BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-043A20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 120,874,072 - 120,962,088
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpon1
Upstream geneTead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228
Downstream geneRras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-043A20.bB6Ng01-043A20.g
ACCDH869234DH869235
length1,0801,136
definitionDH869234|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043A20, 5' end.DH869235|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043A20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,874,072 - 120,875,163)(120,960,948 - 120,962,088)
sequence
gaattctgggtaagttggagactctatttactctgtcaatataggaatgt
gtattcattcagtaacatttactgaatggcctctctgtgttaaggttata
tgagtcactaggaatccgtcattgaacaaataaaaaggtataaatgactc
tactttccaatgaggatgtctgatagaaaatcaaatgaaaggtaagatac
ctagtgtgctgactgccacagagcacctcaggaacagagccacactttca
gtgccattgtgtgtatggcttagctgcgagataggacccgtacatttaca
caaaggagaaaagaaaaacccctttccaagtttgtttccatggcaaccat
atttcatactttcttctgtgtgtctaaacatgagcaagtttcaacctgag
ggggttagaacataataatccttgcaaactacccatgagttatgagtgct
tcagtgatcggagccgttcaccaggcattgtgtgcacacctgccctggct
ctaccggtgagtgggacctgaggtcctgccttgcatctggctaaggttga
atgtaccacagtgagtgcacgtagacatagcactacaacagaggaacatc
tgaacagtggaagggagcaaccaatagcctcaaaccctgctcttgaactt
gaggtagatatttcactttgaccttgaatgactgctggccttgtgtcaga
cagagagcaggggttgggacaggaaaatgagctagagatgaagaacagta
catatacaggacaataaagggacaatgcctgtcttagtcagggtttctat
tcctacacaaacatcatgaccaagaagcaagttggggaggaaagggttta
ttcagcttatacttccacattgctgtttatcgccaaaggaaatcagactg
gaactcaagcagtcagaagaggcatggagggatgtcacttatttgcttgc
ttccctggcttgctcagcttgctttcttatagaacccaagctacagccca
ggtatggcaccacccacaggggccgctcaccttgatcttaatgagaaaat
gccttacagctgatctcatggagcattttc
gaattctgcagaggcactagggagggcaaccctcatatacagaggaaaac
tgatccccatcaggtccttaaaaactttgggttgtctgtttctctttcct
gttccatacttatgtctgacataaacaccgccagacagataggaagctag
atccgcctcctggaggtacactttcccacggacccagcctcccagattca
ccagatcagctaggcctcgggctttatcagaatacaacttatcttgcctc
tcccaagaggcccagagtgggagttggcaaattccgctcactgtcaagtg
tggacagatggctgtctggattagaagcaccttttgtttctggtctcact
cacaagtcaaaagtgtgagggggagactagatgatggggttaccacacag
acaggaaaagtaaccgttttatttatttatttatttatttttacaatgca
tttagaagatcataagtagaagagggtgactccctttgtcttcactctag
cagaagactgtgtcatttccagcatatttgctgatctcctttcccaccca
cccttcagtccccctccaaatcctgacacttgcttgtccctgcctaactc
agaaaaaattagcaaagggtctgagctgttcccactcaccccttgcatcc
ctgcctttgccttgagaaggagctaagctgctgggagctgtctcattgga
ggtcttcattttctagaacataaaagcatgtcgggtttctctctgctttt
agagtgcaaagagcaggcatcacacatggatgcatatcttactcaatatg
gtccacatctcagaacgtctccactctctggagcaatgccaaactttgat
ctaattctatcttgacactaagaatggctcttgaatcaatgggcttatag
gaataattactgggtattggtcaacacacccagtgtggttattggctagt
ggcactgtaatttacaaaacagatcaaacactcgtagagaaggcattttg
tttgtgcccctgagagtgctgggcttgagggaaatccatgcatcagatca
tgcagcttaatagtgagatttccatgaatctgtgtggaagcgacttaatg
tagctgtggctgaaaagcgggtggtcactcttgctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120874072_120875163
seq2: B6Ng01-043A20.b_29_1108

seq1  GAATTCTGGGTAAGTTGGAGACTCTATTTACTCTGTCAATATAGGAATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGTAAGTTGGAGACTCTATTTACTCTGTCAATATAGGAATGT  50

seq1  GTATTCATTCAGTAACATTTACTGAATGGCCTCTCTGTGTTAAGGTTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCATTCAGTAACATTTACTGAATGGCCTCTCTGTGTTAAGGTTATA  100

seq1  TGAGTCACTAGGAATCCGTCATTGAACAAATAAAAAGGTATAAATGACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCACTAGGAATCCGTCATTGAACAAATAAAAAGGTATAAATGACTC  150

seq1  TACTTTCCAATGAGGATGTCTGATAGAAAATCAAATGAAAGGTAAGATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCCAATGAGGATGTCTGATAGAAAATCAAATGAAAGGTAAGATAC  200

seq1  CTAGTGTGCTGACTGCCACAGAGCACCTCAGGAACAGAGCCACACTTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGTGCTGACTGCCACAGAGCACCTCAGGAACAGAGCCACACTTTCA  250

seq1  GTGCCATTGTGTGTATGGCTTAGCTGCGAGATAGGACCCGTACATTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCATTGTGTGTATGGCTTAGCTGCGAGATAGGACCCGTACATTTACA  300

seq1  CAAAGGAGAAAAGAAAAACCCCTTTCCAAGTTTGTTTCCATGGCAACCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGAGAAAAGAAAAACCCCTTTCCAAGTTTGTTTCCATGGCAACCAT  350

seq1  ATTTCATACTTTCTTCTGTGTGTCTAAACATGAGCAAGTTTCAACCTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATACTTTCTTCTGTGTGTCTAAACATGAGCAAGTTTCAACCTGAG  400

seq1  GGGGTTAGAACATAATAATCCTTGCAAACTACCCATGAGTTATGAGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTAGAACATAATAATCCTTGCAAACTACCCATGAGTTATGAGTGCT  450

seq1  TCAGTGATCGGAGCCGTTCACCAGGCATTGTGTGCACACCTGCCCTGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGATCGGAGCCGTTCACCAGGCATTGTGTGCACACCTGCCCTGGCT  500

seq1  CTACCGGTGAGTGGGACCTGAGGTCCTGCCTTGCATCTGGCTAAGGTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCGGTGAGTGGGACCTGAGGTCCTGCCTTGCATCTGGCTAAGGTTGA  550

seq1  ATGTACCACAGTGAGTGCACGTAGACATAGCACTACAACAGAGGAACATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACCACAGTGAGTGCACGTAGACATAGCACTACAACAGAGGAACATC  600

seq1  TGAACAGTGGAAGGGAGCAACCAATAGCCTCAAACCCTGCTCTTGAACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAGTGGAAGGGAGCAACCAATAGCCTCAAACCCTGCTCTTGAACTT  650

seq1  GAGGTAGATATTTCACTTTGACCTTGAATGACTGCTGGCCTTGTGTCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGATATTTCACTTTGACCTTGAATGACTGCTGGCCTTGTGTCAGA  700

seq1  CAGAGAGCAGGGGTTGGGACAGGAAAATGAGCTAGAGATGAAGAACAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGCAGGGGTTGGGACAGGAAAATGAGCTAGAGATGAAGAACAGTA  750

seq1  CATATACAGGACAATAAAGGGACAATGCCTGTCTTAGTCAGGGTTTCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATACAGGACAATAAAGGGACAATGCCTGTCTTAGTCAGGGTTTCTAT  800

seq1  TCCTACACAAACATCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGGAAAGGGTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACACAAACATCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGGAAAGGGTTTA  850

seq1  TTCAGCTTATACTTCCACATTGCTGTTTATCGCCAAAGGAAATCAGGACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTCAGCTTATACTTCCACATTGCTGTTTATCGCCAAAGGAAATCA-GACT  899

seq1  GGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGAGGCCATGGAGGGATGTCACTTATTTGC  950
      |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTCAAGCA-GTCA-GAAGAGG-CATGGAGGGATGTCACTTATTTGC  946

seq1  TTGCTTCCCCTGGCTTGCTCAGCTTGCTTTCTTATAGAACCCAAGGCTAC  1000
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| 
seq2  TTGCTT-CCCTGGCTTGCTCAGCTTGCTTTCTTATAGAACCCAA-GCTA-  993

seq1  CAGCCCAGGTATGGCACCACCCACAAGGGGCCCGCTCACCTTGATCTTAA  1050
      |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAGGTATGGCACCACCCACA--GGGGCCGCTCACCTTGATCTTAA  1041

seq1  TTGAGAAAATGCCTTACAGCTGGATCTCATGGAGGCATTTTC  1092
       |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  -TGAGAAAATGCCTTACAGCT-GATCTCATGGA-GCATTTTC  1080

seq1: chr7_120960948_120962088
seq2: B6Ng01-043A20.g_68_1203 (reverse)

seq1  AAGCAAGAGTGACCACCCGCTTCTCAGCCACAGCTACACTCAGTCGCTT-  49
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| 
seq2  AAGCAAGAGTGACCACCCGCTTTTCAGCCACAGCTACATTAAGTCGCTTC  50

seq1  CACACAGA-TCATGGAAATCTCACTATT-AGCTGCATGATCTGATGCATG  97
      |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGATTCATGGAAATCTCACTATTAAGCTGCATGATCTGATGCATG  100

seq1  GATTTCCCCTCCAAGCCCAGCACTCTCAGGGGCACAAAACCAAAATGCCT  147
      ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  GATTTCCC--TCAAGCCCAGCACTCTCAGGGGCACAAA--CAAAATGCCT  146

seq1  TCTCTTACGAGTGTTTGATCTGTTTTGTAAATTACCAGTGCCCACTAGCC  197
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  TCTC-TACGAGTGTTTGATCTGTTTTGTAAATTA-CAGTG-CCACTAGCC  193

seq1  AATAACCACACTGGGTGTGTTTGACCAATACCCAGTAATTATTCCTATAA  247
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACCACACTGGGTGTG-TTGACCAATACCCAGTAATTATTCCTATAA  242

seq1  GCCCATTGATTCAAGAGCCATTCTTAGTGTCAAGATAGAATTAGATCAAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATTGATTCAAGAGCCATTCTTAGTGTCAAGATAGAATTAGATCAAA  292

seq1  GTTTGGCATTGCTCCAGAGAGTGGAGACGTTCTGAGATGTGGACCATATT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGCATTGCTCCAGAGAGTGGAGACGTTCTGAGATGTGGACCATATT  342

seq1  GAGTAAGATATGCATCCATGTGTGATGCCTGCTCTTTGCACTCTAAAAGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAGATATGCATCCATGTGTGATGCCTGCTCTTTGCACTCTAAAAGC  392

seq1  AGAGAGAAACCCGACATGCTTTTATGTTCTAGAAAATGAAGACCTCCAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAACCCGACATGCTTTTATGTTCTAGAAAATGAAGACCTCCAAT  442

seq1  GAGACAGCTCCCAGCAGCTTAGCTCCTTCTCAAGGCAAAGGCAGGGATGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGCTCCCAGCAGCTTAGCTCCTTCTCAAGGCAAAGGCAGGGATGC  492

seq1  AAGGGGTGAGTGGGAACAGCTCAGACCCTTTGCTAATTTTTTCTGAGTTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGTGAGTGGGAACAGCTCAGACCCTTTGCTAATTTTTTCTGAGTTA  542

seq1  GGCAGGGACAAGCAAGTGTCAGGATTTGGAGGGGGACTGAAGGGTGGGTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGGACAAGCAAGTGTCAGGATTTGGAGGGGGACTGAAGGGTGGGTG  592

seq1  GGAAAGGAGATCAGCAAATATGCTGGAAATGACACAGTCTTCTGCTAGAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGAGATCAGCAAATATGCTGGAAATGACACAGTCTTCTGCTAGAG  642

seq1  TGAAGACAAAGGGAGTCACCCTCTTCTACTTATGATCTTCTAAATGCATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGACAAAGGGAGTCACCCTCTTCTACTTATGATCTTCTAAATGCATT  692

seq1  GTAAAAATAAATAAATAAATAAATAAAACGGTTACTTTTCCTGTCTGTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAATAAATAAATAAATAAATAAAACGGTTACTTTTCCTGTCTGTGT  742

seq1  GGTAACCCCATCATCTAGTCTCCCCCTCACACTTTTGACTTGTGAGTGAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACCCCATCATCTAGTCTCCCCCTCACACTTTTGACTTGTGAGTGAG  792

seq1  ACCAGAAACAAAAGGTGCTTCTAATCCAGACAGCCATCTGTCCACACTTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAAACAAAAGGTGCTTCTAATCCAGACAGCCATCTGTCCACACTTG  842

seq1  ACAGTGAGCGGAATTTGCCAACTCCCACTCTGGGCCTCTTGGGAGAGGCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGAGCGGAATTTGCCAACTCCCACTCTGGGCCTCTTGGGAGAGGCA  892

seq1  AGATAAGTTGTATTCTGATAAAGCCCGAGGCCTAGCTGATCTGGTGAATC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAGTTGTATTCTGATAAAGCCCGAGGCCTAGCTGATCTGGTGAATC  942

seq1  TGGGAGGCTGGGTCCGTGGGAAAGTGTACCTCCAGGAGGCGGATCTAGCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGCTGGGTCCGTGGGAAAGTGTACCTCCAGGAGGCGGATCTAGCT  992

seq1  TCCTATCTGTCTGGCGGTGTTTATGTCAGACATAAGTATGGAACAGGAAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCTGTCTGGCGGTGTTTATGTCAGACATAAGTATGGAACAGGAAA  1042

seq1  GAGAAACAGACAACCCAAAGTTTTTAAGGACCTGATGGGGATCAGTTTTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACAGACAACCCAAAGTTTTTAAGGACCTGATGGGGATCAGTTTTC  1092

seq1  CTCTGTATATGAGGGTTGCCCTCCCTAGTGCCTCTGCAGAATTC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTATATGAGGGTTGCCCTCCCTAGTGCCTCTGCAGAATTC  1136