BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010F02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 37,143,663 - 37,250,149
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRhpn2, C230052I12Rik, Ccdc123, Slc7a9, 2410004F06Rik, Nudt19, Rgs9bp, Ankrd27, Pdcd5, Dpy19l3, zfp507, LOC100043872, EG668988, LOC668507
Downstream geneTshz3, LOC100043874
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010F02.bB6Ng01-010F02.g
ACCDH846019DH846020
length9991,049
definitionDH846019|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010F02, 5' end.DH846020|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010F02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,249,156 - 37,250,149)(37,143,663 - 37,144,715)
sequence
cacaaatgtttggagctacacaactgttatacatcctttagtatctatct
atctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctat
ctatctatccatctatgtacccatccatctatctatatcatcatattaca
ttaaccagttatccttttatccattcatctatctaaacactcattttatt
ctatccatcaatacacaatattatctatttgcttgttattggtctaacca
atcatcctgtatctaatcatactactatccacctatctatatatcgttca
catatcctattatctatccacacatccatatatatccatccttttaccta
tctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatctatcatct
acttacctagccattctatttatccactcatgctattattcatttgtctc
tctatacaagcatcctactatctatgtatccattctactaactatacatc
cattatatagttatctatttatctatatacctaatctgcatctcacctat
taccattgaaattttctcatatcaaaaaaagacatgcttgatcattacta
tttatttaccactatggcactcttcatctttatgtaccacttttgcactt
gatcttagccaaaaggccgagaagcgatatgtaccactttttgaacatct
agttttcaatacagtcttgctttttcatctgtctatataactgtctttag
tagttcttggagactttgcatgtaccattgcttctgcctcgaatgttctt
ttccagttacttgtccagttggttcccttttgatgccttttgctcaaacg
tcatagttagcaaaggacacttttcctgctttttgacactgcaggggtct
accaatgtaaaacctccccaaccctcacagtttcatattatgacctgact
tgtggttgacctttgtagaacttataggccggggatagtttcccttggt
gaattcatagacctaaatacattccctgtttatgataaacgggcacatac
atgaagcataaacacaagccaatagattgtcctgacttttccaattcaaa
aacaggcaggttatttcaaaattttaataagtacaatagcctctcatccc
ctcccatgttaagtacttcatagcttattcatgaaagccagcaaaatatt
gatattcaaaccagtctgtataccatgaaagtgaaaaaagaaacccacag
atgctcacttaggaatttagacttaatttcctaaatgttaaactattcgc
cgtagtgctgggactggatcgtgatggaagcgctcctgtggcgaagactc
ttttagattacaaaggtgatccaacaccaaggaacctattaatataatta
ataccatcatttgaagagaacaaaagggagaaaaatcatctccttccttg
ctagaaggcatctgataaaatgtaaaaatggtttctgctgaaatatgtta
ggaacatacttaaaaattttgtgaaagtatattttgacccatttgtcacc
atgatatataattataaaacaccgggactatatctgttatggtggagaac
agtaaagggtggcagatacctatgctatcacttcgtatggctggggagat
acagacaatgtgatcaggcaagaaaagggaataaaaaaaaaaaacatgta
acaagaaagccaaaggaaagaggagtcgtcatccacaggcagtacagcaa
gcagaatagttggaggccgggagctctgagttagatgtatagtaggtacc
actaagaagcactcatcatgcaagaactaactctaaagatgttcacagac
acgttaccctccatattagcttagtctgtagttaggaaggctttttctcc
tcatgtgtgtttggctttggatctttggacaaaagggctgagatgcctat
tttacataccaaagcagacctgacttcagttctcccagcatgcttctgtg
cccagcttgcatacccaggggctggctgtcctatctagcagagttcttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_37249156_37250149
seq2: B6Ng01-010F02.b_41_1039 (reverse)

seq1  ACCAAAGGAAACTAT-CACAGACTATAAGTTCTAACAAAAGTCAAACCAC  49
      ||||| ||||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||
seq2  ACCAAGGGAAACTATCCCCGGCCTATAAGTTCT-ACAAAGGTC-AACCAC  48

seq1  AAGTCAGGTCATAATATGAAACGTGTG-GGGTTGGAGAGGATTCTACA-T  97
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||| |
seq2  AAGTCAGGTCATAATATGAAAC-TGTGAGGGTTGGGGAGG-TTTTACATT  96

seq1  CGTAGAACCCTGCAGTGTC-AAATGCAGTGAAAGTGTCCTATGCTAACTA  146
       ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||
seq2  GGTAGACCCCTGCAGTGTCAAAAAGCAGGAAAAGTGTCCTTTGCTAACTA  146

seq1  TGACGTTTGAGCAAAAGGCATCAAAAGGGAACCAACTGGACAGGTAACTG  196
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGACGTTTGAGCAAAAGGCATCAAAAGGGAACCAACTGGACAAGTAACTG  196

seq1  GAAAAAGAACATTCGAGGCAGAAGCAATGGTACATGCAAAGTCTCCAAGA  246
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-AAAAGAACATTCGAGGCAGAAGCAATGGTACATGCAAAGTCTCCAAGA  245

seq1  ACTACTAAAGACAGTTATATAGACAGATG-AAAAGCAAGACTGTATTGAA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTAAAGACAGTTATATAGACAGATGAAAAAGCAAGACTGTATTGAA  295

seq1  AACTAGATGTTC-AAAAGTGGTACATATCGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAA  344
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGATGTTCAAAAAGTGGTACATATCGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAA  345

seq1  GATCAAGTGCAAAAGTGGTACATAAAGATGAAGAGTGCCATAGTGGTAAA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAGTGCAAAAGTGGTACATAAAGATGAAGAGTGCCATAGTGGTAAA  395

seq1  TAAATAGTAATGATCAAGCATGTCTTTTTTTGATATGAGAAAATTTCAAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGTAATGATCAAGCATGTCTTTTTTTGATATGAGAAAATTTCAAT  445

seq1  GGTAATAGGTGAGATGCAGATTAGGTATATAGATAAATAGATAACTATAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATAGGTGAGATGCAGATTAGGTATATAGATAAATAGATAACTATAT  495

seq1  AATGGATGTATAGTTAGTAGAATGGATACATAGATAGTAGGATGCTTGTA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATGTATAGTTAGTAGAATGGATACATAGATAGTAGGATGCTTGTA  545

seq1  TAGAGAGACAAATGAATAATAGCATGAGTGGATAAATAGAATGGCTAGGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGACAAATGAATAATAGCATGAGTGGATAAATAGAATGGCTAGGT  595

seq1  AAGTAGATGATAGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGATGATAGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGA  645

seq1  TAGATAGGTAAAAGGATGGATATATATGGATGTGTGGATAGATAATAGGA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGGTAAAAGGATGGATATATATGGATGTGTGGATAGATAATAGGA  695

seq1  TATGTGAACGATATATAGATAGGTGGATAGTAGTATGATTAGATACAGGA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAACGATATATAGATAGGTGGATAGTAGTATGATTAGATACAGGA  745

seq1  TGATTGGTTAGACCAATAACAAGCAAATAGATAATATTGTGTATTGATGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGGTTAGACCAATAACAAGCAAATAGATAATATTGTGTATTGATGG  795

seq1  ATAGAATAAAATGAGTGTTTAGATAGATGAATGGATAAAAGGATAACTGG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAATAAAATGAGTGTTTAGATAGATGAATGGATAAAAGGATAACTGG  845

seq1  TTAATGTAATATGATGATATAGATAGATGGATGGGTACATAGATG----G  890
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |
seq2  TTAATGTAATATGATGATATAGATAGATGGATGGGTACATAGATGGATAG  895

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  945

seq1  AGATAGATAGATACTAAAGGATGTATAACAGTTGTGTAGCTCCAAACATT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGATAGATACTAAAGGATGTATAACAGTTGTGTAGCTCCAAACATT  995

seq1  TGTG  994
      ||||
seq2  TGTG  999

seq1: chr7_37143663_37144715
seq2: B6Ng01-010F02.g_66_1114

seq1  GAATTCATAGACCTAAATACATTCCCTGTTTATGATAAACGGGCACATAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGACCTAAATACATTCCCTGTTTATGATAAACGGGCACATAC  50

seq1  ATGAAGCATAAACACAAGCCAATAGATTGTCCTGACTTTTCCAATTCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCATAAACACAAGCCAATAGATTGTCCTGACTTTTCCAATTCAAA  100

seq1  AACAGGCAGGTTATTTCAAAATTTTAATAAGTACAATAGCCTCTCATCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGCAGGTTATTTCAAAATTTTAATAAGTACAATAGCCTCTCATCCC  150

seq1  CTCCCATGTTAAGTACTTCATAGCTTATTCATGAAAGCCAGCAAAATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCATGTTAAGTACTTCATAGCTTATTCATGAAAGCCAGCAAAATATT  200

seq1  GATATTCAAACCAGTCTGTATACCATGAAAGTGAAAAAAGAAACCCACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTCAAACCAGTCTGTATACCATGAAAGTGAAAAAAGAAACCCACAG  250

seq1  ATGCTCACTTAGGAATTTAGACTTAATTTCCTAAATGTTAAACTATTCGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCACTTAGGAATTTAGACTTAATTTCCTAAATGTTAAACTATTCGC  300

seq1  CGTAGTGCTGGGACTGGATCGTGATGGAAGCGCTCCTGTGGCGAAGACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGTGCTGGGACTGGATCGTGATGGAAGCGCTCCTGTGGCGAAGACTC  350

seq1  TTTTAGATTACAAAGGTGATCCAACACCAAGGAACCTATTAATATAATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGATTACAAAGGTGATCCAACACCAAGGAACCTATTAATATAATTA  400

seq1  ATACCATCATTTGAAGAGAACAAAAGGGAGAAAAATCATCTCCTTCCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATCATTTGAAGAGAACAAAAGGGAGAAAAATCATCTCCTTCCTTG  450

seq1  CTAGAAGGCATCTGATAAAATGTAAAAATGGTTTCTGCTGAAATATGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGGCATCTGATAAAATGTAAAAATGGTTTCTGCTGAAATATGTTA  500

seq1  GGAACATACTTAAAAATTTTGTGAAAGTATATTTTGACCCATTTGTCACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATACTTAAAAATTTTGTGAAAGTATATTTTGACCCATTTGTCACC  550

seq1  ATGATATATAATTATAAAACACCGGGACTATATCTGTTATGGTGGAGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATATAATTATAAAACACCGGGACTATATCTGTTATGGTGGAGAAC  600

seq1  AGTAAAGGGTGGCAGATACCTATGCTATCACTTCGTATGGCTGGGGAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAGGGTGGCAGATACCTATGCTATCACTTCGTATGGCTGGGGAGAT  650

seq1  ACAGACAATGTGATCAGGCAAGAAAAGGGAATAAAAAAAAAAAACATGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAATGTGATCAGGCAAGAAAAGGGAATAAAAAAAAAAAACATGTA  700

seq1  ACAAGAAAGCCAAAGGAAAGAGGAGTCGTCATCCACAGGCAGTACAGCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAAAGCCAAAGGAAAGAGGAGTCGTCATCCACAGGCAGTACAGCAA  750

seq1  GCAGAATAGTTGGAGGCCGGGAGCTCTGAGTTAGATGTATAGTAGGTACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAATAGTTGGAGGCCGGGAGCTCTGAGTTAGATGTATAGTAGGTACC  800

seq1  ACTAAGAAGCACTCATCATGCAAGAACTAACTCTAAAGATGTTCACAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGAAGCACTCATCATGCAAGAACTAACTCTAAAGATGTTCACAGAC  850

seq1  ACGTTACCCTCCATATTAGCTTAGTCTGTAGTTAGGAAGGCCTTTTTCCC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  ACGTTACCCTCCATATTAGCTTAGTCTGTAGTTAGGAAGG-CTTTTTCTC  899

seq1  CTCATGTGTGTTTGGCTTTGGATCCTTGGAC-AAAGGGCTGAGATGCCTA  949
      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTCATGTGTGTTTGGCTTTGGATCTTTGGACAAAAGGGCTGAGATGCCTA  949

seq1  TTTTACATACCAAAGCAGACCTGACCTCCAGGTTCTCCCAGCATGCCTCT  999
      ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||
seq2  TTTTACATACCAAAGCAGACCTGACTTC--AGTTCTCCCAGCATGCTTCT  997

seq1  GTGCCCAGCTGGCATACCCAGGGGCTGGGCTGCCCTTCCTAGCAGAGGTT  1049
      |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||
seq2  GTGCCCAGCTTGCATACCCAGGGGCT-GGCTGTCCTATCTAGCAGA-GTT  1045

seq1  CTTC  1053
      ||||
seq2  CTTC  1049