BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024F10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 138,752,603 - 138,936,029
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC677073, LOC100043679
Upstream geneTacc2, LOC619876, Btbd16, EG434249, Plekha1, Htra1, Dmbt1, 4933402N03Rik, 5430419D17Rik, LOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik, Pstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3
Downstream geneGpr26, Cpxm2, 4631426J05Rik, LOC100043682, LOC100043683, Oat, Nkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024F10.bB6Ng01-024F10.g
ACCDH856002DH856003
length8001,101
definitionDH856002|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024F10, 5' end.DH856003|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024F10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(138,935,231 - 138,936,029)(138,752,603 - 138,753,723)
sequence
gaattccatctaccccacagcgggttcccactaatacggggtttcagcac
cctgacgctttcagggatacgtctctcctaacttaaccctagggccgcga
gcaggggaggtgccacccacagcacaactatgcactttcccttgcagact
tgttctcaacactggcttgtgatgagtctgccatttggaagcggcaccca
gatctgcctgatggttactgcagtcatgaattttgccaccatattccttc
aaccaccaagtgcagggatgtgacctgggtcagtatgatgtactgaatat
aggttgactctctaccgggacccctgagatctctcagacactgagccacc
aaccaggcagtatacacaagctggtctgagactccccaacacatatacaa
cagaggactgcctggtctagttgagactgctggtctttctatggggttgc
ccttctcctcagcttcttccagccttctcctaataaaaccacaggggtcc
caacttcagttcaatgggtggtgtaaaaatatagagggccgttgttccac
ctgctaagccacggctttgtctttgaacccttggcctcctctatgtccca
catgatgttactgaaacaccctgcggatagatccacatctgagcagagag
aaagtaattttgtaatcatctcaggacttgaccacaaaggagtaataatg
aatctttgctccgcattgatcaccatctagtgtcccatcttcccaagcaa
tggtctagctttgcaaataatgaaaacggcgacttaacctttacccacat

gaattctcagagaccctagcattctgtgccaccttgtcccctgtggctct
tcatgtttgtcgtttctctcattacaaggctggttaagctcatcctgggc
taactgctcagatcagtgattctcatcctgtgggttgtgaccccagaggg
tatggaactacaccctcacaggggtcacctagagaccacccagaaaacac
agaaaattacattatgattcataacagtagcaaaatcacaattatggagt
agcaacaaaataattttagggttgggctcactacacgtgaagagctgtat
ttaagggtggcggcattgggaaggttgacaacattgccaggccaccgcac
ccttgagtccatagggacaagttgacttgttcggtttttcagagaacaaa
caactctttctttggggcgactatgcaaatggagcaagaggctgtgtttt
gcagacaaagcgaacagagaagtggatgataactgggaatacacagctgg
ggcccgtgggtccaaatatcccaggagatatcggacatcctttcttagga
gcagatcagctctagtctgtaataaatttaaatgtttaaaatttaaacta
aaataaatgtttgttgatgcagtagagtaacgcccacctctctgatggtt
tggactgagcaagcctctccggtgtggtgcagcagtagccctgattggcc
cacttctctctaagcttcactttgagccccgccctgttcagcccctccca
gctttaaaacccatttgtaaccattactctgcgtcaggtctgttgatgaa
gtacattttctccctttgccttggtggctgcatgcagggacaggcctggc
cacagaagtgagagggaggtccagcctctcaccgccagaggcgcatgaat
cacgtcataatgggtggtaacctgagccctctggcatctcacacagacct
catgacactccttccacttaatttcagcctaaggatgcttttagagattt
agagctccaaaacatctcctcagaagattgtagtacattaaaactattat
catagcttaggtatagatctgctgccacttaccagagagcatttatcttc
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_138935231_138936029
seq2: B6Ng01-024F10.b_34_833 (reverse)

seq1  ATGTGGGTGGCGGTTAAGTCGCCGTTTTCATTATTTGCAAAGCTAGACCA  50
      ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGGTAAAGGTTAAGTCGCCGTTTTCATTATTTGCAAAGCTAGACCA  50

seq1  TTGCTTGGGAAGATGGGACACTAGATGGTGATCAATGCGGAGCAAAGATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGGGAAGATGGGACACTAGATGGTGATCAATGCGGAGCAAAGATT  100

seq1  CATTATTACTCCTTTGTGGTCAAGTCCTGAGATGATTAC-AAATTACTTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CATTATTACTCCTTTGTGGTCAAGTCCTGAGATGATTACAAAATTACTTT  150

seq1  CTCTCTGCTCAGATGTGGATCTATCCGCAGGGTGTTTCAGTAACATCATG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGCTCAGATGTGGATCTATCCGCAGGGTGTTTCAGTAACATCATG  200

seq1  TGGGACATAGAGGAGGCCAAGGGTTCAAAGACAAAGCCGTGGCTTAGCAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACATAGAGGAGGCCAAGGGTTCAAAGACAAAGCCGTGGCTTAGCAG  250

seq1  GTGGAACAACGGCCCTCTATATTTTTACACCACCCATTGAACTGAAGTTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAACAACGGCCCTCTATATTTTTACACCACCCATTGAACTGAAGTTG  300

seq1  GGACCCCTGTGGTTTTATTAGGAGAAGGCTGGAAGAAGCTGAGGAGAAGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCCTGTGGTTTTATTAGGAGAAGGCTGGAAGAAGCTGAGGAGAAGG  350

seq1  GCAACCCCATAGAAAGACCAGCAGTCTCAACTAGACCAGGCAGTCCTCTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCCCATAGAAAGACCAGCAGTCTCAACTAGACCAGGCAGTCCTCTG  400

seq1  TTGTATATGTGTTGGGGAGTCTCAGACCAGCTTGTGTATACTGCCTGGTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATGTGTTGGGGAGTCTCAGACCAGCTTGTGTATACTGCCTGGTT  450

seq1  GGTGGCTCAGTGTCTGAGAGATCTCAGGGGTCCCGGTAGAGAGTCAACCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTCAGTGTCTGAGAGATCTCAGGGGTCCCGGTAGAGAGTCAACCT  500

seq1  ATATTCAGTACATCATACTGACCCAGGTCACATCCCTGCACTTGGTGGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCAGTACATCATACTGACCCAGGTCACATCCCTGCACTTGGTGGTT  550

seq1  GAAGGAATATGGTGGCAAAATTCATGACTGCAGTAACCATCAGGCAGATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAATATGGTGGCAAAATTCATGACTGCAGTAACCATCAGGCAGATC  600

seq1  TGGGTGCCGCTTCCAAATGGCAGACTCATCACAAGCCAGTGTTGAGAACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGCCGCTTCCAAATGGCAGACTCATCACAAGCCAGTGTTGAGAACA  650

seq1  AGTCTGCAAGGGAAAGTGCATAGTTGTGCTGTGGGTGGCACCTCCCCTGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGCAAGGGAAAGTGCATAGTTGTGCTGTGGGTGGCACCTCCCCTGC  700

seq1  TCGCGGCCCTAGGGTTAAGTTAGGAGAGACGTATCCCTGAAAGCGTCAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCGGCCCTAGGGTTAAGTTAGGAGAGACGTATCCCTGAAAGCGTCAGG  750

seq1  GTGCTGAAACCCCGTATTAGTGGGAACCCGCTGTGGGGTAGATGGAATTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGAAACCCCGTATTAGTGGGAACCCGCTGTGGGGTAGATGGAATTC  800

seq1: chr7_138752603_138753723
seq2: B6Ng01-024F10.g_67_1167

seq1  GAATTCTCAGAGACCCTAGCATTCTGTGCCACCTTGTCCCCTGTGGCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGAGACCCTAGCATTCTGTGCCACCTTGTCCCCTGTGGCTCT  50

seq1  TCATGTTTGTCGTTTCTCTCATTACAAGGCTGGTTAAGCTCATCCTGGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTTTGTCGTTTCTCTCATTACAAGGCTGGTTAAGCTCATCCTGGGC  100

seq1  TAACTGCTCAGATCAGTGATTCTCATCCTGTGGGTTGTGACCCCAGAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGCTCAGATCAGTGATTCTCATCCTGTGGGTTGTGACCCCAGAGGG  150

seq1  TATGGAACTACACCCTCACAGGGGTCACCTAGAGACCACCCAGAAAACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAACTACACCCTCACAGGGGTCACCTAGAGACCACCCAGAAAACAC  200

seq1  AGAAAATTACATTATGATTCATAACAGTAGCAAAATCACAATTATGGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATTACATTATGATTCATAACAGTAGCAAAATCACAATTATGGAGT  250

seq1  AGCAACAAAATAATTTTAGGGTTGGGCTCACTACACGTGAAGAGCTGTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACAAAATAATTTTAGGGTTGGGCTCACTACACGTGAAGAGCTGTAT  300

seq1  TTAAGGGTGGCGGCATTGGGAAGGTTGACAACATTGCCAGGCCACCGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGGTGGCGGCATTGGGAAGGTTGACAACATTGCCAGGCCACCGCAC  350

seq1  CCTTGAGTCCATAGGGACAAGTTGACTTGTTCGGTTTTTCAGAGAACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGTCCATAGGGACAAGTTGACTTGTTCGGTTTTTCAGAGAACAAA  400

seq1  CAACTCTTTCTTTGGGGCGACTATGCAAATGGAGCAAGAGGCTGTGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCTTTCTTTGGGGCGACTATGCAAATGGAGCAAGAGGCTGTGTTTT  450

seq1  GCAGACAAAGCGAACAGAGAAGTGGATGATAACTGGGAATACACAGCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACAAAGCGAACAGAGAAGTGGATGATAACTGGGAATACACAGCTGG  500

seq1  GGCCCGTGGGTCCAAATATCCCAGGAGATATCGGACATCCTTTCTTAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCGTGGGTCCAAATATCCCAGGAGATATCGGACATCCTTTCTTAGGA  550

seq1  GCAGATCAGCTCTAGTCTGTAATAAATTTAAATGTTTAAAATTTAAACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATCAGCTCTAGTCTGTAATAAATTTAAATGTTTAAAATTTAAACTA  600

seq1  AAATAAATGTTTGTTGATGCAGTAGAGTAACGCCCACCTCTCTGATGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATGTTTGTTGATGCAGTAGAGTAACGCCCACCTCTCTGATGGTT  650

seq1  TGGACTGAGCAAGCCTCTCCGGTGTGGTGCAGCAGTAGCCCTGATTGGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGAGCAAGCCTCTCCGGTGTGGTGCAGCAGTAGCCCTGATTGGCC  700

seq1  CACTTCTCTCTAAGCTTCACTTTGAGCCCCGCCCTGTTCAGCCCCTCCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTCTCTAAGCTTCACTTTGAGCCCCGCCCTGTTCAGCCCCTCCCA  750

seq1  GCTTTAAAACCCATTTGTAACCATTACTCTGCGTCAGGTCTGTTGATGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAAAACCCATTTGTAACCATTACTCTGCGTCAGGTCTGTTGATGAA  800

seq1  GTACATTTTCTCCCTTTGCCTTGGTGGCTGCATGCAGGGACAGGCCTGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATTTTCTCCCTTTGCCTTGGTGGCTGCATGCAGGGACAGGCCTGGC  850

seq1  CACAGAGGTGAGAGGGAGGTCCAGCCTCTCACCGCCAGAGGCGCATGAAT  900
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAGTGAGAGGGAGGTCCAGCCTCTCACCGCCAGAGGCGCATGAAT  900

seq1  CACGTCAGAAGGGGTTGGTAACCTGAGCCCATCTGGCATCTCACCACAGA  950
      ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  CACGTCATAATGGG-TGGTAACCTGAGCCC-TCTGGCATCTCA-CACAGA  947

seq1  CCTCCATGACACTCCTTCCAACTTAATTTCAGCCTAAGGGATGCTTTTAA  1000
      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  CCT-CATGACACTCCTTCC-ACTTAATTTCAGCCTAA-GGATGCTTTTA-  993

seq1  GAAGATTTTAGAGCTCAAAAACATCTCCTCAGAAGAATTGTAGTTACATT  1050
        ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  -GAGA-TTTAGAGCTCCAAAACATCTCCTCAGAAG-ATTGTAG-TACATT  1039

seq1  AAAAACTAATTATCAGAGCTTAGGGGTATAGATCTGCTGCCATATTTTAC  1100
       |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    ||||
seq2  -AAAACT-ATTATCATAGCTTA--GGTATAGATCTGCTGCCA---CTTAC  1082

seq1  ACAGAGAGCAATTTATCTTCC  1121
       |||||||| |||||||||||
seq2  -CAGAGAGC-ATTTATCTTCC  1101