BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-055E08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 58,612,015 - 58,613,171
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneNell1, 4933405O20Rik, EG668766, EG668767, EG668768, EG638046, EG668770, EG668774, LOC668776, LOC434186, LOC546971
Downstream geneLOC668779, Tmem16e, Slc17a6, EG620599, LOC654473, LOC100040608, Gas2, 1700015G11Rik, EG668783
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-055E08.b
ACCDH877771
length1,156
definitionDH877771|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055E08, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccacaccagggatgcattataaattctttcctctgtgacagctat
gagccttcacaaactcaacacttaaaatatttaacgagcatagcaaagca
ggcgcatgatcagagagctggaatgaaatgcttcttaaggcattattaag
catgccctgatgtcagaatacagcatgggtctgtaagcaggaagagttgc
agaagaggaattaagtggaataatttcattacaaaagttcattggaaaat
tctcatcactttgggaaaacactaagatgcatttcttttgaaaccagtcg
tattttattggcacagtctaaatgaatgaaagaatacatgaaaatacaca
aataccaaaagtatatattgcagttgatggatgaaaaagttttatcagga
tgctcccttcagaacccaaaagggtgggcatgtttttgacaatatggaaa
ctaaataatggtacatctgtgggataaactgtcagggcccagttaataat
caaaggccctcaaagactctctccttcagcctggatgatgcttcccccca
ttgttttgaagcctttttatacaatgtgcaatccaagcattgcttgcatt
actatcagctaacagagttttggaaatggttgataagtcttttctctaac
ttatgctaaaaaagaatctacaacccaacaagataccgtgtaataccttg
catcctattagagtttacaaacactatatcttggatgcgcatggttgcca
cgcatccctgtcatacacataggacactcagaacttgaatgagacagaag
cccaggctagaatcctccccttagccatcattgtgctataataacacaat
gacaaaatggagataatgagtgcaaggccatttgatgcttccctgcttag
aggagaatctacccagcaccagacaaaaattcatttactgatacaaagaa
ctgggtaaccactgtgaaaggggatgtgaaaaagataccagtgctccagc
ccagacctaaagcactgtcttgaactgtctctctatcatacttaggaaga
tctgaagttcaacaggaagtcatgacaagttcagaacacaagctgcagct
atctagaacagacatgtccgttctaccacatacatttcttatataagaat
tctctg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_58612015_58613171
seq2: B6Ng01-055E08.b_47_1202

seq1  GAATTCCACACCAGGGATGCATTATAAATTCTTTCCTCTGTGACAGCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACACCAGGGATGCATTATAAATTCTTTCCTCTGTGACAGCTAT  50

seq1  GAGCCTTCACAAACTCAACACTTAAAATATTTAACGAGCATAGCAAAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTCACAAACTCAACACTTAAAATATTTAACGAGCATAGCAAAGCA  100

seq1  GGCGCATGATCAGAGAGCTGGAATGAAATGCTTCTTAAGGCATTATTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGCATGATCAGAGAGCTGGAATGAAATGCTTCTTAAGGCATTATTAAG  150

seq1  CATGCCCTGATGTCAGAATACAGCATGGGTCTGTAAGCAGGAAGAGTTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCCTGATGTCAGAATACAGCATGGGTCTGTAAGCAGGAAGAGTTGC  200

seq1  AGAAGAGGAATTAAGTGGAATAATTTCATTACAAAAGTTCATTGGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGAATTAAGTGGAATAATTTCATTACAAAAGTTCATTGGAAAAT  250

seq1  TCTCATCACTTTGGGAAAACACTAAGATGCATTTCTTTTGAAACCAGTCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCACTTTGGGAAAACACTAAGATGCATTTCTTTTGAAACCAGTCG  300

seq1  TATTTTATTGGCACAGTCTAAATGAATGAAAGAATACATGAAAATACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTATTGGCACAGTCTAAATGAATGAAAGAATACATGAAAATACACA  350

seq1  AATACCAAAAGTATATATTGCAGTTGATGGATGAAAAAGTTTTATCAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCAAAAGTATATATTGCAGTTGATGGATGAAAAAGTTTTATCAGGA  400

seq1  TGCTCCCTTCAGAACCCAAAAGGGTGGGCATGTTTTTGACAATATGGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCCTTCAGAACCCAAAAGGGTGGGCATGTTTTTGACAATATGGAAA  450

seq1  CTAAATAATGGTACATCTGTGGGATAAACTGTCAGGGCCCAGTTAATAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATAATGGTACATCTGTGGGATAAACTGTCAGGGCCCAGTTAATAAT  500

seq1  CAAAGGCCCTCAAAGACTCTCTCCTTCAGCCTGGATGATGCTTCCCCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGCCCTCAAAGACTCTCTCCTTCAGCCTGGATGATGCTTCCCCCCA  550

seq1  TTGTTTTGAAGCCTTTTTATACAATGTGCAATCCAAGCATTGCTTGCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGAAGCCTTTTTATACAATGTGCAATCCAAGCATTGCTTGCATT  600

seq1  ACTATCAGCTAACAGAGTTTTGGAAATGGTTGATAAGTCTTTTCTCTAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCAGCTAACAGAGTTTTGGAAATGGTTGATAAGTCTTTTCTCTAAC  650

seq1  TTATGCTAAAAAAGAATCTACAACCCAACAAGATACCGTGTAATACCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCTAAAAAAGAATCTACAACCCAACAAGATACCGTGTAATACCTTG  700

seq1  CATCCTATTAGAGTTTACAAACACTATATCTTGGATGCGCATGGTTGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTATTAGAGTTTACAAACACTATATCTTGGATGCGCATGGTTGCCA  750

seq1  CGCATCCCTGTCATACACATAGGACACTCAGAACTTGAATGAGACAGAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATCCCTGTCATACACATAGGACACTCAGAACTTGAATGAGACAGAAG  800

seq1  CCCAGGCTAGAATCCTCCCCTTAGCCATCATTGTGCTATAATAACACAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCTAGAATCCTCCCCTTAGCCATCATTGTGCTATAATAACACAAT  850

seq1  GACAAAATGGAGATAATGAGTGCAAGGCCATTTGATGCTTCCCTGCTTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAATGGAGATAATGAGTGCAAGGCCATTTGATGCTTCCCTGCTTAG  900

seq1  AGGAGAATCTACCCAGCACCAGACAAAAATTCATTTACTGATACAAAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAATCTACCCAGCACCAGACAAAAATTCATTTACTGATACAAAGAA  950

seq1  CTGGGTAACCACTGTGAAAGGGGATGTGAAAAAGGATACCAGTGCTCCCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  CTGGGTAACCACTGTGAAAGGGGATGTGAAAAA-GATACCAGTGCT-CCA  998

seq1  GCCCAGACCTAAAGCACTGTCTTGAACTGTCTCTCTATCCATACTTAGGA  1050
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCCCAGACCTAAAGCACTGTCTTGAACTGTCTCTCTAT-CATACTTAGGA  1047

seq1  AGATCTGAAGTTCAACAAGGAAGTCATGACAAGTTCCAGACACAAGCTGC  1100
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||
seq2  AGATCTGAAGTTCAAC-AGGAAGTCATGACAAGTTCAGAACACAAGCTGC  1096

seq1  AGCTATCTAG-ACAGACATTGCCCGTTCTACACCAT-CATTTCTTATATA  1148
      |||||||||| ||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||
seq2  AGCTATCTAGAACAGACA-TGTCCGTTCTACCACATACATTTCTTATATA  1145

seq1  AGA--TCTCTG  1157
      |||  ||||||
seq2  AGAATTCTCTG  1156