BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-022I04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,840,338 - 91,960,407
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2610206C17Rik
Upstream geneIl16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik, Arnt2, LOC100039239, Fah, Zfand6
Downstream geneEG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69, LOC330581, LOC100039339, Vmn2r70, Vmn2r-ps72, EG233445, Vmn2r-ps74, EG244114
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-022I04.bB6Ng01-022I04.g
ACCDH854701DH854702
length1,158943
definitionDH854701|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022I04, 5' end.DH854702|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022I04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,959,243 - 91,960,407)(91,840,338 - 91,841,282)
sequence
ttctactaaccctttcatgaataatactacagttcctcctaaaaccacaa
cccacctatttcctaggacatggtaaattcttgcatatgggaatgccaag
gttgcaggaggctaagtttttgtgaaactctttgccttgggactgcttcc
aagctttctaggcctgtcacgcaagtcactactggagcagttgtagcaat
gaccaaagtggggagtgtggacacatgttccagtccaggaatctggcaag
gagcagggaggcacctaccatctcacatgtgtagccaaatgccagggtct
cagacctgctctatctcatcaggtttcccggccttggtcattgtcccaca
ggagggcactttgccttaactacttcagtggacttctattagtgaagaac
tgaattagactgaaatactgaatgtgtctgatgatcatgtacatttctga
ctagatatgcatcagtgtgtaaagtgcccagatcatcagtatggcaataa
ccagctttttataaatctccacaaaaaaataactgattaaagatgtctgt
cttggggctggcaagatggcttagagggtcagagcactgaggtcctgagt
tcaaatcccagaaaccacatggtggctcacagacacccaaaatgagatct
gacaccctcttctcaagtgtctgaagagagctacagtgtactttatttat
aataataaataaatctttgggacagagagagcagggactgagaatgcaga
gttgactggagagagcagggatcctaaaaaaagaaaattcatttccagca
accacatgaaggctcacaaccatctgtacagctacagtgtactcatatac
ataaaaataaataaataaatcttttttaaaaaaagtctgtcacttctgtc
actttcaagcttatgaaggcttcctggaaaggctttggctggcagaaccc
tgagtttacttgttctctcagctggtatacttggttctccttatgaagca
ccagaaattctaatagccaggccaataagctggatcctcaggtatgtcct
gctcatcttcctcatcatctcttcatctgctctctttctttcatgcaatc
cacttgtgatatgtatctaggaagacacatgggcgctatgttatactatt
ctatccaa
gaattcttttagggttcactagtttctggccgttgggaaggaaaattata
tgagaagaatgtagaatttcgtctagggtttaaattgttgctcaggcact
ttttgacttactacattgagccatctctaatctttctatgtcctaagttt
agtgagtgatgaaaagatttttccacctctagagaggtaattctaatgga
gggcatgcaaataaacctaatagcaaacatctgtatgctgtgaattataa
ggtgatatgtgacctagatggagaaggtaactatataaacagatgcttga
aggctgttggaccagggacagtagtcaggataggccccatggggaagagt
aggtttaaataaaataagtggttagagtatcttggtggagattccagtgt
gagggattaataaggaccattctcaagccagaaacatagaaaaggcttaa
gttagtggatcctgtgacctgggaagatgaagttgtgaatcaggtggacc
tgtgaggtaatataaaactcttactataaattaaatggaccagcacaggg
ttttaaacagaaaacatgaaacaccataaattttaaaggataattctatg
ttgaaagtagtctcaagaacaccagtgttagcagcaagaccccatatgga
aggttctgtgtgactccatgtaagtgataatggtgccttgcacccaggtg
gcaacaagggtggccacaggaagagatcaaatttgggacacattttaatg
gtagagccaactgtgtttcctgataggatggtacattttcactctatgtg
ggaatgaaagagagatcaatcgggtgaaactgggttttggcttgtgcact
cagaggtagaccagaacgaggttttcttttttgtagacattgcattgggc
attgccacacatccaaatagaaaggtagtgttgtagttggata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91959243_91960407
seq2: B6Ng01-022I04.b_55_1212 (reverse)

seq1  TTGGATAGTATAGT-TAACATAGCTGCAGTGTGGTCTTCTGTAGGATACA  49
      |||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||  || ||||||
seq2  TTGGATAGAATAGTATAACATAGCGCCCATGT-GTCTTC-CTA-GATACA  47

seq1  TATCAACATGTTGGGATGGCCAATGAAAAGAAAG-GAGCAGATGAAAGAG  98
      |||| ||| ||  |||| ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||
seq2  TATC-ACAAGT--GGATTGC--ATG-AAAGAAAGAGAGCAGATG-AAGAG  90

seq1  ATGATGAGGGAGATGAGCAGGACATAACTGA-GATCCAGCTTATTGGCCT  147
      ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| 
seq2  ATGATGAGGAAGATGAGCAGGACATACCTGAGGATCCAGCTTATTGGCC-  139

seq1  TGGCTATTAGAATGTCTTGGTGCTTCATAAGGAG-ACCAAGTATAGCAGC  196
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  TGGCTATTAGAATTTC-TGGTGCTTCATAAGGAGAACCAAGTATACCAGC  188

seq1  TGTGAGAAC-AGTAAACTCAGGGTTCTGCCAGCCAAAGCCTTTCCAGGGA  245
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGAGAGAACAAGTAAACTCAGGGTTCTGCCAGCCAAAGCCTTTCCAGGAA  238

seq1  GGCTTCATAAGCTATGAAAGTGACAGAAGTGACAGACCTTTTTTTAAAAA  295
      | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCCTTCATAAGCT-TGAAAGTGACAGAAGTGACAGA-CTTTTTTTAAAAA  286

seq1  AGATTTATTTATTTA-TTTTATGTATATGAGTACACTGTAGCTGTACAGA  344
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTATTTATTTATTTTTATGTATATGAGTACACTGTAGCTGTACAGA  336

seq1  TGGTTGTGAGCCTTCATGTGGTTGCTGGAAATGAATTTTCTTTTTTTAGG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGTGAGCCTTCATGTGGTTGCTGGAAATGAATTTTCTTTTTTTAGG  386

seq1  ATCCCTGCTCTCTCCAGTCAACTCTGCATTCTCAGTCCCTGCTCTCTCTG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGCTCTCTCCAGTCAACTCTGCATTCTCAGTCCCTGCTCTCTCTG  436

seq1  TCCCAAAGATTTATTTATTATTATAAAT-AAGTACACTGTAGCTCTCTTC  493
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAAGATTTATTTATTATTATAAATAAAGTACACTGTAGCTCTCTTC  486

seq1  AGACACTTGAGAAGAGGGTGTCAGATCTCATTTTGGGTGTCTGTGAGCCA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTTGAGAAGAGGGTGTCAGATCTCATTTTGGGTGTCTGTGAGCCA  536

seq1  CCATGTGGTTTCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCAGTGCTCTGACCCTCT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGGTTTCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCAGTGCTCTGACCCTCT  586

seq1  AAGCCATCTTGCCAGCCCCAAGACAGACATCTTTAATCAGTTATTTTTTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATCTTGCCAGCCCCAAGACAGACATCTTTAATCAGTTATTTTTTT  636

seq1  GTGGAGATTTATAAAAAGCTGGTTATTGCCATACTGATGATCTGGGCACT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGATTTATAAAAAGCTGGTTATTGCCATACTGATGATCTGGGCACT  686

seq1  TTACACACTGATGCATATCTAGTCAGAAATGTACATGATCATCAGACACA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACACACTGATGCATATCTAGTCAGAAATGTACATGATCATCAGACACA  736

seq1  TTCAGTATTTCAGTCTAATTCAGTTCTTCACTAATAGAAGTCCACTGAAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTATTTCAGTCTAATTCAGTTCTTCACTAATAGAAGTCCACTGAAG  786

seq1  TAGTTAAGGCAAAGTGCCCTCCTGTGGGACAATGACCAAGGCCGGGAAAC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAAGGCAAAGTGCCCTCCTGTGGGACAATGACCAAGGCCGGGAAAC  836

seq1  CTGATGAGATAGAGCAGGTCTGAGACCCTGGCATTTGGCTACACATGTGA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGAGATAGAGCAGGTCTGAGACCCTGGCATTTGGCTACACATGTGA  886

seq1  GATGGTAGGTGCCTCCCTGCTCCTTGCCAGATTCCTGGACTGGAACATGT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTAGGTGCCTCCCTGCTCCTTGCCAGATTCCTGGACTGGAACATGT  936

seq1  GTCCACACTCCCCACTTTGGTCATTGCTACAACTGCTCCAGTAGTGACTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACACTCCCCACTTTGGTCATTGCTACAACTGCTCCAGTAGTGACTT  986

seq1  GCGTGACAGGCCTAGAAAGCTTGGAAGCAGTCCCAAGGCAAAGAGTTTCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGACAGGCCTAGAAAGCTTGGAAGCAGTCCCAAGGCAAAGAGTTTCA  1036

seq1  CAAAAACTTAGCCTCCTGCAACCTTGGCATTCCCATATGCAAGAATTTAC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACTTAGCCTCCTGCAACCTTGGCATTCCCATATGCAAGAATTTAC  1086

seq1  CATGTCCTAGGAAATAGGTGGGTTGTGGTTTTAGGAGGAACTGTAGTATT  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCCTAGGAAATAGGTGGGTTGTGGTTTTAGGAGGAACTGTAGTATT  1136

seq1  ATTCATGAAAGGGTTAGTAGAA  1165
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATGAAAGGGTTAGTAGAA  1158

seq1: chr7_91840338_91841282
seq2: B6Ng01-022I04.g_70_1012

seq1  GAATTCTTTTAGGGTTCACTAGTTTCTGGCCGTTGGGAAGGAAAATTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTAGGGTTCACTAGTTTCTGGCCGTTGGGAAGGAAAATTATA  50

seq1  TGAGAAGAATGTAGAATTTCGTCTAGGGTTTAAATTGTTGCTCAGGCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGAATGTAGAATTTCGTCTAGGGTTTAAATTGTTGCTCAGGCACT  100

seq1  TTTTGACTTACTACATTGAGCCATCTCTAATCTTTCTATGTCCTAAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACTTACTACATTGAGCCATCTCTAATCTTTCTATGTCCTAAGTTT  150

seq1  AGTGAGTGATGAAAAGATTTTTCCACCTCTAGAGAGGTAATTCTAATGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTGATGAAAAGATTTTTCCACCTCTAGAGAGGTAATTCTAATGGA  200

seq1  GGGCATGCAAATAAACCTAATAGCAAACATCTGTATGCTGTGAATTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGCAAATAAACCTAATAGCAAACATCTGTATGCTGTGAATTATAA  250

seq1  GGTGATATGTGACCTAGATGGAGAAGGTAACTATATAAACAGATGCTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATATGTGACCTAGATGGAGAAGGTAACTATATAAACAGATGCTTGA  300

seq1  AGGCTGTTGGACCAGGGACAGTAGTCAGGATAGGCCCCATGGGGAAGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTTGGACCAGGGACAGTAGTCAGGATAGGCCCCATGGGGAAGAGT  350

seq1  AGGTTTAAATAAAATAAGTGGTTAGAGTATCTTGGTGGAGATTCCAGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTAAATAAAATAAGTGGTTAGAGTATCTTGGTGGAGATTCCAGTGT  400

seq1  GAGGGATTAATAAGGACCATTCTCAAGCCAGAAACATAGAAAAGGCTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGATTAATAAGGACCATTCTCAAGCCAGAAACATAGAAAAGGCTTAA  450

seq1  GTTAGTGGATCCTGTGACCTGGGAAGATGAAGTTGTGAATCAGGTGGACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGTGGATCCTGTGACCTGGGAAGATGAAGTTGTGAATCAGGTGGACC  500

seq1  TGTGAGGTAATATAAAACTCTTACTATAAATTAAATGGACCAGCACAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGGTAATATAAAACTCTTACTATAAATTAAATGGACCAGCACAGGG  550

seq1  TTTTAAACAGAAAACATGAAACACCATAAATTTTAAAGGATAATTCTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAACAGAAAACATGAAACACCATAAATTTTAAAGGATAATTCTATG  600

seq1  TTGAAAGTAGTCTCAAGAACACCAGTGTTAGCAGCAAGACCCCATATGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAGTAGTCTCAAGAACACCAGTGTTAGCAGCAAGACCCCATATGGA  650

seq1  AGGTTCTGTGTGACTCCATGTAAGTGATAATGGTGCCTTGCACCCAGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTGTGTGACTCCATGTAAGTGATAATGGTGCCTTGCACCCAGGTG  700

seq1  GCAACAAGGGTGGCCACAGGAAGAGATCAAATTTGGGACACATTTTAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACAAGGGTGGCCACAGGAAGAGATCAAATTTGGGACACATTTTAATG  750

seq1  GTAGAGCCAACTGTGTTTCCTGATAGGATGGTACATTTTCACTCTATGT-  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GTAGAGCCAACTGTGTTTCCTGATAGGATGGTACATTTTCACTCTATGTG  800

seq1  GGAATGAAAGAGAGATCAATCGGGTGAAACTGGGTTTTGGCTTGTGCAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGAATGAAAGAGAGATCAATCGGGTGAAACTGGGTTTTGGCTTGTGC-AC  849

seq1  TCAGAGGTAGACCAAGACAGAGGTTTTCTTTTTTGTAGACATTGCATTGG  899
      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGTAGACC-AGAACGAGGTTTTCTTTTTTGTAGACATTGCATTGG  898

seq1  GCATTGCCACACATCCAAATAGAAAGGTAAGTGTTGTAGTTGGATA  945
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCATTGCCACACATCCAAATAGAAAGGT-AGTGTTGTAGTTGGATA  943