BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024N16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 14,073,801 - 14,139,574
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfp606, 2900092C05Rik, EG637908, EG666085, Vmn2r55, LOC629079, LOC629081, EG232875, LOC100043128, LOC100042515, Zfp329, Zfp110, Zfp128, Zscan22, Rps5, 2310014L17Rik, 1810019N24Rik, Zfp324, Zfp446, Slc27a5, ZBTB45, LOC100042553, Trim28, Chmp2a, Ube2m, Mzf1, V1rj3, LOC100043156, V1rk1, LOC666177, EG232887, V1rj2, 6330408A02Rik, Lig1, Pla2g4c, LOC666225, Cabp5, LOC666232, Gm767, LOC666243
Downstream gene9230107M04Rik, EG666256, LOC666267, LOC100042624, LOC100043194, Sult2a1, EG620627, EG434121, EG629203, LOC677512, EG629219, EG434123, 2810007J24Rik, EG638251
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024N16.bB6Ng01-024N16.g
ACCDH856367DH856368
length1,059962
definitionDH856367|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024N16, 5' end.DH856368|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024N16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,138,510 - 14,139,574)(14,073,801 - 14,074,601)
sequence
gaattcttttattcaaaattatgcattatagagccacccagatactccca
tatcaatactttgttttctctatgaccaaataatactctgctgggtgagt
aagccccatgctttttaatcactaacatgcatgtcttgaaagttcatagc
tgctgtctggcattagggtaattttcaaaagttaagccatccatgtaaaa
tttacctgtttacatggtataaatatttctcatattgtggatttaaaaat
ttatttctttcactggttaagaaaatgtttagcacagtctcattgaatac
attgtcatgtatgctcttaggttctctgtactcctcccccctttacacca
tgaattcttacgagattatctttagaatatatttaaaagttgttgaattt
gggccatgcttatcttattatcctctttgtgtatctgtctctctgtctcc
ctgcctctgtgcatgtgtgtgtgtgcacacatatgtaaatgttttatatg
catgtgtgttcaagggtgtgtgcttggttgtatattatgtgtagatatca
acttaggatattttcaattatcgctctccattttatttgggggatgaaga
tgatgtctcccactgaacttgaagcttaccattatagctaagctggctgg
tcagcaagaaccaggatctgttgaccctacaaccactcctatcttagtag
ggttcccattgttgtgaagagataccatgatcaaggcaactattataaag
gacacttaattggggctggtttaaaggttctaaggttcagtcagtccatt
atcatcgtagcagtgacaaggcaggcatggtgctggaggagctgaaagtt
ctatatcttgttctgaagaaaaccaggaaaagactaactttgaggcagct
agaagaaggtctcaaagcgcagtccagtacacacttcctccaacaagcca
catctactgcacaaggccatacctcctaacagggccattccagggtcagt
attcctcaaacaccacaatccccaagctgtgtagattttataagtgtgtg
gtgtgtgtt
gaattcagcagtttcagtcttagctaacattcatattctatttcagtctt
gttcatgtgtatgtctgtgcctctgttactagcattgactatggggatct
cttggaagctagaggtttctagcactgggttatatcctcaaggcttcatc
tcagtctttcagaaggggaatacttcctgaatgtgaatgcccgtctttac
ctagggccattcagtgacagaaactaaggggtgacaccctacatcaaaga
caaagaaaatttctggatactcctattgcttcctaaagtcttttagcatg
tgtccttggtaccagaagtgtggggtattcctgtgacaacctggccatgc
tttggggaggactgtggaaggactttggaactttgagctacaagatccat
tcggtgttaagagctctgtcagatgttgtgtaggagcttggaagataatg
ttgaaaacaatgcagaagatggaggcctggcttgtgaagtttcagaggga
aaattaaagtctctttgcagggccattgctactttggttgtgaagattct
gtggttctggttagctggggctgaagaatcagctgtgattaacaagatac
cagaactactaaagcaaaaactttgcattactgggactattgatgctggt
tagctggtgctaagaaattagcggtgattaagaagagaccagcatcattg
aggtgacatcttctaggaagtgttttctgaaagcacaaagaggctgtgtt
ccagagatagccaaggttgtactcctgctgcagcgggacttggtaatgtg
taagggtcaccaaggtggtactagttttgaaggcatgaaggggtcacatg
gagcagctgaggcttggcactgtgagaaggcatgggagcccattggtgaa
agagcagcctcagttgtaattaatggcccaaggactgaaggggtcatgca
gtgttttgaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_14138510_14139574
seq2: B6Ng01-024N16.b_45_1102 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACCTATAAATTCTACACAGCTTGGGGATTGTGGTGT  50
      |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAC-CACACACTTATAAAATCTACACAGCTTGGGGATTGTGGTGT  49

seq1  TTTGAGAATACCTGACCCTGGGAATGGCCCTGTTAGGAGGTATGGCCTTG  100
      ||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGAATA-CTGACCCT-GGAATGGCCCTGTTAGGAGGTATGGCCTTG  97

seq1  TTGCAGTAGATGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTTACTGGACTGCGCTT  150
       |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  -TGCAGTAGATGTGG-CTTGTTGGAGGAAGTGTG-TACTGGACTGCGCTT  144

seq1  TGAGACCCTTCTTCTAGCTGCCTCAAAGTTAGTCTTTTCCTGGTTTTCTT  200
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGA-CCTTCTTCTAGCTGCCTCAAAGTTAGTCTTTTCCTGGTTTTCTT  193

seq1  CAGAACAAGATATAGAACTTTCAGCTCCTCCAGCACCATGCCTGCCTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACAAGATATAGAACTTTCAGCTCCTCCAGCACCATGCCTGCCTTGT  243

seq1  CACTGCTACGATGATAATGGACTGACTGAACCTTAGAACCTTTAAACCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTACGATGATAATGGACTGACTGAACCTTAGAACCTTTAAACCAG  293

seq1  CCCCAATTAAGTGTCCTTTATAATAGTTGCCTTGATCATGGTATCTCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAATTAAGTGTCCTTTATAATAGTTGCCTTGATCATGGTATCTCTTC  343

seq1  ACAACAATGGGAACCCTACTAAGATAGGAGTGGTTGTAGGGTCAACAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAATGGGAACCCTACTAAGATAGGAGTGGTTGTAGGGTCAACAGAT  393

seq1  CCTGGTTCTTGCTGACCAGCCAGCTTAGCTATAATGGTAAGCTTCAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTCTTGCTGACCAGCCAGCTTAGCTATAATGGTAAGCTTCAAGTT  443

seq1  CAGTGGGAGACATCATCTTCATCCCCCAAATAAAATGGAGAGCGATAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGAGACATCATCTTCATCCCCCAAATAAAATGGAGAGCGATAATT  493

seq1  GAAAATATCCTAAGTTGATATCTACACATAATATACAACCAAGCACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATATCCTAAGTTGATATCTACACATAATATACAACCAAGCACACAC  543

seq1  CCTTGAACACACATGCATATAAAACATTTACATATGTGTGCACACACACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAACACACATGCATATAAAACATTTACATATGTGTGCACACACACA  593

seq1  CATGCACAGAGGCAGGGAGACAGAGAGACAGATACACAAAGAGGATAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCACAGAGGCAGGGAGACAGAGAGACAGATACACAAAGAGGATAATA  643

seq1  AGATAAGCATGGCCCAAATTCAACAACTTTTAAATATATTCTAAAGATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAGCATGGCCCAAATTCAACAACTTTTAAATATATTCTAAAGATAA  693

seq1  TCTCGTAAGAATTCATGGTGTAAAGGGGGGAGGAGTACAGAGAACCTAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGTAAGAATTCATGGTGTAAAGGGGGGAGGAGTACAGAGAACCTAAG  743

seq1  AGCATACATGACAATGTATTCAATGAGACTGTGCTAAACATTTTCTTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATACATGACAATGTATTCAATGAGACTGTGCTAAACATTTTCTTAAC  793

seq1  CAGTGAAAGAAATAAATTTTTAAATCCACAATATGAGAAATATTTATACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAAAGAAATAAATTTTTAAATCCACAATATGAGAAATATTTATACC  843

seq1  ATGTAAACAGGTAAATTTTACATGGATGGCTTAACTTTTGAAAATTACCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAACAGGTAAATTTTACATGGATGGCTTAACTTTTGAAAATTACCC  893

seq1  TAATGCCAGACAGCAGCTATGAACTTTCAAGACATGCATGTTAGTGATTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCCAGACAGCAGCTATGAACTTTCAAGACATGCATGTTAGTGATTA  943

seq1  AAAAGCATGGGGCTTACTCACCCAGCAGAGTATTATTTGGTCATAGAGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCATGGGGCTTACTCACCCAGCAGAGTATTATTTGGTCATAGAGAA  993

seq1  AACAAAGTATTGATATGGGAGTATCTGGGTGGCTCTATAATGCATAATTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGTATTGATATGGGAGTATCTGGGTGGCTCTATAATGCATAATTT  1043

seq1  TGAATAAAAGAATTC  1065
      |||||||||||||||
seq2  TGAATAAAAGAATTC  1058

seq1: chr7_14073801_14074601
seq2: B6Ng01-024N16.g_68_868

seq1  GAATTCAGCAGTTTCAGTCTTAGCTAACATTCATATTCTATTTCAGTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAGTTTCAGTCTTAGCTAACATTCATATTCTATTTCAGTCTT  50

seq1  GTTCATGTGTATGTCTGTGCCTCTGTTACTAGCATTGACTATGGGGATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGTGTATGTCTGTGCCTCTGTTACTAGCATTGACTATGGGGATCT  100

seq1  CTTGGAAGCTAGAGGTTTCTAGCACTGGGTTATATCCTCAAGGCTTCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAAGCTAGAGGTTTCTAGCACTGGGTTATATCCTCAAGGCTTCATC  150

seq1  TCAGTCTTTCAGAAGGGGAATACTTCCTGAATGTGAATGCCCGTCTTTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCTTTCAGAAGGGGAATACTTCCTGAATGTGAATGCCCGTCTTTAC  200

seq1  CTAGGGCCATTCAGTGACAGAAACTAAGGGGTGACACCCTACATCAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGCCATTCAGTGACAGAAACTAAGGGGTGACACCCTACATCAAAGA  250

seq1  CAAAGAAAATTTCTGGATACTCCTATTGCTTCCTAAAGTCTTTTAGCATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAAATTTCTGGATACTCCTATTGCTTCCTAAAGTCTTTTAGCATG  300

seq1  TGTCCTTGGTACCAGAAGTGTGGGGTATTCCTGTGACAACCTGGCCATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTGGTACCAGAAGTGTGGGGTATTCCTGTGACAACCTGGCCATGC  350

seq1  TTTGGGGAGGACTGTGGAAGGACTTTGGAACTTTGAGCTACAAGATCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGAGGACTGTGGAAGGACTTTGGAACTTTGAGCTACAAGATCCAT  400

seq1  TCGGTGTTAAGAGCTCTGTCAGATGTTGTGTAGGAGCTTGGAAGATAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTGTTAAGAGCTCTGTCAGATGTTGTGTAGGAGCTTGGAAGATAATG  450

seq1  TTGAAAACAATGCAGAAGATGGAGGCCTGGCTTGTGAAGTTTCAGAGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAACAATGCAGAAGATGGAGGCCTGGCTTGTGAAGTTTCAGAGGGA  500

seq1  AAATTAAAGTCTCTTTGCAGGGCCATTGCTACTTTGGTTGTGAAGATTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAGTCTCTTTGCAGGGCCATTGCTACTTTGGTTGTGAAGATTCT  550

seq1  GTGGTTCTGGTTAGCTGGGGCTGAAGAATCAGCTGTGATTAACAAGATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTCTGGTTAGCTGGGGCTGAAGAATCAGCTGTGATTAACAAGATAC  600

seq1  CAGAACTACTAAAGCAAAAACTTTGCATTACTGGGACTATTGATGCTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACTACTAAAGCAAAAACTTTGCATTACTGGGACTATTGATGCTGGT  650

seq1  TAGCTGGTGCTAAGAAATTAGCGGTGATTAAGAAGAGACCAGCATCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGGTGCTAAGAAATTAGCGGTGATTAAGAAGAGACCAGCATCATTG  700

seq1  AGGTGACATCTTCTAGGAAGTGTTTTCTGAAAGCACAAAGAGGCTGTGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACATCTTCTAGGAAGTGTTTTCTGAAAGCACAAAGAGGCTGTGTT  750

seq1  CCAGAGATAGCCAAGGTTGTACTCCTGCTGCAGCGGGACTTGGTAATGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGATAGCCAAGGTTGTACTCCTGCTGCAGCGGGACTTGGTAATGTG  800

seq1  T  801
      |
seq2  T  801