seq1  CATGGGGCCAGAAGCATGGAGGGGTGTGCCAGGGAGTGAGGCCAGTCCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGGCCAGAAGCATGGAGGGGTGTGCCAGGGAGTGAGGCCAGTCCTA  591

seq1  GGCACGTTGGAACAACTAGAGATTGTCTGAGGTGGGCAAAGTTAGATGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACGTTGGAACAACTAGAGATTGTCTGAGGTGGGCAAAGTTAGATGAG  641

seq1  CTGAAGGGCTCCTGGTGAAGTCTGACTGAAAGCTGCAAAGTGCTGGTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGGCTCCTGGTGAAGTCTGACTGAAAGCTGCAAAGTGCTGGTTAT  691

seq1  ATTTGAGATGAACATTCCAAACCTTTCACTGTGGATCATTTAGAGCATAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAGATGAACATTCCAAACCTTTCACTGTGGATCATTTAGAGCATAC  741

seq1  ACAGACCGCACAGAAAAGCATGGAGATTCCCCCTTTATATACTACCCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCGCACAGAAAAGCATGGAGATTCCCCCTTTATATACTACCCCAG  791

seq1  TGTCACTGTCCGAGAAAAAGGTTACCACTTCCATTGCCAGTATGAAGCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTGTCCGAGAAAAAGGTTACCACTTCCATTGCCAGTATGAAGCCA  841

seq1  TCATCACGTATAGCAACAGTTTTGACCCCAGCATCAGTTTATTTCTCTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACGTATAGCAACAGTTTTGACCCCAGCATCAGTTTATTTCTCTGG  891

seq1  CACCCTGGTGCTCATGGAAAGCAAGACTGAAGGTGGTCTCTGGGGGCCCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGGTGCTCATGGAAAGCAAGACTGAAGGTGGTCTCTGGGGGCCCC  941

seq1  TGGCCACATCAGGACCTATTCTGCCTGGGCGAGCATTACAGTTGTCCCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACATCAGGACCTATTCTGCCTGGGCGAGCATTACAGTTGTCCCTG  991

seq1  AGTCACCAAGAAGCAGAGGAATTC  1024
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACCAAGAAGCAGAGGAATTC  1015