BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-039A04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 72,810,692 - 72,982,751
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTarsl2, Tm2d3, LOC665241
Upstream geneApba2, 5730507A09Rik, Ndnl2, Tjp1, Gm1693, EG665234
Downstream genePcsk6, Snrpa1, H47, Chsy1, Lrrk1, Aldh1a3, Asb7, Lins2, Lass3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-039A04.bB6Ng01-039A04.g
ACCDH866404DH866405
length9651,129
definitionDH866404|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-039A04, 5' end.DH866405|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-039A04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,981,785 - 72,982,751)(72,810,692 - 72,811,830)
sequence
gaattcactctgtagaccaggctggcctggaactcagaaatccgcctgcc
tctgcctcccgagtgctgggattaaaggtgtgtgccaacacctctggttc
aaagagctcttgaggtaacatttttagaatcctgcagggcaagaccacca
tcaaagatgtcctcggcagcatcaggagccccaactctatgctgccaact
gtaaaggctcccggacttgctttcagagacctctactagggtgaagcagg
ctttcttgaccacggcacagaaaataacttcaggattcctcagtatgaag
caagttgtagacatgctttggggggctggctaggtggctcggtgggtaaa
ggtgcttgcggacaagcctggtgatatcagagtttgattccccaagaccc
acctggtagaaaaataaaactgactccaacagtttgccctctgacttctg
tgtgtgtgtgccatgctctcttgccccaaacaaacaaacaaaatacatat
aagtacaatagttttaagacagaaataggttaatatagacttaagcatga
gggttgagggagagaagagagtgtttaatttagtaaacgcacaaataagg
tttccttaccctactcccagggtctcaaagacatttctttcccctctcat
tcttcaagtagaatagcatcaacttttgagatgaatctatatttgacatc
aatgttgtcatgactgtgtaaatagtttctgaggctgtagataggtccag
gtgcgattacacttatcatttaccttcatggacaagttgttcttccagta
gggatagcttcttgctgtccttccccaagggaaggctcgtccatgtctga
gagtgggtaggcctccttgttatgcctgaatagcggaggacttgggattc
tgagctgggagtccacaaatgtcaaaggctgaccttctcttagttttcag
tgttgccattgagtg
gaattcttgtgatgtcttccttagcatctccccctgctgcctttcttcac
cctagttactctctttgtgtctcagatgctgaaatccttcttctctgagc
ccatcttccttgtgctcatttctccctaactctaattcaagggatggctt
tcttcaggagctttctaagaaaaggggcatccatgggatatgctgggtca
tcactgtggctacagctctctcttctcttccttccttccttgccctgtaa
ctctggcggcggaagtagacctctgtggagtagctcccagcctgcattcc
ttccattaaggacagccactgtgaggcagtagaacagggacaggggagtg
aggcctgaagagtcattgaaggctctggagactggtgggtgacagtggcc
ggtcactgctgatgtcttgagctatttgctggcatcagcacagtttggta
cctgaaactccaggctaggtatggtggcctttagggctctctcatctttt
atagatacgacacagtcatggctgatgatcaggccaaagcctgattgtat
gggttgctgcattggaaagcatttaaatatacaatcccagtggtttctaa
tgctaaggtaagggctgagccccttaaattcccagatacccttgtatgaa
gtaattgattttatgatgcataaaagaacttccagggacctcagctactt
ccttatgtttgtttttttctttttttaagagactcatgtagcccaggcta
accttgaacttgctatgtatccatgaatgtctggattcctgattttcctg
ctccagtgcccaagtgctgaggttacagcaaacgccactatgcccagaaa
ccccagctagttttaatcttaattttcagttatgtcattttcactctttt
ctcctctgatatttttcaatttgtgcatatataatgtatagaataattat
ggagatgatgctgtcttctgatgtttgccatctgccaagatggacaatga
ttattcggtgtcctgatttatttattatcaacttgacacagctggagtca
tctgggagagggaatctcacgaaaaaatgcttcatcaaatatctgttgtg
ggcattgatgaagtggggaagggaggccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_72981785_72982751
seq2: B6Ng01-039A04.b_47_1011 (reverse)

seq1  CACTCAATGGCAACACTGAAAACTAAAGAGAAGGTCAGCCTTTGACATTT  50
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAATGGCAACACTGAAAACT-AAGAGAAGGTCAGCCTTTGACATTT  49

seq1  GTTGGACTTCCAGCTCAGAATCCCAAGTCCTCCGCTATTCAGGCATAACA  100
      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TGGACTCCCAGCTCAGAATCCCAAGTCCTCCGCTATTCAGGCATAACA  98

seq1  AGGAGGCCTACCCACTCTCAGACATGGACGAGCCTTCCCTTGGGGAAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCCTACCCACTCTCAGACATGGACGAGCCTTCCCTTGGGGAAGGA  148

seq1  CAGCAAGAAGCTATCCCTACTGGAAGAACAACTTGTCCATGAAGGTAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGAAGCTATCCCTACTGGAAGAACAACTTGTCCATGAAGGTAAAT  198

seq1  GATAAGTGTAATCGCACCTGGACCTATCTACAGCCTCAGAAACTATTTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGTGTAATCGCACCTGGACCTATCTACAGCCTCAGAAACTATTTAC  248

seq1  ACAGTCATGACAACATTGATGTCAAATATAGATTCATCTCAAAAGTTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATGACAACATTGATGTCAAATATAGATTCATCTCAAAAGTTGAT  298

seq1  GCTATTCTACTTGAAGAATGAGAGGGGAAAGAAATGTCTTTGAGACCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCTACTTGAAGAATGAGAGGGGAAAGAAATGTCTTTGAGACCCTG  348

seq1  GGAGTAGGGTAAGGAAACCTTATTTGTGCGTTTACTAAATTAAACACTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTAGGGTAAGGAAACCTTATTTGTGCGTTTACTAAATTAAACACTCT  398

seq1  CTTCTCTCCCTCAACCCTCATGCTTAAGTCTATATTAACCTATTTCTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTCCCTCAACCCTCATGCTTAAGTCTATATTAACCTATTTCTGTC  448

seq1  TTAAAACTATTGTACTTATATGTATTTTGTTTGTTTGTTTGGGGCAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACTATTGTACTTATATGTATTTTGTTTGTTTGTTTGGGGCAAGAG  498

seq1  AGCATGGCACACACACACAGAAGTCAGAGGGCAAACTGTTGGAGTCAGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGGCACACACACACAGAAGTCAGAGGGCAAACTGTTGGAGTCAGTT  548

seq1  TTATTTTTCTACCAGGTGGGTCTTGGGGAATCAAACTCTGATATCACCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTCTACCAGGTGGGTCTTGGGGAATCAAACTCTGATATCACCAG  598

seq1  GCTTGTCCGCAAGCACCTTTACCCACCGAGCCACCTAGCCAGCCCCCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTCCGCAAGCACCTTTACCCACCGAGCCACCTAGCCAGCCCCCCAA  648

seq1  AGCATGTCTACAACTTGCTTCATACTGAGGAATCCTGAAGTTATTTTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGTCTACAACTTGCTTCATACTGAGGAATCCTGAAGTTATTTTCTG  698

seq1  TGCCGTGGTCAAGAAAGCCTGCTTCACCCTAGTAGAGGTCTCTGAAAGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGTGGTCAAGAAAGCCTGCTTCACCCTAGTAGAGGTCTCTGAAAGCA  748

seq1  AGTCCGGGAGCCTTTACAGTTGGCAGCATAGAGTTGGGGCTCCTGATGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCGGGAGCCTTTACAGTTGGCAGCATAGAGTTGGGGCTCCTGATGCT  798

seq1  GCCGAGGACATCTTTGATGGTGGTCTTGCCCTGCAGGATTCTAAAAATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGAGGACATCTTTGATGGTGGTCTTGCCCTGCAGGATTCTAAAAATGT  848

seq1  TACCTCAAGAGCTCTTTGAACCAGAGGTGTTGGCACACACCTTTAATCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCAAGAGCTCTTTGAACCAGAGGTGTTGGCACACACCTTTAATCCC  898

seq1  AGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCCAGGCCAGCCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCCAGGCCAGCCTG  948

seq1  GTCTACAGAGTGAATTC  967
      |||||||||||||||||
seq2  GTCTACAGAGTGAATTC  965

seq1: chr7_72810692_72811830
seq2: B6Ng01-039A04.g_66_1194

seq1  GAATTCTTGTGATGTCTTCCTTAGCATCTCCCCCTGCTGCCTTTCTTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTGATGTCTTCCTTAGCATCTCCCCCTGCTGCCTTTCTTCAC  50

seq1  CCTAGTTACTCTCTTTGTGTCTCAGATGCTGAAATCCTTCTTCTCTGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTACTCTCTTTGTGTCTCAGATGCTGAAATCCTTCTTCTCTGAGC  100

seq1  CCATCTTCCTTGTGCTCATTTCTCCCTAACTCTAATTCAAGGGATGGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTCCTTGTGCTCATTTCTCCCTAACTCTAATTCAAGGGATGGCTT  150

seq1  TCTTCAGGAGCTTTCTAAGAAAAGGGGCATCCATGGGATATGCTGGGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGGAGCTTTCTAAGAAAAGGGGCATCCATGGGATATGCTGGGTCA  200

seq1  TCACTGTGGCTACAGCTCTCTCTTCTCTTCCTTCCTTCCTTGCCCTGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTGGCTACAGCTCTCTCTTCTCTTCCTTCCTTCCTTGCCCTGTAA  250

seq1  CTCTGGCGGCGGAAGTAGACCTCTGTGGAGTAGCTCCCAGCCTGCATTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCGGCGGAAGTAGACCTCTGTGGAGTAGCTCCCAGCCTGCATTCC  300

seq1  TTCCATTAAGGACAGCCACTGTGAGGCAGTAGAACAGGGACAGGGGAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTAAGGACAGCCACTGTGAGGCAGTAGAACAGGGACAGGGGAGTG  350

seq1  AGGCCTGAAGAGTCATTGAAGGCTCTGGAGACTGGTGGGTGACAGTGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGAAGAGTCATTGAAGGCTCTGGAGACTGGTGGGTGACAGTGGCC  400

seq1  GGTCACTGCTGATGTCTTGAGCTATTTGCTGGCATCAGCACAGTTTGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACTGCTGATGTCTTGAGCTATTTGCTGGCATCAGCACAGTTTGGTA  450

seq1  CCTGAAACTCCAGGCTAGGTATGGTGGCCTTTAGGGCTCTCTCATCTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAACTCCAGGCTAGGTATGGTGGCCTTTAGGGCTCTCTCATCTTTT  500

seq1  ATAGATACGACACAGTCATGGCTGATGATCAGGCCAAAGCCTGATTGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATACGACACAGTCATGGCTGATGATCAGGCCAAAGCCTGATTGTAT  550

seq1  GGGTTGCTGCATTGGAAAGCATTTAAATATACAATCCCAGTGGTTTCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGCTGCATTGGAAAGCATTTAAATATACAATCCCAGTGGTTTCTAA  600

seq1  TGCTAAGGTAAGGGCTGAGCCCCTTAAATTCCCAGATACCCTTGTATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAGGTAAGGGCTGAGCCCCTTAAATTCCCAGATACCCTTGTATGAA  650

seq1  GTAATTGATTTTATGATGCATAAAAGAACTTCCAGGGACCTCAGCTACTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTGATTTTATGATGCATAAAAGAACTTCCAGGGACCTCAGCTACTT  700

seq1  CCTTATGTTTGTTTTTTTCTTTTTTTAAGAGACTCATGTAGCCCAGGCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATGTTTGTTTTTTTCTTTTTTTAAGAGACTCATGTAGCCCAGGCTA  750

seq1  ACCTTGAACTTGCTATGTATCCATGAATGTCTGGATTCCTGATTTTCCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGAACTTGCTATGTATCCATGAATGTCTGGATTCCTGATTTTCCTG  800

seq1  CTCCAGTGCCCAAGTGCTGAGGTTACAGCAAACGCCACTATGCCCAGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTGCCCAAGTGCTGAGGTTACAGCAAACGCCACTATGCCCAGAAA  850

seq1  CCCCAGCTAGTTTTAATCTTAATTTTCAGTTATGTCATTTTCACTCTTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCTAGTTTTAATCTTAATTTTCAGTTATGTCATTTTCACTCTTTT  900

seq1  CTCCTCTGATAATTTTTCAATTTGTGCCATATATAATGTATAGAATAATT  950
      |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTGAT-ATTTTTCAATTTGTG-CATATATAATGTATAGAATAATT  948

seq1  ATGGAGAATGATGCTGTCTTCTGATGTTTGCCATCTGCCAAGATGGACAA  1000
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAG-ATGATGCTGTCTTCTGATGTTTGCCATCTGCCAAGATGGACAA  997

seq1  TGATTATTCGGTGTCCTGATTTATTTATTTATCAACTTGACACAAGCTGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  TGATTATTCGGTGTCCTGATTTATTTA-TTATCAACTTGACAC-AGCTGG  1045

seq1  AGTCATCTGGGAAGAGGGAATCTCAACAGAGAAAATGCCTCCATCAGATT  1100
      ||||||||||| |||||||||||||   || |||||| || ||||| | |
seq2  AGTCATCTGGG-AGAGGGAATCTCA--CGAAAAAATG-CTTCATCA-AAT  1090

seq1  ATCCTGTTGTGGGCATTGATTGATGTGGG--AGGGAGGCCC  1139
      || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||
seq2  AT-CTGTTGTGGGCATTGA-TGAAGTGGGGAAGGGAGGCCC  1129