BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-052C05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 76,545,103 - 76,695,457
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041800, EG384639, Arrdc4, LOC384741
Downstream geneEG665410, Nr2f2, LOC100042833, B130024G19Rik, LOC100042838, LOC665486, LOC100041957
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-052C05.bB6Ng01-052C05.g
ACCDH875580DH875581
length1,139978
definitionDH875580|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052C05, 5' end.DH875581|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052C05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,694,306 - 76,695,457)(76,545,103 - 76,546,084)
sequence
gaattcaaggcagctgttcacatttctctgcagatagaaaacagaaaggt
gaatgttagtgttcaatgggttatatccttcccccactcctcttaactca
gtctggatctttatcccatgaaacagtgccattcaaattgagggtatttc
tcctctagttctcaagtaaacctcgctggccacagccagagtagtttttc
ctaagtggttcttagtcctggcaaagattaacagttcaaagtgtcctttc
tcccctgagaacatggcccctcagccatactctgatgtttttctttattg
cactttcattggagatatgtccctatcacatccttttcaagacagtggaa
aacatcatggcagagaatctcaaagggatgccctaaacacacctactcat
tgttgagtcagaataccaaactagcaaattgtattacaggggaagcaagc
accctgggctggtcctttagtagattcccatttaaaatttaacaaacttt
agaacagcccattgtaatgcatgattgtgtatttcaaatttgaaaaatca
ttatcacaaatacatttagtgaattaataatgtgtggtttggatctctca
ggcttcatggatgttcagttttctataatgggggaagaaagtttgagtga
tacactggttttctttgttttgcagattgcatcacaagatatatgtagca
gtgtgccagtttcattaaccgaaagttgtacaccctcctgtgatatctcc
actggacctttattctgtgtgatgcctttttgtgtttctccgataagaac
atcagctatattggacagaagcccaccctaatgaaatcatttccccttta
tcacacctttaaatgttcagttgtactcacaatggaaactaacgcttctt
aacacacaggagttatagagttcagtccagaaacaccccacctcttattt
cattgttacagcaaagcatatcagttatcatcatagctagtgtgtctttg
gaactagccacatattacttccattaaaaccatctcgaagaacttctaga
ctatcagcccacaaagaaagaaaagataaagtgaagagtgtgagatggtc
ctcttaacattacttaatatgaaatgtacagcattcaaa
gaattcttggcactatgaggaaagcttcatgttcaaggtttctgaaaaag
agaaatggtacaccatcatgattattcattttatgtgttaacttgactca
gtcatagaatatttagatacttgtttaaatcttactctgcattaaaagag
agagaggatatttttctatgtgagattaagatttgaattggtagactgaa
taacacaagcagttcaatccaaagcaggttttattccaagctggagaaag
aaagtctgggtatagtgaaagtccaatgtctacaagccaggttgttctgt
cttctaactcagaactgggctagaaattatacctttagttctcctgggta
accagccaatcaactgcacaatttgatttttcctttctctatagtcaaag
taacaaattctttaaagagagatgttaatgatagacagatgatggatata
gataaatacctacagatagataaatagataaaacaataagcagacataaa
tggaaaaagataatagatcatagataaaggtacttagataaggtagatat
agattacatagagagatttaaacatacatacatacatacattcatacata
catacacagataatgtatatgtatcttactggctctgttttccttgagga
cctagaatattgtaggtcttttaggtcttaattccttatctttccacaca
gagggtccccatatgtaccccagtgttctaataccatttacctgacccta
ggatattcgatcaaaatcaggtgagcataactgaccttcccaaatagccg
gtgtatacattaatggagcagaaaatggatagaaaaatataataaaaaat
atcgtgaccattagcaaatggtagatgaaaactaagaataaatacatggc
aaagttttgcaagtgaacttaggtaaataaaactgtatagctgtatattg
tgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_76694306_76695457
seq2: B6Ng01-052C05.b_44_1182 (reverse)

seq1  TTTGAAATGCTGT-CATTTCATATTAAAAGGAAATGTTATAGAGGAACAT  49
      |||| |||||||| |||||||||||||   | ||||||| |||||| |||
seq2  TTTG-AATGCTGTACATTTCATATTAA---GTAATGTTA-AGAGGACCAT  45

seq1  CTCTACACTCTTTCACTTTATCTTTTTCTTCTCCTTGGTGGGCATGATGG  99
      ||| |||||| |||||||||||||||  ||   ||| |||||| ||||  
seq2  CTC-ACACTC-TTCACTTTATCTTTTCTTT---CTTTGTGGGC-TGAT-A  88

seq1  GTCTAGAAGTTCTTCGAAGATGGTTTTAATGGAAGTAAATATGTGGCTAG  149
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GTCTAGAAGTTCTTCG-AGATGGTTTTAATGGAAGT-AATATGTGGCTAG  136

seq1  TTCCAAAGACACACTAGCTATGATGATAACTGATATGCTTTGCTGTAACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAAGACACACTAGCTATGATGATAACTGATATGCTTTGCTGTAACA  186

seq1  ATGAAATAAGAGGTGGGGTGTTTCTGGACTGAACTCTATAACCTCCTGTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATGAAATAAGAGGTGGGGTGTTTCTGGACTGAACTCTATAA-CTCCTGTG  235

seq1  TGTTAAGAAGCCTTAGTTTCCATTGTGAGTACAACTGAACATTTAAAGGT  299
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAGAAGCGTTAGTTTCCATTGTGAGTACAACTGAACATTTAAAGGT  285

seq1  GTGATAAAGGGGAAATGATTTCATTAGGGTGGGCTTCTGTCCAATATAGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAAAGGGGAAATGATTTCATTAGGGTGGGCTTCTGTCCAATATAGC  335

seq1  TGATGTTCTTATCGGAGAAACAC-AAAAGGCATCACACAGAATAAAGGTC  398
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTCTTATCGGAGAAACACAAAAAGGCATCACACAGAATAAAGGTC  385

seq1  CAGTGGAGATATCACAGGAGGGTGTACAACTTTCGGTTAATGAAACTGGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGAGATATCACAGGAGGGTGTACAACTTTCGGTTAATGAAACTGGC  435

seq1  ACACTGCTACATATATCTTGTGATGCAATCTGCAAAACAAAGAAAACCAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCTACATATATCTTGTGATGCAATCTGCAAAACAAAGAAAACCAG  485

seq1  TGTATCACTCAAACTTTCTTCCCCCATTATAGAAAACTGAACATCCATGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCACTCAAACTTTCTTCCCCCATTATAGAAAACTGAACATCCATGA  535

seq1  AGCCTGAGAGATCCAAACCACACATTATTAATTCACTAAATGTATTTGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGAGAGATCCAAACCACACATTATTAATTCACTAAATGTATTTGTG  585

seq1  ATAATGATTTTTCAAATTTGAAATACACAATCATGCATTACAATGGGCTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGATTTTTCAAATTTGAAATACACAATCATGCATTACAATGGGCTG  635

seq1  TTCTAAAGTTTGTTAAATTTTAAATGGGAATCTACTAAAGGACCAGCCCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAGTTTGTTAAATTTTAAATGGGAATCTACTAAAGGACCAGCCCA  685

seq1  GGGTGCTTGCTTCCCCTGTAATACAATTTGCTAGTTTGGTATTCTGACTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTTGCTTCCCCTGTAATACAATTTGCTAGTTTGGTATTCTGACTC  735

seq1  AACAATGAGTAGGTGTGTTTAGGGCATCCCTTTGAGATTCTCTGCCATGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGAGTAGGTGTGTTTAGGGCATCCCTTTGAGATTCTCTGCCATGA  785

seq1  TGTTTTCCACTGTCTTGAAAAGGATGTGATAGGGACATATCTCCAATGAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCCACTGTCTTGAAAAGGATGTGATAGGGACATATCTCCAATGAA  835

seq1  AGTGCAATAAAGAAAAACATCAGAGTATGGCTGAGGGGCCATGTTCTCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCAATAAAGAAAAACATCAGAGTATGGCTGAGGGGCCATGTTCTCAG  885

seq1  GGGAGAAAGGACACTTTGAACTGTTAATCTTTGCCAGGACTAAGAACCAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAAGGACACTTTGAACTGTTAATCTTTGCCAGGACTAAGAACCAC  935

seq1  TTAGGAAAAACTACTCTGGCTGTGGCCAGCGAGGTTTACTTGAGAACTAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAAAACTACTCTGGCTGTGGCCAGCGAGGTTTACTTGAGAACTAG  985

seq1  AGGAGAAATACCCTCAATTTGAATGGCACTGTTTCATGGGATAAAGATCC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAATACCCTCAATTTGAATGGCACTGTTTCATGGGATAAAGATCC  1035

seq1  AGACTGAGTTAAGAGGAGTGGGGGAAGGATATAACCCATTGAACACTAAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGAGTTAAGAGGAGTGGGGGAAGGATATAACCCATTGAACACTAAC  1085

seq1  ATTCACCTTTCTGTTTTCTATCTGCAGAGAAATGTGAACAGCTGCCTTGA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACCTTTCTGTTTTCTATCTGCAGAGAAATGTGAACAGCTGCCTTGA  1135

seq1  ATTC  1152
      ||||
seq2  ATTC  1139

seq1: chr7_76545103_76546084
seq2: B6Ng01-052C05.g_70_1047

seq1  GAATTCTTGGCACTATGAGGAAAGCTTCATGTTCAAGGTTTCTGAAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGCACTATGAGGAAAGCTTCATGTTCAAGGTTTCTGAAAAAG  50

seq1  AGAAATGGTACACCATCATGATTATTCATTTTATGTGTTAACTTGACTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGTACACCATCATGATTATTCATTTTATGTGTTAACTTGACTCA  100

seq1  GTCATAGAATATTTAGATACTTGTTTAAATCTTACTCTGCATTAAAAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGAATATTTAGATACTTGTTTAAATCTTACTCTGCATTAAAAGAG  150

seq1  AGAGAGGATATTTTTCTATGTGAGATTAAGATTTGAATTGGTAGACTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGATATTTTTCTATGTGAGATTAAGATTTGAATTGGTAGACTGAA  200

seq1  TAACACAAGCAGTTCAATCCAAAGCAGGTTTTATTCCAAGCTGGAGAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACAAGCAGTTCAATCCAAAGCAGGTTTTATTCCAAGCTGGAGAAAG  250

seq1  AAAGTCTGGGTATAGTGAAAGTCCAATGTCTACAAGCCAGGTTGTTCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTGGGTATAGTGAAAGTCCAATGTCTACAAGCCAGGTTGTTCTGT  300

seq1  CTTCTAACTCAGAACTGGGCTAGAAATTATACCTTTAGTTCTCCTGGGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAACTCAGAACTGGGCTAGAAATTATACCTTTAGTTCTCCTGGGTA  350

seq1  ACCAGCCAATCAACTGCACAATTTGATTTTTCCTTTCTCTATAGTCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCCAATCAACTGCACAATTTGATTTTTCCTTTCTCTATAGTCAAAG  400

seq1  TAACAAATTCTTTAAAGAGAGATGTTAATGATAGACAGATGATGGATATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAATTCTTTAAAGAGAGATGTTAATGATAGACAGATGATGGATATA  450

seq1  GATAAATACCTACAGATAGATAAATAGATAAAACAATAAGCAGACATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATACCTACAGATAGATAAATAGATAAAACAATAAGCAGACATAAA  500

seq1  TGGAAAAAGATAATAGATCATAGATAAAGGTACTTAGATAAGGTAGATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAAAGATAATAGATCATAGATAAAGGTACTTAGATAAGGTAGATAT  550

seq1  AGATTACATAGAGAGATTTAAACATACATACATACATACATTCATACATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTACATAGAGAGATTTAAACATACATACATACATACATTCATACATA  600

seq1  CATACACAGATAATGTATATGTATCTTACTGGCTCTGTTTTCCTTGAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACAGATAATGTATATGTATCTTACTGGCTCTGTTTTCCTTGAGGA  650

seq1  CCTAGAATATTGTAGGTCTTTTAGGTCTTAATTCCTTATCTTTCCACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAATATTGTAGGTCTTTTAGGTCTTAATTCCTTATCTTTCCACACA  700

seq1  GAGGGTCCCCATATGTACCCCAGTGTTCTAATACCATTTACCTGACCCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTCCCCATATGTACCCCAGTGTTCTAATACCATTTACCTGACCCTA  750

seq1  GGATATTCGATCAAAATCAGGTGAGCATAACTGACCTTCCCAAATAGCCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTCGATCAAAATCAGGTGAGCATAACTGACCTTCCCAAATAGCCG  800

seq1  GTGTATACATTAATGGAGCAGGAAAATGGATAGAAAAATATAATAAAAAA  850
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATACATTAATGGAGCA-GAAAATGGATAGAAAAATATAATAAAAAA  849

seq1  TATCGTGACCATTTAGCAAATGGTAGATGAAAACTAAGAAATAAATACAT  900
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TATCGTGACCA-TTAGCAAATGGTAGATGAAAACTAAG-AATAAATACAT  897

seq1  GGCAAAGTTTTGCAAGTGAACTTAGGTAAATAAAACTGTATAAGCTGTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGCAAAGTTTTGCAAGTGAACTTAGGTAAATAAAACTGTAT-AGCTGTAT  946

seq1  ATGGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTG  982
      || |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTG  978