BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074N22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 72,609,342 - 72,754,612
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm1693, EG665234
Upstream geneApba2, 5730507A09Rik, Ndnl2, Tjp1
Downstream geneTarsl2, Tm2d3, LOC665241, Pcsk6, Snrpa1, H47, Chsy1, Lrrk1, Aldh1a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074N22.bB6Ng01-074N22.g
ACCDH891600DH891601
length9221,098
definitionDH891600|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074N22, 5' end.DH891601|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074N22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,609,342 - 72,610,261)(72,753,519 - 72,754,612)
sequence
gaattcaaggtaagtgcttgctttgcgcaggcaaatgctaatttaaggta
tcacgtggtgtttgaaagatttaatttgtcattattgaagttgaatttag
caagaaaattgtcactatggaaaactgccttgtgcatgatttctgcaaag
tttacttagtcggagggagctgttccactttcaaatctgtatatacagaa
ggactgataaattgtaactatttggaaagccttgctacattgtaaataat
taacaaactgttgttcaatatatggccagagttttctaaggtctcagaag
ggcaatggagtgcccagggtagtgtatgttatccctacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacaatttagcataacagagtaagtgggg
aagtcatcactgtatttcctcaatgggcaacaagcaatgcttacatctaa
tccaccagaggctgattaacttcatccctaattaaaaaaggaaaaaagat
ggtagcattaaattcatatttactttccatgatggcggctaagggaaacc
cacgggatgggggggtggggtgcttcaaatccctacataagcactgtcac
aacacacagtgttctcttgtcctggtagctttccttgtctcactgctcag
ttcctgagcccacataacgtctgatgtcattcaaaattggaatttttctc
gaagacctcaccttcaacatagcagatctaactgttaatccacgatatta
ggtttaaatatccagaaattaggtttaaagccaacttactgctatatttg
agtaacatttctaagctacactacacaattgggatatagtattaccaaac
agtgagctgggatattatattggcctttttctctcccagccacacccccc
caatcatctacatgccaacaca
gaattccagaatggtgtaaagtcaggtgctatgggaagcacagggaacaa
cctctagtagttggtttcgatgaaagtatgaaagggtgagtatcctcatc
atctactgatgcataataaactattaacacaaacagcacctgcgggcagg
atacctggacacagctcacttgtgaatccagctccaggtttctcagaagg
ctacagtcagggtgtcagacatgatgtcatctgaaggtgccactggagca
ggatcgcgtctaagcttcccccatgtcctttttggaggcattcagttctg
ctagacactgggataagggtcgtgctccattggcggtggtcggaggctgc
ccccagcttcttgccgtgtgaatgtccccaactcgctataatcacagcaa
gcatgtgagaagagtcagagaatgaatgaataaagaagatggaaaacata
gtcttttatagtccactctcatgatacccatcatccttgctgaattacat
acattgaaatggggttattgggttcatctcccacatacaaggaggggatt
attctatccattgcatggctatcaggagtgggaatctcaccagaagctag
ttgcattgctagagattgggaaggtagaaatgtcttgggcctcaaataca
atgacaggatggaattccgtaggcctccgatgacgaatccatgtgtcggt
gagtgtgcagtgagaatgtggcttccagaaccacaacctatgactatctg
agacacaggacagctccaggacgagagcaagctggagagacagggttagc
aagcatccctgtttctggccaccagcaaggcatgggtcatttaaacttca
ttgcacattgtccccaccataagagagttctccactaggaccagcaggcc
ctccttgagaacttttaacagacctacctccagctgatgtccatttttcc
agaaaaatctcatgtgattccaaagaaccggctgatgaaactgactttga
ccacgtattagaccatattgggagaaatgagcactttaacatttttaaaa
acaaaataagtctgaaaatatgtttctttaataaacaggttactggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_72609342_72610261
seq2: B6Ng01-074N22.b_46_967

seq1  GAATTCAAGGTAAGTGCTTGCTTTGCGCAGGCAAATGCTAATTTAAGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGTAAGTGCTTGCTTTGCGCAGGCAAATGCTAATTTAAGGTA  50

seq1  TCACGTGGTGTTTGAAAGATTTAATTTGTCATTATTGAAGTTGAATTTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGTGGTGTTTGAAAGATTTAATTTGTCATTATTGAAGTTGAATTTAG  100

seq1  CAAGAAAATTGTCACTATGGAAAACTGCCTTGTGCATGATTTCTGCAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAAATTGTCACTATGGAAAACTGCCTTGTGCATGATTTCTGCAAAG  150

seq1  TTTACTTAGTCGGAGGGAGCTGTTCCACTTTCAAATCTGTATATACAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTAGTCGGAGGGAGCTGTTCCACTTTCAAATCTGTATATACAGAA  200

seq1  GGACTGATAAATTGTAACTATTTGGAAAGCCTTGCTACATTGTAAATAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGATAAATTGTAACTATTTGGAAAGCCTTGCTACATTGTAAATAAT  250

seq1  TAACAAACTGTTGTTCAATATATGGCCAGAGTTTTCTAAGGTCTCAGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAACTGTTGTTCAATATATGGCCAGAGTTTTCTAAGGTCTCAGAAG  300

seq1  GGCAATGGAGTGCCCAGGGTAGTGTATGTTATCCCTACACACACACACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATGGAGTGCCCAGGGTAGTGTATGTTATCCCTACACACACACACAC  350

seq1  ACACACACACACACACACACACACAATTTAGCATAACAGAGTAAGTGGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACAATTTAGCATAACAGAGTAAGTGGGG  400

seq1  AAGTCATCACTGTATTTCCTCAATGGGCAACAAGCAATGCTTACATCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATCACTGTATTTCCTCAATGGGCAACAAGCAATGCTTACATCTAA  450

seq1  TCCACCAGAGGCTGATTAACTTCATCCCTAATTAAAAAAGGAAAAAAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCAGAGGCTGATTAACTTCATCCCTAATTAAAAAAGGAAAAAAGAT  500

seq1  GGTAGCATTAAATTCATATTTACTTTCCATGATGGCGGCTAAGGGAAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGCATTAAATTCATATTTACTTTCCATGATGGCGGCTAAGGGAAACC  550

seq1  CACGGGATGGGGGGGTGGGGTGCTTCAAATCCCTACATAAGCACTGTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGGATGGGGGGGTGGGGTGCTTCAAATCCCTACATAAGCACTGTCAC  600

seq1  AACACACAGTGTTCTCTTGTCCTGGTAGCTTTCCTTGTCTCACTGCTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACAGTGTTCTCTTGTCCTGGTAGCTTTCCTTGTCTCACTGCTCAG  650

seq1  TTCCTGAGCCCACATAACGTCTGATGTCATTCAAAATTGGAATTTTTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGAGCCCACATAACGTCTGATGTCATTCAAAATTGGAATTTTTCTC  700

seq1  GAAGACCTCACCTTCAACATAGCAGATCTAACTGTTAATCCACGATATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACCTCACCTTCAACATAGCAGATCTAACTGTTAATCCACGATATTA  750

seq1  GGTTT-AATATCCAGAAATTAGGTTTAAAGCCAACTTACTGCTATATTTG  799
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAAATATCCAGAAATTAGGTTTAAAGCCAACTTACTGCTATATTTG  800

seq1  AGTAACATTTCTAAAGCTACACTACACAATTGGGATATAGTATTACCAAA  849
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACATTTCT-AAGCTACACTACACAATTGGGATATAGTATTACCAAA  849

seq1  CAGTGAGCTGGGATATTATA-TGGCC-TTTTCTCTCCAAGCCACA-CCCC  896
      |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||
seq2  CAGTGAGCTGGGATATTATATTGGCCTTTTTCTCTCCCAGCCACACCCCC  899

seq1  CCAATCATTCTACATGCCAACACA  920
      ||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAATCA-TCTACATGCCAACACA  922

seq1: chr7_72753519_72754612
seq2: B6Ng01-074N22.g_66_1163 (reverse)

seq1  AACCAGTAA-CTGTTTAATAAAAGAAACATAATTTTCAGACTTTATTTTG  49
      ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  AACCAGTAACCTGTTT-ATTAAAGAAACAT-ATTTTCAGAC-TTATTTTG  47

seq1  TTTTTAAAAATGTTTAAGTGGCTCATTTCTCCC-ATATGGTCTAATACCG  98
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  TTTTTAAAAATGTTAAAGT-GCTCATTTCTCCCAATATGGTCTAATA-CG  95

seq1  TGGTCAAGGTCAGTTTCATCAGCCGGTTCTTTTGGAATCACATGAGATTT  148
      ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAAAGTCAGTTTCATCAGCCGGTTC-TTTGGAATCACATGAGATTT  144

seq1  TTCTGG-AAAATGGACATCAGCTGGAGGTAGGTCTGTTAAAAGTTCTCAA  197
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGAAAAATGGACATCAGCTGGAGGTAGGTCTGTTAAAAGTTCTCAA  194

seq1  GGA-GGCCTGCTGGTCCTAGTGGAGAACTCTCTTATGGTGGGGAC-ATGT  245
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGAGGGCCTGCTGGTCCTAGTGGAGAACTCTCTTATGGTGGGGACAATGT  244

seq1  GCAATGAAG-TTAAATGA-CCATGCCTTGCTGGTGGCCAG-AACA-GGAT  291
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||
seq2  GCAATGAAGTTTAAATGACCCATGCCTTGCTGGTGGCCAGAAACAGGGAT  294

seq1  GCTTGCTAA-CCTGTCTCTCCAGCTTGCTCTCGTCCTGGAGCTGTCCTGT  340
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTAACCCTGTCTCTCCAGCTTGCTCTCGTCCTGGAGCTGTCCTGT  344

seq1  GTCTCAGATAGTCATAGGTTGTGGTTCTGGAAGCCACATTCTCACTGCAC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGATAGTCATAGGTTGTGGTTCTGGAAGCCACATTCTCACTGCAC  394

seq1  ACTCACCGACACATGGATTCGTCATCGGAGGCCTACGGAATTCCATCCTG  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACCGACACATGGATTCGTCATCGGAGGCCTACGGAATTCCATCCTG  444

seq1  TCATTGTATTTGAGGCCCAAGACATTTCTACCTTCCCAATCTCTAGCAAT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGTATTTGAGGCCCAAGACATTTCTACCTTCCCAATCTCTAGCAAT  494

seq1  GCAACTAGCTTCTGGTGAGATTCCCACTCCTGATAGCCATGCAATGGATA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTAGCTTCTGGTGAGATTCCCACTCCTGATAGCCATGCAATGGATA  544

seq1  GAATAATCCCCTCCTTGTATGTGGGAGATGAACCCAATAACCCCATTTCA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATCCCCTCCTTGTATGTGGGAGATGAACCCAATAACCCCATTTCA  594

seq1  ATGTATGTAATTCAGCAAGGATGATGGGTATCATGAGAGTGGACTATAAA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTAATTCAGCAAGGATGATGGGTATCATGAGAGTGGACTATAAA  644

seq1  AGACTATGTTTTCCATCTTCTTTATTCATTCATTCTCTGACTCTTCTCAC  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTATGTTTTCCATCTTCTTTATTCATTCATTCTCTGACTCTTCTCAC  694

seq1  ATGCTTGCTGTGATTATAGCGAGTTGGGGACATTCACACGGCAAGAAGCT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTGCTGTGATTATAGCGAGTTGGGGACATTCACACGGCAAGAAGCT  744

seq1  GGGGGCAGCCTCCGACCACCGCCAATGGAGCACGACCCTTATCCCAGTGT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGCAGCCTCCGACCACCGCCAATGGAGCACGACCCTTATCCCAGTGT  794

seq1  CTAGCAGAACTGAATGCCTCCAAAAAGGACATGGGGGAAGCTTAGACGCG  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCAGAACTGAATGCCTCCAAAAAGGACATGGGGGAAGCTTAGACGCG  844

seq1  ATCCTGCTCCAGTGGCACCTTCAGATGACATCATGTCTGACACCCTGACT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGCTCCAGTGGCACCTTCAGATGACATCATGTCTGACACCCTGACT  894

seq1  GTAGCCTTCTGAGAAACCTGGAGCTGGATTCACAAGTGAGCTGTGTCCAG  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCTTCTGAGAAACCTGGAGCTGGATTCACAAGTGAGCTGTGTCCAG  944

seq1  GTATCCTGCCCGCAGGTGCTGTTTGTGTTAATAGTTTATTATGCATCAGT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCTGCCCGCAGGTGCTGTTTGTGTTAATAGTTTATTATGCATCAGT  994

seq1  AGATGATGAGGATACTCACCCTTTCATACTTTCATCGAAACCAACTACTA  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGATGAGGATACTCACCCTTTCATACTTTCATCGAAACCAACTACTA  1044

seq1  GAGGTTGTTCCCTGTGCTTCCCATAGCACCTGACTTTACACCCTTCTGGA  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAGGTTGTTCCCTGTGCTTCCCATAGCACCTGACTTTACACCATTCTGGA  1094

seq1  ATTC  1094
      ||||
seq2  ATTC  1098