BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-044A22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,386,664 - 145,537,499
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcerg1l
Upstream geneEbf3, 9430038I01Rik, Txnl2, LOC435235
Downstream geneLOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-044A22.bB6Ng01-044A22.g
ACCDH869924DH869925
length8101,108
definitionDH869924|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044A22, 5' end.DH869925|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044A22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,386,664 - 145,387,473)(145,536,378 - 145,537,499)
sequence
gaattccatatataaacctaagcacaggtagaaccagagcatacttctta
gccaatgcctctcgggactcagagggaaacaggaagcttttggggtacct
gaaaagctctaggctccctgaaacttgtagccacagctcactgtgttcac
agatcagagttaaagtggatctgagacctaagtgtaaatagaggacatgt
gcaaacatcaggaaaaggaacagtgggtttctctaaaacctggatatggc
aagagaagatggtggataggttcctccaacttacattcatgttgtgacca
ttttgatgtccttgatgggaaacctcatggaaagttactcaattctaatc
tagaaacatgaagacaagacctctcagctaacttggctcccgctatattg
cctgcctgtgcaaatatcctcctccagctaactctaatcttagtgtctgt
gaaactgcttactatggaaaacctccccctgtagcaactggtcaaggtac
caggatgtggtttttgcctttaaaaaatctcctattctagacactcagta
ctacaattgagtcatgaatacctgagtgtagtcccagccagctggaataa
agactttcagtgggctctagactgtatctgagtggtcttctaaggtggga
ttcccataacaacagggagcaagtgtctggttgagatgcaggctaaatag
caataaaataaaaggtaggtagatcaggggtgggacaacctacttcttta
gttgtgtggtagaattcactgagactatgtaggtgtgtacatgtgtgcct
gtgtgtgtgt
gaattccaaagaggttaggctaggcaaccccacctaatggattaaatact
gtaattaatatcgctctggtgcctcctctcattggactctttaattacat
tctgcagcctattttccggcctgtggcagagtcacggttcctgcacccca
ggctggtggcagtcataccaatgagcccctccagaggagctcaggcctgg
caggcttccatcagctcgggtcctttaccaagaagttcccgagtcctcct
ttagcagaaggattagtttctgtggttgtaattgacaccgatggtcccat
agtgtggctgtgtccatggtgagagctttcaaagcttgtccttgtagcac
aggctcatcaccttctttgtcctctgggccccacctggactcttctctac
acttgtctcttccggttgtcatgtttttattactcaaagtgtctagggca
gggtgatattgggccacctctgggcagtagatgtagagcaagctgcagtc
ctcactggaggatacgttcagggcaccaggctataaccaaactcctctgt
agtctggggcacctggatcctaaacttaaaaaggccctgttatcatgtcc
cttctgcgctgtgacctcaggatcaacagtatttgggagtcttcttcagc
cagcaccttaatctgactttaccctgatcttaacctgtataagagcatgt
gcactgcactctgacacttctgagaccacagtctgggcatggccagtgag
aactgcggcagagtggctaagcctgctaaacttcctgttgctgctctccc
cagaacacctgaagcctgattgaccacctttccagactgcagagagcaga
atcctgccctcaggttcactacgcatggccactcacccaggttccacatt
gcagggaaacctctgtctctgcctttttctcttcctgtcactatttctgt
ctctctctggcctctgtctctctgtctgtctgtctctttctcctgctctc
aaatgcatgaaacccctggaggccaaggcttgacaaggtaggataactca
tctcttatccaccctggcccggcccagactatcttggcttttctatagaa
tctcatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145386664_145387473
seq2: B6Ng01-044A22.b_38_847

seq1  GAATTCCATATATAAACCTAAGCACAGGTAGAACCAGAGCATACTTCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATATATAAACCTAAGCACAGGTAGAACCAGAGCATACTTCTTA  50

seq1  GCCAATGCCTCTCGGGACTCAGAGGGAAACAGGAAGCTTTTGGGGTACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGCCTCTCGGGACTCAGAGGGAAACAGGAAGCTTTTGGGGTACCT  100

seq1  GAAAAGCTCTAGGCTCCCTGAAACTTGTAGCCACAGCTCACTGTGTTCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGCTCTAGGCTCCCTGAAACTTGTAGCCACAGCTCACTGTGTTCAC  150

seq1  AGATCAGAGTTAAAGTGGATCTGAGACCTAAGTGTAAATAGAGGACATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCAGAGTTAAAGTGGATCTGAGACCTAAGTGTAAATAGAGGACATGT  200

seq1  GCAAACATCAGGAAAAGGAACAGTGGGTTTCTCTAAAACCTGGATATGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACATCAGGAAAAGGAACAGTGGGTTTCTCTAAAACCTGGATATGGC  250

seq1  AAGAGAAGATGGTGGATAGGTTCCTCCAACTTACATTCATGTTGTGACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAGATGGTGGATAGGTTCCTCCAACTTACATTCATGTTGTGACCA  300

seq1  TTTTGATGTCCTTGATGGGAAACCTCATGGAAAGTTACTCAATTCTAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATGTCCTTGATGGGAAACCTCATGGAAAGTTACTCAATTCTAATC  350

seq1  TAGAAACATGAAGACAAGACCTCTCAGCTAACTTGGCTCCCGCTATATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAACATGAAGACAAGACCTCTCAGCTAACTTGGCTCCCGCTATATTG  400

seq1  CCTGCCTGTGCAAATATCCTCCTCCAGCTAACTCTAATCTTAGTGTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTGTGCAAATATCCTCCTCCAGCTAACTCTAATCTTAGTGTCTGT  450

seq1  GAAACTGCTTACTATGGAAAACCTCCCCCTGTAGCAACTGGTCAAGGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGCTTACTATGGAAAACCTCCCCCTGTAGCAACTGGTCAAGGTAC  500

seq1  CAGGATGTGGTTTTTGCCTTTAAAAAATCTCCTATTCTAGACACTCAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGTGGTTTTTGCCTTTAAAAAATCTCCTATTCTAGACACTCAGTA  550

seq1  CTACAATTGAGTCATGAATACCTGAGTGTAGTCCCAGCCAGCTGGAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATTGAGTCATGAATACCTGAGTGTAGTCCCAGCCAGCTGGAATAA  600

seq1  AGACTTTCAGTGGGCTCTAGACTGTATCTGAGTGGTCTTCTAAGGTGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTCAGTGGGCTCTAGACTGTATCTGAGTGGTCTTCTAAGGTGGGA  650

seq1  TTCCCATAACAACAGGGAGCAAGTGTCTGGTTGAGATGCAGGCTAAATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATAACAACAGGGAGCAAGTGTCTGGTTGAGATGCAGGCTAAATAG  700

seq1  CAATAAAATAAAAGGTAGGTAGATCAGGGGTGGGACAACCTACTTCTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAAATAAAAGGTAGGTAGATCAGGGGTGGGACAACCTACTTCTTTA  750

seq1  GTTGTGTGGTAGAATTCACTGAGACTATGTAGGTGTGTACATGTGTGCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTGGTAGAATTCACTGAGACTATGTAGGTGTGTACATGTGTGCCT  800

seq1  GTGTGTGTGT  810
      ||||||||||
seq2  GTGTGTGTGT  810

seq1: chr7_145536378_145537499
seq2: B6Ng01-044A22.g_67_1174 (reverse)

seq1  ATATGAAGAATCTATTAAGAAAAGCCAAGAAAAGGTCTGGGGCGGGGGCA  50
      ||||| ||| |||||  ||||||||||||| |  |||| |||| ||| ||
seq2  ATATG-AGATTCTAT--AGAAAAGCCAAGATA--GTCT-GGGCCGGGCCA  44

seq1  GGGGGTGGGAATAAGAGATGAGTGTATCCTACTATGTCAAAGGCTTGGGC  100
        ||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||| |
seq2  --GGGTGG--ATAAGAGATGAGT-TATCCTACCTTGTC-AAGCCTTGGCC  88

seq1  CTCAGGGGTTTCATGCATTTGAGAGGAAGGGAGAAAGAGACAGACAGACA  150
        ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGGTTTCATGCATTTGAGAGCA--GGAGAAAGAGACAGACAGACA  136

seq1  GAGAGACAGAGG-CAGAGAGAGACAGAAATAGTGACAGGAAGAGAAAAAG  199
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACAGAGGCCAGAGAGAGACAGAAATAGTGACAGGAAGAGAAAAAG  186

seq1  GCAGAGACAGAGGTTTCCCTGCAATGTGGGAACCTGGGTGAGTGGCCATG  249
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGACAGAGGTTTCCCTGCAATGT-GGAACCTGGGTGAGTGGCCATG  235

seq1  CGTAGTGAACCTGAGGGCAGGATTCTGCTCTCTGCAGTCTGGAAAGGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGTGAACCTGAGGGCAGGATTCTGCTCTCTGCAGTCTGGAAAGGTGG  285

seq1  TCAATCAGGCTTCAGGTGTTCTGGGGAGAGCAGCAACAGGAAGTTTAGCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCAGGCTTCAGGTGTTCTGGGGAGAGCAGCAACAGGAAGTTTAGCA  335

seq1  GGCTTAGCCACTCTGCCGCAGTTCTCACTGGCCATGCCCAGACTGTGGTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAGCCACTCTGCCGCAGTTCTCACTGGCCATGCCCAGACTGTGGTC  385

seq1  TCAGAAGTGTCAGAGTGCAGTGCACATGCTCTTATACAGGTTAAGATCAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGTGTCAGAGTGCAGTGCACATGCTCTTATACAGGTTAAGATCAG  435

seq1  GGTAAAGTCAGATTAAGGTGCTGGCTGAAGAAGACTCCCAAATACTGTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGTCAGATTAAGGTGCTGGCTGAAGAAGACTCCCAAATACTGTTG  485

seq1  ATCCTGAGGTCACAGCGCAGAAGGGACATGATAACAGGGCCTTTTTAAGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGAGGTCACAGCGCAGAAGGGACATGATAACAGGGCCTTTTTAAGT  535

seq1  TTAGGATCCAGGTGCCCCAGACTACAGAGGAGTTTGGTTATAGCCTGGTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGATCCAGGTGCCCCAGACTACAGAGGAGTTTGGTTATAGCCTGGTG  585

seq1  CCCTGAACGTATCCTCCAGTGAGGACTGCAGCTTGCTCTACATCTACTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAACGTATCCTCCAGTGAGGACTGCAGCTTGCTCTACATCTACTGC  635

seq1  CCAGAGGTGGCCCAATATCACCCTGCCCTAGACACTTTGAGTAATAAAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGTGGCCCAATATCACCCTGCCCTAGACACTTTGAGTAATAAAAA  685

seq1  CATGACAACCGGAAGAGACAAGTGTAGAGAAGAGTCCAGGTGGGGCCCAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACAACCGGAAGAGACAAGTGTAGAGAAGAGTCCAGGTGGGGCCCAG  735

seq1  AGGACAAAGAAGGTGATGAGCCTGTGCTACAAGGACAAGCTTTGAAAGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAAAGAAGGTGATGAGCCTGTGCTACAAGGACAAGCTTTGAAAGCT  785

seq1  CTCACCATGGACACAGCCACACTATGGGACCATCGGTGTCAATTACAACC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCATGGACACAGCCACACTATGGGACCATCGGTGTCAATTACAACC  835

seq1  ACAGAAACTAATCCTTCTGCTAAAGGAGGACTCGGGAACTTCTTGGTAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAACTAATCCTTCTGCTAAAGGAGGACTCGGGAACTTCTTGGTAAA  885

seq1  GGACCCGAGCTGATGGAAGCCTGCCAGGCCTGAGCTCCTCTGGAGGGGCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCGAGCTGATGGAAGCCTGCCAGGCCTGAGCTCCTCTGGAGGGGCT  935

seq1  CATTGGTATGACTGCCACCAGCCTGGGGTGCAGGAACCGTGACTCTGCCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGTATGACTGCCACCAGCCTGGGGTGCAGGAACCGTGACTCTGCCA  985

seq1  CAGGCCGGAAAATAGGCTGCAGAATGTAATTAAAGAGTCCAATGAGAGGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCGGAAAATAGGCTGCAGAATGTAATTAAAGAGTCCAATGAGAGGA  1035

seq1  GGCACCAGAGCGATATTAATTACAGTATTTAATCCATTAGGTGGGGTTGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCAGAGCGATATTAATTACAGTATTTAATCCATTAGGTGGGGTTGC  1085

seq1  CTAGCCTAACCTCTTTGGAATTC  1122
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCTAACCTCTTTGGAATTC  1108