BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-034C07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 133,202,803 - 133,308,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGsg1l, Xpo6
Upstream geneEG545999, LOC670828, 4933440M02Rik, LOC100043014, Jmjd5, Nsmce1, EG244214, Il4ra, Il21r, Gtf3c1, D430042O09Rik
Downstream geneSbk1, LOC100043495, Lat, 2210013K02Rik, Nfatc2ip, Cd19, Rabep2, Atp2a1, Sh2b1, Tufm, Atxn2l, Eif3s8, Cln3, Apob48r, Il27, Nupr1, Ccdc101, Sult1a1, LOC629029, Giyd2, Bola2, Coro1a, Snrp1c-ps1, LOC100043044, Mapk3, Gdpd3, Ypel3, Tbx6, Ppp4c, Aldoa, 1500016O10Rik, 4930451I11Rik, Doc2a, Ccdc95, Hirip3, 1110032O16Rik, Kctd13, A830007L07Rik, Sez6l2, D830044I16Rik, Cdipt, Mvp, 2900092E17Rik, Maz, Kif22, 1810010M01Rik, AI467606, Qprt, Spn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-034C07.bB6Ng01-034C07.g
ACCDH862988DH862989
length1,0321,041
definitionDH862988|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-034C07, 5' end.DH862989|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-034C07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,202,803 - 133,203,843)(133,307,923 - 133,308,964)
sequence
gaattctgatttctagtactggcatttacaaacactgtgcagtgtccccc
aggaggtggacaagtgacttgatacctcacactgccagtccacctctgtc
ccatgggaggataggatctggcttgtgaatacaccctctcggatcccagg
acacagtggtctcagccacacttcatgcctgggcatttccaatgagtttt
agagagcctttcaaatacaaaaagagacaaacagcctcctccctgagacc
agagggagcagccactggagactgtcatctgacacccacttatccctctg
cacgcgctgcaccccgaaggcttcggggtccacattcatgaacacaatct
cgtccagcactttgtgtttaaaatgccacgtgcaatgagagccccattgt
cacactagatctatagagtgacccaaataataagtcacttaaagtcttct
tcagagttttcccaggactgactacaaatgtcagcctgagcactcaagat
ctctcacaacctgatcctacagatgggaagtctacctgcctgctgcaggc
caggtgtagtggccagcctgcaagctccccgtggttaaagcttgaagcaa
agctgagagtgcttctcttggtttaccaggtcacatcagtgccaccaggc
cattctcctctagagatcattgcttgtcagtatagggctcccccgagcct
gcaaatgacattgtgacaaaaagctgtttggaactgactaagagagctag
aataggttgatttggggacacaggaggcagccctaagcaagtgattcttg
cttcatgtccacatacctgccagctcccctcggcatctgccaagtgataa
ggtcacagattggtatctcaaagtaagtgtgcacaaagagcttggaagtt
tcttgtagtttctgtggaactcagtgatgcctgtcaaatggtcaccagga
gttgagggaatggcagcctgtgtctgtacctcagaacccagaatcgaaac
gaggcttctgactcactggcagcaacctagcc
gaattctctatgtagaccaggctggccttaaaccagtggtctcaaccttc
tcaatgctgtgaccctttaatatagtttttcatttggttgtgatcccaac
caaaaattattcttgttgctaatttagaactgtaattttgctactgttat
aaatcacaatgtaaaaacatctgttttctgatggtcttaggcaactccta
tgaaaaggggtttcgacctgttggttgagaaccatgatttgaactcatgg
agatcaatcagcttgtctctgcctgcagagtgctggggtacaaggaatgt
gctaccacacctagcaagagtgactttattatgtcttatgtcctacgtgt
tcagtctttagcactaccaaaaaagaaaaaaggtcatgaagaatgaattc
cttccttgctaacttctccctcaggatggaacctagggccatacagtgct
aggcaaaccgtctactattgagctctagctcttgttagattgtttgtttg
tttgttttttggagacagggtcttgctgtatagtccaggctgccctcaaa
tttatgatcttggtgctgcctctgttttcctagtgcctagatgtctaggt
gtgtgccaccattcctagtgatggctttctttttttcactggatttctta
cctgtgctttctttcctttgaataaagaaaggagatttaagatggatttt
ctatattgtagaggatctgaccatatgtgaggagcacagaggcatttcat
atctaaaggaaagtgagtaactgagttggagagatggacatggatggctc
ctaaaagcacttacaggagaacaaggttcatttcagttcccagtattatc
actggcctcagcagtcacttggacacttgtgcatataaattcatatagtg
ggcacacctgtgcacacataaccacataacacacacatgcaccacacata
tacaacaaccttgaaggggatgttgccaagtagatcatttggcaaaaata
gtttattcaccctgaaagaattaagtgcttaggagctgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_133202803_133203843
seq2: B6Ng01-034C07.b_48_1079

seq1  GAATTCTGATTTCTAGTACTGGCATTTACAAACACTGTGCAGTGTCCCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATTTCTAGTACTGGCATTTACAAACACTGTGCAGTGTCCCCC  50

seq1  AGGAGGTGGACAAGTGACTTGATACCTCACACTGCCAGTCCACCTCTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGTGGACAAGTGACTTGATACCTCACACTGCCAGTCCACCTCTGTC  100

seq1  CCATGGGAGGATAGGATCTGGCTTGTGAATACACCCTCTCGGATCCCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGGAGGATAGGATCTGGCTTGTGAATACACCCTCTCGGATCCCAGG  150

seq1  ACACAGTGGTCTCAGCCACACTTCATGCCTGGGCATTTCCAATGAGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGTGGTCTCAGCCACACTTCATGCCTGGGCATTTCCAATGAGTTTT  200

seq1  AGAGAGCCTTTCAAATACAAAAAGAGACAAACAGCCTCCTCCCTGAGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCCTTTCAAATACAAAAAGAGACAAACAGCCTCCTCCCTGAGACC  250

seq1  AGAGGGAGCAGCCACTGGAGACTGTCATCTGACACCCACTTATCCCTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAGCAGCCACTGGAGACTGTCATCTGACACCCACTTATCCCTCTG  300

seq1  CACGCGCTGCACCCCGAAGGCTTCGGGGTCCACATTCATGAACACAATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCGCTGCACCCCGAAGGCTTCGGGGTCCACATTCATGAACACAATCT  350

seq1  CGTCCAGCACTTTGTGTTTAAAATGCCACGTGCAATGAGAGCCCCATTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCCAGCACTTTGTGTTTAAAATGCCACGTGCAATGAGAGCCCCATTGT  400

seq1  CACACTAGATCTATAGAGTGACCCAAATAATAAGTCACTTAAAGTCTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTAGATCTATAGAGTGACCCAAATAATAAGTCACTTAAAGTCTTCT  450

seq1  TCAGAGTTTTCCCAGGACTGACTACAAATGTCAGCCTGAGCACTCAAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTTTTCCCAGGACTGACTACAAATGTCAGCCTGAGCACTCAAGAT  500

seq1  CTCTCACAACCTGATCCTACAGATGGGAAGTCTACCTGCCTGCTGCAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACAACCTGATCCTACAGATGGGAAGTCTACCTGCCTGCTGCAGGC  550

seq1  CAGGTGTAGTGGCCAGCCTGCAAGCTCCCCGTGGTTAAAGCTTGAAGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTAGTGGCCAGCCTGCAAGCTCCCCGTGGTTAAAGCTTGAAGCAA  600

seq1  AGCTGAGAGTGCTTCTCTTGGTTTACCAGGTCACATCAGTGCCACCAGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGAGTGCTTCTCTTGGTTTACCAGGTCACATCAGTGCCACCAGGC  650

seq1  CATTCTCCTCTAGAGATCATTGCTTGTCAGTATAGGGCTCCCCCGAGCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCCTCTAGAGATCATTGCTTGTCAGTATAGGGCTCCCCCGAGCCT  700

seq1  GCAAATGACATTGTGACAAAAAGCTGTTTGGAACTGACCAAGAGAGGCTA  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  GCAAATGACATTGTGACAAAAAGCTGTTTGGAACTGACTAAGAGA-GCTA  749

seq1  GAATAGG-TGATTTGGGGACACAGGAGGCAG-CCTAAGCAAGTGATTCTT  798
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAATAGGTTGATTTGGGGACACAGGAGGCAGCCCTAAGCAAGTGATTCTT  799

seq1  GCTTCATGTCCACATACCTGCCAGCTCCCCTCGGCATCTGCCAAGTGATA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATGTCCACATACCTGCCAGCTCCCCTCGGCATCTGCCAAGTGATA  849

seq1  AGGTCACAGATTGGTATCTCAAAGGTAAGTGTGCACAAAGAGCCTTGAAG  898
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||
seq2  AGGTCACAGATTGGTATCTCAAA-GTAAGTGTGCACAAAGAGCTTGGAAG  898

seq1  ATTCTTGTAGCTTCTGT-GAACTCAGTGATGCCTGTCAAATGGTCACCCA  947
       ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTCTTGTAGTTTCTGTGGAACTCAGTGATGCCTGTCAAATGGTCA-CCA  947

seq1  GGAGTTGAGGGGACATGGCAGCCTGTGTCTGTAACCCCAGAACCCAGAAT  997
      |||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  GGAGTTGAGGG--AATGGCAGCCTGTGTCTGT-ACCTCAGAACCCAGAAT  994

seq1  CAGAGACGAGGGCTCCTGGAGCTCACTGGCCAGCCAACCTAGCC  1041
      | || |||| |||| |||   |||||||| ||| ||||||||||
seq2  C-GAAACGA-GGCTTCTG--ACTCACTGG-CAG-CAACCTAGCC  1032

seq1: chr7_133307923_133308964
seq2: B6Ng01-034C07.g_68_1108 (reverse)

seq1  CCCCAGCTCCTAAGCACTTAAATCTTTCAGGGTTGAATAAACCTATTCTG  50
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   || ||
seq2  CCCCAGCTCCTAAGCACTTAATTCTTTCAGGG-TGAATAAACTATTTTTG  49

seq1  CCAAATGATCTACTTGGCAACATTCACTTTCAAGGTTTGTGTATATGTGT  100
      |||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||
seq2  CCAAATGATCTACTTGGCAACA-TCCCCTTCAAGGTTGTTGTATATGTGT  98

seq1  GGTGCATGTGTGTGTTATGTGGTTATGTGTGCACAGGTGTGCCCACCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGTGCATGTGTGTGTTATGTGGTTATGTGTGCACAGGTGTGCCCA-CTAT  147

seq1  ATGAATTTATATGCACAAGTGTCCAAGTGACTGCTGAGGCCAGTGATAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTTATATGCACAAGTGTCCAAGTGACTGCTGAGGCCAGTGATAAT  197

seq1  ACTGGGAACTG-AATGAACCTTGTTCTCCTGTAAGTGCTTTTAGGAGCCA  249
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAACTGAAATGAACCTTGTTCTCCTGTAAGTGCTTTTAGGAGCCA  247

seq1  TCCATGTCCATCTCTCCAACTCAGTTACTCACTTTCCTTTAGATATGAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGTCCATCTCTCCAACTCAGTTACTCACTTTCCTTTAGATATGAAA  297

seq1  TGCCTCTGTGCTCCTCACATATGGTCAGATCCTCTACAATATAGAAAATC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGTGCTCCTCACATATGGTCAGATCCTCTACAATATAGAAAATC  347

seq1  CATCTTAAATCTCCTTTCTTTATTCAAAGGAAAGAAAGCACAGGTAAGAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTAAATCTCCTTTCTTTATTCAAAGGAAAGAAAGCACAGGTAAGAA  397

seq1  ATCCAGTG-AAAAAAGAAAGCCATCACTAGGAATGGTGGCACACACCTAG  448
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTGAAAAAAAGAAAGCCATCACTAGGAATGGTGGCACACACCTAG  447

seq1  ACATCTAGGCACTAGGAAAACAGAGGCAGCACCAAGATCATAAATTTGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTAGGCACTAGGAAAACAGAGGCAGCACCAAGATCATAAATTTGAG  497

seq1  GGCAGCCTGGACTATACAGCAAGACCCTGTCTCCAAAAAACAAACAAACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCCTGGACTATACAGCAAGACCCTGTCTCCAAAAAACAAACAAACA  547

seq1  AACAATCTAACAAGAGCTAGAGCTCAATAGTAGACGGTTTGCCTAGCACT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCTAACAAGAGCTAGAGCTCAATAGTAGACGGTTTGCCTAGCACT  597

seq1  GTATGGCCCTAGGTTCCATCCTGAGGGAGAAGTTAGCAAGGAAGGAATTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGCCCTAGGTTCCATCCTGAGGGAGAAGTTAGCAAGGAAGGAATTC  647

seq1  ATTCTTCATGACCTTTTTTCTTTTTTGGTAGTGCTAAAGACTGAACACGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTCATGACCTTTTTTCTTTTTTGGTAGTGCTAAAGACTGAACACGT  697

seq1  AGGACATAAGACATAATAAAGTCACTCTTGCTAGGTGTGGTAGCACATTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACATAAGACATAATAAAGTCACTCTTGCTAGGTGTGGTAGCACATTC  747

seq1  CTTGTACCCCAGCACTCTGCAGGCAGAGACAAGCTGATTGATCTCCATGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTACCCCAGCACTCTGCAGGCAGAGACAAGCTGATTGATCTCCATGA  797

seq1  GTTCAAATCATGGTTCTCAACCAACAGGTCGAAACCCCTTTTCATAGGAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAATCATGGTTCTCAACCAACAGGTCGAAACCCCTTTTCATAGGAG  847

seq1  TTGCCTAAGACCATCAGAAAACAGATGTTTTTACATTGTGATTTATAACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTAAGACCATCAGAAAACAGATGTTTTTACATTGTGATTTATAACA  897

seq1  GTAGCAAAATTACAGTTCTAAATTAGCAACAAGAATAATTTTTGGTTGGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAAAATTACAGTTCTAAATTAGCAACAAGAATAATTTTTGGTTGGG  947

seq1  ATCACAACCAAATGAAAAACTATATTAAAGGGTCACAGCATTGAGAAGGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAACCAAATGAAAAACTATATTAAAGGGTCACAGCATTGAGAAGGT  997

seq1  TGAGACCACTGGTTTAAGGCCAGCCTGGTCTACATAGAGAATTC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCACTGGTTTAAGGCCAGCCTGGTCTACATAGAGAATTC  1041