BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-036M18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 150,747,211 - 150,869,727
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23
Upstream geneH19, Igf2, Igf2as, Ins2, EG640264, EG624121, Th, Ascl2, Tspan32, R74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4
Downstream geneOsbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-036M18.bB6Ng01-036M18.g
ACCDH864858DH864859
length316970
definitionDH864858|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036M18, 5' end.DH864859|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036M18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,747,211 - 150,747,526)(150,868,748 - 150,869,727)
sequence
aattagctaaatcctgagcttgggatacaggagaccctgtttcaacaaaa
cacaacagaataaactgctaactccactaccaacccctttacattttgtg
gggacaaggtcacactatgtagccttggctaggctgaaatgaactatgta
aacccagctggtctcaaactcagagagatatactttgtctgcatccttag
tgttgagattaaaggaatgaaccacaacactcagccaaagggtccctttt
ctgaattagtaacctacccggttaacttatttttatgatttttttttgag
gggagggggagggtgt
gaattcctgacaaaataaatgggcagagaataccagaaagatagagatag
atagatagatagatagatagatagatagatacatagatacatagatatat
agatacatagatacgtagatacatagatacatagatatagatagatagac
agacacagacagacagacggacagaagacagatacatacatacatacaca
cacacacaaacacacggacagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagatcctatctatgaaccaggaaaatcctgtggccaaggaatttctc
ctgaaggctggacaacactggctagctatgagatcagaacacagtggtaa
ggatgaatgatgatggctcccacaaatgtatagatgggccctaagggttg
atgctgtggagaatttttttccagagtgtgtaccataaaaatgcaaatat
aaagaagtgagcctcagtgctcattttttttgtaaagagctcaagtgact
agagtagtaagtatattaatatctccatttaacagatgagaaaagtgaga
catggggatggtaaatagtgaatatcctattaatccatagactctgttag
cttgtgtgatatcatggctccacacatgttctttcaatcccctataaatg
atcaatgatcactacatcaactttgggggtttttatggtttgttttttgt
ttttttgttttgttgcttgtattggctctgtttcatgtaggcatgtatca
gtatctggggtgcattaagtaatggctactcttgtagagtaacaaggctc
agttccaagcacccaacattgtttgttattcttagtcccaggaatctgct
gccttcttctggacttcctcaatcactgcccacatcatggtatatattgc
attcaagcaggcacaactctaacacaatatatcttaggtcatctgttgcg
aactagaatatagcacatta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_150747211_150747526
seq2: B6Ng01-036M18.b_49_364

seq1  AATTAGCTAAATCCTGAGCTTGGGATACAGGAGACCCTGTTTCAACAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGCTAAATCCTGAGCTTGGGATACAGGAGACCCTGTTTCAACAAAA  50

seq1  CACAACAGAATAAACTGCTAACTCCACTACCAACCCCTTTACATTTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACAGAATAAACTGCTAACTCCACTACCAACCCCTTTACATTTTGTG  100

seq1  GGGACAAGGTCACACTATGTAGCCTTGGCTAGGCTGAAATGAACTATGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAAGGTCACACTATGTAGCCTTGGCTAGGCTGAAATGAACTATGTA  150

seq1  AACCCAGCTGGTCTCAAACTCAGAGAGATATACTTTGTCTGCATCCTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAGCTGGTCTCAAACTCAGAGAGATATACTTTGTCTGCATCCTTAG  200

seq1  TGTTGAGATTAAAGGAATGAACCACAACACTCAGCCAAAGGGTCCCTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAGATTAAAGGAATGAACCACAACACTCAGCCAAAGGGTCCCTTTT  250

seq1  CTGAATTAGTAACCTACCCGGTTAACTTATTTTTATGATTTTTTTTTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTAGTAACCTACCCGGTTAACTTATTTTTATGATTTTTTTTTGAG  300

seq1  GGGAGGGGGAGGGTGT  316
      ||||||||||||||||
seq2  GGGAGGGGGAGGGTGT  316

seq1: chr7_150868748_150869727
seq2: B6Ng01-036M18.g_68_1037 (reverse)

seq1  TAATGTGCTATATTTCTAGTTCTGCAACAGATGACTTTAAAGATTTATAT  50
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||   
seq2  TAATGTGCTATA-TTCTAGTTC-GCAACAGATGACCT--AAGATATA---  43

seq1  TTGTGTTTATGAGTGTGTGCCTGCTTGAATGC-ATATATACCATG-TGTG  98
      |||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  TTGTGTT--AGAGT-TGTGCCTGCTTGAATGCAATATATACCATGATGTG  90

seq1  TGCAGTGATTGAGG-AGGCCAGAAGAAGGCAGCAGATTCCTGGGACT-AG  146
       ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGCAGTGATTGAGGAAGTCCAGAAGAAGGCAGCAGATTCCTGGGACTAAG  140

seq1  AATTACAAAC-ATGTGTGGGTGCTTGGAACTGAGCCTTGTTACTCTACAA  195
      ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACAAACAATGT-TGGGTGCTTGGAACTGAGCCTTGTTACTCTACAA  189

seq1  GAGTAGCCATTACTTAATGCACCCCAGATACTGATACATG-CTACATGAA  244
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GAGTAGCCATTACTTAATGCACCCCAGATACTGATACATGCCTACATGAA  239

seq1  ACAGAGGCAAATAACAAAGACAACAAAACAAAAAAACAAAAAACAAACCA  294
      |||||| |||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCCAA--TACAA--GCAACAAAACAAAAAAACAAAAAACAAACCA  285

seq1  TAAAAAACCCCAAAGTTTGATGTAGTGATCATTGATCATTTATAGGGGAT  344
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACCCCCAAAG-TTGATGTAGTGATCATTGATCATTTATAGGGGAT  334

seq1  TGAAAGAACATGTGTGGAGCCATGATATCACACAAGCTAACAGAGTCTAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGAACATGTGTGGAGCCATGATATCACACAAGCTAACAGAGTCTAT  384

seq1  GGATTAATAGGATATTCACTATTTACCATCCCCATGTCTCACTTTTCTCA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAATAGGATATTCACTATTTACCATCCCCATGTCTCACTTTTCTCA  434

seq1  TCTGTTAAATGGAGATATTAATATACTTACTACTCTAGTCACTTGAGCTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAAATGGAGATATTAATATACTTACTACTCTAGTCACTTGAGCTC  484

seq1  TTTACAAAAAAAATGAGCACTGAGGCTCACTTCTTTATATTTGCATTTTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAAAAAAATGAGCACTGAGGCTCACTTCTTTATATTTGCATTTTT  534

seq1  ATGGTACACACTCTGGAAAAAAATTCTCCACAGCATCAACCCTTAGGGCC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTACACACTCTGGAAAAAAATTCTCCACAGCATCAACCCTTAGGGCC  584

seq1  CATCTATACATTTGTGGGAGCCATCATCATTCATCCTTACCACTGTGTTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATACATTTGTGGGAGCCATCATCATTCATCCTTACCACTGTGTTC  634

seq1  TGATCTCATAGCTAGCCAGTGTTGTCCAGCCTTCAGGAGAAATTCCTTGG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTCATAGCTAGCCAGTGTTGTCCAGCCTTCAGGAGAAATTCCTTGG  684

seq1  CCACAGGATTTTCCTGGTTCATAGATAGGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGATTTTCCTGGTTCATAGATAGGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  734

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTGTCCGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTATGTATGTA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTGTCCGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTATGTATGTA  784

seq1  TGTATCTGTCTTCTGTCCGTCTGTCTGTCTGTGTCTGTCTATCTATCTAT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCTGTCTTCTGTCCGTCTGTCTGTCTGTGTCTGTCTATCTATCTAT  834

seq1  ATCTATGTATCTATGTATCTACGTATCTATGTATCTATATATCTATGTAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGTATCTATGTATCTACGTATCTATGTATCTATATATCTATGTAT  884

seq1  CTATGTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTATCTTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTATCTTT  934

seq1  CTGGTATTCTCTGCCCATTTATTTTGTCAGGAATTC  980
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATTCTCTGCCCATTTATTTTGTCAGGAATTC  970