BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-049G09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 47,212,558 - 47,347,635
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100038955, LOC100038967, LOC620018, LOC100038914, EG668531, EG628058, EG668618, EG330513, EG434168, 9430025M13Rik, LOC100038985, 3000002G13Rik, EG215208, LOC100039133, LOC100039050, EG668540, 4930558N11Rik
Downstream geneEG628161, LOC100039094, 2900093B09Rik, 4930433I11Rik, EG233164, LOC668555
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-049G09.bB6Ng01-049G09.g
ACCDH873674DH873675
length955931
definitionDH873674|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049G09, 5' end.DH873675|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049G09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,346,672 - 47,347,635)(47,212,558 - 47,213,489)
sequence
gaattccagaaaggaaaaggtctcaggtgctggatggggaccacactagg
tcacaggcaacacttgtaaatgagagacaggggtggcagtgacctccccc
cacccccaggccagtattctacaaactaaaagaaaataaaggatgggacc
tggaaagagaatccagcacaggagccctgatctagcttctgctgcagata
ttcattcagtaactagttacaactcttaattataaaattctcatttaggg
aaactgaaaaataatttaagagaaggtgtatataatccctacttggtaag
aagagtgacaacgcttccaggaacccaagcaagatagaatgaggagtggc
cactagtgcatgggaatgacagtatttgtgatggacaacagcccaggaag
gataaatgcgggagaatgaggctctaagggacatgagcaggactgcatta
tcagagaagttctctccatcttcaaaatgactcagcagggctctcaatac
tcgcatttgtggcaaaagtaatttgccttttccacctgtgctgtgatgac
ctgctatgtggctgtttgggcaacagaagcctcaagggatcttgaatggg
tattgagccatcagaggaagatgagatgaaggtgggaagttcagtaatgg
tatttaattctgagacatatgaaaaatgggtcccttccccttgataaacc
tcactgttccccctgcaggaatacgcatgaatcattccagagccatcaca
ggaacaatgttcagtggagagcaaaggtgcacttaatgaatgcaagttgc
aaatgatcagagtgactgaaagatcagaacttcagggatggaggatagtg
taagcagggatagcctgcaaccatgttgcttactgttacactgcccatgt
gtggatggagcagtagtatgagtgagcactagcatgcttggatgttggat
gcttc
gaattctactactgagccatagccagagtcccttcctgggagattctagc
tgttacatcccaaccctgagtgcctgccagcatctcgttgagaattcatg
gaacatctttgctggcgtttgtctccactctatttcctagcatcctttgt
agtggaacccaaccatgtgactacgtctagccaataaaatgagccatcaa
caacaagcccctcctggtctaaaacgtcataacatgccatgcaatctttc
atattcctgattttctactcatttcctctttgaatgcagaggagcccaaa
caaagtatttttaaaagaaagaccaagagaccctagcagatggcagagac
ataatggtgggaacccctgatccctctgtgcccatggaatgctgcccagt
aaccatgctcactgagtagaaaccaactctatatcatgtaaagcctctga
gatttggaggggggattatttttaaaaagcagccagcctgctgtgactga
gtcctgcttgacggcatgcttgtctaaatggaagctttcttctttcttct
atgtaataaagaaggtaatggcatacactagcaagcctttgttgcaagga
ccgtgatatagctgtcccttgtgagactaggccggggcctagcaaacaca
gaaagtggatgctcacagtcaactattggatggatcacagggcccccaat
ggaggagctagagaaagtatccaaggagctaaagagatctgcaaccctgt
aggtgcaacaacaacatgaactaaccagtacccagagctcttgactctag
ctgcatatgtatcaaaagatggcctagtcggtcatcaatggaaagagagg
cccattggtcaggcaaactttatatgcctcagtacagggaacgccagagc
caaaaaataggaatgggtgggtagggaagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_47346672_47347635
seq2: B6Ng01-049G09.b_47_1001 (reverse)

seq1  GAAGCATCCAAGCATCCAAGCATGGCTAGCTGCTACACTCATTACTACTG  50
      ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||
seq2  GAAGCATCCAA-CATCCAAGCAT-GCTAG-TGCT-CACTCA-TACTACTG  45

seq1  CTCCATCCACACATGGGCAGTGTAACAGGTAAGCAACATGGTTGCAGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
seq2  CTCCATCCACACATGGGCAGTGTAACA-GTAAGCAACATGGTTGCAGG-C  93

seq1  TATCCCTGCTAACACTATCCTCCATCCCTGAAGTTCTGATCTTTCAGTCA  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCTGCTTACACTATCCTCCATCCCTGAAGTTCTGATCTTTCAGTCA  143

seq1  CTCTGATCATTTGCAACTTGCATTCATTAAGTTGCACCTTTGCTCTCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATCATTTGCAACTTGCATTCATTAAG-TGCACCTTTGCTCTCCAC  192

seq1  TGAACATTGTTCCTGTGATGGGCTCTGGAATGATTCATGCGTATTCCTGC  250
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATTGTTCCTGTGAT-GGCTCTGGAATGATTCATGCGTATTCCTGC  241

seq1  AGGGGGAACAGTGAGGTTTATCAAGGGGAAGGGACCCATTTTTCATATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGAACAGTGAGGTTTATCAAGGGGAAGGGACCCATTTTTCATATGT  291

seq1  CTCAGAATTAAATACCATTACTGAACTTCCCACCTTCATCTCATCTTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAATTAAATACCATTACTGAACTTCCCACCTTCATCTCATCTTCCT  341

seq1  CTGATGGCTCAATACCCATTCAAGATCCCTTGAGGCTTCTGTTGCCCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGCTCAATACCCATTCAAGATCCCTTGAGGCTTCTGTTGCCCAAA  391

seq1  CAGCCACATAGCAGGTCATCACAGCACAGGTGGAAAAGGCAAATTACTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACATAGCAGGTCATCACAGCACAGGTGGAAAAGGCAAATTACTTT  441

seq1  TGCCACAAATGCGAGTATTGAGAGCCCTGCTGAGTCATTTTGAAGATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACAAATGCGAGTATTGAGAGCCCTGCTGAGTCATTTTGAAGATGGA  491

seq1  GAGAACTTCTCTGATAATGCAGTCCTGCTCATGTCCCTTAGAGCCTCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTTCTCTGATAATGCAGTCCTGCTCATGTCCCTTAGAGCCTCATT  541

seq1  CTCCCGCATTTATCCTTCCTGGGCTGTTGTCCATCACAAATACTGTCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCGCATTTATCCTTCCTGGGCTGTTGTCCATCACAAATACTGTCATT  591

seq1  CCCATGCACTAGTGGCCACTCCTCATTCTATCTTGCTTGGGTTCCTGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGCACTAGTGGCCACTCCTCATTCTATCTTGCTTGGGTTCCTGGAA  641

seq1  GCGTTGTCACTCTTCTTACCAAGTAGGGATTATATACACCTTCTCTTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTTGTCACTCTTCTTACCAAGTAGGGATTATATACACCTTCTCTTAAA  691

seq1  TTATTTTTCAGTTTCCCTAAATGAGAATTTTATAATTAAGAGTTGTAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTCAGTTTCCCTAAATGAGAATTTTATAATTAAGAGTTGTAACT  741

seq1  AGTTACTGAATGAATATCTGCAGCAGAAGCTAGATCAGGGCTCCTGTGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTGAATGAATATCTGCAGCAGAAGCTAGATCAGGGCTCCTGTGCT  791

seq1  GGATTCTCTTTCCAGGTCCCATCCTTTATTTTCTTTTAGTTTGTAGAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCTCTTTCCAGGTCCCATCCTTTATTTTCTTTTAGTTTGTAGAATA  841

seq1  CTGGCCTGGGGGTGGGGGGAGGTCACTGCCACCCCTGTCTCTCATTTACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTGGGGGTGGGGGGAGGTCACTGCCACCCCTGTCTCTCATTTACA  891

seq1  AGTGTTGCCTGTGACCTAGTGTGGTCCCCATCCAGCACCTGAGACCTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGCCTGTGACCTAGTGTGGTCCCCATCCAGCACCTGAGACCTTTT  941

seq1  CCTTTCTGGAATTC  964
      ||||||||||||||
seq2  CCTTTCTGGAATTC  955

seq1: chr7_47212558_47213489
seq2: B6Ng01-049G09.g_65_995

seq1  GAATTCTACTACTGAGCCATAGCCAGAGTCCCTTCCTGGGAGATTCTAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTACTGAGCCATAGCCAGAGTCCCTTCCTGGGAGATTCTAGC  50

seq1  TGTTACATCCCAACCCTGAGTGCCTGCCAGCATCTCGTTGAGAATTCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACATCCCAACCCTGAGTGCCTGCCAGCATCTCGTTGAGAATTCATG  100

seq1  GAACATCTTTGCTGGCGTTTGTCTCCACTCTATTTCCTAGCATCCTTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATCTTTGCTGGCGTTTGTCTCCACTCTATTTCCTAGCATCCTTTGT  150

seq1  AGTGGAACCCAACCATGTGACTACGTCTAGCCAATAAAATGAGCCATCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAACCCAACCATGTGACTACGTCTAGCCAATAAAATGAGCCATCAA  200

seq1  CAACAAGCCCCTCCTGGTCTAAAACGTCATAACATGCCATGCAATCTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGCCCCTCCTGGTCTAAAACGTCATAACATGCCATGCAATCTTTC  250

seq1  ATATTCCTGATTTTCTACTCATTTCCTCTTTGAATGCAGAGGAGCCCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCTGATTTTCTACTCATTTCCTCTTTGAATGCAGAGGAGCCCAAA  300

seq1  CAAAGTATTTTTAAAAGAAAGACCAAGAGACCCTAGCAGATGGCAGAGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTATTTTTAAAAGAAAGACCAAGAGACCCTAGCAGATGGCAGAGAC  350

seq1  ATAATGGTGGGAACCCCTGATCCCTCTGTGCCCATGGAATGCTGCCCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGGTGGGAACCCCTGATCCCTCTGTGCCCATGGAATGCTGCCCAGT  400

seq1  AACCATGCTCACTGAGTAGAAACCAACTCTATATCATGTAAAGCCTCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATGCTCACTGAGTAGAAACCAACTCTATATCATGTAAAGCCTCTGA  450

seq1  GATTTGGAGGGGGGATTATTTTTAAAAAGCAGCCAGCCTGCTGTGACTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGAGGGGGGATTATTTTTAAAAAGCAGCCAGCCTGCTGTGACTGA  500

seq1  GTCCTGCTTGACGGCATGCTTGTCTAAATGGAAGCTTTCTTCTTTCTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCTTGACGGCATGCTTGTCTAAATGGAAGCTTTCTTCTTTCTTCT  550

seq1  ATGTAATAAAGAAGGTAATGGCATACACTAGCAAGCCTTTGTTGCAAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATAAAGAAGGTAATGGCATACACTAGCAAGCCTTTGTTGCAAGGA  600

seq1  CCGTGATATAGCTGTCCCTTGTGAGACTAGGCCGGGGCCTAGCAAACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGATATAGCTGTCCCTTGTGAGACTAGGCCGGGGCCTAGCAAACACA  650

seq1  G-AAGTGGATGCTCACAGTCAACTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAAT  699
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGGATGCTCACAGTCAACTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAAT  700

seq1  GGAGGAGCTAGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGCTAGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGT  750

seq1  AGGTGCAACAACAACATGAACTAACCAGTACCCCAGAGCTCTTGACTCTA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCAACAACAACATGAACTAACCAGTA-CCCAGAGCTCTTGACTCTA  799

seq1  GCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCAATGGAAAGAGAG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGTCATCAATGGAAAGAGAG  849

seq1  GCCCATTGGTCAGGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  GCCCATTGGTCAGGCAAACTTTATATGCCTCAGTACA-GGGAACGCCAGA  898

seq1  GCCAAAAAATAGGAATGGGTGGGTAGGGGAGTA  932
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCCAAAAAATAGGAATGGGTGGGTAGGGAAGTA  931