BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070I10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 99,389,101 - 99,508,917
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream genenone
Downstream geneCcdc90b, Ankrd42, Pcf11, LOC676240, LOC100040007, 4632427E13Rik, Rab30, 4632434I11Rik, Prcp, A830059I20Rik, LOC100040298
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070I10.bB6Ng01-070I10.g
ACCDH888505DH888506
length1,2341,083
definitionDH888505|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070I10, 5' end.DH888506|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070I10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,507,679 - 99,508,917)(99,389,101 - 99,390,195)
sequence
gaattctggctaacattaaatcaaagcacaaaaactttcatgtcagagaa
tctgttttcagatacttaaagtgacaaacactttcttttattgacgccat
gccatctccaaggcccttaagaatctcacagttgtctgttggcttttaaa
gttaaagcctgatagaaattctccttggaatatttttgaagtattcaaca
agggcttcatgaggcaactagagaaatagagggtgtgtcctgagttctca
ttacaggaattgagaaggatggaagtgtgtggtcatctcactaggagaat
gcacagccactcagcagaaatcaattcactaagtatttgtggtgtgtggt
ctgagaagggtcctttctgttgaggagctatttgtgctgaggaataggag
gtagtttcttggaagaagagaaatcttattagaaatttgtcacattctta
gggaataagagataggttcatggaggaagccacggcatatcattttgtgt
acatgtacaaggactgacagcaatttgtcagatgaacagttcgaccaaag
aggcaaaggagagaaatctacttacagttaacccatgttagtcaagactc
agatttgagtaagtctcaaatagaaaaccaacatgaagttgggccatcac
ctctgacagaagtgagaaaattggacagggaatcataagaggaaccagac
tctgctagctgttcctagcaaactctacatccagtagcacacaaactggg
atagggctagagatatctagatgagaaggcagaagtgagaagcactcaga
ctgcccctggcaggggagccttgtgactagaaagatccacactgtaataa
tcacgatttctatattctgctttgcagtctgctatcacacagtgatcata
acaactgtcttcgaactaccatggacctggactctgtccattacgcattc
tccatgtactttgttttctgatctggtccccagaagttagtaggactttt
tgcttgtcttaaatactgtgcttagtgctgaaggtagcagtccatttata
ctcaatttatgacccagctggcgagacagtactgccagcagatcagttat
attagaagtttgttagaatatccacagtagaggcttttagaatcttgtga
gagaaaaactaagccttgcttgtctgaatgttgatggtgactaatcctgt
ggcgttgtcttactggctagcgaatggcttctcc
gaattcactttgagtgggctggtttatatctattctgaacccaagagtaa
atcatttgcctcattctgaaatttagaataaaggtagccttcctagggct
ttacaagtctctaaatgacatttttcagctgttgctgtgacttaggtttg
gtgaggatggtagagaagctgtcaataggtttgggacatccacaacttgt
taactacaaaacacataattaacaaatgtcctctccagtcagtacataga
ataatatagtgagagccaaccatatcagatggtgcttaatgtccataaat
caacttccaggatgagtaggggctttccagagaataagactgagaaagtt
gaggtgcagctcagcaaaagagtgcttgcctagaacacaaacctccaggt
ttgattccccagcattgaaaatttaaataaaagaaaaagataagcttcaa
ggcacagaatataatccttttgtgttcacggataccatccaggtagctgt
taccctggcactattacaagactcaccagccagaagccatctgtcccaaa
atgtaatgagcagaaaacctgaagtatcaacttcaccaaaactggctatt
tgactctaccatagacaaatactctcatgttctttccctcgctctctccc
tccctccctcccttcctttttccctccctcccctccctcccctcccctcc
acttccccccactctctctctcctcagtataaatgcatgtttggactcaa
ctcaatgtgaaccttaacatttttgtcccaaggttcagagtgatagtatt
ttagagctggctataccatcttcatccttatcactgcactttcccctctt
aatgaaacctacagaaatggttcctaactcacacagtaccgcaaatgctt
ttggattttggtgtcatgaaactaaggtattaacatgaagatgaatggga
ggattcgctgagtgatacatatgatgtgtatcatattgagatgacattca
gcaggatgaaatattttttattccaaatacaattgtttcatggtaatcag
acttaactcggatctctgcagtatgttatattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_99507679_99508917
seq2: B6Ng01-070I10.b_44_1277 (reverse)

seq1  GGAGAAAGCCATCTGGCTAGCCCAGTAAAAGCAAACAGCCACAGGGGTTA  50
      |||| ||||||| | ||||| ||||||| | |||   |||||| || |||
seq2  GGAG-AAGCCAT-TCGCTAG-CCAGTAAGA-CAA--CGCCACA-GGATTA  43

seq1  GTCACCATCAACATTCAGACAAGGCAAGCCTTAG-TTTTCTCT-AC-AGA  97
      |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||
seq2  GTCACCATCAACATTCAGACAA-GCAAGGCTTAGTTTTTCTCTCACAAGA  92

seq1  TCCTAAAAGCTTCTACTGT-GATA-TCTAACAAACTCTAAATATAACTGA  145
      | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||
seq2  TTCTAAAAGCCTCTACTGTGGATATTCTAACAAACTTCTAATATAACTGA  142

seq1  TCTGCTTGCAGTACTGTCTCGCCAGCTTGGTTCATAAATTGAGTATAAAT  195
      |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGGCAGTACTGTCTCGCCAGC-TGGGTCATAAATTGAGTATAAAT  191

seq1  GGACTGCTACCTTCAGCACTAAGCACAGTATTTAAGACAAGCAAAAAGTC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGCTACCTTCAGCACTAAGCACAGTATTTAAGACAAGCAAAAAGTC  241

seq1  CTTACTAACTTCTGGGGACCAGATCAGAAAACAAAGTACATGGAGAATGC  295
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TACTAACTTCTGGGGACCAGATCAGAAAACAAAGTACATGGAGAATGC  290

seq1  GTAATGGACAGAGTCCAGGTCCATGGTAGTTCGAAGACAGTTGTTATGAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGGACAGAGTCCAGGTCCATGGTAGTTCGAAGACAGTTGTTATGAT  340

seq1  CACTGTGTGATAGCAGACTGCAAAGCAGAATATAGAAATCGTGATTATTA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGTGATAGCAGACTGCAAAGCAGAATATAGAAATCGTGATTATTA  390

seq1  CAGTGTGGATCTTTCTAGTCACAAGGCTCCCCTGCCAGGGGCAGTCTGAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGGATCTTTCTAGTCACAAGGCTCCCCTGCCAGGGGCAGTCTGAG  440

seq1  TGCTTCTCACTTCTGCCTTCTCATCTAGATATCTCTAGCCCTATCCCAGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTCACTTCTGCCTTCTCATCTAGATATCTCTAGCCCTATCCCAGT  490

seq1  TTGTGTGCTACTGGATGTAGAGTTTGCTAGGAACAGCTAGCAGAGTCTGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGCTACTGGATGTAGAGTTTGCTAGGAACAGCTAGCAGAGTCTGG  540

seq1  TTCCTCTTATGATTCCCTGTCCAATTTTCTCACTTCTGTCAGAGGTGATG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTTATGATTCCCTGTCCAATTTTCTCACTTCTGTCAGAGGTGATG  590

seq1  GCCCAACTTCATGTTGGTTTTCTATTTGAGACTTACTCAAATCTGAGTCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAACTTCATGTTGGTTTTCTATTTGAGACTTACTCAAATCTGAGTCT  640

seq1  TGACTAACATGGGTTAACTGTAAGTAGATTTCTCTCCTTTGCCTCTTTGG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAACATGGGTTAACTGTAAGTAGATTTCTCTCCTTTGCCTCTTTGG  690

seq1  TCGAACTGTTCATCTGACAAATTGCTGTCAGTCCTTGTACATGTACACAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAACTGTTCATCTGACAAATTGCTGTCAGTCCTTGTACATGTACACAA  740

seq1  AATGATATGCCGTGGCTTCCTCCATGAACCTATCTCTTATTCCCTAAGAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATATGCCGTGGCTTCCTCCATGAACCTATCTCTTATTCCCTAAGAA  790

seq1  TGTGACAAATTTCTAATAAGATTTCTCTTCTTCCAAGAAACTACCTCCTA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAAATTTCTAATAAGATTTCTCTTCTTCCAAGAAACTACCTCCTA  840

seq1  TTCCTCAGCACAAATAGCTCCTCAACAGAAAGGACCCTTCTCAGACCACA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAGCACAAATAGCTCCTCAACAGAAAGGACCCTTCTCAGACCACA  890

seq1  CACCACAAATACTTAGTGAATTGATTTCTGCTGAGTGGCTGTGCATTCTC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAAATACTTAGTGAATTGATTTCTGCTGAGTGGCTGTGCATTCTC  940

seq1  CTAGTGAGATGACCACACACTTCCATCCTTCTCAATTCCTGTAATGAGAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGAGATGACCACACACTTCCATCCTTCTCAATTCCTGTAATGAGAA  990

seq1  CTCAGGACACACCCTCTATTTCTCTAGTTGCCTCATGAAGCCCTTGTTGA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGACACACCCTCTATTTCTCTAGTTGCCTCATGAAGCCCTTGTTGA  1040

seq1  ATACTTCAAAAATATTCCAAGGAGAATTTCTATCAGGCTTTAACTTTAAA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTCAAAAATATTCCAAGGAGAATTTCTATCAGGCTTTAACTTTAAA  1090

seq1  AGCCAACAGACAACTGTGAGATTCTTAAGGGCCTTGGAGATGGCATGGCG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAACAGACAACTGTGAGATTCTTAAGGGCCTTGGAGATGGCATGGCG  1140

seq1  TCAATAAAAGAAAGTGTTTGTCACTTTAAGTATCTGAAAACAGATTCTCT  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAAAAGAAAGTGTTTGTCACTTTAAGTATCTGAAAACAGATTCTCT  1190

seq1  GACATGAAAGTTTTTGTGCTTTGATTTAATGTTAGCCAGAATTC  1239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGAAAGTTTTTGTGCTTTGATTTAATGTTAGCCAGAATTC  1234

seq1: chr7_99389101_99390195
seq2: B6Ng01-070I10.g_65_1147

seq1  GAATTCACTTTGAGTGGGCTGGTTTATATCTATTCTGAACCCAAGAGTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTGAGTGGGCTGGTTTATATCTATTCTGAACCCAAGAGTAA  50

seq1  ATCATTTGCCTCATTCTGAAATTTAGAATAAAGGTAGCCTTCCTAGGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTGCCTCATTCTGAAATTTAGAATAAAGGTAGCCTTCCTAGGGCT  100

seq1  TTACAAGTCTCTAAATGACATTTTTCAGCTGTTGCTGTGACTTAGGTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGTCTCTAAATGACATTTTTCAGCTGTTGCTGTGACTTAGGTTTG  150

seq1  GTGAGGATGGTAGAGAAGCTGTCAATAGGTTTGGGACATCCACAACTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGATGGTAGAGAAGCTGTCAATAGGTTTGGGACATCCACAACTTGT  200

seq1  TAACTACAAAACACATAATTAACAAATGTCCTCTCCAGTCAGTACATAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTACAAAACACATAATTAACAAATGTCCTCTCCAGTCAGTACATAGA  250

seq1  ATAATATAGTGAGAGCCAACCATATCAGATGGTGCTTAATGTCCATAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATAGTGAGAGCCAACCATATCAGATGGTGCTTAATGTCCATAAAT  300

seq1  CAACTTCCAGGATGAGTAGGGGCTTTCCAGAGAATAAGACTGAGAAAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCCAGGATGAGTAGGGGCTTTCCAGAGAATAAGACTGAGAAAGTT  350

seq1  GAGGTGCAGCTCAGCAAAAGAGTGCTTGCCTAGAACACAAACCTCCAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGCAGCTCAGCAAAAGAGTGCTTGCCTAGAACACAAACCTCCAGGT  400

seq1  TTGATTCCCCAGCATTGAAAATTTAAATAAAAGAAAAAGATAAGCTTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTCCCCAGCATTGAAAATTTAAATAAAAGAAAAAGATAAGCTTCAA  450

seq1  GGCACAGAATATAATCCTTTTGTGTTCACGGATACCATCCAGGTAGCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGAATATAATCCTTTTGTGTTCACGGATACCATCCAGGTAGCTGT  500

seq1  TACCCTGGCACTATTACAAGACTCACCAGCCAGAAGCCATCTGTCCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTGGCACTATTACAAGACTCACCAGCCAGAAGCCATCTGTCCCAAA  550

seq1  ATGTAATGAGCAGAAAACCTGAAGTATCAACTTCACCAAAACTGGCTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATGAGCAGAAAACCTGAAGTATCAACTTCACCAAAACTGGCTATT  600

seq1  TGACTCTACCATAGACAAATACTCTCATGTTCTTTCCCTCGCTCTCTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCTACCATAGACAAATACTCTCATGTTCTTTCCCTCGCTCTCTCCC  650

seq1  TCCCTCCCTCCCTTCCTTTTTCCCTCCCTCCCCTCCCTCACCTCCCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCCCTCCCTCCCTTCCTTTTTCCCTCCCTCCCCTCCCTCCCCTCCCCTCC  700

seq1  ACTTCCCCCCACTCTCTCTCTCCTCAGTATAAATGCATGTTTGGACTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCCCCACTCTCTCTCTCCTCAGTATAAATGCATGTTTGGACTCAA  750

seq1  CTCAATGTGAACCTTAACATTTTTGTCCCAAGGTTCAGAGTGATAGTATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATGTGAACCTTAACATTTTTGTCCCAAGGTTCAGAGTGATAGTATT  800

seq1  TTAGAGCTGGCTATACCATCTTCATCCTTATCACTGCACTTTCCCCTCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGCTGGCTATACCATCTTCATCCTTATCACTGCACTTTCCCCTCTT  850

seq1  AATGAAACCTACAGAAAATGGTTCCTAACTCACACAGTACCGCAAATGCT  900
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAACCTACAG-AAATGGTTCCTAACTCACACAGTACCGCAAATGCT  899

seq1  TTTGGATTTTGGTGTCATGAAACTAAGGGTATTAACATGTAAGATGAATG  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  TTTGGATTTTGGTGTCATGAAACTAA-GGTATTAACATG-AAGATGAATG  947

seq1  GGAGGATTCGCTGAGTGATACATATGATGTGTATCATATTGAGAATGACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGAGGATTCGCTGAGTGATACATATGATGTGTATCATATTGAG-ATGACA  996

seq1  TACAGCAGAATGAAATATTTTTTA-TCCAAATACAAATGTTCCATGGAAA  1049
      | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |
seq2  TTCAGCAGGATGAAATATTTTTTATTCCAAATACAATTGTTTCATGG-TA  1045

seq1  ATCAGACTTAACTCTGATCTCTGCAGTATGTATAATTTATATATTT  1095
      |||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||
seq2  ATCAGACTTAACTCGGATCTCTGCAGTATGT--------TATATTT  1083