BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026C17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,021,994 - 119,170,474
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668399, LOC100042678, Usp47
Upstream geneMrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658, Galntl4
Downstream geneDkk3, Mical2, Micalcl, Parva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026C17.bB6Ng01-026C17.g
ACCDH857289DH857290
length1,0351,138
definitionDH857289|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026C17, 5' end.DH857290|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026C17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,021,994 - 119,023,027)(119,169,308 - 119,170,474)
sequence
gaattcaaaaacccacatgatggctcacaaccgtctgtaactccaggtcc
agaggatgaggcaccctcttctgaccttcacaagcactaggcatgaaagt
agtatacatacatgcatcaggcaaagcatccatacacataaaataaagac
atttaaaaataaataaaataaaaatatttaaaaaaaaataaaacacttta
aatgtgtacccctcctaagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagagagagagagaggatgtgaaaacaaaaatagccaagt
caaatagctaaagtagcaagaggcatttcattccaagacagaaattgtta
attggctacaggtcaaggtctcttaacctcagtaccactgacaatcagga
cgggcaacgtctttaaaaatttcaaagcaaagtggtctgcaccctcaata
ctgacccccatgcacacactagatcatagtcattgtatagacttctcagt
ggtcctcttaacgttataaacgtctggattacatgctactgtggtgtccc
tactctctctaagcctgacacacagcatcaccacagtgtagctgatttta
acttagactacacggtagagaatgtagacagtgccctagtcctttgtcta
gtctatgtattgttttccctatagcatcccccccaagctgtgaccaagct
tctgctgatgtaactttgataacaggtgcaatgactaattgtatttatca
aattgattagactgagaaacacccaagagattatgagtgaagtacaccag
ggttgtgtaatgggtttccagactgactggatcatgaggactgctgcgat
gaggtaatccctggtgtattcatgatatgccctcacttttgggagatggt
gaagagcagaggttagacctagttggagaaagcaaacctccatgagcatg
ttctagggggatgtcccttgcttgactccttccatagtcattctcagctt
cctgggcaccatgctaaagtgacatctgttcttcc
gaattcccaatgaacatcataaaatgtgtaccatagtcagaaaccacagt
agatgttccaaaatactgtttatgaactgctaagtgagctctgctcttat
gctaaagccttctatggagaaaatccttaggttaaaatgctccagactct
ttgacaaagagggtttatggactgtgtacggaggatttgaacaggtgaag
taagtaggaaagagggacagcacaataaagcaagctggagagaaacctgt
ttgtctacattaaaaacttgttccatgggaagagagataagctaggaaag
ggcaggctatggccagaagcaagtgtactgcactttgaataccaggctgc
acacagcctacacagcagccactcaacactgctgccaccactgaaaactg
tgtcctaacaatgaaattcccatgtcaaccatgctcatgtatcacagaaa
gctattctttttttagttttttaaatccagcaatttaaaaatcactccta
actcaaaccaaaacaggctgggagctgggcaacaattagttaatctgtac
actaagatgccgcctacagcagttctccaagggacatttgtcctggagtt
ttaggaccaaaataatcttaacttacttaacaactctatgaattcacaca
tagaatcgaaagccacatccataaaggtcagaccttctctgaagcaaaac
aaagctctctcgggttgttaatatagctggaataggcacaggtaagcttc
taattctgcactgtattgtcacttactaaacaagtacccggagaaataga
aactattcttagagctccaaggtaacatggactgaacgtaagaggatgaa
aagacccgatggaggacccaagctctagacccccacctgtgagtccttat
ttgaacaagtcactttcaacctgagagctgtacttctcactctgtgagag
tgagtggtttaaatacacgattgcctcagattagcactgtataattcaat
gctatttgataacaaagaaaataaaactcctattaaaactcaccaagaga
aggccctttttagagatctaatgctctacatacctaaagagaaaagggag
aagccacaattgttagagaatcagcttctttgggatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_119021994_119023027
seq2: B6Ng01-026C17.b_43_1077

seq1  GAATTCAAAAACCCACATGATGGCTCACAACCGTCTGTAACTCCAGGTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAACCCACATGATGGCTCACAACCGTCTGTAACTCCAGGTCC  50

seq1  AGAGGATGAGGCACCCTCTTCTGACCTTCACAAGCACTAGGCATGAAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATGAGGCACCCTCTTCTGACCTTCACAAGCACTAGGCATGAAAGT  100

seq1  AGTATACATACATGCATCAGGCAAAGCATCCATACACATAAAATAAAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATACATACATGCATCAGGCAAAGCATCCATACACATAAAATAAAGAC  150

seq1  ATTTAAAAATAAATAAAATAAAAATATTTAAAAAAAAATAAAACACTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAAATAAATAAAATAAAAATATTTAAAAAAAAATAAAACACTTTA  200

seq1  AATGTGTACCCCTCCTA--AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  248
      |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTACCCCTCCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  250

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGATGTGAAAACAAAAATAGCCAAGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGATGTGAAAACAAAAATAGCCAAGT  300

seq1  CAAATAGCTAAAGTAGCAAGAGGCATTTCATTCCAAGACAGAAATTGTTA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAGCTAAAGTAGCAAGAGGCATTTCATTCCAAGACAGAAATTGTTA  350

seq1  ATTGGCTACAGGTCAAGGTCTCTTAACCTCAGTACCACTGACAATCAGGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTACAGGTCAAGGTCTCTTAACCTCAGTACCACTGACAATCAGGA  400

seq1  CGGGCAACGTCTTTAAAAATTTCAAAGCAAAGTGGTCTGCACCCTCAATA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGCAACGTCTTTAAAAATTTCAAAGCAAAGTGGTCTGCACCCTCAATA  450

seq1  CTGACCCCCATGCACACACTAGATCATAGTCATTGTATAGACTTCTCAGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCCCATGCACACACTAGATCATAGTCATTGTATAGACTTCTCAGT  500

seq1  GGTCCTCTTAACGTTATAAACGTCTGGATTACATGCTACTGTGGTGTCCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCTTAACGTTATAAACGTCTGGATTACATGCTACTGTGGTGTCCC  550

seq1  TACTCTCTCTAAGCCTGACACACAGCATCACCACAGTGTAGCTGATTTTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTCTCTAAGCCTGACACACAGCATCACCACAGTGTAGCTGATTTTA  600

seq1  ACTTAGACTACACGGTAGAGAATGTAGACAGTGCCCTAGTCCTTTGTCTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGACTACACGGTAGAGAATGTAGACAGTGCCCTAGTCCTTTGTCTA  650

seq1  GTCTATGTATTGTTTTCCCTATAGCATCCCCCCCAAGCTGTGACCAAGCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGTATTGTTTTCCCTATAGCATCCCCCCCAAGCTGTGACCAAGCT  700

seq1  TCTGCTGATGTAACTTTGATAACAGGTGCAATGACTAATTGTATTTATCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGATGTAACTTTGATAACAGGTGCAATGACTAATTGTATTTATCA  750

seq1  AATTGATTAGACTGAGAAACACCCAAGAGATTATGAGTGAAGTACACCAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGATTAGACTGAGAAACACCCAAGAGATTATGAGTGAAGTACACCAG  800

seq1  GGTTGTGTAATGGGTTTCCAGACTGACTGGATCATGAGGACTGCTGCGAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTGTAATGGGTTTCCAGACTGACTGGATCATGAGGACTGCTGCGAT  850

seq1  GAAGTAATCCCTGGTGTATTCATGATATGCCCTCACTTTTGGGAGATGGT  898
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAATCCCTGGTGTATTCATGATATGCCCTCACTTTTGGGAGATGGT  900

seq1  GAAGAGCAGAGGTAAGACCTAGTTGGAGAAAGCAAACCTCCATGAGCATG  948
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCAGAGGTTAGACCTAGTTGGAGAAAGCAAACCTCCATGAGCATG  950

seq1  TTCTAGGGTGATGTCCCTTGCTTGACTCCTTCCCATAGTCATTCTCAGCT  998
      |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGGGGATGTCCCTTGCTTGACTCCTT-CCATAGTCATTCTCAGCT  999

seq1  TCCTGGTCACCATGCTATAAGTGAC-TCTGTTCTTCC  1034
      |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TCCTGGGCACCATGCTA-AAGTGACATCTGTTCTTCC  1035

seq1: chr7_119169308_119170474
seq2: B6Ng01-026C17.g_68_1205 (reverse)

seq1  GTATCCCAAAAGGAAGCTAGTGATCTCTTAAACCAAATATGTGGGCTTCT  50
      ||||||||||  |||||   |||| |||  |||  ||| ||| |||||||
seq2  GTATCCCAAA--GAAGC---TGAT-TCTCTAAC--AAT-TGT-GGCTTCT  40

seq1  CCCCTTCTCTTCCTTTAGTTAGTTAGTAGCATTAGATACTTTAAAACATG  100
       ||||| |||  |||||| ||  ||| |||||||||| || ||||| | |
seq2  -CCCTTTTCT--CTTTAGGTATGTAG-AGCATTAGAT-CTCTAAAA-AGG  84

seq1  GCCTTTCTCTTGTTTGTGTTTTTAGTAATGAGTTTTATTTTCTTTGTTAT  150
      ||| ||||||||  || ||||| |   | |||||||||||||||||||||
seq2  GCC-TTCTCTTG-GTGAGTTTTAA--TAGGAGTTTTATTTTCTTTGTTAT  130

seq1  CAAATAGCATTTGAATTATACAGTGCTAAATCTGAGGGCAAATCGTGTAA  200
      ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |
seq2  CAAATAGCA-TTGAATTATACAGTGCT-AATCTGAGG--CAATCGTGT-A  175

seq1  TTTAAACCACTTCACTTCTCACAGGAGTGAGAAGTACAGCTCTCAGGTTG  250
      |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACCAC-TCAC-TCTCACA-GAGTGAGAAGTACAGCTCTCAGGTTG  222

seq1  AAAGTGACTTGTTCAAATTAAGGACTCACAGGTGGGGGTCTAGAGCTTGG  300
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGACTTGTTCAAA-TAAGGACTCACAGGTGGGGGTCTAGAGCTTGG  271

seq1  GTCCTCCATCGGGTCTTTTCATCCTCTTACGTTCAGTCCATGTTACCTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCCATCGGGTCTTTTCATCCTCTTACGTTCAGTCCATGTTACCTTG  321

seq1  GAGCTCTAAGAATAGTTTCTATTTCTCCGGGTACTTGTTTAGTAAGTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTAAGAATAGTTTCTATTTCTCCGGGTACTTGTTTAGTAAGTGAC  371

seq1  AATACAGTGCAGAATTAGAAGCTTACCTGTGCCTATTCCAGCTATATTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGTGCAGAATTAGAAGCTTACCTGTGCCTATTCCAGCTATATTAA  421

seq1  CAACCCGAGAGAGCTTTGTTTTGCTTCAGAGAAGGTCTGACCTTTATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCGAGAGAGCTTTGTTTTGCTTCAGAGAAGGTCTGACCTTTATGGA  471

seq1  TGTGGCTTTCGATTCTATGTGTGAATTCATAGAGTTGTTAAGTAAGTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTTTCGATTCTATGTGTGAATTCATAGAGTTGTTAAGTAAGTTAA  521

seq1  GATTATTTTGGTCCTAAAACTCCAGGACAAATGTCCCTTGGAGAACTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTTTGGTCCTAAAACTCCAGGACAAATGTCCCTTGGAGAACTGCT  571

seq1  GTAGGCGGCATCTTAGTGTACAGATTAACTAATTGTTGCCCAGCTCCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCGGCATCTTAGTGTACAGATTAACTAATTGTTGCCCAGCTCCCAG  621

seq1  CCTGTTTTGGTTTGAGTTAGGAGTGATTTTTAAATTGCTGGATTTAAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTTTGGTTTGAGTTAGGAGTGATTTTTAAATTGCTGGATTTAAAAA  671

seq1  ACTAAAAAAAGAATAGCTTTCTGTGATACATGAGCATGGTTGACATGGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAAAAAGAATAGCTTTCTGTGATACATGAGCATGGTTGACATGGGA  721

seq1  ATTTCATTGTTAGGACACAGTTTTCAGTGGTGGCAGCAGTGTTGAGTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATTGTTAGGACACAGTTTTCAGTGGTGGCAGCAGTGTTGAGTGGC  771

seq1  TGCTGTGTAGGCTGTGTGCAGCCTGGTATTCAAAGTGCAGTACACTTGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTAGGCTGTGTGCAGCCTGGTATTCAAAGTGCAGTACACTTGCT  821

seq1  TCTGGCCATAGCCTGCCCTTTCCTAGCTTATCTCTCTTCCCATGGAACAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCCATAGCCTGCCCTTTCCTAGCTTATCTCTCTTCCCATGGAACAA  871

seq1  GTTTTTAATGTAGACAAACAGGTTTCTCTCCAGCTTGCTTTATTGTGCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAATGTAGACAAACAGGTTTCTCTCCAGCTTGCTTTATTGTGCTG  921

seq1  TCCCTCTTTCCTACTTACTTCACCTGTTCAAATCCTCCGTACACAGTCCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTTTCCTACTTACTTCACCTGTTCAAATCCTCCGTACACAGTCCA  971

seq1  TAAACCCTCTTTGTCAAAGAGTCTGGAGCATTTTAACCTAAGGATTTTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCCTCTTTGTCAAAGAGTCTGGAGCATTTTAACCTAAGGATTTTCT  1021

seq1  CCATAGAAGGCTTTAGCATAAGAGCAGAGCTCACTTAGCAGTTCATAAAC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAAGGCTTTAGCATAAGAGCAGAGCTCACTTAGCAGTTCATAAAC  1071

seq1  AGTATTTTGGAACATCTACTGTGGTTTCTGACTATGGTACACATTTTATG  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTTGGAACATCTACTGTGGTTTCTGACTATGGTACACATTTTATG  1121

seq1  ATGTTCATTGGGAATTC  1167
      |||||||||||||||||
seq2  ATGTTCATTGGGAATTC  1138