BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-031H23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 142,754,072 - 142,860,976
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtpre
Upstream geneLOC668750, Dock1, B830028B13Rik, EG668693, LOC100043254, Foxi2, Clrn3
Downstream geneMki67, LOC668764, LOC546009
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-031H23.bB6Ng01-031H23.g
ACCDH861091DH861092
length999533
definitionDH861091|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031H23, 5' end.DH861092|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031H23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(142,754,072 - 142,755,085)(142,860,440 - 142,860,976)
sequence
gaattcatctctttagtcccctgagatgattcttttaaaaacttgtcatg
gactcttaagtgagcagatacgtcttgatttagtcacaactgaaccagtg
acttggactgtaacaccattttcaatggctaagtatttaggaatcataaa
gtgtgaactgcattaagtgtcatcatgttgctttgtggttcttctattat
ggaatgaaagacatagatgactgtggtataatattttaattccagctcaa
cgaaaacatgtacttaccattctcttcctttctgttaaaaagagacacat
tgagggactagaacaatgcctcagcagttaagaaccctggctgctcttga
agaggacccggcttcagtctccagcacctacaaggccacaccactgtcca
tagctacagttccagggcattcaatgccctcttcttaccctcattcgtac
tgcatgtacatagtgcatatctatacatgcaagtaaacgttcatatacat
aaaataaaaataagtaaatctttttctagaaaattgagaaggaagcaaat
gtgatgcatatattgagcattaacaagctatgatttaattgttgcttccc
catgagatttcctgactgatgggcatccttcattttatatttatcatatt
gtggccaaacatagatatgtcaggagctcatggtttgcagtgcaagaata
tgagatggacttctctcctgaaggtgtacatagcagagctggctgtgttt
gtatgggccatgatgagcctcataaagaagtgccagtaccaggtcaaatt
tgagtccttgtgggtgggtggagcagaagactctttcatcagttcgcact
tgggtctactcaccttcctgtcctacctcaccagatttttatggtgggct
gtgacaaatgagccactcagtagtcaaaaatacagacaagatcagttctc
gtcctaggctctgtggtcagacccagagcatggcttcggtctggctgct
ctttctccacacgcaactttgggtatagctgcttcaaaacttcattcccc
ccagccctagctctgcccaccccaccactgccgcactggccattccccac
actgtggctggcccctccctgacatacctacagtgaaccacaatgggccc
agcatgtgaggggttgagtgtcttcactttcttcaggaacttgagcatcc
cgatgggggtaaacggcaccccgaagtcaggccagctggtgaagtgcagc
tgtgagaccagccgcggggctttgcagctgtctgggagttgctgtaaggg
atgagggggaagtgagagatgggaggtggaactgtttagcatctccttcc
gaaggacagtggggctcatgccaggtcagcggctgcaaacacataaaacc
ctggaatgcaggggtaccatacccgatgtgacaatacacatctcttggtt
ggcaaaaggcttttgcaactggctataccacgccaggatcccagtatcca
catattcccaaagctgggtctttaatgctcaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_142754072_142755085
seq2: B6Ng01-031H23.b_47_1045

seq1  GAATTCATCTCTTTAGTCCCCTGAGATGATTCTTTTAAAAACTTGTCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTCTTTAGTCCCCTGAGATGATTCTTTTAAAAACTTGTCATG  50

seq1  GACTCTTAAGTGAGCAGATACGTCTTGATTTAGTCACAACTGAACCAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTTAAGTGAGCAGATACGTCTTGATTTAGTCACAACTGAACCAGTG  100

seq1  ACTTGGACTGTAACACCATTTTCAATGGCTAAGTATTTAGGAATCATAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGACTGTAACACCATTTTCAATGGCTAAGTATTTAGGAATCATAAA  150

seq1  GTGTGAACTGCATTAAGTGTCATCATGTTGCTTTGTGGTTCTTCTATTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAACTGCATTAAGTGTCATCATGTTGCTTTGTGGTTCTTCTATTAT  200

seq1  GGAATGAAAGACATAGATGACTGTGGTATAATATTTTAATTCCAGCTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGAAAGACATAGATGACTGTGGTATAATATTTTAATTCCAGCTCAA  250

seq1  CGAAAACATGTACTTACCATTCTCTTCCTTTCTGTTAAAAAGAGACACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAACATGTACTTACCATTCTCTTCCTTTCTGTTAAAAAGAGACACAT  300

seq1  TGAGGGACTAGAACAATGCCTCAGCAGTTAAGAACCCTGGCTGCTCTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGACTAGAACAATGCCTCAGCAGTTAAGAACCCTGGCTGCTCTTGA  350

seq1  AGAGGACCCGGCTTCAGTCTCCAGCACCTACAAGGCCACACCACTGTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGACCCGGCTTCAGTCTCCAGCACCTACAAGGCCACACCACTGTCCA  400

seq1  TAGCTACAGTTCCAGGGCATTCAATGCCCTCTTCTTACCCTCATTCGTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTACAGTTCCAGGGCATTCAATGCCCTCTTCTTACCCTCATTCGTAC  450

seq1  TGCATGTACATAGTGCATATCTATACATGCAAGTAAACGTTCATATACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTACATAGTGCATATCTATACATGCAAGTAAACGTTCATATACAT  500

seq1  AAAATAAAAATAAGTAAATCTTTTTCTAGAAAATTGAGAAGGAAGCAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAATAAGTAAATCTTTTTCTAGAAAATTGAGAAGGAAGCAAAT  550

seq1  GTGATGCATATATTGAGCATTAACAAGCTATGATTTAATTGTTGCTTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGCATATATTGAGCATTAACAAGCTATGATTTAATTGTTGCTTCCC  600

seq1  CATGAGATTTCCTGACTGATGGGCATCCTTCATTTTATATTTATCATATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGATTTCCTGACTGATGGGCATCCTTCATTTTATATTTATCATATT  650

seq1  GTGGCCAAACATAGATATGTCAGGAGCTCATGGTTTGCAGTGCAAGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCAAACATAGATATGTCAGGAGCTCATGGTTTGCAGTGCAAGAATA  700

seq1  TGAGATGGACTTCTCTCCTGAAGGTGTACATAGCAGAGCTGGCTGTGTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGGACTTCTCTCCTGAAGGTGTACATAGCAGAGCTGGCTGTGTTT  750

seq1  GTATGGGGCCATGATGAGCCTCATAAAGAAGTGCCAGTACCAGGTCAAAT  800
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAT-GGGCCATGATGAGCCTCATAAAGAAGTGCCAGTACCAGGTCAAAT  799

seq1  TTGAGTCCTTGTGGGTGGGTGGAGCAAGAAGACTCTTTCATCAGTTCGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTCCTTGTGGGTGGGTGGAGC-AGAAGACTCTTTCATCAGTTCGCA  848

seq1  CTTGGGTCTAACTCACCTTCCTGTCCTACCCTCACCAGATTTTTATGGTG  900
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGTCT-ACTCACCTTCCTGTCCTA-CCTCACCAGATTTTTATGGTG  896

seq1  GGCTGTGACAAATGAGCACACTCAGTAAGTTCAGATATACAGACAAGATC  950
      ||||||||||||||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||
seq2  GGCTGTGACAAATGAGC-CACTCAGTA--GTCAAAAATACAGACAAGATC  943

seq1  AGTTTCTTCGTCCCTTAGGCTCTGTGGGTCAGAACCCAGAGCATGGCTTC  1000
      ||||   ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| 
seq2  AGTT--CTCGTCC--TAGGCTCTGT-GGTCAG-ACCCAGAGCATGGCTT-  986

seq1  CGGTCCTGGCTGCT  1014
      |||| |||||||||
seq2  CGGT-CTGGCTGCT  999

seq1: chr7_142860440_142860976
seq2: B6Ng01-031H23.g_66_604 (reverse)

seq1  TGTGAGCATT-AAGA-CCAGCTTTGGGGATATGTGGCTACTGGGATCCTG  48
      |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  TGTGAGCATTAAAGACCCAGCTTTGGGAATATGTGGATACTGGGATCCTG  50

seq1  GCCTGGTATAGCCAGCTGCAAAAGCCCTTTGCCAGCCAAGAGCTGTGTAT  98
      || |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||
seq2  GCGTGGTATAGCCAGTTGCAAAAGCCTTTTGCCAACCAAGAGATGTGTAT  100

seq1  TGTCACATCGGGTATGGTACCCCTGCATTCCAGGGTTCTCTGTGTTTGCA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
seq2  TGTCACATCGGGTATGGTACCCCTGCATTCCAGGGTTTTATGTGTTTGCA  150

seq1  GCCGCTGACCTGGCATGAGCCCCACTGTCCTTCGGAAGGAGATGCTAAAC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGCTGACCTGGCATGAGCCCCACTGTCCTTCGGAAGGAGATGCTAAAC  200

seq1  AGTTCCACCTCCCATCTCTCACTTCCCCCTCATCCCTTACAGCAACTCCC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCACCTCCCATCTCTCACTTCCCCCTCATCCCTTACAGCAACTCCC  250

seq1  AGACAGCTGCAAAGCCCCGCGGCTGGTCTCACAGCTGCACTTCACCAGCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCTGCAAAGCCCCGCGGCTGGTCTCACAGCTGCACTTCACCAGCT  300

seq1  GGCCTGACTTCGGGGTGCCGTTTACCCCCATCGGGATGCTCAAGTTCCTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGACTTCGGGGTGCCGTTTACCCCCATCGGGATGCTCAAGTTCCTG  350

seq1  AAGAAAGTGAAGACACTCAACCCCTCACATGCTGGGCCCATTGTGGTTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTGAAGACACTCAACCCCTCACATGCTGGGCCCATTGTGGTTCA  400

seq1  CTGTAGGTATGTCAGGGAGGGGCCAGCCACAGTGTGGGGAATGGCCAGTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGGTATGTCAGGGAGGGGCCAGCCACAGTGTGGGGAATGGCCAGTG  450

seq1  CGGCAGTGGTGGGGTGGGCAGAGCTAGGGCTGGGGGGAATGAAGTTTTGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAGTGGTGGGGTGGGCAGAGCTAGGGCTGGGGGGAATGAAGTTTTGA  500

seq1  AGCAGCTATACCCAAAGTTGCGTGTGGAGAAAGGAATTC  537
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTATACCCAAAGTTGCGTGTGGAGAAAGGAATTC  539