BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-048P09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 81,701,563 - 81,828,742
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1810026B05Rik, EG665610, LOC244061, A830073O21Rik, St8sia2, LOC100042127, LOC100042140, LOC546979, Slco3a1, EG665308
Downstream geneEG665641, 0610006L08Rik, Sv2b, 1500012K07Rik, LOC100042171, Akap13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-048P09.bB6Ng01-048P09.g
ACCDH873363DH873364
length1,079955
definitionDH873363|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048P09, 5' end.DH873364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048P09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,827,643 - 81,828,742)(81,701,563 - 81,702,523)
sequence
gaattccagtttgatctgaatcttgattcttaaaagtctccaggaactca
tgagtctactgagaatggaggtgtggagctatatgtgtctctgtcccttc
accataacaatatataaattgttgaccacccatttgtacacttctaatgt
ctgacattcatctggctaccagggtcttatataagaaaccaagagcttta
tgtagacctagtctcttggaaaaatagactgatctgtgcagaatagtgtt
gctgcatatggaagaggctctatgaatgctgaccaggacatcaggacaga
ttcagctgcttcaagaccttgttgcatgaccctgaaggagtgtgtgacct
ttctcagctgaccactgtgtgttatgagaaccaaatcagctaacatatgc
aaagtgatttttaaattggtgtataacaaatacaaagcattagctattat
tatcattactgcatttttatacatagatgaatatttcctttataataagg
ggtatggccttgtagcaaaactcataaaacaaggcaggccagctgtattg
gtattcaaagaatttcattaggagtacaatagttctgtagcttatatcta
agctgaggttcttttttctgattggatgacttttcattagttttgttttc
acttaatggtacctaaacagaaacaaggtggaaaacagaaacaaggtgga
aaacagaaaacaaaggtggaaaacccttgctagtagctacacaggctact
ccaggtgaaagctgggatggagttgctgaagagcacccaataaatagcat
agctgcttgcctttctcatccacttctgtctttgttggtggtctctctga
tcttgactggaacctgctacaagaagtctgcattagggaaagctccagat
gactcctccctttcagctgccatgtttgctctgagactaccatgcacagt
gacagagcacagcagctcctgcactgccaccctgctcgagtgagactccc
atcctgctagaaagctgttcttagagctgtgctgcagttgagcttgtcta
ctatcatcctcttcgccctgcacagatgc
gaattccaattccttcaggactgttaattcaatagtctggtagccaaaaa
ggggggggggggcacacttgtctctgggctcgtgtgtggctctattacac
catggctgaaatccttactgtttggctgtacctttcccatctctgccacc
tctgggtatgcattgccaaccttctttggatcttttgcttcttgttcttg
atctttctcatgactctgcccttacatagtccctcctcactaaccctgat
tcctttggtgagctggaagacagggggaatctccctctgaatgagtcaca
aggctgaaggttgaaatatcggggtgtgttagtctttgagactcatttac
ataccctgcaatcacacaaataccgatgttcattttgtgcttgccttgac
caagccctcagtatagagcagcaccttaccataaccccacagcaaccttc
taaactagatggtgcacttagccttgttcagggagaaaactgagatctag
gaaggggaactaacttgacccatgccacccactcactcagtcaaggttgg
cagagccaacaaaatgtctactgtttcatcctgcagtcctaccaggaagg
tgagagtcacaccgttctccttaaaggcagaaattcagagagatgtagta
gctagcccaaagtcacacaccaaattggaacaggacttctgtctcagccc
gggctctctgcttcaaatcacttttgcctcatgtagactcaggggaaggc
aacttgactttattttagatttatacatgaactatctttaaataaattag
gcataaatgctgtcagaggtagggttctagattatgcatgtctgtttctt
ctgtcattaatagtagctgagtatgagtgccatatgcatcagagatttag
gattcacaggctagctgcaggcttacagtgtggagagattgagcacttag
tcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_81827643_81828742
seq2: B6Ng01-048P09.b_45_1123 (reverse)

seq1  GCATCTGTGCAGTGGGCCGGAGAGGGATGATTAGTTGGGACAAGCCTCAA  50
      |||||||||||   || || ||| |||||| ||||   |||||| ||| |
seq2  GCATCTGTGCA---GGGCGAAGA-GGATGA-TAGT--AGACAAG-CTC-A  41

seq1  ACTGCAGCACAGCTCTAAGAACAGCTTTTCTAGGCAGATGGGGAGTCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||| |||
seq2  ACTGCAGCACAGCTCTAAGAACAGC-TTTCTA-GCAGGATGGGAGT-CTC  88

seq1  CACCTCGAGGCAGGGGTGGGCAGGTGCAGGGAGCCCTGCTGTGCTCTGTC  150
         ||||| ||||||   |||| ||||| ||||  |||||||||||||||
seq2  --ACTCGA-GCAGGG--TGGCA-GTGCA-GGAG--CTGCTGTGCTCTGTC  129

seq1  ACTGTGCATGGTAGTCTCAGAGCAAACATGGCAGCTGAAAGGGA-GAGTC  199
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACTGTGCATGGTAGTCTCAGAGCAAACATGGCAGCTGAAAGGGAGGAGTC  179

seq1  ATCTGGAGCTTTCCCTAATGCAGACTTCTTGTAGCAGGTTCCAGTCAAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGAGCTTTCCCTAATGCAGACTTCTTGTAGCAGGTTCCAGTCAAGA  229

seq1  TCAGAGAGACCACCAACAAAGGACAGAAGTGGATGAGAAAGGCAAGCAGC  299
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGACCACCAACAAA-GACAGAAGTGGATGAGAAAGGCAAGCAGC  278

seq1  TATGCTATTTTATTGGGTGCTCTTCAGCAACTCCATCCCAGCTTTCACCT  349
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTA-TTTATTGGGTGCTCTTCAGCAACTCCATCCCAGCTTTCACCT  327

seq1  GGAGTAGCCTGTGTAGCTACTAGCAAGGGTTTTCCACC-TTGTTTTCTGT  398
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGAGTAGCCTGTGTAGCTACTAGCAAGGGTTTTCCACCTTTGTTTTCTGT  377

seq1  TTTCCACCTTGTTTCTGTTTTCCACCTTGTTTCTGTTTAGGTACCATTAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACCTTGTTTCTGTTTTCCACCTTGTTTCTGTTTAGGTACCATTAA  427

seq1  GTGAAAACAAAACTAATGAAAAGTCATCCAATCAGAAAAAAGAACCTCAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAACAAAACTAATGAAAAGTCATCCAATCAGAAAAAAGAACCTCAG  477

seq1  CTTAGATATAAGCTACAGAACTATTGTACTCCTAATGAAATTCTTTGAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGATATAAGCTACAGAACTATTGTACTCCTAATGAAATTCTTTGAAT  527

seq1  ACCAATACAGCTGGCCTGCCTTGTTTTATGAGTTTTGCTACAAGGCCATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATACAGCTGGCCTGCCTTGTTTTATGAGTTTTGCTACAAGGCCATA  577

seq1  CCCCTTATTATAAAGGAAATATTCATCTATGTATAAAAATGCAGTAATGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTATTATAAAGGAAATATTCATCTATGTATAAAAATGCAGTAATGA  627

seq1  TAATAATAGCTAATGCTTTGTATTTGTTATACACCAATTTAAAAATCACT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATAGCTAATGCTTTGTATTTGTTATACACCAATTTAAAAATCACT  677

seq1  TTGCATATGTTAGCTGATTTGGTTCTCATAACACACAGTGGTCAGCTGAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATATGTTAGCTGATTTGGTTCTCATAACACACAGTGGTCAGCTGAG  727

seq1  AAAGGTCACACACTCCTTCAGGGTCATGCAACAAGGTCTTGAAGCAGCTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCACACACTCCTTCAGGGTCATGCAACAAGGTCTTGAAGCAGCTG  777

seq1  AATCTGTCCTGATGTCCTGGTCAGCATTCATAGAGCCTCTTCCATATGCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTCCTGATGTCCTGGTCAGCATTCATAGAGCCTCTTCCATATGCA  827

seq1  GCAACACTATTCTGCACAGATCAGTCTATTTTTCCAAGAGACTAGGTCTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACACTATTCTGCACAGATCAGTCTATTTTTCCAAGAGACTAGGTCTA  877

seq1  CATAAAGCTCTTGGTTTCTTATATAAGACCCTGGTAGCCAGATGAATGTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGCTCTTGGTTTCTTATATAAGACCCTGGTAGCCAGATGAATGTC  927

seq1  AGACATTAGAAGTGTACAAATGGGTGGTCAACAATTTATATATTGTTATG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTAGAAGTGTACAAATGGGTGGTCAACAATTTATATATTGTTATG  977

seq1  GTGAAGGGACAGAGACACATATAGCTCCACACCTCCATTCTCAGTAGACT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGGGACAGAGACACATATAGCTCCACACCTCCATTCTCAGTAGACT  1027

seq1  CATGAGTTCCTGGAGACTTTTAAGAATCAAGATTCAGATCAAACTGGAAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTTCCTGGAGACTTTTAAGAATCAAGATTCAGATCAAACTGGAAT  1077

seq1  TC  1100
      ||
seq2  TC  1079

seq1: chr7_81701563_81702523
seq2: B6Ng01-048P09.g_67_1017

seq1  GAATTCCAATTCCTTCAGGACTGTTAATTCAATAGTCTGGTAGCCAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATTCCTTCAGGACTGTTAATTCAATAGTCTGGTAGCCAAAAA  50

seq1  GGGGGGGGGGGGCACACTTGTCTCTGGGCTCGTGTGTGGCTCTATTACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGGGGGGGCACACTTGTCTCTGGGCTCGTGTGTGGCTCTATTACAC  100

seq1  CATGGCTGAAATCCTTACTGTTTGGCTGTACCTTTCCCATCTCTGCCACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTGAAATCCTTACTGTTTGGCTGTACCTTTCCCATCTCTGCCACC  150

seq1  TCTGGGTATGCATTGCCAACCTTCTTTGGATCTTTTGCTTCTTGTTCTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGTATGCATTGCCAACCTTCTTTGGATCTTTTGCTTCTTGTTCTTG  200

seq1  ATCTTTCTCATGACTCTGCCCTTACATAGTCCCTCCTCACTAACCCTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTCTCATGACTCTGCCCTTACATAGTCCCTCCTCACTAACCCTGAT  250

seq1  TCCTTTGGTGAGCTGGAAGACAGGGGGAATCTCCCTCTGAATGAGTCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGGTGAGCTGGAAGACAGGGGGAATCTCCCTCTGAATGAGTCACA  300

seq1  AGGCTGAAGGTTGAAATATCGGGGTGTGTTAGTCTTTGAGACTCATTTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAAGGTTGAAATATCGGGGTGTGTTAGTCTTTGAGACTCATTTAC  350

seq1  ATACCCTGCAATCACACAAATACCGATGTTCATTTTGTGCTTGCCTTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCTGCAATCACACAAATACCGATGTTCATTTTGTGCTTGCCTTGAC  400

seq1  CAAGCCCTCAGTATAGAGCAGCACCTTACCATAACCCCACAGCAACCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCCTCAGTATAGAGCAGCACCTTACCATAACCCCACAGCAACCTTC  450

seq1  TAAACTAGATGGTGCACTTAGCCTTGTTCAGGGAGAAAACTGAGATCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTAGATGGTGCACTTAGCCTTGTTCAGGGAGAAAACTGAGATCTAG  500

seq1  GAAGGGGAACTAACTTGACCCATGCCACCCACTCACTCAGTCAAGGTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGGAACTAACTTGACCCATGCCACCCACTCACTCAGTCAAGGTTGG  550

seq1  CAGAGCCAACAAAATGTCTACTGTTTCATCCTGCAGTCCTACCAGGAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCCAACAAAATGTCTACTGTTTCATCCTGCAGTCCTACCAGGAAGG  600

seq1  TGAGAGTCACACCGTTCTCCTTAAAGGCAGAAATTCAGAGAGATGTAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGTCACACCGTTCTCCTTAAAGGCAGAAATTCAGAGAGATGTAGTA  650

seq1  GCTAGCCCAAAGTCACACACCAAATTGGAACAGGACTTCTGTCTCAGCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCCAAAGTCACACACCAAATTGGAACAGGACTTCTGTCTCAGCCC  700

seq1  GGGCTCTCTGCTTCAAATCAC-TTTGCCTCATGTAGACTCAGGGGAAGGC  749
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTCTGCTTCAAATCACTTTTGCCTCATGTAGACTCAGGGGAAGGC  750

seq1  AACTTGACTTTATTTTAGATTTATAACATGAACTATCTTTAAATAAATTA  799
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGACTTTATTTTAGATTTAT-ACATGAACTATCTTTAAATAAATTA  799

seq1  GGCATAAATGCTGTCAGAGGTAGGGTTCTAGATTATGCATGTCTGTTCTT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  GGCATAAATGCTGTCAGAGGTAGGGTTCTAGATTATGCATGTCTGTTTCT  849

seq1  CCTGTCATTAATAGTAGCTGAGTATGAGTGCCATAATGCATCAGAAGATT  899
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  TCTGTCATTAATAGTAGCTGAGTATGAGTGCCAT-ATGCATCAG-AGATT  897

seq1  TAGGAATCCACCAGGCTAGCTGCAGGCTTACAGTGTGGA-AGAAGGAATT  948
      ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||       
seq2  TAGGATTC--ACAGGCTAGCTGCAGGCTTACAGTGTGGAGAGA-------  938

seq1  TTGAGCACTTAGT  961
      |||||||||||||
seq2  TTGAGCACTTAGT  951