BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051E10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 109,390,569 - 109,497,059
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRhog, Stim1
Upstream geneFchsd2, Atg16l2, Stard10, Centd2, Pde2a, Art2a, EG630138, Art2b, Clpb, Phox2a, Inppl1, Folr2, Folr1, 3200002M19Rik, F930017I19Rik, 2400001E08Rik, Lrrc51, LOC667222, Numa1, Il18bp, Rnf121, Trpc2, Art5, Art1, Chrna10, Nup98, Frag1
Downstream geneRrm1, Olfr543, Olfr544, Olfr545, LOC667284, Olfr547, Olfr548-ps1, Olfr549, Trim21, LOC384699, Olfr550, Olfr551, Olfr552, Olfr553, Olfr554, LOC100040840, Olfr555, Olfr556, Trim68, Olfr557, Olfr558, Olfr33, Olfr559, Olfr78, Olfr560, Olfr561, Olfr562-ps1, Olfr563-ps1, Olfr564, Olfr565-ps1, Olfr566, GA_x5J8B7W5P47-379997-380552, Olfr567-ps1, Olfr568, Olfr569, Olfr570, Olfr571, Olfr572, Olfr573-ps1, Olfr574, Olfr575, Olfr576, Olfr577, Olfr578, Olfr1527-ps1, Olfr579-ps1, Olfr580-ps1, Olfr581-ps1, Olfr582, Olfr583, Olfr584, Olfr585, Olfr586, Olfr587-ps1, Olfr588-ps1, Olfr589, Olfr590-ps1, Olfr591, Olfr592, Olfr593, Olfr594, Olfr595-ps1, Usp17, Dub2a, LOC100041187, Olfr597, GA_x5J8B7TU1BB-380-666, Olfr598, Olfr599, Olfr600
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051E10.bB6Ng01-051E10.g
ACCDH874966DH874967
length933823
definitionDH874966|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E10, 5' end.DH874967|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,496,130 - 109,497,059)(109,390,569 - 109,391,388)
sequence
gaattcagcatagtaacttgatatctgatgtattatctagatacaatggt
gcacacttataatctgagcatttggaaggcagagccaagagaatcaccac
cagttaaccagcctagtctatatagcaagttccaggccagccaacaataa
gcaataagattccatctcaaaacaacattgccaggcagtatatgctcacc
agcacaataaaggcttgactgtggtgggcatgaccaacttcactctgatt
gcatttaaggcctgtttggggagtagagtcagggaagtaaataggcaccc
tacagctagtattgtaagcccagctaacaacccaggtctagaggtcacag
gccgagctctaaacctattgttgctatatcagcaaactgtcttctaaata
cctgtgcttatacaaatacgtagacaaaagctgttcccagcctaaatcag
agaagcctctccctatactgaagggcagtgaatgtagagaatcctggctg
cccaagatgcaaagactaagcaatgattgtgggccttataccagcccctt
taaagctcaggaacattgttgaagagagtccagaaagtttttaaaaacca
gaaaatagagtgaagggctacaaaatgctattctgtagaactggttaacc
attaattcctaaaaattgtagtagcttgcactgggcccacataagaccca
ataagtcaaggaaagggggtggggagtctcatgacacatttgttctttga
tcaataatagagtcatagggcgaaccactgtcatcagttgtatacccatt
gctgagagtaccgggttctaattgatagctctagtctcacagcttcaaag
atggctctgggtaatcttagtgaatcacaaacctaaaaaaaacaagtgaa
agatttgtgaggaggatttggggtgatgtaaac
gaattcctgggcctgaaatcttcaggtccgttcagaagcggatgaagtgg
cagtaagactatggccccctcaaatccagcaatgggctgcacagacagga
aggcaaggagggaatgttagccagcagtcacaggcccaagagaccaaaag
tgcaacaggctctctagggaggtggttatcaaccagcgatcagtaagtca
gccctcacaggagtggggagggagagtagcttccaggctggcaccggaaa
aggattatgaatgacttagtgtggcatatgatcaagagcaccagatacct
gaatctgacccactgagctcaccctgctgacctagatcctcaataaaaca
ccctaaccctaactgttaaaagtaatctaacctcacacagctacttagag
tatgggagccaggacacaaacttagctctgtgatccaaagccccaagttt
ttttcactgtatctgatggctcccagataactgtggagccttgaacaaat
tagtcatttcctttacgtcagcctcagtttcttcatctacagcaacagcc
ataacactcgccttcctggcctcatgagggtacagaatgagggtgcattc
tactttgtaaattatctcgagccatgtacattggcagcgacaagagcaaa
gccttccatccctacaggcaataagcatgacatatgcgcatgtgtgagta
ggatctagttgctccctacttactcccagttcaaacttttccccctttcc
caatacaactattctcttttcacctttatttttattatcttgttgttgtt
gttaacattagtgagtgattgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_109496130_109497059
seq2: B6Ng01-051E10.b_41_973 (reverse)

seq1  GTCTACATCACCCCAACTCCTCCTCACAAATCTTTCACTTGTTTTTTTTA  50
      || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACATCACCCCAAATCCTCCTCACAAATCTTTCACTTGTTTTTTTTA  50

seq1  GTTTTGTGATTCACTAAGAATAACCAGAGCCATCTTTGAAGCTGTGAGAC  100
      | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGTGATTCACTAAGATTACCCAGAGCCATCTTTGAAGCTGTGAGAC  100

seq1  TAGAGCTATCTATTAGAACCCGGTACTCTCAGCAATGGGTATACAACTGA  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTATCAATTAGAACCCGGTACTCTCAGCAATGGGTATACAACTGA  150

seq1  TGACAGTGGTTCGCCCTATGACTCTATTATTGATC-AAGAAC-AATGTGT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  TGACAGTGGTTCGCCCTATGACTCTATTATTGATCAAAGAACAAATGTGT  200

seq1  CATGAGACT-CCCACCCCCTTTCCTTGACTTATTGGGTCTTATGTGGGCC  247
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGACTCCCCACCCCCTTTCCTTGACTTATTGGGTCTTATGTGGGCC  250

seq1  CAGTGCAAGCTACTACAATTTTTAGGAATTAATGGTTAACCAGTTCTACA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCAAGCTACTACAATTTTTAGGAATTAATGGTTAACCAGTTCTACA  300

seq1  GAATAGCATTTTGTAGCCCTTCACTCTATTTTCTGGTTTTTAAAAACTTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGCATTTTGTAGCCCTTCACTCTATTTTCTGGTTTTTAAAAACTTT  350

seq1  CTGGACTCTCTTCAACAATGTTCCTGAGCTTTAAAGGGGCTGGTATAAGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACTCTCTTCAACAATGTTCCTGAGCTTTAAAGGGGCTGGTATAAGG  400

seq1  CCCACAATCATTGCTTAGTCTTTGCATCTTGGGCAGCCAGGATTCTCTAC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAATCATTGCTTAGTCTTTGCATCTTGGGCAGCCAGGATTCTCTAC  450

seq1  ATTCACTGCCCTTCAGTATAGGGAGAGGCTTCTCTGATTTAGGCTGGGAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTGCCCTTCAGTATAGGGAGAGGCTTCTCTGATTTAGGCTGGGAA  500

seq1  CAGCTTTTGTCTACGTATTTGTATAAGCACAGGTATTTAGAAGACAGTTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTTGTCTACGTATTTGTATAAGCACAGGTATTTAGAAGACAGTTT  550

seq1  GCTGATATAGCAACAATAGGTTTAGAGCTCGGCCTGTGACCTCTAGACCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATATAGCAACAATAGGTTTAGAGCTCGGCCTGTGACCTCTAGACCT  600

seq1  GGGTTGTTAGCTGGGCTTACAATACTAGCTGTAGGGTGCCTATTTACTTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTTAGCTGGGCTTACAATACTAGCTGTAGGGTGCCTATTTACTTC  650

seq1  CCTGACTCTACTCCCCAAACAGGCCTTAAATGCAATCAGAGTGAAGTTGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACTCTACTCCCCAAACAGGCCTTAAATGCAATCAGAGTGAAGTTGG  700

seq1  TCATGCCCACCACAGTCAAGCCTTTATTGTGCTGGTGAGCATATACTGCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCCCACCACAGTCAAGCCTTTATTGTGCTGGTGAGCATATACTGCC  750

seq1  TGGCAATGTTGTTTTGAGATGGAATCTTATTGCTTATTGTTGGCTGGCCT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAATGTTGTTTTGAGATGGAATCTTATTGCTTATTGTTGGCTGGCCT  800

seq1  GGAACTTGCTATATAGACTAGGCTGGTTAACTGGTGGTGATTCTCTTGGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTTGCTATATAGACTAGGCTGGTTAACTGGTGGTGATTCTCTTGGC  850

seq1  TCTGCCTTCCAAATGCTCAGATTATAAGTGTGCACCATTGTATCTAGATA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTTCCAAATGCTCAGATTATAAGTGTGCACCATTGTATCTAGATA  900

seq1  ATACATCAGATATCAAGTTACTATGCTGAATTC  930
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATCAGATATCAAGTTACTATGCTGAATTC  933

seq1: chr7_109390569_109391388
seq2: B6Ng01-051E10.g_68_890

seq1  GAATTCCTGGGCCTGAAATCTTCAGGTCCGTTCAGAAGCGGATGAAGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGGCCTGAAATCTTCAGGTCCGTTCAGAAGCGGATGAAGTGG  50

seq1  CAGTAAGACTATGGCCCCCTCAAATCCAGCAATGGGCTGCACAGACAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGACTATGGCCCCCTCAAATCCAGCAATGGGCTGCACAGACAGGA  100

seq1  AGGCAAGGAGGGAATGTTAGCCAGCAGTCACAGGCCCAAGAGACCAAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGGAGGGAATGTTAGCCAGCAGTCACAGGCCCAAGAGACCAAAAG  150

seq1  TGCAACAGGCTCTCTAGGGAGGTGGTTATCAACCAGCGATCAGTAAGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACAGGCTCTCTAGGGAGGTGGTTATCAACCAGCGATCAGTAAGTCA  200

seq1  GCCCTCACAGGAGTGGGGAGGGAGAGTAGCTTCCAGGCTGGCACCGGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCACAGGAGTGGGGAGGGAGAGTAGCTTCCAGGCTGGCACCGGAAA  250

seq1  AGGATTATGAATGACTTAGTGTGGCATATGATCAAGAGCACCAGATACCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTATGAATGACTTAGTGTGGCATATGATCAAGAGCACCAGATACCT  300

seq1  GAATCTGACCCACTGAGCTCACCCTGCTGACCTAGATCCTCAATAAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTGACCCACTGAGCTCACCCTGCTGACCTAGATCCTCAATAAAACA  350

seq1  CCCTAACCCTAACTGTTAAAAGTAATCTAACCTCACACAGCTACTTAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAACCCTAACTGTTAAAAGTAATCTAACCTCACACAGCTACTTAGAG  400

seq1  TATGGGAGCCAGGACACAAACTTAGCTCTGTGATCCAAAGCCCCAAGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGAGCCAGGACACAAACTTAGCTCTGTGATCCAAAGCCCCAAGTTT  450

seq1  TTTTCACTGTATCTGATGGCTCCCAGATAACTGTGGAGCCTTGAACAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCACTGTATCTGATGGCTCCCAGATAACTGTGGAGCCTTGAACAAAT  500

seq1  TAGTCATTTCCTTTACGTCAGCCTCAGTTTCTTCATCTACAGCAACAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCATTTCCTTTACGTCAGCCTCAGTTTCTTCATCTACAGCAACAGCC  550

seq1  ATAACACTCGCCTTCCTGGCCTCATGAGGGTACAGAATGAGGGTGCATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACTCGCCTTCCTGGCCTCATGAGGGTACAGAATGAGGGTGCATTC  600

seq1  TACTTTGTAAATTATCTCGTGCCATGTACATTGGCAGCGACAAGAGCAAA  650
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTGTAAATTATCTCGAGCCATGTACATTGGCAGCGACAAGAGCAAA  650

seq1  GCCTTCCATCCCTACAGGCAATAAGCATGACATATGCGCATGTGTGAGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCATCCCTACAGGCAATAAGCATGACATATGCGCATGTGTGAGTA  700

seq1  GGATCTAGTTGCTCCCTACTTACTCCCAGTTCAAAC-TTTCCCCCTTTCC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGATCTAGTTGCTCCCTACTTACTCCCAGTTCAAACTTTTCCCCCTTTCC  750

seq1  CAATACAACTATTCTCTTTTCACCTTTA-TTTTATTATCTTGTTGTTGTT  798
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAATACAACTATTCTCTTTTCACCTTTATTTTTATTATCTTGTTGTTGTT  800

seq1  GTTAGCATTAGTGAG-GATTGAA  820
      |||| |||||||||| |||||||
seq2  GTTAACATTAGTGAGTGATTGAA  823