BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057I20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 132,378,522 - 132,518,393
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933440M02Rik
Upstream geneEG628779, EG545999, LOC670828
Downstream geneLOC100043014, Jmjd5, Nsmce1, EG244214, Il4ra, Il21r, Gtf3c1, D430042O09Rik, Gsg1l, Xpo6, Sbk1, LOC100043495, Lat, 2210013K02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057I20.bB6Ng01-057I20.g
ACCDH879391DH879392
length1,0181,067
definitionDH879391|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057I20, 5' end.DH879392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057I20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(132,517,375 - 132,518,393)(132,378,522 - 132,379,603)
sequence
gaattcactccctcttggttggggaaggcagtgcagagtggctctagctg
gggtgatgtgattgagtgacctaagcttttcacatcatggttaactagaa
agcagagcacacaggctggaactctggggtggatataaccttcaaaggcc
tacccctaacaacctatgtctaccagtcagggactacttcctaaaggccc
cacagccttcaaaacgttaccgcaagcagaggatagaacattgaatcccc
agtcctccctcatcactgacctccttggggtacagcctggagatctcacc
tgagaactcagctcaggctagcttttggaggagccagcctgaggcactgt
cctctcccttcctacatgcattgagcttctggctcaggaggagtcagtgg
gggagctgttaggaccttccatccagagcaacaggtccttcaacaaagga
caaagacaaagtgccatcctggctgcgggatgaggccaagggtgaattta
ggaagggaggccatgtttagatacccagctccctggccctgtaggttttt
cgtttttttttttcaccccaggttcatgaggtctactggctggccacctt
tcccactttcccattttatgtctatacagagtcttggggtcttcttagtc
tgctggccagagagaactggcaaaacagctcttcctccagctcagttaat
aattcaggagccagcacctacagccacccattactctaagcccattgaca
ccctcaatgctggggcaatggacaggaaaggaaaaaaatcacctgtctac
ttaacaaatagacctcccctcacgtgcttgcctggtccctctgctggggt
gggagggactctgaggcacctgtggcatcacactgcactctaggccttgg
aaggtgcagcttgcttctttagatttggccatttatcccttccctccatc
ttctgttcaggatgctgagacacagaacgagtggtggagaggtgaaaagt
gagttcttcctcaagctg
gaattcagaacaggttgaagagaatctcctcattcatctctcgctaatac
gttttagcagcctttctacagacactggaactactccaagctatttcccc
tttaatcttctggtggagtgaattttattaattgcttctctaacggcatc
cagactcacatcctgaaatgagtcccgccaggacatgacatgtgatctgc
tgaacgtgctgccggattcctttttgataaccatgtgttggggtcctttc
catccatgttaataagtgagtgtggtgtgaaatcctcctgccttccttct
ttgtgagcactggtgtgatcattgtctcatcagatacgtgccttctcctc
taaagactcatgggagaaaaagaaaaaaggactaagactagtgcttactt
tctccatctgacgagtgttgggatgagttggtctcaagtgaccatttgta
cttatcagtcctctgtgttgtatttatatctgtaccttgtttgtatctaa
aaataataagtcttcttgaagaacagagggctgccctatgagcagaagta
ttttctctccaaaaggagcagaaatgaatgacttctctggcaccctttgc
tagaggtctgatttctttcttgggtgttgtgagcctaatgtggctcagaa
gatacatctcttttaagggcattgtttcatcagagaaggtctcagctcca
gcaccaccatgtgctaccgtctttagtgcccaacacagcccttcacaggc
tgcagaatagacacagcctcacaccaggctggccttgctgccatgtcatt
gactgagatatcagtcaatcaaatacccttcttttaaatacatacataca
tacgtacatacatacatacatactacatacatacacactcacacaccatg
gatgttaagtgacactgtgcacccccagagtttctagagaatagttttag
ttataatgagtcgtggcaaggttgaatgtggccccttagttcctcgtgaa
actaatccaaatcttccaataatgtatgccacatggggctaatgtggatc
ttgaaaaggggtctcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_132517375_132518393
seq2: B6Ng01-057I20.b_45_1062 (reverse)

seq1  CAGCTTGAGGAAGAACTCATCTCTCACCTCTCCAACACTCGTTCTGTGTC  50
      |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGCTTGAGGAAGAACTCACTTTTCACCTCTCCACCACTCGTTCTGTGTC  50

seq1  TTCAGCATCCCTGAACAGAAGATGGAGGG-AGGGATAAATGGCCAAATCT  99
       ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  -TCAGCAT-CCTGAACAGAAGATGGAGGGAAGGGATAAATGGCCAAATCT  98

seq1  AAAGAAGCAAGCTGCACCTTCCAAGGCCTAGAGTGCAGTGTGATGCCACA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGCAAGCTGCACCTTCCAAGGCCTAGAGTGCAGTGTGATGCCACA  148

seq1  GGTGCCTCAGGGTCCCTCCCACCCCAGCAGAGGGACCAGGCAAGCACGTG  199
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCTCAGAGTCCCTCCCACCCCAGCAGAGGGACCAGGCAAGCACGTG  198

seq1  AGGGGAGGTCTATTTGTTAAGTAGACAGGTGATTTTTTTTCCTTTCCTGT  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGTCTATTTGTTAAGTAGACAGGTGA-TTTTTTTCCTTTCCTGT  247

seq1  CCATTGCCCCAGCATTGAGGGTGTCAATGGGCTTAGAGTAATGGGTGGCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGCCCCAGCATTGAGGGTGTCAATGGGCTTAGAGTAATGGGTGGCT  297

seq1  GTAGGTGCTGGCTCCTGAATTATTAACTGAGCTGGAGGAAGAGCTG-TTT  348
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTAGGTGCTGGCTCCTGAATTATTAACTGAGCTGGAGGAAGAGCTGTTTT  347

seq1  GCCAGTTCTCTCTGGCCAGCAGACTAAGAAGACCCCAAGACTCTGTATAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTTCTCTCTGGCCAGCAGACTAAGAAGACCCCAAGACTCTGTATAG  397

seq1  ACATAAAATGGGAAAGTGGGAAAGGTGGCCAGCCAGTAGACCTCATGAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAATGGGAAAGTGGGAAAGGTGGCCAGCCAGTAGACCTCATGAAC  447

seq1  CTGGGGTGAAAAAAAAAAACGAAAAACCTACAGGGCCAGGGAGCTGGGTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTGAAAAAAAAAAACGAAAAACCTACAGGGCCAGGGAGCTGGGTA  497

seq1  TCTAAACATGGCCTCCCTTCCTAAATTCACCCTTGGCCTCATCCCGCAGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACATGGCCTCCCTTCCTAAATTCACCCTTGGCCTCATCCCGCAGC  547

seq1  CAGGATGGCACTTTGTCTTTGTCCTTTGTTGAAGGACCTGTTGCTCTGGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGGCACTTTGTCTTTGTCCTTTGTTGAAGGACCTGTTGCTCTGGA  597

seq1  TGGAAGGTCCTAACAGCTCCCCCACTGACTCCTCCTGAGCCAGAAGCTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGTCCTAACAGCTCCCCCACTGACTCCTCCTGAGCCAGAAGCTCA  647

seq1  ATGCATGTAGGAAGGGAGAGGACAGTGCCTCAGGCTGGCTCCTCCAAAAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTAGGAAGGGAGAGGACAGTGCCTCAGGCTGGCTCCTCCAAAAG  697

seq1  CTAGCCTGAGCTGAGTTCTCAGGTGAGATCTCCAGGCTGTACCCCAAGGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCTGAGCTGAGTTCTCAGGTGAGATCTCCAGGCTGTACCCCAAGGA  747

seq1  GGTCAGTGATGAGGGAGGACTGGGGATTCAATGTTCTATCCTCTGCTTGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGTGATGAGGGAGGACTGGGGATTCAATGTTCTATCCTCTGCTTGC  797

seq1  GGTAACGTTTTGAAGGCTGTGGGGCCTTTAGGAAGTAGTCCCTGACTGGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACGTTTTGAAGGCTGTGGGGCCTTTAGGAAGTAGTCCCTGACTGGT  847

seq1  AGACATAGGTTGTTAGGGGTAGGCCTTTGAAGGTTATATCCACCCCAGAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATAGGTTGTTAGGGGTAGGCCTTTGAAGGTTATATCCACCCCAGAG  897

seq1  TTCCAGCCTGTGTGCTCTGCTTTCTAGTTAACCATGATGTGAAAAGCTTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCCTGTGTGCTCTGCTTTCTAGTTAACCATGATGTGAAAAGCTTA  947

seq1  GGTCACTCAATCACATCACCCCAGCTAGAGCCACTCTGCACTGCCTTCCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACTCAATCACATCACCCCAGCTAGAGCCACTCTGCACTGCCTTCCC  997

seq1  CAACCAAGAGGGAGTGAATTC  1019
      |||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAAGAGGGAGTGAATTC  1018

seq1: chr7_132378522_132379603
seq2: B6Ng01-057I20.g_71_1137

seq1  GAATTCAGAACAGGCTGAAGAGAATCTCCTCATTCATCTCTCGCTAATAC  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAACAGGTTGAAGAGAATCTCCTCATTCATCTCTCGCTAATAC  50

seq1  GTTTTAGCAGCCTTTCTACAGACACTGGAACTACTCCAAGCTATTTCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTAGCAGCCTTTCTACAGACACTGGAACTACTCCAAGCTATTTCCCC  100

seq1  TTTAATCTTCTGGTGGAGTGAATTTTATTAATTGCTTCTCTAACGGCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCTTCTGGTGGAGTGAATTTTATTAATTGCTTCTCTAACGGCATC  150

seq1  CAGACTCACATCCTGAAATGAGTCCCGCCAGGACATGACATGTGATCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCACATCCTGAAATGAGTCCCGCCAGGACATGACATGTGATCTGC  200

seq1  TGAACGTGCTGCCGGATTCCTTTTTGATAACCATGTGTTGGGGTCCTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACGTGCTGCCGGATTCCTTTTTGATAACCATGTGTTGGGGTCCTTTC  250

seq1  CATCCATGTTAATAAGTGAGTGTGGTGTGAAATCCTCCTGCCTTCCTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCATGTTAATAAGTGAGTGTGGTGTGAAATCCTCCTGCCTTCCTTCT  300

seq1  TTGTGAGCACTGGTGTGATCATTGTCTCATCAGATACGTGCCTTCTCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGCACTGGTGTGATCATTGTCTCATCAGATACGTGCCTTCTCCTC  350

seq1  TAAAGACTCATGGGAGAAAAAGAAAAAAGGACTAAGACTAGTGCTTACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACTCATGGGAGAAAAAGAAAAAAGGACTAAGACTAGTGCTTACTT  400

seq1  TCTCCATCTGACGAGTGTTGGGATGAGTTGGTCTCAAGTGACCATTTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATCTGACGAGTGTTGGGATGAGTTGGTCTCAAGTGACCATTTGTA  450

seq1  CTTATCAGTCCTCTGTGTTGTATTTATATCTGTACCTTGTTTGTATCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCAGTCCTCTGTGTTGTATTTATATCTGTACCTTGTTTGTATCTAA  500

seq1  AAATAATAAGTCTTCTTGAAGAACAGAGGGCTGCCCTATGAGCAGAAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATAAGTCTTCTTGAAGAACAGAGGGCTGCCCTATGAGCAGAAGTA  550

seq1  TTTTCTCTCCAAAAGGAGCAGAAATGAATGACTTCTCTGGCACCCTTTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTCCAAAAGGAGCAGAAATGAATGACTTCTCTGGCACCCTTTGC  600

seq1  TAGAGGTCTGATTTCTTTCTTGGGTGTTGTGAGCCTAATGTGGCTCAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTCTGATTTCTTTCTTGGGTGTTGTGAGCCTAATGTGGCTCAGAA  650

seq1  GATACATCTC-TTTAAGGGCATTG-TTCATCAGAGAAGGTCTCAGCTCCA  698
      |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATCTCTTTTAAGGGCATTGTTTCATCAGAGAAGGTCTCAGCTCCA  700

seq1  GCACCACCATGTGCTACCGTCTTTAGTGCCCAACACAGCCCTTCACAGGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCACCATGTGCTACCGTCTTTAGTGCCCAACACAGCCCTTCACAGGC  750

seq1  TGCAGAATAGACACAGCCTCACACCAGGCTGGCCTTGCTGCCATGTCATT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAATAGACACAGCCTCACACCAGGCTGGCCTTGCTGCCATGTCATT  800

seq1  GACTGAGATATCAGTCAATCAAATACCCTTCTTTTAAATACATAACATAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GACTGAGATATCAGTCAATCAAATACCCTTCTTTTAAATACAT-ACATAC  849

seq1  ATACATACATACATACATACATACATACATACATACACACACACACACCA  898
      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  ATACGTACATACATACATACATAC-TACATACATACACACTCACACACCA  898

seq1  TGGATGTTAAGTGACCACTGTGCAACCCCCAGAGTTTCTAGAAGAAATAG  948
      |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||
seq2  TGGATGTTAAGTGA-CACTGTGC-ACCCCCAGAGTTTCTAGA--GAATAG  944

seq1  TTTTAAGTTATTAATGAGTCGTGGCAAGGTTTGAATGTGGCCCCTCAGTT  998
      |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  TTTT-AGTTA-TAATGAGTCGTGGCAAGG-TTGAATGTGGCCCCTTAGTT  991

seq1  CCTCTGTTGAAAACTTAATCCAGAAACCTCCCATTAATGTTATGCACACT  1048
      ||||   |||||   ||||||  ||| || ||| ||||| ||||| ||| 
seq2  CCTC--GTGAAA--CTAATCC--AAATCTTCCAATAATG-TATGC-CACA  1033

seq1  GGGGGCTAAGTGGGATCTTGAGAATGGGTCTCCT  1082
       ||||||||   ||||||||| || |||||||||
seq2  TGGGGCTAATGTGGATCTTGAAAAGGGGTCTCCT  1067