BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-052B21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 26,535,461 - 26,673,855
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHnrpul1, Axl, LOC667950, Cyp2s1, LOC100043732, EG623475
Upstream geneCd177, Ceacam10, EG545936, LOC100043712, Lypd4, Dmrtc2, Rps19, Cd79a, Arhgef1, EG232974, Rabac1, Atp1a3, Grik5, Zfp574, Pou2f2, Dedd2, Zfp526, Gsk3a, 9130221H12Rik, Erf, Cic, Pafah1b3, EG623131, Tmem145, Megf8, Cnfn, Lipe, BC024561, LOC434148, Ceacam1, Ceacam2, LOC100043722, EG632778, 2310004L02Rik, B3gnt8, Bckdha, Exosc5, A830041P22Rik, BC028440, Tgfb1, Ccdc97
Downstream geneCyp2b10, LOC232993, EG667957, BC026762, Cyp2b13, EG668047, LOC623532, Cyp2b9, LOC667968, Cyp2a4, Nlrp9c, LOC100043195, Nlrp4a, Nlrp9a, V1re12, EG243881, LOC623830, Cyp2b19, Cyp2g1, LOC100043745, Cyp2a5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-052B21.bB6Ng01-052B21.g
ACCDH875568DH875569
length1,143968
definitionDH875568|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052B21, 5' end.DH875569|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052B21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,535,461 - 26,536,601)(26,672,888 - 26,673,855)
sequence
gaattcagaaagctctttttcactcccacactgtaagactctaaggctaa
agccttagcacccaggtctaaactctccagggtgctagcactaacaccta
gaagggtaagtgaaatccagactgtgttactgtcttcaaaaccaaacaga
actgggagggaaatggaggcagaaggaccaggaatacaaagccagtacca
gctcctttttgagtttaaggctaacttgaacaacctagtaaggatgctat
ctcaaaaataaaacaaaacaaaaataaaaacctgaactacaaacagaata
aaacctaaatctcaacctaaacaaacaaaccaaccttgccagaaggacaa
aggccagaaaaactacccaagagcgagatgcaaggtcttacttagaagag
agcaagcgtgggagccttcctacctgggtgatatacttgctgctgtggct
ccatgtctagtggtctcctatcatagcttgactcattttcttgcttgatg
actggtgtctcgtagaattggttctgtctggtaatattgtccatgacatc
ttaagattttaaaaaagaaaaaaaaatcagttagatgaatgcatttgaaa
gtacttttgtaaccaagacatcggccttcactcagattgtcggaagtcca
ccttcaaatggtaacctatttaggtagtaggtgtccccagcttcctaagg
ctatgtcctctgtgtctcaaaagtctgcaaacagatccacaactgaatac
actaaactgactgaggaagaagttctacagtttaaaagagatagtagagt
caaagaagtaagtctggcttgatttctgagcagtacatccttagagtagc
tttctactctggagcttaaacttaaagaaatggaagctactctaaggacg
taccaggcacgtcactgagctgttaacactagtctctactttaaagtata
ttgcttagagttgacttcaggcccagtcttcaaaccagcttttctgaaca
gtcccattcgtctgtgacttaaaaccctcctgcctgccctgctttttgat
tgtagattaagtctagggccctcatgcatgcatcacttagcccagcacgc
cagttatccaaaacctcaggatcatatgggtgtccaggattac
gaattcatgtgtccccagtaaatacacttaaaaaacaacctctgtactta
aggctcagggaacatcacagggatattgtgagagccagaggaccaaaaca
gctctcttctaaaaggaaagggggcgggggaaggggggaggaaactactt
tgagatttcatcttaccccagccagaatggccaacattaataaagcaaat
gacagcagatgctggtaagaattcaggagaatggaagcacttattcacag
ctgatagaaatacaaactggtctagccactatgggaatcactgtgacggt
tcttcaacaagctgaaagtagatctaccacaagactccagctacaccatt
cttggacatgtaccagaaggactctccattttactacacagacacttgct
catccatgtcccttgctgctctactggtaacatatggaaatcggaactag
ccaagatgcacatcaagtgatgaacccataatgaaaatgtgtttcattta
cacagggaaatattattcagctgttaaaaaattaaattgcgaaacatcca
ggtaactgtgaaactagaaatgatcatctaggatgacgtaacccagaccc
agaaagaccaacattgtacgttttctgttctgtgtggcttttacacttta
cgtatgagtgtttcatttagaacaccacaggttctaaagggtaagtagct
ggtaagggaccaggctgtagaatgggttctttcaagtaagggagtttaag
caagtgaaagctttcagaggcaaactattgctgatagtgctggtctgggt
ggagatggctgaaacagaggtgggggaggtcagatagagacagtatacac
tcttgtgaccccatgagagaggaacaaacagagaacacctgaactttcgc
acacatatgaactttgcaaatggcaccttggactttaaggacccacaaca
ttacttttaactggtcgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_26535461_26536601
seq2: B6Ng01-052B21.b_40_1182

seq1  GAATTCAGAAAGCTCTTTTTCACTCCCACACTGTAAGACTCTAAGGCTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAAGCTCTTTTTCACTCCCACACTGTAAGACTCTAAGGCTAA  50

seq1  AGCCTTAGCACCCAGGTCTAAACTCTCCAGGGTGCTAGCACTAACACCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTAGCACCCAGGTCTAAACTCTCCAGGGTGCTAGCACTAACACCTA  100

seq1  GAAGGGTAAGTGAAATCCAGACTGTGTTACTGTCTTCAAAACCAAACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGTAAGTGAAATCCAGACTGTGTTACTGTCTTCAAAACCAAACAGA  150

seq1  ACTGGGAGGGAAATGGAGGCAGAAGGACCAGGAATACAAAGCCAGTACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAGGGAAATGGAGGCAGAAGGACCAGGAATACAAAGCCAGTACCA  200

seq1  GCTCCTTTTTGAGTTTAAGGCTAACTTGAACAACCTAGTAAGGATGCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTTTTTGAGTTTAAGGCTAACTTGAACAACCTAGTAAGGATGCTAT  250

seq1  CTCAAAAATAAAACAAAACAAAAATAAAAACCTGAACTACAAACAGAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAAATAAAACAAAACAAAAATAAAAACCTGAACTACAAACAGAATA  300

seq1  AAACCTAAATCTCAACCTAAACAAACAAACCAACCTTGCCAGAAGGACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTAAATCTCAACCTAAACAAACAAACCAACCTTGCCAGAAGGACAA  350

seq1  AGGCCAGAAAAACTACCCAAGAGCGAGATGCAAGGTCTTACTTAGAAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGAAAAACTACCCAAGAGCGAGATGCAAGGTCTTACTTAGAAGAG  400

seq1  AGCAAGCGTGGGAGCCTTCCTACCTGGGTGATATACTTGCTGCTGTGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCGTGGGAGCCTTCCTACCTGGGTGATATACTTGCTGCTGTGGCT  450

seq1  CCATGTCTAGTGGTCTCCTATCATAGCTTGACTCATTTTCTTGCTTGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTCTAGTGGTCTCCTATCATAGCTTGACTCATTTTCTTGCTTGATG  500

seq1  ACTGGTGTCTCGTAGAATTGGTTCTGTCTGGTAATATTGTCCATGACATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTGTCTCGTAGAATTGGTTCTGTCTGGTAATATTGTCCATGACATC  550

seq1  TTAAGATTTTAAAAAAGAAAAAAAAATCAGTTAGATGAATGCATTTGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGATTTTAAAAAAGAAAAAAAAATCAGTTAGATGAATGCATTTGAAA  600

seq1  GTACTTTTGTAACCAAGACATCGGCCTTCACTCAGATTGTCGGAAGTCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTTTGTAACCAAGACATCGGCCTTCACTCAGATTGTCGGAAGTCCA  650

seq1  CCTTCAAATGGTAACCTATTTAGGTAGTAGGTGTCCCCAGCTTCCTAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAAATGGTAACCTATTTAGGTAGTAGGTGTCCCCAGCTTCCTAAGG  700

seq1  CTATGTCCTCTGTGTCTCAAAAGTCTGCAAACAGATCCACAACTGAATAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTCCTCTGTGTCTCAAAAGTCTGCAAACAGATCCACAACTGAATAC  750

seq1  ACTAAACTGACTGAGGAAGAAGTTCTACAGTTTAAAAGAGATAGTAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAACTGACTGAGGAAGAAGTTCTACAGTTTAAAAGAGATAGTAGAGT  800

seq1  CAAAGAAGTAAGTCTGGCTTGATTTCTGAGCAGTACATCCTTAGAGTAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAGTAAGTCTGGCTTGATTTCTGAGCAGTACATCCTTAGAGTAGC  850

seq1  -TTCTACTCTGGAGCTTAAACTTAAAGAAATGGAAGCTACTCTAAGGACG  899
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTACTCTGGAGCTTAAACTTAAAGAAATGGAAGCTACTCTAAGGACG  900

seq1  TACCAGGCACGTCACTGAGCTGTTAACACTAGTCTCTACTTTAAAGTATA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGCACGTCACTGAGCTGTTAACACTAGTCTCTACTTTAAAGTATA  950

seq1  TTGCTTAGAGTTGACTTCAGGGCCCAGTCTTCAAAACCAGC-TCTCTGAA  998
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||
seq2  TTGCTTAGAGTTGACTTCA-GGCCCAGTCTTC-AAACCAGCTTTTCTGAA  998

seq1  CAGTCCCATTCGTCTGTGACTTAAAACACTCCTGCCTGCCCCTGCTTTTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  CAGTCCCATTCGTCTGTGACTTAAAACCCTCCTGCCTG-CCCTGCTTTTT  1047

seq1  GA-TGTAGATTAAGTCTAGGG-CCTCATGCATGCATCAC-TAGCACAGGC  1095
      || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||
seq2  GATTGTAGATTAAGTCTAGGGCCCTCATGCATGCATCACTTAGCCCA-GC  1096

seq1  AACGCAG-TATACAAAACCTCAGGATCATAATGGTGTCCAGGATTAC  1141
      |   ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||
seq2  ACGCCAGTTATCCAAAACCTCAGGATCATATGGGTGTCCAGGATTAC  1143

seq1: chr7_26672888_26673855
seq2: B6Ng01-052B21.g_68_1035 (reverse)

seq1  CCGACCAGTTAAAGAGTAATGTTGTGGGTTCATAAAAGTCCAAGGTGGCA  50
      ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||
seq2  CCGACCAGTTAAA-AGTAATGTTGTGGG-TCCTTAAAGTCCAAGGTGCCA  48

seq1  TTTTGCCAAGTTCATATGTGTGCG-AAGGTCAGGTGTACTCTG-TTGGTC  98
       ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||
seq2  -TTTGCAAAGTTCATATGTGTGCGAAAGTTCAGGTGTTCTCTGTTTGTTC  97

seq1  CTCTCTCATGGGGTCACAAGAGTGTATACTGTCTCTATCTGACCT-CCCC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTCTCTCATGGGGTCACAAGAGTGTATACTGTCTCTATCTGACCTCCCCC  147

seq1  ACCTCTGTTTCAGCCATCTCCACCCAGACCAGCACTATCAGCAATAGTTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGTTTCAGCCATCTCCACCCAGACCAGCACTATCAGCAATAGTTT  197

seq1  GCCTCTGAAAGCTTTCACTTGCTTAAACTCCCTTACTTGAAAGAACCCAT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGAAAGCTTTCACTTGCTTAAACTCCCTTACTTGAAAGAACCCAT  247

seq1  TCTACAGCCTGGTCCCTTACCAGCTACTTACCCTTTAGAACCTGTGGTGT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACAGCCTGGTCCCTTACCAGCTACTTACCCTTTAGAACCTGTGGTGT  297

seq1  TCTAAATGAAACACTCATACGTAAAGTGTAAAAGCCACACAGAACAGAAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAATGAAACACTCATACGTAAAGTGTAAAAGCCACACAGAACAGAAA  347

seq1  ACGTACAATGTTGGTCTTTCTGGGTCTGGGTTACGTCATCCTAGATGATC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTACAATGTTGGTCTTTCTGGGTCTGGGTTACGTCATCCTAGATGATC  397

seq1  ATTTCTAGTTTCACAGTTACCTGGATGTTTCGCAATTTAATTTTTTAACA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTAGTTTCACAGTTACCTGGATGTTTCGCAATTTAATTTTTTAACA  447

seq1  GCTGAATAATATTTCCCTGTGTAAATGAAACACATTTTCATTATGGGTTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATAATATTTCCCTGTGTAAATGAAACACATTTTCATTATGGGTTC  497

seq1  ATCACTTGATGTGCATCTTGGCTAGTTCCGATTTCCATATGTTACCAGTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTGATGTGCATCTTGGCTAGTTCCGATTTCCATATGTTACCAGTA  547

seq1  GAGCAGCAAGGGACATGGATGAGCAAGTGTCTGTGTAGTAAAATGGAGAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCAAGGGACATGGATGAGCAAGTGTCTGTGTAGTAAAATGGAGAG  597

seq1  TCCTTCTGGTACATGTCCAAGAATGGTGTAGCTGGAGTCTTGTGGTAGAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCTGGTACATGTCCAAGAATGGTGTAGCTGGAGTCTTGTGGTAGAT  647

seq1  CTACTTTCAGCTTGTTGAAGAACCGTCACAGTGATTCCCATAGTGGCTAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTTCAGCTTGTTGAAGAACCGTCACAGTGATTCCCATAGTGGCTAG  697

seq1  ACCAGTTTGTATTTCTATCAGCTGTGAATAAGTGCTTCCATTCTCCTGAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTTTGTATTTCTATCAGCTGTGAATAAGTGCTTCCATTCTCCTGAA  747

seq1  TTCTTACCAGCATCTGCTGTCATTTGCTTTATTAATGTTGGCCATTCTGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTACCAGCATCTGCTGTCATTTGCTTTATTAATGTTGGCCATTCTGG  797

seq1  CTGGGGTAAGATGAAATCTCAAAGTAGTTTCCTCCCCCCTTCCCCCGCCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTAAGATGAAATCTCAAAGTAGTTTCCTCCCCCCTTCCCCCGCCC  847

seq1  CCTTTCCTTTTAGAAGAGAGCTGTTTTGGTCCTCTGGCTCTCACAATATC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCTTTTAGAAGAGAGCTGTTTTGGTCCTCTGGCTCTCACAATATC  897

seq1  CCTGTGATGTTCCCTGAGCCTTAAGTACAGAGGTTGTTTTTTAAGTGTAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGATGTTCCCTGAGCCTTAAGTACAGAGGTTGTTTTTTAAGTGTAT  947

seq1  TTACTGGGGACACATGAATTC  968
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGGGACACATGAATTC  968