BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054K09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,552,468 - 145,713,975
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcerg1l
Upstream gene9430038I01Rik, Txnl2, LOC435235
Downstream geneLOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2, Inpp5a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054K09.bB6Ng01-054K09.g
ACCDH877337DH877338
length1,1811,086
definitionDH877337|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054K09, 5' end.DH877338|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054K09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,552,468 - 145,553,667)(145,712,877 - 145,713,975)
sequence
gaattctcaacctgcctcctgcagacttactatgcaagctctaccacagc
acacgatcaactctcaaaagcaactaagattcggggagggaagattcact
ctctggcattccaagttgacactgctatcacgtttgaagaaaccagcatt
gcacaggacacagggcaccctgattccagtcaacaaatacaacacagaca
gcagcatgcacatcacatggacacagcagataatgtggccagtctgggac
ccattccacgactcaagagcccacacctctcaaactcagtactccaggat
gctgggatacctcaagatcatcctctccgattctccaaaaaggctcagta
ctctgaggaccaatggctcaggagccatcatgcctcttgtcccctgcccc
ctgccagatgggcaggacttcccataggcccacatagctatctcaaatcc
caagcaaggcaaaggctatcggtgtgcagctcagcagtgggacctggtgc
atcactggcaacatcagttgctcttcttgggtgagccaccctagctctgt
gacatgtgtcacacaaggaaatggctgagatcttagggtcttgaagtatc
tacatgagctgtaaaggggtcttatctcttcacacaggcacatacaagaa
gccatatgggcacagtcaagccgtgctccacagagtccatgtgtatttgt
atagtctgacactgagcaagccccatacaagcccaactgaatgcccccca
cactggatctggcctccaataacccgcagcatgtgtccagaggctgttac
caagacattgagcccctcggcccagctggccctgctttttcatctcaatt
ctgggagcaattatgacctttcctggtggcacaatgttcctacctgagaa
tggggcagtccggaaggggattctgatgggggtcaatgtcagaagtggca
cggctgcatgatggaggggctcaggcctcggagttcctcgggtctacaga
gaccatggcagtagctgcagcagcagctgttgcagcatgatgggtgatgg
tgggaccctgctgattgcttagactgtcatgacaacccctggggggagag
agaccactcagcgagtaacacacacattcatctcaggtaaaggatccagg
cctgaggtgacctgccccttcaatgactccc
gaattctcattggcaggaaggagactgtggggctaaaggccaggggcttc
ctgtgctcaggtcacctgaagaaaggttctggcatagccaggcaagacat
aggcacagtcttattggtgtgaaaagaaaccaccaccatggcaactctta
actggggctgccttacagtttcagaggtttagtccattatcatcagtgta
ggaagcatggcagtgtccaggaagacaaggtactgaaaaggagctgggag
ttctacttcttgatcagcaggcaagcagaacgggactccctctctaggtg
tgacttgaacatatataaaacctcaaagcctgccttcacagcaacacact
tcctccaacaaagccatacctcctaatgatgccactccctatgggcctac
agtggcaaattacattcaaactactataggcactatgtttcatccacagc
aatcttgggatattggaaacacagcccagcttaaagaagtgtaatggagg
tctcagcaggactgagagacagggccaaggttaagtttacactgctattc
aatagtaagctaggggcaggtatgtcagaagttccagggagtcttcagtc
atgaccagtcctcagttggctaccatgagcttgaagtcatgatgaaccag
aggatggcgttttcccatctcagtgaacctacaacaggatacaagcctgc
caggtagcaataggagaatcagtggtcctaaggacaggtccaggtggtgg
gaagcaagacttctggcaaaggaggagaagcagggtgagtggccaatagt
tttagaaaaaagagtcaggaatttcataatttcattctttttaatagctg
agtagtactccattgtgtaaatgtaccacatttttctgtatccatttcct
ctgtgagggcatctgggttctttccagcttctggctattataataagctg
ctatgctagtgagcatgtagggcatcattctgagtgagtaacccattcac
aaagactcccacaatatgtactcactgatagttgatattagcccagaaac
tagggatccaagaattaagtacaatttgctacgcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145552468_145553667
seq2: B6Ng01-054K09.b_44_1224

seq1  GAATTCTCAACCTGCCTCCTGCAGACTTACTATGCAAGCTCTACCACAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAACCTGCCTCCTGCAGACTTACTATGCAAGCTCTACCACAGC  50

seq1  ACACGATCAACTCTCAAAAGCAACTAAGATTCGGGGAGGGAAGATTCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGATCAACTCTCAAAAGCAACTAAGATTCGGGGAGGGAAGATTCACT  100

seq1  CTCTGGCATTCCAAGTTGACACTGCTATCACGTTTGAAGAAACCAGCATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCATTCCAAGTTGACACTGCTATCACGTTTGAAGAAACCAGCATT  150

seq1  GCACAGGACACAGGGCACCCTGATTCCAGTCAACAAATACAACACAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGACACAGGGCACCCTGATTCCAGTCAACAAATACAACACAGACA  200

seq1  GCAGCATGCACATCACATGGACACAGCAGATAATGTGGCCAGTCTGGGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCATGCACATCACATGGACACAGCAGATAATGTGGCCAGTCTGGGAC  250

seq1  CCATTCCACGACTCAAGAGCCCACACCTCTCAAACTCAGTACTCCAGGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCCACGACTCAAGAGCCCACACCTCTCAAACTCAGTACTCCAGGAT  300

seq1  GCTGGGATACCTCAAGATCATCCTCTCCGATTCTCCAAAAAGGCTCAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGATACCTCAAGATCATCCTCTCCGATTCTCCAAAAAGGCTCAGTA  350

seq1  CTCTGAGGACCAATGGCTCAGGAGCCATCATGCCTCTTGTCCCCTGCCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGGACCAATGGCTCAGGAGCCATCATGCCTCTTGTCCCCTGCCCC  400

seq1  CTGCCAGATGGGCAGGACTTCCCATAGGCCCACATAGCTATCTCAAATCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAGATGGGCAGGACTTCCCATAGGCCCACATAGCTATCTCAAATCC  450

seq1  CAAGCAAGGCAAAGGCTATCGGTGTGCAGCTCAGCAGTGGGACCTGGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAGGCAAAGGCTATCGGTGTGCAGCTCAGCAGTGGGACCTGGTGC  500

seq1  ATCACTGGCAACATCAGTTGCTCTTCTTGGGTGAGCCACCCTAGCTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTGGCAACATCAGTTGCTCTTCTTGGGTGAGCCACCCTAGCTCTGT  550

seq1  GACATGTGTCACACAAGGAAATGGCTGAGATCTTAGGGTCTTGAAGTATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTGTCACACAAGGAAATGGCTGAGATCTTAGGGTCTTGAAGTATC  600

seq1  TACATGAGCTGTAAAGGGGTCTTATCTCTTCACACAGGCACATACAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGAGCTGTAAAGGGGTCTTATCTCTTCACACAGGCACATACAAGAA  650

seq1  GCCATATGGGCACAGTCAAGCCGTGCTCCACAGAGTCCATGTGTATTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATATGGGCACAGTCAAGCCGTGCTCCACAGAGTCCATGTGTATTTGT  700

seq1  ATAGTCTGACACTGAGCAAGCCCCATACAAGCCCAACTGAATGCCCCCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTGACACTGAGCAAGCCCCATACAAGCCCAACTGAATGCCCCCCA  750

seq1  CACTGGATCTGGCCTCCAATAACCCGCAGCATGTGTCCAGAGGCTGTTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGATCTGGCCTCCAATAACCCGCAGCATGTGTCCAGAGGCTGTTAC  800

seq1  CAAGACATTGAGCCCCTCGGCCCAGCTGGCCCTGCTTTTTCATCTCAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACATTGAGCCCCTCGGCCCAGCTGGCCCTGCTTTTTCATCTCAATT  850

seq1  CTGGGAGCAATTATGACCTTTCCTGGTGGCACAATGTTCCTACCTGAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAGCAATTATGACCTTTCCTGGTGGCACAATGTTCCTACCTGAGAA  900

seq1  TGGGGCAGTCCGGAAGGGGATTCTGATGGGGGTCAATGTCAGGAAGTGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGGGGCAGTCCGGAAGGGGATTCTGATGGGGGTCAATGTCA-GAAGTGGC  949

seq1  ACGGCTGCATGATGGAGGGGCTCAGGCCCCGGAGTTCCTCGGGGTCTACA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  ACGGCTGCATGATGGAGGGGCTCAGGCCTCGGAGTTCCTC-GGGTCTACA  998

seq1  GAGACCATGGCAGTAGCTGCAGCAGCAGCTGTGGCAGCAGTGAT-GGTGA  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||
seq2  GAGACCATGGCAGTAGCTGCAGCAGCAGCTGTTGCAGCA-TGATGGGTGA  1047

seq1  TGGTGGGACCCCTGCTGATTGGCTTAAGACTGTCATGACAACCACCTGTG  1099
      |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  | |
seq2  TGGTGGGA-CCCTGCTGATT-GCTT-AGACTGTCATGACAACCCCTGGGG  1094

seq1  GGAGAGAGACCAAGGTCAGCAGATGTAACACACACATCCATCTCAGGTAA  1149
      ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGAGAGAGACCA--CTCAGC-GA-GTAACACACACATTCATCTCAGGTAA  1140

seq1  CAGTATCCTCAAAGCTCATGAAGGTGACACTGCCCCCTTCAATGACATCC  1199
       || ||||    ||  | || ||||||| ||| ||||||||||||| |||
seq2  -AGGATCC----AG-GCCTG-AGGTGAC-CTG-CCCCTTCAATGAC-TCC  1180

seq1  C  1200
      |
seq2  C  1181

seq1: chr7_145712877_145713975
seq2: B6Ng01-054K09.g_67_1152 (reverse)

seq1  ATGCGTTTAGCAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAAGTTTCTGGG  50
      |||||  |||||||||||| ||||  ||||||  ||||  ||||||||||
seq2  ATGCG--TAGCAAATTGTA-CTTAATTCTTGG--ATCCCTAGTTTCTGGG  45

seq1  CTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTCCTTTGTGATT  100
      |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |
seq2  CTAATATCAAC-TATCAGTGAGTACATATTGTGGGAGT--CTTTGTGAAT  92

seq1  GGGTTACCTCACTCAGAATGATGCCCTACATGCTCCACTAGCATAGCAGC  150
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
seq2  GGGTTA-CTCACTCAGAATGATGCCCTACATGCT-CACTAGCATAGCAG-  139

seq1  CTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAG  200
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  CTTA-TTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATG-CCCTC-ACAG  186

seq1  AGG-AATGGATACAG-AAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACT  248
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAATGGATACAGAAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACT  236

seq1  CAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTGACTCTTTTTTTCTAA  298
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAGCTATTAAAAAGAATGAAATTATGAAATTCCTGACTC-TTTTTTCTAA  285

seq1  AACTATTGGCCACTCACCCTGCTTCTCCTCCTTTGCCAGAAGTCTTGCTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTGGCCACTCACCCTGCTTCTCCTCCTTTGCCAGAAGTCTTGCTT  335

seq1  CCCACCACCTGGACCTGTCCTTAGGACCACTGATTCTCCTATTGCTACCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCACCTGGACCTGTCCTTAGGACCACTGATTCTCCTATTGCTACCT  385

seq1  GGCAGGCTTGTATCCTGTTGTAGGTTCACTGAGATGGGAAAACGCCATCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGCTTGTATCCTGTTGTAGGTTCACTGAGATGGGAAAACGCCATCC  435

seq1  TCTGGTTCATCATGACTTCAAGCTCATGGTAGCCAACTGAGGACTGGTCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTCATCATGACTTCAAGCTCATGGTAGCCAACTGAGGACTGGTCA  485

seq1  TGACTGAAGACTCCCTGGAACTTCTGACATACCTGCCCCTAGCTTACTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGAAGACTCCCTGGAACTTCTGACATACCTGCCCCTAGCTTACTAT  535

seq1  TGAATAGCAGTGTAAACTTAACCTTGGCCCTGTCTCTCAGTCCTGCTGAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAGCAGTGTAAACTTAACCTTGGCCCTGTCTCTCAGTCCTGCTGAG  585

seq1  ACCTCCATTACACTTCTTTAAGCTGGGCTGTGTTTCCAATATCCCAAGAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCATTACACTTCTTTAAGCTGGGCTGTGTTTCCAATATCCCAAGAT  635

seq1  TGCTGTGGATGAAACATAGTGCCTATAGTAGTTTGAATGTAATTTGCCAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGGATGAAACATAGTGCCTATAGTAGTTTGAATGTAATTTGCCAC  685

seq1  TGTAGGCCCATAGGGAGTGGCATCATTAGGAGGTATGGCTTTGTTGGAGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGCCCATAGGGAGTGGCATCATTAGGAGGTATGGCTTTGTTGGAGG  735

seq1  AAGTGTGTTGCTGTGAAGGCAGGCTTTGAGGTTTTATATATGTTCAAGTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGTTGCTGTGAAGGCAGGCTTTGAGGTTTTATATATGTTCAAGTC  785

seq1  ACACCTAGAGAGGGAGTCCCGTTCTGCTTGCCTGCTGATCAAGAAGTAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTAGAGAGGGAGTCCCGTTCTGCTTGCCTGCTGATCAAGAAGTAGA  835

seq1  ACTCCCAGCTCCTTTTCAGTACCTTGTCTTCCTGGACACTGCCATGCTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCAGCTCCTTTTCAGTACCTTGTCTTCCTGGACACTGCCATGCTTC  885

seq1  CTACACTGATGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGGCAGCCCCAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACTGATGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGGCAGCCCCAG  935

seq1  TTAAGAGTTGCCATGGTGGTGGTTTCTTTTCACACCAATAAGACTGTGCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGTTGCCATGGTGGTGGTTTCTTTTCACACCAATAAGACTGTGCC  985

seq1  TATGTCTTGCCTGGCTATGCCAGAACCTTTCTTCAGGTGACCTGAGCACA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTTGCCTGGCTATGCCAGAACCTTTCTTCAGGTGACCTGAGCACA  1035

seq1  GGAAGCCCCTGGCCTTTAGCCCCACAGTCTCCTTCCTGCCAATGAGAATT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCCCCTGGCCTTTAGCCCCACAGTCTCCTTCCTGCCAATGAGAATT  1085

seq1  C  1099
      |
seq2  C  1086