BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-036J05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 106,188,991 - 106,354,730
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUvrag, Dgat2
Upstream geneGdpd4, Myo7a, Capn5, Omp, B3gnt6, Phca, Tsku, LOC100040269, Gucy2d, LOC100040721, EG434215, A630091E08Rik, 2210018M11Rik, LOC100040769, Prkrir, Wnt11, LOC666978, EG666529
Downstream geneMogat2, Mtap6, Serpinh1, Gdpd5, 2810406K13Rik, Rps3, Rnu15-b, EG449630, Arrb1, EG245190, Slco2b1, Olfr520, Olfr521, Neu3, Spcs2, Xrra1, EG330602, Chrdl2, Pold3, 2610209A20Rik, Kcne3, LOC631577
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-036J05.bB6Ng01-036J05.g
ACCDH864706DH864707
length652855
definitionDH864706|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036J05, 5' end.DH864707|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036J05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(106,188,991 - 106,189,642)(106,353,869 - 106,354,730)
sequence
gaattccaccatggtggcaggccacagttgaagaaaatgtcacctcatgg
gcacctctctatttgttttacaaataaaaagagatacaggaggggttgga
gtgttagtcttcctaccaatgactcactccatgacccaacttttatctac
taggctgcaccgggtaatagtcctcctgtgccccaggagcaccactgtct
agcaaccaatcctctccagggtaggctgctgagggtacttagccaaacca
ctgcactgggatagaagaaaagcaacctgtgagcatgtaaatcccacatt
ataaacttgaaagcaacgatacaacagagctgggaagacaagtcataaaa
acccaaggagcctataaaaaagaaagagactaataacagtgggttaaagt
gagcacagataccaggtggaacgtaaattcagcaacagtatcaatgaatg
ggaactaaaatggtctggaattcagctcaacacagagctctccctgcttg
ctcacaatccttgcttcaggacccagagctgctaagaaaaagcctaagac
ctggataagcatcccactcagtgggcagagcctatcccactagatacgca
aggggaacatcaaggtgggaggggctgtgttgcggaggaggaagggtgtg
gg
gaattccatttcttgtttgtagagctctaacacagaaatgtatactcagt
tacttagttacatcagtcacatttttggtgggcacaaattcctctgctct
gcttgacacccccacagtctccttttgtcctgaaaatcctccggttaacc
ctgtggtggttagtttgcccagaagcccctatctttccatttaaccaact
tgtcctaagccatcccaggtcctccttccatgacacagacagaagcagct
tgctggtgacatctggcctctttggtccctgcagtaatcttccctgactc
ctgcacatgccctctggattcccggggtcttggttgtccacactcatcac
tgcttaccttctcagccagccactcccctgcagccgggatggacatcttc
tttgagataccttgcttccacagaacctttcacaagctgccctctctgcc
taagacacattttctacccaagtcttggtctttctcatcactgaaggcat
cacctgcctctagagagcttccttggctccactccccttgttagatgcct
ctgctgacctcccagagcctctgtttcttgccattcccgttgaccacatt
tggatgtctgtggactctgctggactgcgagccgctcagtgccagagttt
gatctgttccacactggtggccatgctcaccgatgatgacaggttcctgc
cactcttgcttcttgactaaagggcaggcaagggctgggactgggtatcc
tgaggcctagttatttcctctcaggctgtgtttctcatcttgacaaaagt
gtcccttgctgctctcaaggtgagtcatggtgggatgtgaaatgttgggt
ggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_106188991_106189642
seq2: B6Ng01-036J05.b_41_692

seq1  GAATTCCACCATGGTGGCAGGCCACAGTTGAAGAAAATGTCACCTCATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCATGGTGGCAGGCCACAGTTGAAGAAAATGTCACCTCATGG  50

seq1  GCACCTCTCTATTTGTTTTACAAATAAAAAGAGATACAGGAGGGGTTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTCTCTATTTGTTTTACAAATAAAAAGAGATACAGGAGGGGTTGGA  100

seq1  GTGTTAGTCTTCCTACCAATGACTCACTCCATGACCCAACTTTTATCTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAGTCTTCCTACCAATGACTCACTCCATGACCCAACTTTTATCTAC  150

seq1  TAGGCTGCACCGGGTAATAGTCCTCCTGTGCCCCAGGAGCACCACTGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTGCACCGGGTAATAGTCCTCCTGTGCCCCAGGAGCACCACTGTCT  200

seq1  AGCAACCAATCCTCTCCAGGGTAGGCTGCTGAGGGTACTTAGCCAAACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACCAATCCTCTCCAGGGTAGGCTGCTGAGGGTACTTAGCCAAACCA  250

seq1  CTGCACTGGGATAGAAGAAAAGCAACCTGTGAGCATGTAAATCCCACATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACTGGGATAGAAGAAAAGCAACCTGTGAGCATGTAAATCCCACATT  300

seq1  ATAAACTTGAAAGCAACGATACAACAGAGCTGGGAAGACAAGTCATAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTTGAAAGCAACGATACAACAGAGCTGGGAAGACAAGTCATAAAA  350

seq1  ACCCAAGGAGCCTATAAAAAAGAAAGAGACTAATAACAGTGGGTTAAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGGAGCCTATAAAAAAGAAAGAGACTAATAACAGTGGGTTAAAGT  400

seq1  GAGCACAGATACCAGGTGGAACGTAAATTCAGCAACAGTATCAATGAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACAGATACCAGGTGGAACGTAAATTCAGCAACAGTATCAATGAATG  450

seq1  GGAACTAAAATGGTCTGGAATTCAGCTCAACACAGAGCTCTCCCTGCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTAAAATGGTCTGGAATTCAGCTCAACACAGAGCTCTCCCTGCTTG  500

seq1  CTCACAATCCTTGCTTCAGGACCCAGAGCTGCTAAGAAAAAGCCTAAGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAATCCTTGCTTCAGGACCCAGAGCTGCTAAGAAAAAGCCTAAGAC  550

seq1  CTGGATAAGCATCCCACTCAGTGGGCAGAGCCTATCCCACTAGATACGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATAAGCATCCCACTCAGTGGGCAGAGCCTATCCCACTAGATACGCA  600

seq1  AGGGGAACATCAAGGTGGGAGGGGCTGTGTTGCGGAGGAGGAAGGGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAACATCAAGGTGGGAGGGGCTGTGTTGCGGAGGAGGAAGGGTGTG  650

seq1  GG  652
      ||
seq2  GG  652

seq1: chr7_106353869_106354730
seq2: B6Ng01-036J05.g_70_924 (reverse)

seq1  CCTCCACCCAACATTCCAC-TCCCACCATTGACTCACGCTTGAGAGCCAG  49
      ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||
seq2  CCTCCACCCAACATTTCACATCCCACCA-TGACTCAC-CTTGAGAG-CAG  47

seq1  CAAGGGACACTATTGTACAGATGAGAAACCACAGCCCTGAGAAGGAAATA  99
      ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| 
seq2  CAAGGGACACTTTTGTCAAGATGAGAAA-CACAG-CCTGAG-AGGAAAT-  93

seq1  AACTAGGCCTCAGGATACCCAGTCCCAGCCCTTGCCTGCCCTTTAGTCAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGGCCTCAGGATACCCAGTCCCAGCCCTTGCCTGCCCTTTAGTCAA  143

seq1  GAAGCAAGAGTGGGCAGGAACCTTGTCATCATCGGTGAGCATGGCCACCA  199
      ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAAGAGT-GGCAGGAACC-TGTCATCATCGGTGAGCATGGCCACCA  191

seq1  GTGTGGAACAGATC-AACTCTGGCACTGAGCGGCTCGCAGTCCAGCAGAG  248
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGAACAGATCAAACTCTGGCACTGAGCGGCTCGCAGTCCAGCAGAG  241

seq1  TCCACAGACATCCAAATGTGGTCAACGGGAATGGCAAGAAACAGAGGCTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGACATCCAAATGTGGTCAACGGGAATGGCAAGAAACAGAGGCTC  291

seq1  TGGGAGGTCAGCAGAGGCATCTAACAAGGGGAGTGGAGCCAAGGAAGCTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGTCAGCAGAGGCATCTAACAAGGGGAGTGGAGCCAAGGAAGCTC  341

seq1  TCTAGAGGCAGGTGATGCCTTCAGTGATGAGAAAGACCAAGACTTGGGTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGGCAGGTGATGCCTTCAGTGATGAGAAAGACCAAGACTTGGGTA  391

seq1  GAAAATGTGTCTTAGGCAGAGAGGGCAGCTTGTGAAAGGTTCTGTGGAAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGTGTCTTAGGCAGAGAGGGCAGCTTGTGAAAGGTTCTGTGGAAG  441

seq1  CAAGGTATCTCAAAGAAGATGTCCATCCCGGCTGCAGGGGAGTGGCTGGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTATCTCAAAGAAGATGTCCATCCCGGCTGCAGGGGAGTGGCTGGC  491

seq1  TGAGAAGGTAAGCAGTGATGAGTGTGGACAACCAAGACCCCGGGAATCCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGGTAAGCAGTGATGAGTGTGGACAACCAAGACCCCGGGAATCCA  541

seq1  GAGGGCATGTGCAGGAGTCAGGGAAGATTACTGCAGGGACCAAAGAGGCC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCATGTGCAGGAGTCAGGGAAGATTACTGCAGGGACCAAAGAGGCC  591

seq1  AGATGTCACCAGCAAGCTGCTTCTGTCTGTGTCATGGAAGGAGGACCTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTCACCAGCAAGCTGCTTCTGTCTGTGTCATGGAAGGAGGACCTGG  641

seq1  GATGGCTTAGGACAAGTTGGTTAAATGGAAAGATAGGGGCTTCTGGGCAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTTAGGACAAGTTGGTTAAATGGAAAGATAGGGGCTTCTGGGCAA  691

seq1  ACTAACCACCACAGGGTTAACCGGAGGATTTTCAGGACAAAAGGAGACTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACCACCACAGGGTTAACCGGAGGATTTTCAGGACAAAAGGAGACTG  741

seq1  TGGGGGTGTCAAGCAGAGCAGAGGAATTTGTGCCCACCAAAAATGTGACT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTGTCAAGCAGAGCAGAGGAATTTGTGCCCACCAAAAATGTGACT  791

seq1  GATGTAACTAAGTAACTGAGTATACATTTCTGTGTTAGAGCTCTACAAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAACTAAGTAACTGAGTATACATTTCTGTGTTAGAGCTCTACAAAC  841

seq1  AAGAAATGGAATTC  862
      ||||||||||||||
seq2  AAGAAATGGAATTC  855