BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073K02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 90,717,861 - 90,829,633
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmc3, Stard5, Il16
Upstream geneAdamtsl3, 1700129I04Rik, Eftud1, LOC100038986, LOC619808, Rkhd3, LOC619909, A530021J07Rik, EG666160
Downstream genePhgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik, Arnt2, LOC100039239, Fah, Zfand6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073K02.bB6Ng01-073K02.g
ACCDH890698DH890699
length1,0451,186
definitionDH890698|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073K02, 5' end.DH890699|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073K02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,717,861 - 90,718,910)(90,828,437 - 90,829,633)
sequence
gaattccaaaatcaacctatttgagtcataagatagaaagacattcaagt
tttagtgaaagacataggacttccttcagcactgagaaaatcataactcc
attttaaacacacaaaaacatacgtgtgtaccaataagccagattttgcc
aagaatcaaacacaagaagcagaggtggtggtggtggtgttttctgatcc
tgtgtatgaggtttgcaattaattctgcagaaattatggaaaagatggct
tccagggacctcacacagctccaggtattgccatgccagccagatctgga
tccccaaatgtcaatgtaaacatgagaaatcaatcccccaaattttagag
ggtggagctaccgatcttaaggtggcttcaagtattctgtgtctacaaag
tttcctaaaaggtggtctgtggtggttagaattagaatggccccataggc
tgatgtttgaatacttggtctctagttggtggcttgtttggaaaagatta
gaagatgtggccctgctggagagtttatgtttctggggatgggattttaa
ggtttcaaaagattattttgagtcagcactctctgcctcatgctcatgga
atcaagatatgagttcagctgttcctaccttccttctaccatcatggact
cttgagcctatgaaactgtaagcacaaatagattctttcttttatagttg
tcatggtgttttatcacagcaatagagagccccccaactaagacagcatc
ctttctccttttttggcatgcatccaggaaagcacacaggacaatagcag
agcaagagttgccttgacacagagatgctgtgaagtttacagaaaagctg
actggactgtgtggttccgtgataggatactgtataaactgatgctgtat
aaacagcaggaaagacctggctggccagaaccatgacatgagattcacag
agagcccagtgatacctggtactatagtctaaaacattccttgatggtgg
gggattgatggacacagttcccaattctatgtggttgggaactct
gaattcatcttccccctttgagtctttgagttctagacttcttgcctact
gcacactcatgcctagcgcaagcagggcttttggaaaatgtgctttgagc
tgaacacaattttatagtgatgtctcgaactcagctcaaggtcttgcttg
acctttgagactaattctgagggcagtgtggtgtgtgatgttactgcttt
cacaaaggctcaccagccaggtcacttggaggaaagcttcctgcataagc
caccatatctgaatgacactcctcaaatcaccctccagctcttatactgc
tggcccctgggagacagagagtggggctcttctccttggctgatttcaca
ggtggctcatttctaccctctcgggttcttcattacagggcactgcaaga
ccaactcggtcactgagcacagctcagctcgggcagctgtctgggggtct
gcaggcgtcagtcatctccaacatagtgctgatgaagggccaagcaaagg
tgagcagagaccatcaccaacaggaagccccagagcagcgctcgctctct
tctgggaaagttgctccaaggaagagtgggaccagggttatcatccactc
gagggggcagacaagttcattcacactttcttgttgaagttaaggcaatt
ctgattcttccagttccactaagtgatcattctctctctgaggacaccgc
agtgctccccaactgctccagcactctccaggctggttccctgctcctct
tgacatgatatccccacaatgtcatcttgcctgaaacataagttaaattc
ccttacattgatttatagggctggatttcacatccacattcagatgttgg
tagaagaaagttggactcaaacacaaattttatggactctgtgtttccat
atgggtcatttgatgggcacagatgttctggctctgtcggagcatcctga
agagtcagaatggactctgttctgtctagatgatgacacatcatactaat
gtctatcccatgcctgagaagtttcaacagggcaaccaaggtatagatag
tgaaagaaatgccccagtatctcttgtgctcaccctaaagcatgctacct
tcattgcctgggccttgtttggtaactcctggcactttaccagctaaagg
aagaaagttattaccctaagttgagtgcagtccacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_90717861_90718910
seq2: B6Ng01-073K02.b_44_1088

seq1  GAATTCCAAAATCAACCTATTTGAGTCATAAGATAGAAAGACATTCAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAATCAACCTATTTGAGTCATAAGATAGAAAGACATTCAAGT  50

seq1  TTTAGTGAAAGACATAGGACTTCCTTCAGCACTGAGAAAATCATAACTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGAAAGACATAGGACTTCCTTCAGCACTGAGAAAATCATAACTCC  100

seq1  ATTTTAAACACACAAAAACATACGTGTGTACCAATAAGCCAGATTTTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAACACACAAAAACATACGTGTGTACCAATAAGCCAGATTTTGCC  150

seq1  AAGAATCAAACACAAGAAGCAGAGGTGGTGGTGGTGGTGTTTTCTGATCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATCAAACACAAGAAGCAGAGGTGGTGGTGGTGGTGTTTTCTGATCC  200

seq1  TGTGTATGAGGTTTGCAATTAATTCTGCAGAAATTATGGAAAAGATGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGAGGTTTGCAATTAATTCTGCAGAAATTATGGAAAAGATGGCT  250

seq1  TCCAGGGACCTCACACAGCTCCAGGTATTGCCATGCCAGCCAGATCTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGACCTCACACAGCTCCAGGTATTGCCATGCCAGCCAGATCTGGA  300

seq1  TCCCCAAATGTCAATGTAAACATGAGAAATCAATCCCCCAAATTTTAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAAATGTCAATGTAAACATGAGAAATCAATCCCCCAAATTTTAGAG  350

seq1  GGTGGAGCTACCGATCTTAAGGTGGCTTCAAGTATTCTGTGTCTACAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAGCTACCGATCTTAAGGTGGCTTCAAGTATTCTGTGTCTACAAAG  400

seq1  TTTCCTAAAAGGTGGTCTGTGGTGGTTAGAATTAGAATGGCCCCATAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTAAAAGGTGGTCTGTGGTGGTTAGAATTAGAATGGCCCCATAGGC  450

seq1  TGATGTTTGAATACTTGGTCTCTAGTTGGTGGCTTGTTTGGAAAAGATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTTGAATACTTGGTCTCTAGTTGGTGGCTTGTTTGGAAAAGATTA  500

seq1  GAAGATGTGGCCCTGCTGGAGAGTTTATGTTTCTGGGGATGGGATTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGTGGCCCTGCTGGAGAGTTTATGTTTCTGGGGATGGGATTTTAA  550

seq1  GGTTTCAAAAGATTATTTTGAGTCAGCACTCTCTGCCTCATGCTCATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCAAAAGATTATTTTGAGTCAGCACTCTCTGCCTCATGCTCATGGA  600

seq1  ATCAAGATATGAGTTCAGCTGTTCCTACCTTCCTTCTACCATCATGGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGATATGAGTTCAGCTGTTCCTACCTTCCTTCTACCATCATGGACT  650

seq1  CTTGAGCCTATGAAACTGTAAGCACAAATAGATTCTTTCTTTTATAGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGCCTATGAAACTGTAAGCACAAATAGATTCTTTCTTTTATAGTTG  700

seq1  TCATGGTGTTTTATCACAGCAATAGAGAGCCCCCCAACTAAGACAGCATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGTGTTTTATCACAGCAATAGAGAGCCCCCCAACTAAGACAGCATC  750

seq1  C-TTCTCCTTTTTTGGCATGCATCCAGGAAAGCACACAGGACAATAGCAG  799
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCCTTTTTTGGCATGCATCCAGGAAAGCACACAGGACAATAGCAG  800

seq1  AGCAAGAGTTGCCTTGACACAGAGAATGCTGTGAAGTTTACAGAAAAGCT  849
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGAGTTGCCTTGACACAGAG-ATGCTGTGAAGTTTACAGAAAAGCT  849

seq1  GACTGGACTGTGTGGTTCCGTGATAGGATACTGTATAAACTGATGCTGTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGACTGTGTGGTTCCGTGATAGGATACTGTATAAACTGATGCTGTA  899

seq1  TAAACAGCAGGGAAAGACCTGGCTGGCCAGAACCATGACATGAGATTCAC  949
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGCA-GGAAAGACCTGGCTGGCCAGAACCATGACATGAGATTCAC  948

seq1  AGAAGAGCCCAGTGATACCTGGTACTATAGTCTAAACACATTCCTTGATT  999
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  AG-AGAGCCCAGTGATACCTGGTACTATAGTCTAAA-ACATTCCTTGATG  996

seq1  GTGTGTGATTGATGGACACAGTTCCCAAATTCATATGTGGCTGGGGACTC  1049
      ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||
seq2  GTGGGGGATTGATGGACACAGTTCCC-AATTC-TATGTGGTTGGGAACTC  1044

seq1  T  1050
      |
seq2  T  1045

seq1: chr7_90828437_90829633
seq2: B6Ng01-073K02.g_66_1251 (reverse)

seq1  GGTGGACTGCACACTCAAACTGTGAGGGTAAATAAACCCTTCCTCCTCTA  50
      |||||||||  |||||||    | ||||| |||||  | ||| |||| | 
seq2  GGTGGACTG--CACTCAA---CTTAGGGT-AATAA--CTTTCTTCCT-TT  41

seq1  AGCTGGTAAGTGGCCAGGAAGGTACCCAATACAAAGCCCCAGGC-ATG-A  98
      |||||||||   |||||| || |||| ||    ||| ||||||| ||| |
seq2  AGCTGGTAAAGTGCCAGG-AGTTACCAAA---CAAGGCCCAGGCAATGAA  87

seq1  GGTAGCATGCTTTAGGGTGAGCACAAGAGATACTGGGGCA-TTCTCTCAC  147
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
seq2  GGTAGCATGCTTTAGGGTGAGCACAAGAGATACTGGGGCATTTCTTTCAC  137

seq1  TATCTATACCTTGGTTTCCCCTGTTGATACTTCTCAGGCATGGGATAGAC  197
      |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATACCTTGG-TTGCCCTGTTGAAACTTCTCAGGCATGGGATAGAC  186

seq1  ATTAGTATGATGTGTCATCATCTAGACAGAACAGAGTCCATTCTGACTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTATGATGTGTCATCATCTAGACAGAACAGAGTCCATTCTGACTCT  236

seq1  TCAGGATGCTCCGACAGAGCCAGAACATCTGTGGCCATCAAATGACCCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCAGGATGCTCCGACAGAGCCAGAACATCTGTGCCCATCAAATGACCCAT  286

seq1  ATGGAAACACAGAGTCCATAAAATTTGTGTTTGAGTCCAACTTTCTTCTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAACACAGAGTCCATAAAATTTGTGTTTGAGTCCAACTTTCTTCTA  336

seq1  CCAACATCTGAATGTGGATGTGAAATCCAGCCCTATAAATCAATGTAAGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATCTGAATGTGGATGTGAAATCCAGCCCTATAAATCAATGTAAGG  386

seq1  GAATTTAACTTATGTTTCAGGCAAGATGACATTGTGGGGATATCATGTCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTAACTTATGTTTCAGGCAAGATGACATTGTGGGGATATCATGTCA  436

seq1  AGAGGAGCAGGGAACCAGCCTGGAGAGTGCTGGAGCAGTTGGGGAGCACT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGCAGGGAACCAGCCTGGAGAGTGCTGGAGCAGTTGGGGAGCACT  486

seq1  GCGGTGTCCTCAGAGAGAGAATGATCACTTAGTGGAACTGGAAGAATCAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTGTCCTCAGAGAGAGAATGATCACTTAGTGGAACTGGAAGAATCAG  536

seq1  AATTGCCTTAACTTCAACAAGAAAGTGTGAATGAACTTGTCTGCCCCCTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCCTTAACTTCAACAAGAAAGTGTGAATGAACTTGTCTGCCCCCTC  586

seq1  GAGTGGATGATAACCCTGGTCCCACTCTTCCTTGGAGCAACTTTCCCAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGATGATAACCCTGGTCCCACTCTTCCTTGGAGCAACTTTCCCAGA  636

seq1  AGAGAGCGAGCGCTGCTCTGGGGCTTCCTGTTGGTGATGGTCTCTGCTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCGAGCGCTGCTCTGGGGCTTCCTGTTGGTGATGGTCTCTGCTCA  686

seq1  CCTTTGCTTGGCCCTTCATCAGCACTATGTTGGAGATGACTGACGCCTGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGCTTGGCCCTTCATCAGCACTATGTTGGAGATGACTGACGCCTGC  736

seq1  AGACCCCCAGACAGCTGCCCGAGCTGAGCTGTGCTCAGTGACCGAGTTGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCCCAGACAGCTGCCCGAGCTGAGCTGTGCTCAGTGACCGAGTTGG  786

seq1  TCTTGCAGTGCCCTGTAATGAAGAACCCGAGAGGGTAGAAATGAGCCACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAGTGCCCTGTAATGAAGAACCCGAGAGGGTAGAAATGAGCCACC  836

seq1  TGTGAAATCAGCCAAGGAGAAGAGCCCCACTCTCTGTCTCCCAGGGGCCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAATCAGCCAAGGAGAAGAGCCCCACTCTCTGTCTCCCAGGGGCCA  886

seq1  GCAGTATAAGAGCTGGAGGGTGATTTGAGGAGTGTCATTCAGATATGGTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTATAAGAGCTGGAGGGTGATTTGAGGAGTGTCATTCAGATATGGTG  936

seq1  GCTTATGCAGGAAGCTTTCCTCCAAGTGACCTGGCTGGTGAGCCTTTGTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATGCAGGAAGCTTTCCTCCAAGTGACCTGGCTGGTGAGCCTTTGTG  986

seq1  AAAGCAGTAACATCACACACCACACTGCCCTCAGAATTAGTCTCAAAGGT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAGTAACATCACACACCACACTGCCCTCAGAATTAGTCTCAAAGGT  1036

seq1  CAAGCAAGACCTTGAGCTGAGTTCGAGACATCACTATAAAATTGTGTTCA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAGACCTTGAGCTGAGTTCGAGACATCACTATAAAATTGTGTTCA  1086

seq1  GCTCAAAGCACATTTTCCAAAAGCCCTGCTTGCGCTAGGCATGAGTGTGC  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAAGCACATTTTCCAAAAGCCCTGCTTGCGCTAGGCATGAGTGTGC  1136

seq1  AGTAGGCAAGAAGTCTAGAACTCAAAGACTCAAAGGGGGAAGATGAATTC  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGCAAGAAGTCTAGAACTCAAAGACTCAAAGGGGGAAGATGAATTC  1186