BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-016C04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 61,329,741 - 61,439,972
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGm1865, LOC100040718, LOC668789
Downstream geneMrps33p, LOC622146, Luzp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-016C04.bB6Ng01-016C04.g
ACCDH850197DH850198
length1,1591,125
definitionDH850197|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016C04, 5' end.DH850198|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016C04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,329,741 - 61,330,914)(61,438,845 - 61,439,972)
sequence
gaattctataaaaaatatagtaaaattatatggatgtataaaagagtata
ttaggaataaagtatgtacagtcccctcaggggctttggacttagtctcc
tctgacatgggcttatagaaaaggaagtggaaaatggtctgattataaca
gccaatgtcttcatcagaacagctgtgactacttgacagaaactcccaag
agatgggtcctgttgactgttggttgatgtctccttcccaacaatggttc
tcaacttcgctaatgctgcaaccattcaacacagttattcatgttgtggt
gaccaccaacatataattatttttcatactacttctaccatgctaataac
atacctgcaatgttattactgttatggaccacattgtaaatatttatgtt
tttagaaagtattaggcaacccctatgaaaatgacattcaacctctaaag
gggttgtgagtcgtgggttaagagccgctactctagaagaaggaataagg
agtggtctcatacaaaactatctcttgtacctcatgactgcttgatcata
attgtcttctggttgcacttgaccttatggtatggcatggtcctttagca
tacattttagacatttattttatttttttcaagcatatgtgtatataagt
gaagatcagtggacaaattgagagaatccattcttctcctctactacttg
ggttcataggttcatagaatcattaaactgggatcaccatgcttgttgat
aagtacattgacttcttaaggcatgtctccagacccagtagaagtatata
taaggaaatggaggttaactgaaggtaagactttaatctaactagctatg
agaaagtcatcatccattctggtggtacagcttctttgggatcacccctt
attcctgtaactcctcacccatccactctgagtaagcccaatcacttcat
ttttttatcaagttgatattggtggaccatacttaggcttgtaagcaggt
tgtttttattatttacatatcttttggggaaagagtcctcagaaacactt
gtgccagtcatgagcttgttacagtgatgagtagtattcacaaagcatta
aaaaagaaaaataatgtccttgtttattatctatttatcattaccatctg
tttattctt
gaattctgtttattaactgccttttcaagtggttgtggtgaagatggaat
taccatgttctcccaggacatgacttttgtggcatgattggaaatattag
atattctgattttcatgtgtgtgtttaaataaaatttctgacattttgct
aaacctaaatataacaatcgatcaaatgtgctaatctaattgtggactaa
tataatcgaatacttatatcattgttgtgctttgctaatgctaggaatgt
gttagctgtgagattgtgtttgtacacatgcacatatcattctgaacatg
cacaaatatatcagaactacaatgtaaaagctcttttgtacctagtgtta
cacctacatgctttgggtatgagtcacacatgtctctgggttcatatgtt
gtatgtttatttgtcattatggttctactcataagaaacatacaccttct
agtaaggatggcatagaaggaagtatttaggtcaatgagagaacccacct
catataccacagagtgtagttatatttacccacattgtgacaatgaagaa
agtcctgtgtggttgatggtaaaggaatccattgttctcacagaccttgc
tttataagtatgctcaattcaaaatgctggagaagcagacagataggaga
ggatgggtcttaacatatcctttgcattgttctgagtgaactgctccctc
caatgaggcccccagtcctgaaaattgccacatctcttaatattcccaca
aattatcaccagtctttcaaacaggatactacagggaacatttcagatct
tactcacaagacagttgggaaagtgtaagtctgactccacttcacactct
ggttttcatgctttcactgtggcccccttaattaatctcctacagctgct
gatgcaccttgcgtattccataccccaaggacttaatagacctgactaga
gctggtccatgtctttatacctcctgacctatgaaacttcttttaaataa
cacagtccaaatatcagtattttccctttgatctgtatggtgtcatggtg
ccctctcctgaaataagtcttgcattctgttcctctagccctggtgtatt
ctttttcttaacacccctttgtttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_61329741_61330914
seq2: B6Ng01-016C04.b_44_1202

seq1  GAATTCTATAAAAAATATAGTAAAATTATATGGATGTATAAAAGAGTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATAAAAAATATAGTAAAATTATATGGATGTATAAAAGAGTATA  50

seq1  TTAGGAATAAAGTATGTACAGTCCCCTCAGGGGCTTTGGACTTAGTCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAATAAAGTATGTACAGTCCCCTCAGGGGCTTTGGACTTAGTCTCC  100

seq1  TCTGACATGGGCTTATAGAAAAGGAAGTGGAAAATGGTCTGATTATAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACATGGGCTTATAGAAAAGGAAGTGGAAAATGGTCTGATTATAACA  150

seq1  GCCAATGTCTTCATCAGAACAGCTGTGACTACTTGACAGAAACTCCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGTCTTCATCAGAACAGCTGTGACTACTTGACAGAAACTCCCAAG  200

seq1  AGATGGGTCCTGTTGACTGTTGGTTGATGTCTCCTTCCCAACAATGGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGTCCTGTTGACTGTTGGTTGATGTCTCCTTCCCAACAATGGTTC  250

seq1  TCAACTTCGCTAATGCTGCAACCATTCAACACAGTTATTCATGTTGTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTCGCTAATGCTGCAACCATTCAACACAGTTATTCATGTTGTGGT  300

seq1  GACCACCAACATATAATTATTTTTCATACTACTTCTACCATGCTAATAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACCAACATATAATTATTTTTCATACTACTTCTACCATGCTAATAAC  350

seq1  ATACCTGCAATGTTATTACTGTTATGGACCACATTGTAAATATTTATGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTGCAATGTTATTACTGTTATGGACCACATTGTAAATATTTATGTT  400

seq1  TTTAGAAAGTATTAGGCAACCCCTATGAAAATGACATTCAACCTCTAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAAGTATTAGGCAACCCCTATGAAAATGACATTCAACCTCTAAAG  450

seq1  GGGTTGTGAGTCGTGGGTTAAGAGCCGCTACTCTAGAAGAAGGAATAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTGAGTCGTGGGTTAAGAGCCGCTACTCTAGAAGAAGGAATAAGG  500

seq1  AGTGGTCTCATACAAAACTATCTCTTGTACCTCATGACTGCTTGATCATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCTCATACAAAACTATCTCTTGTACCTCATGACTGCTTGATCATA  550

seq1  ATTGTCTTCTGGTTGCACTTGACCTTATGGTATGGCATGGTCCTTTAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCTTCTGGTTGCACTTGACCTTATGGTATGGCATGGTCCTTTAGCA  600

seq1  TACATTTTAGACATTTATTTTATTTTTTTCAAGCATATGTGTATATAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTTAGACATTTATTTTATTTTTTTCAAGCATATGTGTATATAAGT  650

seq1  GAAGATCAGTGGACAAATTGAGAGAATCCATTCTTCTCCTCTACTACTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATCAGTGGACAAATTGAGAGAATCCATTCTTCTCCTCTACTACTTG  700

seq1  GGTTCATAGGTTCATAGAATCATTAAACTGGGATCACCATGCTTGTTGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCATAGGTTCATAGAATCATTAAACTGGGATCACCATGCTTGTTGAT  750

seq1  AAGTACATTGACTTCTTAAGGCATGTCTCCAGACCCAGTAGAAGTATATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACATTGACTTCTTAAGGCATGTCTCCAGACCCAGTAGAAGTATATA  800

seq1  TAAGGAAATGGAGGTTAACTGAAGGTAAGACTTTAATCTAACTAGCTATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAAATGGAGGTTAACTGAAGGTAAGACTTTAATCTAACTAGCTATG  850

seq1  AGAAAGTCATCATCCATTCTGGTGGTACAGCTTCTTTGGGATCACCCCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTCATCATCCATTCTGGTGGTACAGCTTCTTTGGGATCACCCCTT  900

seq1  ATTCCTGTAACTCCTCACCCATCCACTCTGAGTAAGCCCAATCACTTCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTCCTGTAACTCCTCACCCATCCACTCTGAGTAAGCCCAATCACTTCA-  949

seq1  TTTTTTTATCAAGTTGAATATTGGTGGAACCATACTTAGGCTTGTAAGCA  1000
      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTATCAAGTTG-ATATTGGTGG-ACCATACTTAGGCTTGTAAGCA  997

seq1  GGGTTGTTTTTATTATTTACATATCTTTTGGGGAAAGAGTCCTCAG-AAC  1049
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  -GGTTGTTTTTATTATTTACATATCTTTTGGGGAAAGAGTCCTCAGAAAC  1046

seq1  ACTTGTGCACAAGTCATGAGCTTTGTTACAGTGATGAGTAGTATTCACAG  1099
      |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACTTGTG--CCAGTCATGAGC-TTGTTACAGTGATGAGTAGTATTCACAA  1093

seq1  AGCAATTTAAAAAAAGAAAAATAATGGCACTGTGTTATTATCTATTATAA  1149
      ||||   | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||     
seq2  AGCA---TTAAAAAAGAAAAATAATGTCCTTGT-TTATTATCTAT-----  1134

seq1  TTACAATTACCATCTGTTTATTCTT  1174
      |||  ||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATTACCATCTGTTTATTCTT  1159

seq1: chr7_61438845_61439972
seq2: B6Ng01-016C04.g_64_1188 (reverse)

seq1  AAAACAAGAAGGGGTGTTATGAAGAAAGAATACA-CAGGGCTAGA-GAAC  48
      ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||
seq2  AAAACA--AAGGGGTGTTAAGAA-AAAGAATACACCAGGGCTAGAGGAAC  47

seq1  AGAATGC-AGACTTATTTCAGGAGAGGGCA-CATGAACAACCATACAGAT  96
      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||
seq2  AGAATGCAAGACTTATTTCAGGAGAGGGCACCATGA--CACCATACAGAT  95

seq1  CAAAGGGAAAATACTGATATTTGGACTGTGTTATTTAAAAGGAAGGTTTC  146
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||
seq2  CAAAGGGAAAATACTGATATTTGGACTGTGTTATTTAAAAG--AAGTTTC  143

seq1  ATAGGTCAGGAGGTATAAAGACATGGACCAGCTCTAGTCAGGTCTATTAA  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTCAGGAGGTATAAAGACATGGACCAGCTCTAGTCAGGTCTATTAA  193

seq1  GTCCTTGGGGTATGGAATACGCAAGGTGCATCAGCAGCTGTAGGAGATTA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGGGGTATGGAATACGCAAGGTGCATCAGCAGCTGTAGGAGATTA  243

seq1  ATTAAGGGGGCCACAGTGAAAGCATGAAAACCAGAGTGTGAAGTGGAGTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGGGGGCCACAGTGAAAGCATGAAAACCAGAGTGTGAAGTGGAGTC  293

seq1  AGACTTACACTTTCCCAACTGTCTTGTGAGTAAGATCTGAAATGTTCCCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTACACTTTCCCAACTGTCTTGTGAGTAAGATCTGAAATGTTCCCT  343

seq1  GTAGTATCCTGTTTGAAAGACTGGTGATAATTTGTGGGAATATTAAGAGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTATCCTGTTTGAAAGACTGGTGATAATTTGTGGGAATATTAAGAGA  393

seq1  TGTGGCAATTTTCAGGACTGGGGGCCTCATTGGAGGGAGCAGTTCACTCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCAATTTTCAGGACTGGGGGCCTCATTGGAGGGAGCAGTTCACTCA  443

seq1  GAACAATGCAAAGGATATGTTAAGACCCATCCTCTCCTATCTGTCTGCTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAATGCAAAGGATATGTTAAGACCCATCCTCTCCTATCTGTCTGCTT  493

seq1  CTCCAGCATTTTGAATTGAGCATACTTATAAAGCAAGGTCTGTGAGAACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGCATTTTGAATTGAGCATACTTATAAAGCAAGGTCTGTGAGAACA  543

seq1  ATGGATTCCTTTACCATCAACCACACAGGACTTTCTTCATTGTCACAATG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTCCTTTACCATCAACCACACAGGACTTTCTTCATTGTCACAATG  593

seq1  TGGGTAAATATAACTACACTCTGTGGTATATGAGGTGGGTTCTCTCATTG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAAATATAACTACACTCTGTGGTATATGAGGTGGGTTCTCTCATTG  643

seq1  ACCTAAATACTTCCTTCTATGCCATCCTTACTAGAAGGTGTATGTTTCTT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAATACTTCCTTCTATGCCATCCTTACTAGAAGGTGTATGTTTCTT  693

seq1  ATGAGTAGAACCATAATGACAAATAAACATACAACATATGAACCCAGAGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTAGAACCATAATGACAAATAAACATACAACATATGAACCCAGAGA  743

seq1  CATGTGTGACTCATACCCAAAGCATGTAGGTGTAACACTAGGTACAAAAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGACTCATACCCAAAGCATGTAGGTGTAACACTAGGTACAAAAG  793

seq1  AGCTTTTACATTGTAGTTCTGATATATTTGTGCATGTTCAGAATGATATG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTACATTGTAGTTCTGATATATTTGTGCATGTTCAGAATGATATG  843

seq1  TGCATGTGTACAAACACAATCTCACAGCTAACACATTCCTAGCATTAGCA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTGTACAAACACAATCTCACAGCTAACACATTCCTAGCATTAGCA  893

seq1  AAGCACAACAATGATATAAGTATTCGATTATATTAGTCCACAATTAGATT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACAACAATGATATAAGTATTCGATTATATTAGTCCACAATTAGATT  943

seq1  AGCACATTTGATCGATTGTTATATTTAGGTTTAGCAAAATGTCAGAAATT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACATTTGATCGATTGTTATATTTAGGTTTAGCAAAATGTCAGAAATT  993

seq1  TTATTTAAACACACACATGAAAATCAGAATATCTAATATTTCCAATCATG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAAACACACACATGAAAATCAGAATATCTAATATTTCCAATCATG  1043

seq1  CCACAAAAGTCATGTCCTGGGAGAACATGGTAATTCCATCTTCACCACAA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAAAGTCATGTCCTGGGAGAACATGGTAATTCCATCTTCACCACAA  1093

seq1  CCACTTGAAAAGGCAGTTAATAAACAGAATTC  1128
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGAAAAGGCAGTTAATAAACAGAATTC  1125