BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-062G21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,503,804 - 91,634,894
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArnt2
Upstream geneEG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik
Downstream geneLOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69, LOC330581, LOC100039339
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-062G21.bB6Ng01-062G21.g
ACCDH882828DH882829
length1,1921,105
definitionDH882828|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062G21, 5' end.DH882829|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062G21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,503,804 - 91,505,018)(91,633,778 - 91,634,894)
sequence
gaattcttactgaactaacactccaaatgatccttcttaaaggcccaagt
gcttctgatgtcagcacacacaggttggaagatgttagggcagaggggaa
cataaccatgatcaagtgcacccagagtttctgcggtaggaaatgagcag
tcagcatggctcttgagtgtggcatccatctgcagaccctatatcaccct
gcttgtttttagtaggcctgaaggatttggtgagatatagtctcatgatc
caagcaggagagaggctggctgcctgactggaggtctgaggaattccatg
ttttagcagtttattatgagaatggagaatacccagtgagattcggctca
aacaataaacaagcagagaatgaagtatgtgccagaagaccacagttaca
gaggccacaccttctggtccctcatagggagggtgaacttcatttcctag
tctttgagggattgaataagtgacccaggaaatgcatggggcacccaggc
caccaggaggcagtcatgttacacataaagagcatacttgtccacatacc
tcaagatgagccccagtgagatgtgtggctaagcaagaactcgagggacc
taggaactaggatcagatacggcaaaatgaagggaatgaggacagctttt
gcatgtctttgctctggattatatgcagtgcagcctgagttgacatgtcc
agaattccctgacgggatccctcatccacttagatccttggtcctcaaaa
cccaactgtcctcacaacaaaaatggcagttgtgatgaaagaaattcctc
tgtacaaagaggaacggagatggacaggatgaagggaaaagacagaagac
cacatgcatgtcacccgcgagatgaccatgtatcgctctccacagcatgg
ctttggaagttcagccctgggccagagctgtctacaggacaaatggagct
gaatgtgggaattctaaataaagaaagctcattaatatcctgtataatac
taagctatcatctcaccttcctggaaattgcctgtggaaataccaccaaa
aatgtttaactgagtcagtgcattttgcagagccccactgccacctatgc
ttgtaagggaagaatcaccttttcgccttctaaactactacgttccaatt
ccaaagaatgtgcctgatctcaaccgtaataggttaatatac
gaattctttcatttatacttagaccttgagggactgaaggacttggatga
gcctagtggaaacggacgtgtagtgactgtgaggctgtttgcagacatgg
gtaagaccatacacaattgaaaaagtagatgtggttgtgaagagatgctt
cagttagcaaagtgtttgtggcacaagaccaaggacctgagtttgatcct
caaaacctgtattttaaaaaatgcccacatgtgtataatatatatgtgca
gtaggtacagaaattatatggaagtaaccaaccacattctggttggactt
aaagcctgcttgataaaatggataccagtgcttgttgccattaacgaggg
aaaagacctatgactggctaaatcacaggtcttaggagagaacatagtac
tcttattattcattctgctaaatgaatatattaattaactgctcttctgc
agcaataaaaatggcatagagagccaagaagcagaagacaagctagagag
acagttcataggagacctggtagcaaatgtttgacattatgatggtttaa
aagtggaacagaggttatagaaaccacagtattaatttttcctttacctg
actagaagtatttcaaacaaccctctactgatatattgaacagtaccaga
agctctagctcccagcaagtcatgtcatgcaaagggtcccataccacatg
cctatcttttaagtgagctgatcagggggattagtatactgaatgcactt
tccacttaatcttccaagcttagatgggtttatgagaacataatacagga
taggttgaagaacatctggatatgtcctagggtttgaagataccagttga
gacattgcaaaatgcagaagggaaatttgaaaggcaactagtttacacca
gcatggagtagaatgcagacattcatctgggctttcttttgcatcttacc
cctaaaaggagcagctcttcttacctcccactgtttctgtgtcatgtgac
agagtaagccattgctcacttgccgaagaatggggctgttctagtcacag
atgctgctgctgctgggacatggtcatagcatagttttggctagcctcta
tatcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91503804_91505018
seq2: B6Ng01-062G21.b_47_1238

seq1  GAATTCTTACTGAACTAACACTCCAAATGATCCTTCTTAAAGGCCCAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTACTGAACTAACACTCCAAATGATCCTTCTTAAAGGCCCAAGT  50

seq1  GCTTCTGATGTCAGCACACACAGGTTGGAAGATGTTAGGGCAGAGGGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGATGTCAGCACACACAGGTTGGAAGATGTTAGGGCAGAGGGGAA  100

seq1  CATAACCATGATCAAGTGCACCCAGAGTTTCTGCGGTAGGAAATGAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACCATGATCAAGTGCACCCAGAGTTTCTGCGGTAGGAAATGAGCAG  150

seq1  TCAGCATGGCTCTTGAGTGTGGCATCCATCTGCAGACCCTATATCACCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATGGCTCTTGAGTGTGGCATCCATCTGCAGACCCTATATCACCCT  200

seq1  GCTTGTTTTTAGTAGGCCTGAAGGATTTGGTGAGATATAGTCTCATGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTTTTAGTAGGCCTGAAGGATTTGGTGAGATATAGTCTCATGATC  250

seq1  CAAGCAGGAGAGAGGCTGGCTGCCTGACTGGAGGTCTGAGGAATTCCATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAGGAGAGAGGCTGGCTGCCTGACTGGAGGTCTGAGGAATTCCATG  300

seq1  TTTTAGCAGTTTATTATGAGAATGGAGAATACCCAGTGAGATTCGGCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGCAGTTTATTATGAGAATGGAGAATACCCAGTGAGATTCGGCTCA  350

seq1  AACAATAAACAAGCAGAGAATGAAGTATGTGCCAGAAGACCACAGTTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATAAACAAGCAGAGAATGAAGTATGTGCCAGAAGACCACAGTTACA  400

seq1  GAGGCCACACCTTCTGGTCCCTCATAGGGAGGGTGAACTTCATTTCCTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCACACCTTCTGGTCCCTCATAGGGAGGGTGAACTTCATTTCCTAG  450

seq1  TCTTTGAGGGATTGAATAAGTGACCCAGGAAATGCATGGGGCACCCAGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGAGGGATTGAATAAGTGACCCAGGAAATGCATGGGGCACCCAGGC  500

seq1  CACCAGGAGGCAGTCATGTTACACATAAAGAGCATACTTGTCCACATACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGAGGCAGTCATGTTACACATAAAGAGCATACTTGTCCACATACC  550

seq1  TCAAGATGAGCCCCAGTGAGATGTGTGGCTAAGCAAGAACTCGAGGGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATGAGCCCCAGTGAGATGTGTGGCTAAGCAAGAACTCGAGGGACC  600

seq1  TAGGAACTAGGATCAGATACGGCAAAATGAAGGGAATGAGGACAGCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAACTAGGATCAGATACGGCAAAATGAAGGGAATGAGGACAGCTTTT  650

seq1  GCATGTCTTTGCTCTGGATTATATGCAGTGCAGCCTGAGTTGACATGTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTCTTTGCTCTGGATTATATGCAGTGCAGCCTGAGTTGACATGTCC  700

seq1  AGAATTCCCTGACGGGATCCCTCATCCACTTAGATCCTTGGTCCTCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCCCTGACGGGATCCCTCATCCACTTAGATCCTTGGTCCTCAAAA  750

seq1  CCCAACTGTCCTCACAACAAAAATGGCAGTTGTGATGAAAGAAATTCCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACTGTCCTCACAACAAAAATGGCAGTTGTGATGAAAGAAATTCCTC  800

seq1  TGTACAAAGAGGAACGGAGATGGACAGGATGAAGGGAAAAGACAGAAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAAAGAGGAACGGAGATGGACAGGATGAAGGGAAAAGACAGAAGAC  850

seq1  CACATGCATGTCACCCGCGAGATGACCATGTATCGCTCTCCACAGCATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCATGTCACCCGCGAGATGACCATGTATCGCTCTCCACAGCATGG  900

seq1  CTTTGGAAGTTCAGCCCTGGGCCAGAGCTGTCTACAGGACAAATGGAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGAAGTTCAGCCCTGGGCCAGAGCTGTCTACAGGACAAATGGAGCT  950

seq1  GAATGTGGGAATTCTAAATAAAGAAAGCTCATTAATATCCTGTATAATTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAATGTGGGAATTCTAAATAAAGAAAGCTCATTAATATCCTGTATAA-TA  999

seq1  CTAAGCTATCATCTCACCTTCCTGGAAATTGCCTGTGGAAAATAACCACC  1050
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
seq2  CTAAGCTATCATCTCACCTTCCTGGAAATTGCCTGTGGAAA--TACCACC  1047

seq1  AAAAATGTTTAACTGAGGTCAGTTGCATTTTTGCAGAGCCACACTGCCAC  1100
      |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||
seq2  AAAAATGTTTAACTGA-GTCAG-TGCA-TTTTGCAGAGCCCCACTGCCAC  1094

seq1  CTAGTGCTTGTAAAGGGAAAGATCACCTTTTCTGCCTTCATAAACTACCT  1150
      ||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||
seq2  CTA-TGCTTGT-AAGGGAAGAATCACCTTTTC-GCCTTC-TAAACTA-CT  1139

seq1  ACGTTTTCAAAATTCCAAATGATTTGTGCCTGGATTCATCAAAACCGTAA  1200
      |||||     |||||||||  |  ||||||||     |||  |||||| |
seq2  ACGTT---CCAATTCCAAAGAA--TGTGCCTG-----ATCTCAACCGT-A  1178

seq1  ATAGGTGTAATATAC  1215
      |||||| ||||||||
seq2  ATAGGT-TAATATAC  1192

seq1: chr7_91633778_91634894
seq2: B6Ng01-062G21.g_67_1171 (reverse)

seq1  GGATATAGA-GCTATGGCAAAAACTATGCTATGACACATGTCACCAGCAG  49
      ||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  GGATATAGAGGCTA--GCCAAAACTATGCTATGAC-CATGTC-CCAGCAG  46

seq1  CAGCAGCATCTGTGAACTAGGAACAGCCCAATTCTCTGGCAAGGTGAGCA  99
      |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||
seq2  CAGCAGCATCTGTG-ACTA-GAACAGCCCCATTCTTCGGCAA-GTGAGCA  93

seq1  ATGGCTGTACTCTGTCACATGGACACAGAAACAGTGGGAGGTAAGAAGAG  149
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCT-TACTCTGTCACAT-GACACAGAAACAGTGGGAGGTAAGAAGAG  141

seq1  CTTGCTCCTTTTGGGGGGTAGGGTGGCAAAAGAAAGCCCAGATGTATGTC  199
      | ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||
seq2  C-TGCTCCTTTT-AGGGGTAAGAT-GCAAAAGAAAGCCCAGATGAATGTC  188

seq1  TTGCAGTTCTACTCCATGCTGGTGT-AACTAGTTGCCTTTCAAATTTCCC  248
       |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  -TGCA-TTCTACTCCATGCTGGTGTAAACTAGTTGCCTTTCAAATTTCCC  236

seq1  TTCTGCATTTTGCAATGTCTCAACTGGTATCTTCAAACCCTAGGACATAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATTTTGCAATGTCTCAACTGGTATCTTCAAACCCTAGGACATAT  286

seq1  CCAGATGTTCTTCAACCTATCCTGTATTATGTTCTCATAAACCCATCTAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGTTCTTCAACCTATCCTGTATTATGTTCTCATAAACCCATCTAA  336

seq1  GCTTGGAAGATTAAGTGGAAAGTGCATTCAGTATACTAATCCCCCTGATC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGAAGATTAAGTGGAAAGTGCATTCAGTATACTAATCCCCCTGATC  386

seq1  AGCTCACTTAAAAGATAGGCATGTGGTATGGGACCCTTTGCATGACATGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCACTTAAAAGATAGGCATGTGGTATGGGACCCTTTGCATGACATGA  436

seq1  CTTGCTGGGAGCTAGAGCTTCTGGTACTGTTCAATATATCAGTAGAGGGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGGGAGCTAGAGCTTCTGGTACTGTTCAATATATCAGTAGAGGGT  486

seq1  TGTTTGAAATACTTCTAGTCAGGTAAAGGAAAAATTAATACTGTGGTTTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGAAATACTTCTAGTCAGGTAAAGGAAAAATTAATACTGTGGTTTC  536

seq1  TATAACCTCTGTTCCACTTTTAAACCATCATAATGTCAAACATTTGCTAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACCTCTGTTCCACTTTTAAACCATCATAATGTCAAACATTTGCTAC  586

seq1  CAGGTCTCCTATGAACTGTCTCTCTAGCTTGTCTTCTGCTTCTTGGCTCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCTCCTATGAACTGTCTCTCTAGCTTGTCTTCTGCTTCTTGGCTCT  636

seq1  CTATGCCATTTTTATTGCTGCAGAAGAGCAGTTAATTAATATATTCATTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCATTTTTATTGCTGCAGAAGAGCAGTTAATTAATATATTCATTT  686

seq1  AGCAGAATGAATAATAAGAGTACTATGTTCTCTCCTAAGACCTGTGATTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAATGAATAATAAGAGTACTATGTTCTCTCCTAAGACCTGTGATTT  736

seq1  AGCCAGTCATAGGTCTTTTCCCTCGTTAATGGCAACAAGCACTGGTATCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTCATAGGTCTTTTCCCTCGTTAATGGCAACAAGCACTGGTATCC  786

seq1  ATTTTATCAAGCAGGCTTTAAGTCCAACCAGAATGTGGTTGGTTACTTCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATCAAGCAGGCTTTAAGTCCAACCAGAATGTGGTTGGTTACTTCC  836

seq1  ATATAATTTCTGTACCTACTGCACATATATATTATACACATGTGGGCATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATTTCTGTACCTACTGCACATATATATTATACACATGTGGGCATT  886

seq1  TTTTAAAATACAGGTTTTGAGGATCAAACTCAGGTCCTTGGTCTTGTGCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAATACAGGTTTTGAGGATCAAACTCAGGTCCTTGGTCTTGTGCC  936

seq1  ACAAACACTTTGCTAACTGAAGCATCTCTTCACAACCACATCTACTTTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACTTTGCTAACTGAAGCATCTCTTCACAACCACATCTACTTTTT  986

seq1  CAATTGTGTATGGTCTTACCCATGTCTGCAAACAGCCTCACAGTCACTAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGTGTATGGTCTTACCCATGTCTGCAAACAGCCTCACAGTCACTAC  1036

seq1  ACGTCCGTTTCCACTAGGCTCATCCAAGTCCTTCAGTCCCTCAAGGTCTA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCCGTTTCCACTAGGCTCATCCAAGTCCTTCAGTCCCTCAAGGTCTA  1086

seq1  AGTATAAATGAAAGAATTC  1117
      |||||||||||||||||||
seq2  AGTATAAATGAAAGAATTC  1105