BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-033E18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 116,112,456 - 116,253,791
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTub, Ric3
Upstream geneOlfr477, LOC626732, Olfr478, Olfr479, Olfr480, Olfr481, LOC100043059, Olfr482, Olfr483, Olfr484, Olfr485, Olfr486, Olfr487, Olfr1538-ps1, Olfr488, LOC546990, Olfr489-ps1, Olfr490, LOC626881, Olfr491, Olfr492, Olfr493, Olfr494, Olfr495, Olfr496-ps1, Olfr497, Olfr498, Olfr499-ps1, Olfr500-ps1, Olfr501-ps1, Olfr502, LOC269980, Olfr503, Olfr504, Olfr505-ps1, Olfr506, Olfr507, Olfr508, Olfr509, Olfr510, Olfr511-ps1, Olfr512, Olfr513, Olfr514, Olfr515-ps1, Olfr516, Olfr517, Olfr518, Olfr519, Nlrp10, Eif3s5, BC049265
Downstream geneLmo1, Stk33, EG668320, 1700095J03Rik, Trim66, Rpl27a, St5, LOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-033E18.bB6Ng01-033E18.g
ACCDH862392DH862393
length6971,038
definitionDH862392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-033E18, 5' end.DH862393|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-033E18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,253,096 - 116,253,791)(116,112,456 - 116,113,502)
sequence
gaattcaggagcccattgtgctttctggggactgggctcatgcgggatgt
gggaaattgaagggcacacagctatcgtaggcattggtatgcttttgctc
tgccaagtcagaaggcccaggagactgcagaaacacagcttcaactcact
cccattaacaccaggaattaagtcctgattggagaacacacaaggagagc
tctaggggcgtttagagagccatgaagctctgcgaagcctgcctttacct
tcttgagctctctgcaaagccatccgagagctagttgggtcctcacctct
gggcactggagcagatgccagttctgccagggaggagttctggacccagg
gtccgctgggctggcttctgggagagcagagcttttggtgttttcaggga
caggactgcctgtgggttcttagtagcacacacagcaaggaagacttggg
tcctggcttcctgacaccacattctgaattccagctttctagaaacaggc
tttccttctctttcccattcctttcctgtccctctaagactgaggaccac
acactcttcagcttagagacacattttcattcttctgcctctttccatca
cttgcatgtgggtgcatgagtgtgtgtgtttatgtacaaacatgtccatg
catgtgtttatgtgtgtgcatatgtatgttatgtgtatgtggagttt
gaattcccgtaacctgagttgaatgtccaggatctttgttgtgagaaaag
agacgtgactctccccccacacctgcccccgtgctcttctggtttccacg
tgcttgctgcagcccacgtactaactaattgtcttaaatatcaaaacaaa
acaaatgcacaaacatctccaagcaagaaaatcccaggatttggccttgc
ttatctaactccactattttcagacatcggttagtcgtggacacatttgt
agttttttctattaaagtggtacatttcattgtagagcgagttttttagt
acatccttaaactctgcatggccccagccttgccaccctcactcccctct
gggaactcacccctgcttccttcagtgctcacgtctactgccctgagtag
agtggctcaactgctcttctgagtgggggccctgagtagcaaggacgtag
ggaaaccctcctgccccacccctataactgtcctaatgtgcccttcctcc
atcggtccatctggaccctgcatcatccccgagaagaagacacctcaaag
aaggtctgtaggttaccctggtaactagaagacagaccatgctggtcttt
tgcccttcctgtaagcatgtccagacagggcagtggaggcaagcacacag
catccctggcacggggatctaaagagcaacaaaagtgtcctgtgtgtgtg
cagaagtagagaaaattacacttgcctgaattcctcccagggagaggaca
gcatgtggctgacagaggacaatgaggatctcatttgacagagagatgga
ccactggaacacacatggatgcccgctaaccagccttctgcagagggtag
gtcttgtttgttgaagggctccattgtggaaatagattctgttaaagagg
gaagccttgtcaccagagaacacctctctctgcatcaccaggttgtactg
aattcttctaagagctgaacacattgctgaaagatcggtgttatatgttg
ccaaggtgctaagattgctcgtatggggcctgggtcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_116253096_116253791
seq2: B6Ng01-033E18.b_44_739 (reverse)

seq1  AACTCCACATACACATAACATACATATGCACACACATAAACACATGCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCACATACACATAACATACATATGCACACACATAAACACATGCATG  50

seq1  GACATGTTTGTACATAAACACACACACTCATGCACCCACATGCAAGTGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTTTGTACATAAACACACACACTCATGCACCCACATGCAAGTGAT  100

seq1  GGAAAGAGGCAGAAGAATGAAAATGTGTCTCTAAGCTGAAGAGTGTGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGAGGCAGAAGAATGAAAATGTGTCTCTAAGCTGAAGAGTGTGTGG  150

seq1  TCCTCAGTCTTAGAGGGACAGGAAAGGAATGGGAAAGAGAAGGAAAGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGTCTTAGAGGGACAGGAAAGGAATGGGAAAGAGAAGGAAAGCCT  200

seq1  GTTTCTAGAAAGCTGGAATTCAGAATGTGGTGTCAGGAAGCCAGGACCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTAGAAAGCTGGAATTCAGAATGTGGTGTCAGGAAGCCAGGACCCA  250

seq1  AGTCTTCCTTGCTGTGTGTGCTACTAAGAACCCACAGGCAGTCCTGTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCCTTGCTGTGTGTGCTACTAAGAACCCACAGGCAGTCCTGTCCC  300

seq1  TGAAAACACCAAAAGCTCTGCTCTCCCAGAAGCCAGCCCAGCGGACCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACACCAAAAGCTCTGCTCTCCCAGAAGCCAGCCCAGCGGACCCTG  350

seq1  GGTCCAGAACTCCTCCCTGGCAGAACTGGCATCTGCTCCAGTGCCCAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCAGAACTCCTCCCTGGCAGAACTGGCATCTGCTCCAGTGCCCAGAG  400

seq1  GTGAGGACCCAACTAGCTCTCGGATGGCTTTGCAGAGAGCTCAAGAAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGACCCAACTAGCTCTCGGATGGCTTTGCAGAGAGCTCAAGAAGGT  450

seq1  AAAGGCAGGCTTCGCAGAGCTTCATGGCTCTCTAAACGCCCCTAGAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAGGCTTCGCAGAGCTTCATGGCTCTCTAAACGCCCCTAGAGCTC  500

seq1  TCCTTGTGTGTTCTCCAATCAGGACTTAATTCCTGGTGTTAATGGGAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTGTGTTCTCCAATCAGGACTTAATTCCTGGTGTTAATGGGAGTG  550

seq1  AGTTGAAGCTGTGTTTCTGCAGTCTCCTGGGCCTTCTGACTTGGCAGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAAGCTGTGTTTCTGCAGTCTCCTGGGCCTTCTGACTTGGCAGAGC  600

seq1  AAAAGCATACCAATGCCTACGATAGCTGTGTGCCCTTCAATTTCCCACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCATACCAATGCCTACGATAGCTGTGTGCCCTTCAATTTCCCACAT  650

seq1  CCCGCATGAGCCCAGTCCCCAGAAAGCACAATGGGCTCCTGAATTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCATGAGCCCAGTCCCCAGAAAGCACAATGGGCTCCTGAATTC  696

seq1: chr7_116112456_116113502
seq2: B6Ng01-033E18.g_68_1105

seq1  GAATTCCCGTAACCTGAGTTGAATGTCCAGGATCTTTGTTGTGAGAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCGTAACCTGAGTTGAATGTCCAGGATCTTTGTTGTGAGAAAAG  50

seq1  AGACGTGACTCTCCCCCCACACCTGCCCCCGTGCTCTTCTGGTTTCCACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGTGACTCTCCCCCCACACCTGCCCCCGTGCTCTTCTGGTTTCCACG  100

seq1  TGCTTGCTGCAGCCCACGTACTAACTAATTGTCTTAAATATCAAAACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGCTGCAGCCCACGTACTAACTAATTGTCTTAAATATCAAAACAAA  150

seq1  ACAAATGCACAAACATCTCCAAGCAAGAAAATCCCAGGATTTGGCCTTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGCACAAACATCTCCAAGCAAGAAAATCCCAGGATTTGGCCTTGC  200

seq1  TTATCTAACTCCACTATTTTCAGACATCGGTTAGTCGTGGACACATTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTAACTCCACTATTTTCAGACATCGGTTAGTCGTGGACACATTTGT  250

seq1  AGTTTTTTCTATTAAAGTGGTACATTTCATTGTAGAGCGAGTTTTTTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTTTCTATTAAAGTGGTACATTTCATTGTAGAGCGAGTTTTTTAGT  300

seq1  ACATCCTTAAACTCTGCATGGCCCCAGCCTTGCCACCCTCACTCCCCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTTAAACTCTGCATGGCCCCAGCCTTGCCACCCTCACTCCCCTCT  350

seq1  GGGAACTCACCCCTGCTTCCTTCAGTGCTCACGTCTACTGCCCTGAGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACTCACCCCTGCTTCCTTCAGTGCTCACGTCTACTGCCCTGAGTAG  400

seq1  AGTGGCTCAACTGCTCTTCTGAGTGGGGGCCCTGAGTAGCAAGGACGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCTCAACTGCTCTTCTGAGTGGGGGCCCTGAGTAGCAAGGACGTAG  450

seq1  GGAAACCCTCCTGCCCCACCCCTATAACTGTCCTAATGTGCCCTTCCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACCCTCCTGCCCCACCCCTATAACTGTCCTAATGTGCCCTTCCTCC  500

seq1  ATCGGTCCATCTGGACCCTGCATCATCCCCGAGAAGAAGACACCTCAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGGTCCATCTGGACCCTGCATCATCCCCGAGAAGAAGACACCTCAAAG  550

seq1  AAGGTCTGTAGGTTACCCTGGTAACTAGAAGACAGACCATGCTGGTCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTGTAGGTTACCCTGGTAACTAGAAGACAGACCATGCTGGTCTTT  600

seq1  TGCCCTTCCTGTAAGCATGTCCAGACAGGGCAGTGGAGGCAAGCACACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTTCCTGTAAGCATGTCCAGACAGGGCAGTGGAGGCAAGCACACAG  650

seq1  CATCCCTGGCACGGGGATCTAAAGAGCAACAAAAGTGTCCTGTGTGTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTGGCACGGGGATCTAAAGAGCAACAAAAGTGTCCTGTGTGTGTG  700

seq1  CAGAAGTAGAGAAAATTACACTTGCCTGAATTCCTCCCAGGGAGAGGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTAGAGAAAATTACACTTGCCTGAATTCCTCCCAGGGAGAGGACA  750

seq1  GCATGTGGCTGACAGAGGACAATGAGGATCTCATTTTGACAGAGAGATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GCATGTGGCTGACAGAGGACAATGAGGATCTCA-TTTGACAGAGAGATGG  799

seq1  ACCACTGGAACACACATGGATGCCCGCTAACCAGCCTTCTGCAGAGGGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTGGAACACACATGGATGCCCGCTAACCAGCCTTCTGCAGAGGGTA  849

seq1  GGTCTTGTTTGTTGAAGGGCTCCCATTGTGGTAAATAGACTCTGTCAAAG  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||
seq2  GGTCTTGTTTGTTGAAGGGCT-CCATTGTGG-AAATAGATTCTGTTAAAG  897

seq1  A-GGAAGCCCTGTCACCAGAGAACACCCTCTCTCTGCCATCACCAGGTTG  949
      | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  AGGGAAGCCTTGTCACCAGAGAACA-CCTCTCTCTG-CATCACCAGGTTG  945

seq1  TACTGAATTCTTCTAAGAGCTGAACAGCATTGCTGAAAGATCAGTGTCAA  999
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |
seq2  TACTGAATTCTTCTAAGAGCTGAACA-CATTGCTGAAAGATCGGTGT-TA  993

seq1  TATGTTGCCAAGGTGCTAAGACTTGCCTCGTTATGGGGCCTGGGTCAT  1047
      ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||
seq2  TATGTTGCCAAGGTGCTAAGA-TTG-CTCG-TATGGGGCCTGGGTCAT  1038