BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026H12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 32,183,283 - 32,294,244
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043328, LOC100043331, LOC626181, LOC100043334
Upstream geneTyrobp, Hcst, AY078069, Aplp1, Kirrel2, Nphs1, LOC100034728, Prodh2, Gm1082, Snx26, BC053749, Hspb6, 1810054G18Rik, Psenen, U2af1l4, Tmem149, Wbp7, Zbtb32, Upk1a, Cox6b1, Etv2, 3100004P22Rik, 2310022K01Rik, 4930479M11Rik, 2200002J24Rik, EG233075, Atp4a, Tmem147, Gapdhs, Sbsn, Dmkn, Krtdap, Ffar2, Ffar3, Ffar1, Cd22, Mag, Hamp2, Usf2-ps1, Hamp1, Usf2, LOC100043823, Lsr, Tmem162, Fxyd5, Fxyd7, Fxyd1, Lgi4, Fxyd3, Hpn, Scn1b, Gramd1a, LOC672598, LOC100043323, LOC100043827, Apbh, Abpe, LOC100043326, EG384585
Downstream geneLOC100043834, LOC546947, LOC677233, LOC100043337, LOC546949, LOC100043836, EG626305, EG668342, EG626330, LOC100043340, LOC100043343, EG626358, LOC668351, EG384593, LOC100043351, LOC100043352, LOC100043353, EG384594, LOC100043838, EG668361, LOC668362, EG624584, LOC100043355, LOC546951, EG626740, EG668371, EG668377, LOC100043842, LOC634929, EG668379, EG668381, LOC668386, LOC626373, EG384589, EG668393, EG330689, LOC100043362
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026H12.bB6Ng01-026H12.g
ACCDH857504DH857505
length1,148986
definitionDH857504|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026H12, 5' end.DH857505|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026H12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,293,076 - 32,294,244)(32,183,283 - 32,184,277)
sequence
gaattctgttctggccacgtcccgctctcatttccaggctgaaattctgt
tcactgtgaggggcaggaagcctcacaaaagcttttgaaataggtacttt
tattttattttctacatgggaaaccctgtgacacacagacatgcacaact
ggataatgtaccaaacactagagagcagggacagattctgctatcctatc
taaagcctgtgtggtcctcaacagacccttggtattcctggtcctactca
gttccatgttcctggggagttcagtctgggaggtcatgtatgttccttgt
ggaccctgtccaatgagggtggcagacactctagagtaatgactgtggta
tcttcgcattctctaatgcattctgcatggcattttggcagcaccacaat
tgagctgtgacacctcaatgtcccagaggttgtccctgcaatatcgttca
atcaaatcagacccaaccttgaatccaaaaatccagactccccaatgaat
tgcaaggtttttttgttggattcctgtttttagacacctggagggaaggg
ctatagcctgctgcatctatacaggtgagcagacaaatggcttccttgag
agtaaagttgtagccatcatcatagcaggctagcttctattttttcctgc
aaacagaaagctaagtgagacttcgggggtgaagcagaccgaatgccaca
ctgaccatgcactgacacacctcctagaaagacctgcagccaaattgcaa
ttgctcttatatctgaccaggacaagggagccttttccccaacctgttaa
gacaagctttgtaaagagccccaaatccagccagatgggaggagccaact
tgggagacaacatagtcccagtgggaccaaatggacaggagctgacagag
acccatgtgagcctctgggcagctgggaccccacaagcaaactgactcct
gtcacatgttgatggtgaccctcaaatatcttcagctaagcaggctttat
catacctgctctagggacatgagggttcactttaattctacctgaatgtc
cacatgtggagtccaaaagtggtcttcagttcagagaaagatactatgaa
cttttggagctgatgaagcttgaaatgaggaataaagaactaggctag
gaattcaaagtcagttattactgttcatgatgctttgctctggtcaaagt
aggaatctcttccaactagcaggagcagtggctttggtcaaactctggac
ttataatagatagaagaaatcagattcttgtgatggttttaaaataattt
cttttgtaccgaaccatttcttttattaaagcttggttgaggcagaattt
ctgtgccttctactgtgtataaattttaaaatgtgagagacttgttaatg
ttggtgttagtggttttgtattgtgagtcagggtaactatgtgtagtcct
ggctgccatggaagtctctctgttgaccaggctggactccagctcagaga
tttttctgcttctgcctcccaagtgctgcaattaaaggccttctctacaa
ctgactggcatggtaggtgttatttaatgtataaaaccaagaaatcactg
tagtcctgatagtgatcactttcattgctcctaatgtgaccacttatagt
cacccttttcctaactgcccatcagggtgttcattgatttgttttccccc
ttcagaagaacttgtaaataaaataattatctctgatttgtgtacaacca
tgaggattttccattaatatatgtgtgggattgtgtgttgtaaggcaatt
tctcctatgtcattagtccaagaactttttgctgccttcagtttgggact
attttaaataaagcttctatgtgcattcattaacctgttcctctcttctg
cgtgtcaaaaatcagacatcaaaggcctgcatgcctcatttctacatgtg
agagtttaccttctagatatgatggaacaagaattgtcaacaacgaaagg
aacatactacctacatgtatcagagaaggcacatatatcatgccacacat
gctatgtcatgagattattgttgagtggaaaagaaaaacatgagaagagc
ctcacacttcgtggggatccttgggcaaggaactgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_32293076_32294244
seq2: B6Ng01-026H12.b_47_1194 (reverse)

seq1  CTAGCCTAGGTCTTTTATCCTCAATTTTCAAGCCTATCACTCCAGCTCCA  50
      ||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |    |  ||||||| 
seq2  CTAGCCTAGTTCTTTATTCCTCA--TTTCAAGCTT----CATCAGCTCC-  43

seq1  AAAAAGTCATATGTTATCCTGTTCTCTGAACCTTGAAGACCACTTTGTGG  100
      ||||  |||||   ||||   ||||||||||  ||||||||||||| |||
seq2  AAAAGTTCATA--GTATC--TTTCTCTGAAC--TGAAGACCACTTT-TGG  86

seq1  ACTCCACATGTGGACATTCAAGGGTAGAATTAAAGTGAACCCCCTCATGT  150
      ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||
seq2  ACTCCACATGTGGACATTCA--GGTAGAATTAAAGTGAA--CCCTCATGT  132

seq1  CCCTAGAGCAGGTATGATAAAGCCCTGCCTTTAGCTGAAGATATTTGAGG  200
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGAGCAGGTATGATAAAG-CCTGC--TTAGCTGAAGATATTTGAGG  179

seq1  GTCACCATCAACATGTGACAGGAGTCAGTTTGCTTGTGGGGTCCCAGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCATCAACATGTGACAGGAGTCAGTTTGCTTGTGGGGTCCCAGCTG  229

seq1  CCCAGAGGCTCACATGGGTCTCTGTCAGCTCCTGTCCATTTGGTCCCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGGCTCACATGGGTCTCTGTCAGCTCCTGTCCATTTGGTCCCACT  279

seq1  GGGACTATGTTGTCTCCCAAGTTGGCTCCTCCCATCTGGCTGGATTTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTATGTTGTCTCCCAAGTTGGCTCCTCCCATCTGGCTGGATTTGGG  329

seq1  GCTCTTTACAAAGCTTGTCTTAACAGGTTGGGGAAAAGGCTCCCTTGTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTACAAAGCTTGTCTTAACAGGTTGGGGAAAAGGCTCCCTTGTCC  379

seq1  TGGTCAGATATAAGAGCAATTGCAATTTGGCTGCAGGTCTTTCTAGGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGATATAAGAGCAATTGCAATTTGGCTGCAGGTCTTTCTAGGAGG  429

seq1  TGTGTCAGTGCATGGTCAGTGTGGCATTCGGTCTGCTTCACCCCCGAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGTGCATGGTCAGTGTGGCATTCGGTCTGCTTCACCCCCGAAGT  479

seq1  CTCACTTAGCTTTCTGTTTGCAGGAAAAAATAGAAGCTAGCCTGCTATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTTAGCTTTCTGTTTGCAGGAAAAAATAGAAGCTAGCCTGCTATGA  529

seq1  TGATGGCTACAACTTTACTCTCAAGGAAGCCATTTGTCTGCTCACCTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGCTACAACTTTACTCTCAAGGAAGCCATTTGTCTGCTCACCTGTA  579

seq1  TAGATGCAGCAGGCTATAGCCCTTCCCTCCAGGTGTCTAAAAACAGGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGCAGCAGGCTATAGCCCTTCCCTCCAGGTGTCTAAAAACAGGAAT  629

seq1  CCAACAAAAAAACCTTGCAATTCATTGGGGAGTCTGGATTTTTGGATTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACAAAAAAACCTTGCAATTCATTGGGGAGTCTGGATTTTTGGATTCA  679

seq1  AGGTTGGGTCTGATTTGATTGAACGATATTGCAGGGACAACCTCTGGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGGGTCTGATTTGATTGAACGATATTGCAGGGACAACCTCTGGGAC  729

seq1  ATTGAGGTGTCACAGCTCAATTGTGGTGCTGCCAAAATGCCATGCAGAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGGTGTCACAGCTCAATTGTGGTGCTGCCAAAATGCCATGCAGAAT  779

seq1  GCATTAGAGAATGCGAAGATACCACAGTCATTACTCTAGAGTGTCTGCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTAGAGAATGCGAAGATACCACAGTCATTACTCTAGAGTGTCTGCCA  829

seq1  CCCTCATTGGACAGGGTCCACAAGGAACATACATGACCTCCCAGACTGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATTGGACAGGGTCCACAAGGAACATACATGACCTCCCAGACTGAA  879

seq1  CTCCCCAGGAACATGGAACTGAGTAGGACCAGGAATACCAAGGGTCTGTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCAGGAACATGGAACTGAGTAGGACCAGGAATACCAAGGGTCTGTT  929

seq1  GAGGACCACACAGGCTTTAGATAGGATAGCAGAATCTGTCCCTGCTCTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCACACAGGCTTTAGATAGGATAGCAGAATCTGTCCCTGCTCTCT  979

seq1  AGTGTTTGGTACATTATCCAGTTGTGCATGTCTGTGTGTCACAGGGTTTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTGGTACATTATCCAGTTGTGCATGTCTGTGTGTCACAGGGTTTC  1029

seq1  CCATGTAGAAAATAAAATAAAAGTACCTATTTCAAAAGCTTTTGTGAGGC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTAGAAAATAAAATAAAAGTACCTATTTCAAAAGCTTTTGTGAGGC  1079

seq1  TTCCTGCCCCTCACAGTGAACAGAATTTCAGCCTGGAAATGAGAGCGGGA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCCCCTCACAGTGAACAGAATTTCAGCCTGGAAATGAGAGCGGGA  1129

seq1  CGTGGCCAGAACAGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||
seq2  CGTGGCCAGAACAGAATTC  1148

seq1: chr7_32183283_32184277
seq2: B6Ng01-026H12.g_67_1052

seq1  GAATTCAAAGTCAGTTATTACTGTTCATGATGCTTTGCTCTGGTCAAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTCAGTTATTACTGTTCATGATGCTTTGCTCTGGTCAAAGT  50

seq1  AGGAATCTCTTCCAACTAGCAGGAGCAGTGGCTTTGGTCAAACTCTGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATCTCTTCCAACTAGCAGGAGCAGTGGCTTTGGTCAAACTCTGGAC  100

seq1  TTATAATAGATAGAAGAAATCAGATTCTTGTGATGGTTTTAAAATAATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATAGATAGAAGAAATCAGATTCTTGTGATGGTTTTAAAATAATTT  150

seq1  CTTTTGTACCGAACCATTTCTTTTATTAAAGCTTGGTTGAGGCAGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTACCGAACCATTTCTTTTATTAAAGCTTGGTTGAGGCAGAATTT  200

seq1  CTGTGCCTTCTACTGTGTATAAATTTTAAAATGTGAGAGACTTGTTAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTTCTACTGTGTATAAATTTTAAAATGTGAGAGACTTGTTAATG  250

seq1  TTGGTGTTAGTGGTTTTGTATTGTGAGTCAGGGTAACTATGTGTAGTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGTTAGTGGTTTTGTATTGTGAGTCAGGGTAACTATGTGTAGTCCT  300

seq1  GGCTGCCATGGAAGTCTCTCTGTTGACCAGGCTGGACTCCAGCTCAGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCCATGGAAGTCTCTCTGTTGACCAGGCTGGACTCCAGCTCAGAGA  350

seq1  TTTTTCTGCTTCTGCCTCCCAAGTGCTGCAATTAAAGGCCTTCTCTACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTGCTTCTGCCTCCCAAGTGCTGCAATTAAAGGCCTTCTCTACAA  400

seq1  CTGACTGGCATGGTAGGTGTTATTTAATGTATAAAACCAAGAAATCACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTGGCATGGTAGGTGTTATTTAATGTATAAAACCAAGAAATCACTG  450

seq1  TAGTCCTGATAGTGATCACTTTCATTGCTCCTAATGTGACCACTTATAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCTGATAGTGATCACTTTCATTGCTCCTAATGTGACCACTTATAGT  500

seq1  CACCCTTTTCCTAACTGCCCATCAGGGTGTTCATTGATTTGTTTTCCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTTTTCCTAACTGCCCATCAGGGTGTTCATTGATTTGTTTTCCCCC  550

seq1  TTCAGAAGAACTTGTAAATAAAATAATTATCTCTGATTTGTGTACAACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGAACTTGTAAATAAAATAATTATCTCTGATTTGTGTACAACCA  600

seq1  TGAGGATTTTCCATTAATATATGTGTGGGATTGTGTGTTGTAAGGCAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGATTTTCCATTAATATATGTGTGGGATTGTGTGTTGTAAGGCAATT  650

seq1  TCTCCTATGTCATTAGTCCAAGAACTTTTTGCTGCCTTCAGTTTGGGACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTATGTCATTAGTCCAAGAACTTTTTGCTGCCTTCAGTTTGGGACT  700

seq1  ATTTTAAATAAAGCTTCTATGTGCATTCATTAACCTGTTCCTCTCTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAATAAAGCTTCTATGTGCATTCATTAACCTGTTCCTCTCTTCTG  750

seq1  CGTGTCAATAATCAGACATCAAAGGCCTGCATGCCTCATTTCTACATGTG  800
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTCAAAAATCAGACATCAAAGGCCTGCATGCCTCATTTCTACATGTG  800

seq1  AGAGTTTACCTTCTAGATATGATGGAACAAGAA-TGTCAACAACG-AAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  AGAGTTTACCTTCTAGATATGATGGAACAAGAATTGTCAACAACGAAAGG  850

seq1  AACATACTACCTACATGTATCAAGAGAAGGCACATATATCATGCCACACA  898
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AACATACTACCTACATGTATC-AGAGAAGGCACATATATCATGCCACAC-  898

seq1  ATGCTATGTCAGGCAGACTATTGTTGAGTGGGAGACAGAAAAACATGAGG  948
      ||||||||||| | ||| |||||||||||||   | |||||||||||| |
seq2  ATGCTATGTCATG-AGATTATTGTTGAGTGG--AAAAGAAAAACATGA-G  944

seq1  AAGAGGCCTCACCCTTTCGTGGGGACTCCTTGGGCACAGGAAACTGT  995
      |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||
seq2  AAGA-GCCTCACAC-TTCGTGGGGA-TCCTTGGGCA-AGG-AACTGT  986