BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-011I01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 73,926,887 - 74,070,371
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLass3, Adamts17
Upstream geneLOC665241, Pcsk6, Snrpa1, H47, Chsy1, Lrrk1, Aldh1a3, Asb7, Lins2
Downstream geneLysmd4, Mef2a, EG665304, Lrrc28, Ttc23, Dmn, LOC665319, LOC100041771
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-011I01.bB6Ng01-011I01.g
ACCDH846867DH846868
length1,0591,145
definitionDH846867|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-011I01, 5' end.DH846868|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-011I01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,069,306 - 74,070,371)(73,926,887 - 73,927,992)
sequence
gaattcaggaatctcccgccttagcccctccctgcaacttctaggatcac
agatgtgtcccaccacatcagactgtttctcctccattttaatttacttt
ctcaggcaagttatcttaggcagagagcccattcatgtggtccctctaag
caacaggagacacagcaggagtaacaagaaggggcaacgtgtgcactgaa
gggaccactcttcatattgaaggattaagaacctagaggacaactctgga
gtcacggaaccagcagcagctccgtgctttggcatctgatgatccaccag
gcttcttgacttgctgagcactatagaaggtccaaagtttgtcaccaggg
acaagtctagaactgtaccagtccagcgatggcaaagcagagttaattct
tccacatttaccatctcgaagtttgtcagtctaggaatgcaaagcccttc
cttccctttgttctactgctgtactgtgttgtccttttatagagctgctc
ataagcccaagtcctaagagcccattcaggttgctcatccttgagccctt
cagtgtgtatcaatttctctttctttttctcttgtttctctgggaaactt
aagatgaaggaaggaaggggagctacctttacctgctctgtgaggccaag
gctactttacctgctctgtaaggccaaggctacttttcatcctcctctaa
aatcactcagaactccaaccgtgtccttaactctgcgaatcctgagagga
gggggtgccagctgccaggtcttcagggtttggagatctcaaaacttgaa
agcacaggatcttagctagagacgcagacttccttggttctgaacatgga
agctaagcaccgccaaacagaaccccagttccagtgtcccagtactctta
ttttctcctgtaacacccagttttcagggactgtggctgccaagtccttg
ggtaacttaagatgatcaatgaaggaaaatctccagcactgctcatagga
ggatatagtgcaaaccccacatatcccaggtcacttcaatcctaattcat
tgggcagaa
gaattccatgttcccatgtggggatacttccctgaagttttataacagaa
caaagcaaatcataaatggaaatactttaaaaacacatcagtgggaaagc
cagacaagcaggtcacagcaaggcaggggattcgcaaccacaagcccagg
tgccagaagacaacattttaccttggttggcagaagctaaggggtctgtt
tgtatattccgaaggatttacctagccatgaagatgctgggtcacataca
aaggtggctaacaagtggccatgaggaggggctcatgactccccaagata
aatggaaattaggctctaacctttctacctagtcagtcagttagtcattc
agtcagccatacagatcattgcctgttcctcctgaacttctttcacagtt
ctttcaggacgtaatactccataagttaaccaggttaagaactcttgtct
tgacagtgaacacactctgggtcactgtgacagtgaacacacatgtgggt
cagtgtgacagtgaacacactctgagtcagtgtgacagtgaacacactct
gggtcactgtgacagtgaacacacatgtgggtcagtgtgacagtgaacac
actctgagtcagtgtgacagtgaacacactctgggtcactgtgacagtga
acacactctgggtctgtgtcacagtgaagacactctgggtctgtgtcaca
gtgaacacactctgtctgggtcagtgtgacaatgaacatgcacatgggtc
agtgtgatagtgaacacactctaggtcagtgtgacagtgaagacactcaa
ggttagtgtgacagtgaacacacacatgtgggtcagtgtcacagtggaac
acacatggggggtcagtgtgacattgaaagacactctaggccagtgtgac
agtgaacacacatggtgggtcagtgtgacattgaaagacactctaggtca
ggtgacagtgaacacacacatgtggggtcggtgtcacagttgacacacac
gtgggtcttgtgacattgtaagacactctagggtcgttgtgacattgaac
actcatgttggtcagtggtgataggaaagaccttctatggtagttgtgta
cggtaaagctaccgtggggtcaaggggaagagtgatacacacatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_74069306_74070371
seq2: B6Ng01-011I01.b_46_1104 (reverse)

seq1  TTCTGCCCAATGGAATGAGATTGGAAGTGACATGTGATATTGTGGGGGTT  50
      ||||||||||| |||| ||  | |||||||| || |||| |||||||  |
seq2  TTCTGCCCAAT-GAATTAGGATTGAAGTGACCTGGGATA-TGTGGGG--T  46

seq1  TTGCACTTATATCCTCCTATGAGCAGTGCTTGGAGATTTTTCCTCATTGA  100
      |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||
seq2  TTGCAC-TATATCCTCCTATGAGCAGTGC-TGGAGATTTTCCTTCATTGA  94

seq1  TCATCTTAAGGTTACCCAAGGACTTGGCAGCCACAGTCCCTG-AAACTGG  149
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TCATCTTAA-GTTACCCAAGGACTTGGCAGCCACAGTCCCTGAAAACTGG  143

seq1  GTGTTACAGGAGAAAATAAGAGTACTGGGACACTGGAACTGGGGTTCTGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTACAGGAGAAAATAAGAGTACTGGGACACTGGAACTGGGGTTCTGT  193

seq1  TTGGCGGTGCTTAGCTTCCATGTTCAGAACCAAGGAAGTCTGCGTCTCTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCGGTGCTTAGCTTCCATGTTCAGAACCAAGGAAGTCTGCGTCTCTA  243

seq1  GCTAAGATCCTGTGCTTTTCAAGTTTTGAGATCTCCAAACCCTGAAGACC  299
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGATCCTGTGC-TTTCAAGTTTTGAGATCTCCAAACCCTGAAGACC  292

seq1  TGGCAGCTGGCACCCCCTCCTCTCAGGATTCGCAGAGTTAAGGACACGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCTGGCACCCCCTCCTCTCAGGATTCGCAGAGTTAAGGACACGGT  342

seq1  TGGAGTTCTGAGTGATTTTAGAGGAGGATGAAAAGTAGCCTTGGCCTTAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTCTGAGTGATTTTAGAGGAGGATGAAAAGTAGCCTTGGCCTTAC  392

seq1  AGAGCAGGTAAAGTAGCCTTGGCCTCACAGAGCAGGTAAAGGTAGCTCCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGGTAAAGTAGCCTTGGCCTCACAGAGCAGGTAAAGGTAGCTCCC  442

seq1  CTTCCTTCCTTCATCTTAAGTTTCCCAGAGAAACAAGAGAAAAAGAAAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTCCTTCATCTTAAGTTTCCCAGAGAAACAAGAGAAAAAGAAAGA  492

seq1  GAAATTGATACACACTGAAGGGCTCAAGGATGAGCAACCTGAATGGGCTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTGATACACACTGAAGGGCTCAAGGATGAGCAACCTGAATGGGCTC  542

seq1  TTAGGACTTGGGCTTATGAGCAGCTCTATAAAAGGACAACACAGTACAGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACTTGGGCTTATGAGCAGCTCTATAAAAGGACAACACAGTACAGC  592

seq1  AGTAGAACAAAGGGAAGGAAGGGCTTTGCATTCCTAGACTGACAAACTTC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAACAAAGGGAAGGAAGGGCTTTGCATTCCTAGACTGACAAACTTC  642

seq1  GAGATGGTAAATGTGGAAGAATTAACTCTGCTTTGCCATCGCTGGACTGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGTAAATGTGGAAGAATTAACTCTGCTTTGCCATCGCTGGACTGG  692

seq1  TACAGTTCTAGACTTGTCCCTGGTGACAAACTTTGGACCTTCTATAGTGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTTCTAGACTTGTCCCTGGTGACAAACTTTGGACCTTCTATAGTGC  742

seq1  TCAGCAAGTCAAGAAGCCTGGTGGATCATCAGATGCCAAAGCACGGAGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAGTCAAGAAGCCTGGTGGATCATCAGATGCCAAAGCACGGAGCT  792

seq1  GCTGCTGGTTCCGTGACTCCAGAGTTGTCCTCTAGGTTCTTAATCCTTCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGGTTCCGTGACTCCAGAGTTGTCCTCTAGGTTCTTAATCCTTCA  842

seq1  ATATGAAGAGTGGTCCCTTCAGTGCACACGTTGCCCCTTCTTGTTACTCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAGAGTGGTCCCTTCAGTGCACACGTTGCCCCTTCTTGTTACTCC  892

seq1  TGCTGTGTCTCCTGTTGCTTAGAGGGACCACATGAATGGGCTCTCTGCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTCTCCTGTTGCTTAGAGGGACCACATGAATGGGCTCTCTGCCT  942

seq1  AAGATAACTTGCCTGAGAAAGTAAATTAAAATGGAGGAGAAACAGTCTGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATAACTTGCCTGAGAAAGTAAATTAAAATGGAGGAGAAACAGTCTGA  992

seq1  TGTGGTGGGACACATCTGTGATCCTAGAAGTTGCAGGGAGGGGCTAAGGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGGACACATCTGTGATCCTAGAAGTTGCAGGGAGGGGCTAAGGC  1042

seq1  GGGAGATTCCTGAATTC  1066
      |||||||||||||||||
seq2  GGGAGATTCCTGAATTC  1059

seq1: chr7_73926887_73927992
seq2: B6Ng01-011I01.g_67_1211

seq1  GAATTCCATGTTCCCATGTGGGGATACTTCCCTGAAGTTTTATAACAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGTTCCCATGTGGGGATACTTCCCTGAAGTTTTATAACAGAA  50

seq1  CAAAGCAAATCATAAATGGAAATACTTTAAAAACACATCAGTGGGAAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCAAATCATAAATGGAAATACTTTAAAAACACATCAGTGGGAAAGC  100

seq1  CAGACAAGCAGGTCACAGCAAGGCAGGGGATTCGCAACCACAAGCCCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAAGCAGGTCACAGCAAGGCAGGGGATTCGCAACCACAAGCCCAGG  150

seq1  TGCCAGAAGACAACATTTTACCTTGGTTGGCAGAAGCTAAGGGGTCTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAAGACAACATTTTACCTTGGTTGGCAGAAGCTAAGGGGTCTGTT  200

seq1  TGTATATTCCGAAGGATTTACCTAGCCATGAAGATGCTGGGTCACATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATTCCGAAGGATTTACCTAGCCATGAAGATGCTGGGTCACATACA  250

seq1  AAGGTGGCTAACAAGTGGCCATGAGGAGGGGCTCATGACTCCCCAAGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGCTAACAAGTGGCCATGAGGAGGGGCTCATGACTCCCCAAGATA  300

seq1  AATGGAAATTAGGCTCTAACCTTTCTACCTAGTCAGTCAGTTAGTCATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAAATTAGGCTCTAACCTTTCTACCTAGTCAGTCAGTTAGTCATTC  350

seq1  AGTCAGCCATACAGATCATTGCCTGTTCCTCCTGAACTTCTTTCACAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCCATACAGATCATTGCCTGTTCCTCCTGAACTTCTTTCACAGTT  400

seq1  CTTTCAGGACGTAATACTCCATAAGTTAACCAGGTTAAGAACTCTTGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGGACGTAATACTCCATAAGTTAACCAGGTTAAGAACTCTTGTCT  450

seq1  TGACAGTGAACACACTCTGGGTCACTGTGACAGTGAACACACATGTGGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGTGAACACACTCTGGGTCACTGTGACAGTGAACACACATGTGGGT  500

seq1  CAGTGTGACAGTGAACACACTCTGAGTCAGTGTGACAGTGAACACACTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGACAGTGAACACACTCTGAGTCAGTGTGACAGTGAACACACTCT  550

seq1  GGGTCACTGTGACAGTGAACACACATGTGGGTCAGTGTGACAGTGAACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCACTGTGACAGTGAACACACATGTGGGTCAGTGTGACAGTGAACAC  600

seq1  ACTCTGAGTCAGTGTGACAGTGAACACACTCTGGGTCACTGTGACAGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAGTCAGTGTGACAGTGAACACACTCTGGGTCACTGTGACAGTGA  650

seq1  ACACACTCTGGGTCTGTGTCACAGTGAAGACACTCTGGGTCTGTGTCACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTCTGGGTCTGTGTCACAGTGAAGACACTCTGGGTCTGTGTCACA  700

seq1  GTGAACACACTCTGTCTGGGTCAGTGTGACAATGAACATGCACATGGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACACACTCTGTCTGGGTCAGTGTGACAATGAACATGCACATGGGTC  750

seq1  AGTGTGATAGTGAACACACTCTAGGTCAGTGTGACAGTGAAGACACTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGATAGTGAACACACTCTAGGTCAGTGTGACAGTGAAGACACTCAA  800

seq1  GGTTAGTGTGACAGTGAACACACACATGTGGGTCAGTGTCACAGT-GAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGTTAGTGTGACAGTGAACACACACATGTGGGTCAGTGTCACAGTGGAAC  850

seq1  ACACAT-GTGGGTCAGTGTGACATTG-AAGACACTCTAGGCCAGTGTGAC  897
      |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGGGGGGTCAGTGTGACATTGAAAGACACTCTAGGCCAGTGTGAC  900

seq1  AGTGAACACACAT-GTGGGTCAGTGTGACATTG-AAGACACTCTAGGTCA  945
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGTGAACACACATGGTGGGTCAGTGTGACATTGAAAGACACTCTAGGTCA  950

seq1  GTGTGACAGTGAACACACACATGT-GGGTCAGTGTCACAGTGAACACACA  994
      | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||
seq2  G-GTGACAGTGAACACACACATGTGGGGTCGGTGTCACAGTTGACACACA  999

seq1  CGTGGGTCAGTGTGACATTG-AAGACACTCTA-GGTCAGTGTGACAGTGA  1042
      ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||
seq2  CGTGGGTC-TTGTGACATTGTAAGACACTCTAGGGTCGTTGTGACATTGA  1048

seq1  ACACACATGTGGGTCAGT-GTGACATTGAAGACACTCTA-----------  1080
      |||| ||||| ||||||| |||| |   |||||  ||||           
seq2  ACACTCATGTTGGTCAGTGGTGATAGGAAAGACCTTCTATGGTAGTTGTG  1098

seq1  -------------------GGTC-AGTGTGACAGTGA-ACACACATG  1106
                         |||| || |  | ||||| |||||||||
seq2  TACGGTAAAGCTACCGTGGGGTCAAGGGGAAGAGTGATACACACATG  1145