BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-043I18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 84,925,753 - 85,130,592
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneA330068G13Rik, Ntrk3, Mrpl46, Mrps11, Det1, Isg20l1, Isg20
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-043I18.bB6Ng01-043I18.g
ACCDH869575DH869576
length1,1791,120
definitionDH869575|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043I18, 5' end.DH869576|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043I18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,129,399 - 85,130,592)(84,925,753 - 84,926,881)
sequence
gaattcaaatagtagttctttctaaaaccaagactcctactttgcagaca
gcattacagcatgggtagtaaatggtcattacaaacgtcattgcccacat
ttctaaaacttgattctgaggcaggagaatacgattgatcctctatattc
aacacagttctaggcctctctgcataagatacaatctattagtatcatct
attgagtcatgctaaagtttattcaactgactctcctgagccaccacact
actgatggttctaagttctgcctcatgatagaatttcaccttgttcattt
ccggtgtcatggcagtggctagatatctaagacgctgggagttgtcttca
ggttgtgtgaggttagaaccccaagtggctacttttcatttgcatagcac
aatattaacctctggtcagagttgtttgggacattctacatgactgattg
tttcagtcctgcatgagaaaagttgattctgcttctttttttattgaagc
agatttatctaggtctatcccacccccttatttctcttaaggagatacca
ggccagttagaaagtttaagtcctggggaaaaagataagtcaaactaagc
acttcactaaagaattcttgtgcccagggagaggaagtgccagttaaaat
agttttaaacacatctttatgttgtcatgtttcttgccattttgtaagca
ggtgatatatttgtcttctgatgacaagatatttttaaaaaaaatatttg
agagtttgtacatgtttgggagataatagcaggagattgggctggagatc
tgagagaggctgtgttggagaacaagctcattggaagctggggaaagcaa
tggagggattgcagagcatgatagattacaaggatgaatgctaatataat
tgagtgtttgccatcagttttccagagtctgatggactgctaggctggaa
gcaagttgcctgacctcacagatatcttttgccctacttattgagggatc
aagagagaaatcaacatgagcagcagaggaagcctgaaagctgaaagcat
ctgagttctaggggtgtaggaaaagctttataaggtctttagcatcatac
agagatccatgggagcaggataccgcttctagaaatacagacgatacctc
gctgcatggtgtagcattcttgtctattt
tactgaatataagtccaattgccaatgtcagcccaaaattcattgtggaa
ctcaatggtttaaatgaaagcatagagaagaatcaaagagagctttgcag
gggtgacgaggtgaggggaaatgggttttaggaacaggctggaggaagat
tttagagtgattgctatgagtcatggatctctatattgttataatatcct
gactatcaactggtgactgctaatgacatttaaagagagatgatgatggc
aggtaatttccatgccacccagtgagcaattaagtactggacaccctcat
ctttggatgcttcaacatacatgctataaaaatggtgatatattccatag
aaaccacacttcacattttgaattttggtccttctttttgggataccaac
acacaatacaatattttctcagtactccatcacagcaataagccactgtt
tcccatcagtaatatgaacagaggtaaacaactgagagtgtacaataact
gtgctgctgagccagcatgcgctacaggcgatggacatttgttgtatttt
tttcctcacagttttcaattctcaatgggctttggcatatgttcccttga
gacatgtaaaggaacatctgtaatttttttatgggataggataatctaga
actgaaagacttgaaataattggtatctccttgaagatcccatactttcc
cctcatgcattgacagtgagagttcttcaggaaccagtattctgaaaagt
agaacacaaaccacagagctggaagggagtccaaagggaagatgcacata
gggcaagtagactgtcaagtttaagcttgaagaaccaaagccaagagaac
atttatacatgcaagaacaactgaaagccacttttgggcaaggcaataag
acctcttctttataactgagatgactctggaggcagagcactctctggga
gcactgtgtaggattggagtcaggaaacaccagaaaattacttatgaaag
ctacagaggtagcttagtgtagataccgattgaccagatttggattcctg
tcttaagtgtggaggcaaatgtaacaccgtttgtagtctctgacccagaa
aggtgtagctaggattatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_85129399_85130592
seq2: B6Ng01-043I18.b_41_1219 (reverse)

seq1  AAATAGACCAAGAGATGCTAACAGCATGCAGCAGAGTGATCTGTCTGTAT  50
      ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||||
seq2  AAATAGA-CAAGA-ATGCT-ACACCATGCAGC-GAGGTATC-GTCTGTAT  45

seq1  TTCTAGAAAGCAGTCATCCTTGCTCTCATTGGTCTCTGTATGATGCTAAA  100
      |||||| |||| || |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||
seq2  TTCTAG-AAGCGGT-ATCC-TGCTCCCATGGATCTCTGTATGATGCTAAA  92

seq1  GTACTTTATTAAGCTTTTTCCTTCACCCCCTAGAACCTCAGATGCTCTCA  150
      | || |||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||
seq2  G-ACCTTATAAAGC-TTTTCCTACA-CCCCTAGAA-CTCAGATGCTTTCA  138

seq1  GCTCTCAGGCTTCCTCTGCTGCTTCATGTTGATTTCTCTCTTGATCCCTT  200
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GCTTTCAGGCTTCCTCTGCTGC-TCATGTTGATTTCTCTCTTGATCCC-T  186

seq1  CAATAAGTAGGGCAAAAGATATCTGTGAGGTCAGGCAACTTGCTTCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAGTAGGGCAAAAGATATCTGTGAGGTCAGGCAACTTGCTTCCAGC  236

seq1  CTTAGCAGTCCATCAGACTCTGGAAAACTGATGGCAAACACTCAATTATA  300
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TAGCAGTCCATCAGACTCTGGAAAACTGATGGCAAACACTCAATTATA  285

seq1  TTAGCATTCATCCTTGTAATCTATCATGCTCTGCAATCCCTCCATTGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCATTCATCCTTGTAATCTATCATGCTCTGCAATCCCTCCATTGCTT  335

seq1  TCCCCAGCTTCCAATGAGCTTGTTCTCCAACACAGCCTCTCTCAGATCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGCTTCCAATGAGCTTGTTCTCCAACACAGCCTCTCTCAGATCTC  385

seq1  CAGCCCAATCTCCTGCTATTATCTCCCAAACATGTACAAACTCTCAAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAATCTCCTGCTATTATCTCCCAAACATGTACAAACTCTCAAATA  435

seq1  TTTTTTTTAAAAATATCTTGTCATCAGAAGACAAATATATCACCTGCTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTAAAAATATCTTGTCATCAGAAGACAAATATATCACCTGCTTA  485

seq1  CAAAATGGCAAGAAACATGACAACATAAAGATGTGTTTAAAACTATTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGGCAAGAAACATGACAACATAAAGATGTGTTTAAAACTATTTTA  535

seq1  ACTGGCACTTCCTCTCCCTGGGCACAAGAATTCTTTAGTGAAGTGCTTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCACTTCCTCTCCCTGGGCACAAGAATTCTTTAGTGAAGTGCTTAG  585

seq1  TTTGACTTATCTTTTTCCCCAGGACTTAAACTTTCTAACTGGCCTGGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACTTATCTTTTTCCCCAGGACTTAAACTTTCTAACTGGCCTGGTAT  635

seq1  CTCCTTAAGAGAAATAAGGGGGTGGGATAGACCTAGATAAATCTGCTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTAAGAGAAATAAGGGGGTGGGATAGACCTAGATAAATCTGCTTCA  685

seq1  ATAAAAAAAGAAGCAGAATCAACTTTTCTCATGCAGGACTGAAACAATCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAAAGAAGCAGAATCAACTTTTCTCATGCAGGACTGAAACAATCA  735

seq1  GTCATGTAGAATGTCCCAAACAACTCTGACCAGAGGTTAATATTGTGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGTAGAATGTCCCAAACAACTCTGACCAGAGGTTAATATTGTGCTA  785

seq1  TGCAAATGAAAAGTAGCCACTTGGGGTTCTAACCTCACACAACCTGAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATGAAAAGTAGCCACTTGGGGTTCTAACCTCACACAACCTGAAGA  835

seq1  CAACTCCCAGCGTCTTAGATATCTAGCCACTGCCATGACACCGGAAATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCCAGCGTCTTAGATATCTAGCCACTGCCATGACACCGGAAATGA  885

seq1  ACAAGGTGAAATTCTATCATGAGGCAGAACTTAGAACCATCAGTAGTGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTGAAATTCTATCATGAGGCAGAACTTAGAACCATCAGTAGTGTG  935

seq1  GTGGCTCAGGAGAGTCAGTTGAATAAACTTTAGCATGACTCAATAGATGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTCAGGAGAGTCAGTTGAATAAACTTTAGCATGACTCAATAGATGA  985

seq1  TACTAATAGATTGTATCTTATGCAGAGAGGCCTAGAACTGTGTTGAATAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATAGATTGTATCTTATGCAGAGAGGCCTAGAACTGTGTTGAATAT  1035

seq1  AGAGGATCAATCGTATTCTCCTGCCTCAGAATCAAGTTTTAGAAATGTGG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATCAATCGTATTCTCCTGCCTCAGAATCAAGTTTTAGAAATGTGG  1085

seq1  GCAATGACGTTTGTAATGACCATTTACTACCCATGCTGTAATGCTGTCTG  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGACGTTTGTAATGACCATTTACTACCCATGCTGTAATGCTGTCTG  1135

seq1  CAAAGTAGGAGTCTTGGTTTTAGAAAGAACTACTATTTGAATTC  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTAGGAGTCTTGGTTTTAGAAAGAACTACTATTTGAATTC  1179

seq1: chr7_84925753_84926881
seq2: B6Ng01-043I18.g_75_1194

seq1  TACTGAATATAAGTCCAATTGCCAATGTCAGCCCAAAATTCATTGTGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAATATAAGTCCAATTGCCAATGTCAGCCCAAAATTCATTGTGGAA  50

seq1  CTCAATGGTTTAAATGAAAGCATAGAGAAGAATCAAAGAGAGCTTTGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATGGTTTAAATGAAAGCATAGAGAAGAATCAAAGAGAGCTTTGCAG  100

seq1  GGGTGACGAGGTGAGGGGAAATGGGTTTTAGGAACAGGCTGGAGGAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGACGAGGTGAGGGGAAATGGGTTTTAGGAACAGGCTGGAGGAAGAT  150

seq1  TTTAGAGTGATTGCTATGAGTCATGGATCTCTATATTGTTATAATATCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAGTGATTGCTATGAGTCATGGATCTCTATATTGTTATAATATCCT  200

seq1  GACTATCAACTGGTGACTGCTAATGACATTTAAAGAGAGATGATGATGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATCAACTGGTGACTGCTAATGACATTTAAAGAGAGATGATGATGGC  250

seq1  AGGTAATTTCCATGCCACCCAGTGAGCAATTAAGTACTGGACACCCTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAATTTCCATGCCACCCAGTGAGCAATTAAGTACTGGACACCCTCAT  300

seq1  CTTTGGATGCTTCAACATACATGCTATAAAAATGGTGATATATTCCATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGATGCTTCAACATACATGCTATAAAAATGGTGATATATTCCATAG  350

seq1  AAACCACACTTCACATTTTGAATTTTGGTCCTTCTTTTTGGGATACCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCACACTTCACATTTTGAATTTTGGTCCTTCTTTTTGGGATACCAAC  400

seq1  ACACAATACAATATTTTCTCAGTACTCCATCACAGCAATAAGCCACTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAATACAATATTTTCTCAGTACTCCATCACAGCAATAAGCCACTGTT  450

seq1  TCCCATCAGTAATATGAACAGAGGTAAACAACTGAGAGTGTACAATAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATCAGTAATATGAACAGAGGTAAACAACTGAGAGTGTACAATAACT  500

seq1  GTGCTGCTGAGCCAGCATGCGCTACAGGCGATGGACATTTGTTGTATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGCTGAGCCAGCATGCGCTACAGGCGATGGACATTTGTTGTATTTT  550

seq1  TTTCCTCACAGTTTTCAATTCTCAATGGGCTTTGGCATATGTTCCCTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCACAGTTTTCAATTCTCAATGGGCTTTGGCATATGTTCCCTTGA  600

seq1  GACATGTAAAGGAACATCTGTAATTTTTTTATGGGATAGGATAATCTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTAAAGGAACATCTGTAATTTTTTTATGGGATAGGATAATCTAGA  650

seq1  ACTGAAAGACTTGAAATAATTGGTATCTCCTTGAAGATCCCATACTTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAGACTTGAAATAATTGGTATCTCCTTGAAGATCCCATACTTTCC  700

seq1  CCTCATGCATTGACAGTGAGAGTTCTTCAGGAACCAGTATTCTGAAAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATGCATTGACAGTGAGAGTTCTTCAGGAACCAGTATTCTGAAAAGT  750

seq1  AGAACACAAACCACAGAGCTGGAAGGGAGTCCAAAGGGAAGATGCACATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACACAAACCACAGAGCTGGAAGGGAGTCCAAAGGGAAGATGCACATA  800

seq1  GGGCAAGTAGACTGTCAAGTTTAAGCTTGAAGAAACCAAAGCCAAGAGAA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGTAGACTGTCAAGTTTAAGCTTGAAG-AACCAAAGCCAAGAGAA  849

seq1  CATTTATACATGCAAGAACAACTGAAAGCCACTTTTGGGCAAGGCAATAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CATTTATACATGCAAGAACAACTGAAAGCCACTTTTGGGCAAGGCAAT-A  898

seq1  AGACCTCTTCTTTATAACTGAGATGACTCTGGAGGCAGAGCACTCTCTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTCTTCTTTATAACTGAGATGACTCTGGAGGCAGAGCACTCTCTGG  948

seq1  GAGCACTGTGTTAGGATTGGAGTCAGGATACACCAGAAAAATTACTTATG  1000
      |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  GAGCACTGTG-TAGGATTGGAGTCAGGAAACACCAG-AAAATTACTTATG  996

seq1  AAAGGCTACAGAGGTAGCTTAGTGTAGAATACACGAATGACCAGGATTTG  1050
      ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||
seq2  AAA-GCTACAGAGGTAGCTTAGTGTAG-ATAC-CGATTGACCA-GATTTG  1042

seq1  GATTCCTAGTCTAAAGTGT-GAGGCAGATGTAGCAGCTGTTTGTAGTCTC  1099
      ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||
seq2  GATTCCT-GTCTTAAGTGTGGAGGCAAATGTAACA-CCGTTTGTAGTCTC  1090

seq1  TGACCCCAGAAA-GTGTAGCTAGGATTATGA  1129
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGA-CCCAGAAAGGTGTAGCTAGGATTATGA  1120