BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069E06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,614,163 - 119,731,281
singlet/doubletdoublet
Overlap geneParva
Upstream geneGalntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl
Downstream geneLOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069E06.bB6Ng01-069E06.g
ACCDH887626DH887627
length1,0401,028
definitionDH887626|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069E06, 5' end.DH887627|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069E06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,730,234 - 119,731,281)(119,614,163 - 119,615,201)
sequence
gaattctgctatctaggaatgcacacgtaggccataaaataaggaacagc
aaacccttccaaacacagtaactatgaaaggtggggtgtcaggtggtgct
agtgagggagcagggacagcaggtgccctcagagagggaaggcaggtggg
ggaggattgtgctttggaaggaagggcacagggcatgtgatagagttgca
ttcctcctgtcctgacctagctgggggctacacctctgttcctgtgtcat
ttaaaaaatgaaaacagtatttaaaagcatgagtgtgaaggtcacatgaa
gcataaagcctaagacaatagctgatatgggctccaagatgggagagata
gtacaaagccaccggggagaaggtggaattgtggctatgtgctggatcac
aggtccaaagtaccaccaagacaggcagagtgggaagtcagagcccctgg
tgggttgtgttggggttcccttggctttgaggctagtgtggctgtgactg
cagccacatgcactgaagctgagtttccaagcactaaatggctataagct
gagccctgagctgcagattgccttagcgtcctctcatcatgtctgattct
gctatccggcttgcagaccaaccctgctctactccagctgtgtccagatg
tacacttaaatcccttattgatagagaatgggcaactaggacatctggag
aggcatggagcccattgcttcccttttcggtcccatttcagtctttcatc
tgaggcgctggctggtgtcagggctccaccatgtttccctgtttgtgttg
ctccaagtcccatccgaatcaccttcttcatgatgcagttttatggaatc
ttgggctgactgctgttctctctactcatgcagggcttatgaagagctgg
gcaaagtgctcaccgtgcagtgaatatgcagaactagaagctgtgggttg
cacactgggtaagctctggaaagttctggagtctatctttctcttctctt
cttaaccatgtttgtatatgacctgccaattgatatgtac
gaattctttgcacatccctgaaggatctagtcaagttgcctgttggaagg
ccttcccatgccccagggaagcagagggctatcacagcaggaggttgtga
caggtgaacccttcattaataacaataataaaaagaacaattctatcttc
cctttctggggccatgagcttcctagcatgcgcaatagacaaaaaggaca
agggatgtctgtctgctaaaattgaacactgtgtccaaagcttctgtagc
ttacggaaagtgcaagctatggtagactcgaccttgtgtacggttaagag
gaggattcttcctatagggatgggcctgcctccaccactccagcatgagg
cttgagttagtgaatgctcgccccatgcttggcttcgatgtgggggtctg
agcccaggtcctcaggagtgtgtgcagccaccatgtaccccacccctcag
catcttcctcttcagggtttgacttggcggcatgtgatttcacctgcaca
ggatcctgcaatctcgcccatccgaagcctttgggacgggtgtggttacg
tgaactgccacctaggctctaggacattggctgccggttccactgttttt
tcaggatgagattctcaatggaaaagtccagcaacaaactggaaggttgt
ttgccccagatgaaagtcattaatcccccacccaggggtctctcacaaac
agaaagtttatcattgtagcacacagcaagtctgcagaggaggaagacct
aaagagagtattcagagcctcctgggccttttgccccacacaacagtcta
aagcttcagaaaggccccgaatcaggcgcatgctctacccctggccagcc
ccaggatctgagagctgagtggtgactgtgcctggcacgccacttagcca
aacctcagctccgtgccagcgtggagctataattatttttctttgtcaaa
ctttgtcagcacttcatcccaaaggatggtttattttcctttgcgtgttt
gtgactgtagtaataagagaaattacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_119730234_119731281
seq2: B6Ng01-069E06.b_45_1084 (reverse)

seq1  GTACATATACAAATATGCAGGTACATATACAAACATAGGTTAAAGAAGAG  50
      ||||||||   |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| 
seq2  GTACATAT--CAATTGGCAGGT-CATATACAAACAT-GGTT-AAGAAGA-  44

seq1  GAAGAGAAAAGATAGACTCCCAGAAACCTTTCCAGAGCTTACCCCAGTGT  100
      |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAGAG-AAAGATAGACT-CCAGAA--CTTTCCAGAGCTTA-CCCAGTGT  89

seq1  GCAACCCACAGCCTCCTAGTTCTGCCTATTCACTGCACTGTGAGCACTTT  150
      ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  GCAACCCACAG-CTTCTAGTTCTGCATATTCACTGCACGGTGAGCACTTT  138

seq1  GCCCAGCTCTTCAT-AGCCCTGCATGAGTAGAGAGAACAGCAGTCAGCCC  199
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGCTCTTCATAAGCCCTGCATGAGTAGAGAGAACAGCAGTCAGCCC  188

seq1  -AGATTCCATAAAACTGCATCATGAAGAAGGTGATTCGGATGGGACTTGG  248
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCCATAAAACTGCATCATGAAGAAGGTGATTCGGATGGGACTTGG  238

seq1  AGC-ACACAAACAGGGAAACATGGTGGAGCCCTGACACCAGCCAGCGCCT  297
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACACAAACAGGGAAACATGGTGGAGCCCTGACACCAGCCAGCGCCT  288

seq1  CAGATG-AAGACTGAAATGGGACCGAAAAGGGAAGCAATGGGCTCCATGC  346
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGAAAGACTGAAATGGGACCGAAAAGGGAAGCAATGGGCTCCATGC  338

seq1  CTCTCCAGATGTCCTAGTTGCCCATTCTCTATCAATAAGGGATTTAAGTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCAGATGTCCTAGTTGCCCATTCTCTATCAATAAGGGATTTAAGTG  388

seq1  TACATCTGGACACAGCTGGAGTAGAGCAGGGTTGGTCTGCAAGCCGGATA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTGGACACAGCTGGAGTAGAGCAGGGTTGGTCTGCAAGCCGGATA  438

seq1  GCAGAATCAGACATGATGAGAGGACGCTAAGGCAATCTGCAGCTCAGGGC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAATCAGACATGATGAGAGGACGCTAAGGCAATCTGCAGCTCAGGGC  488

seq1  TCAGCTTATAGCCATTTAGTGCTTGGAAACTCAGCTTCAGTGCATGTGGC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTTATAGCCATTTAGTGCTTGGAAACTCAGCTTCAGTGCATGTGGC  538

seq1  TGCAGTCACAGCCACACTAGCCTCAAAGCCAAGGGAACCCCAACACAACC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTCACAGCCACACTAGCCTCAAAGCCAAGGGAACCCCAACACAACC  588

seq1  CACCAGGGGCTCTGACTTCCCACTCTGCCTGTCTTGGTGGTACTTTGGAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGGGCTCTGACTTCCCACTCTGCCTGTCTTGGTGGTACTTTGGAC  638

seq1  CTGTGATCCAGCACATAGCCACAATTCCACCTTCTCCCCGGTGGCTTTGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATCCAGCACATAGCCACAATTCCACCTTCTCCCCGGTGGCTTTGT  688

seq1  ACTATCTCTCCCATCTTGGAGCCCATATCAGCTATTGTCTTAGGCTTTAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCTCTCCCATCTTGGAGCCCATATCAGCTATTGTCTTAGGCTTTAT  738

seq1  GCTTCATGTGACCTTCACACTCATGCTTTTAAATACTGTTTTCATTTTTT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATGTGACCTTCACACTCATGCTTTTAAATACTGTTTTCATTTTTT  788

seq1  AAATGACACAGGAACAGAGGTGTAGCCCCCAGCTAGGTCAGGACAGGAGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACACAGGAACAGAGGTGTAGCCCCCAGCTAGGTCAGGACAGGAGG  838

seq1  AATGCAACTCTATCACATGCCCTGTGCCCTTCCTTCCAAAGCACAATCCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAACTCTATCACATGCCCTGTGCCCTTCCTTCCAAAGCACAATCCT  888

seq1  CCCCCACCTGCCTTCCCTCTCTGAGGGCACCTGCTGTCCCTGCTCCCTCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCTGCCTTCCCTCTCTGAGGGCACCTGCTGTCCCTGCTCCCTCA  938

seq1  CTAGCACCACCTGACACCCCACCTTTCATAGTTACTGTGTTTGGAAGGGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACCACCTGACACCCCACCTTTCATAGTTACTGTGTTTGGAAGGGT  988

seq1  TTGCTGTTCCTTATTTTATGGCCTACGTGTGCATTCCTAGATAGCAGAAT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTCCTTATTTTATGGCCTACGTGTGCATTCCTAGATAGCAGAAT  1038

seq1  TC  1048
      ||
seq2  TC  1040

seq1: chr7_119614163_119615201
seq2: B6Ng01-069E06.g_68_1095

seq1  GAATTCTTTGCACATCCCTGAAGGATCTAGTCAAGTTGCCTGTTGGAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCACATCCCTGAAGGATCTAGTCAAGTTGCCTGTTGGAAGG  50

seq1  CCTTCCCATGCCCCAGGGAAGCAGAGGGCTATCACAGCAGGAGGTTGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCATGCCCCAGGGAAGCAGAGGGCTATCACAGCAGGAGGTTGTGA  100

seq1  CAGGTGAACCCTTCATTAATAACAATAATAAAAAGAACAATTCTATCTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGAACCCTTCATTAATAACAATAATAAAAAGAACAATTCTATCTTC  150

seq1  CCTTTCTGGGGCCATGAGCTTCCTAGCATGCGCAATAGACAAAAAGGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCTGGGGCCATGAGCTTCCTAGCATGCGCAATAGACAAAAAGGACA  200

seq1  AGGGATGTCTGTCTGCTAAAATTGAACACTGTGTCCAAAGCTTCTGTAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGTCTGTCTGCTAAAATTGAACACTGTGTCCAAAGCTTCTGTAGC  250

seq1  TTACGGAAAGTGCAAGCTATGGTAGACTCGACCTTGTGTACGGTTAAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGAAAGTGCAAGCTATGGTAGACTCGACCTTGTGTACGGTTAAGAG  300

seq1  GAGGATTCTTCCTATAGGGATGGGCCTGCCTCCACCACTCCAGCATGAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATTCTTCCTATAGGGATGGGCCTGCCTCCACCACTCCAGCATGAGG  350

seq1  CTTGAGTTAGTGAATGCTCGCCCCATGCTTGGCTTCGATGTGGGGGTCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGTTAGTGAATGCTCGCCCCATGCTTGGCTTCGATGTGGGGGTCTG  400

seq1  AGCCCAGGTCCTCAGGAGTGTGTGCAGCCACCATGTACCCCACCCCTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGGTCCTCAGGAGTGTGTGCAGCCACCATGTACCCCACCCCTCAG  450

seq1  CATCTTCCTCTTCAGGGTTTGACTTGGCGGCATGTGATTTCACCTGCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCCTCTTCAGGGTTTGACTTGGCGGCATGTGATTTCACCTGCACA  500

seq1  GGATCCTGCAATCTCGCCCATCCGAAGCCTTTGGGACGGGTGTGGTTACG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCTGCAATCTCGCCCATCCGAAGCCTTTGGGACGGGTGTGGTTACG  550

seq1  TGAACTGCCACCTAGGCTCTAGGACATTGGCTGCCGGTTCCACTGTTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTGCCACCTAGGCTCTAGGACATTGGCTGCCGGTTCCACTGTTTTT  600

seq1  TCAGGATGAGATTCTCAATGGAAAAGTCCAGCAACAAACTGGAAGGTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGATGAGATTCTCAATGGAAAAGTCCAGCAACAAACTGGAAGGTTGT  650

seq1  TTGCCCCAGATGAAAGTCATTAATCCCCCACCCAGGGGTCTCTCACAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCCAGATGAAAGTCATTAATCCCCCACCCAGGGGTCTCTCACAAAC  700

seq1  AGAAAGTTTATCATTGTAGCACACAGCAAGTCTGCAGAGGAGGAAGACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTTTATCATTGTAGCACACAGCAAGTCTGCAGAGGAGGAAGACCT  750

seq1  AAAGAGAGTATTCAGAGCCTCCTGGGCCTTTTGCCCCACACAACAGTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAGTATTCAGAGCCTCCTGGGCCTTTTGCCCCACACAACAGTCTA  800

seq1  AAGCTTCAGAAAGGCCCCGAATCAGGCGCATGCTCTACCCCTGGCCAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTCAGAAAGGCCCCGAATCAGGCGCATGCTCTACCCCTGGCCAGCC  850

seq1  CCAGGATCTGAGAGCTGAGTGGTGACTGTGCCTGGCACGCCCACTTAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCAGGATCTGAGAGCTGAGTGGTGACTGTGCCTGGCACG-CCACTTAGCC  899

seq1  AAACCTCAGCTCCGTGCCAGCGTGGAGCTATTAATTATTTTTCTTTGTCA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAACCTCAGCTCCGTGCCAGCGTGGAGCTA-TAATTATTTTTCTTTGTCA  948

seq1  AACCTTTGTCAGCAACTTCATCCCAAAAGGAATGGTTTATTTTCCCTTTG  1000
      || |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||
seq2  AA-CTTTGTCAGC-ACTTCATCCCAAA--GGATGGTTTATTTT-CCTTTG  993

seq1  GCGGTGTTTGTGACTGTAGTAAATAAGAGATAATTACAT  1039
         ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  --CGTGTTTGTGACTGTAGT-AATAAGAGA-AATTACAT  1028