BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-077O02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 118,639,890 - 118,792,853
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalntl4
Upstream geneSbf2, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658
Downstream geneLOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl, Parva, LOC627808
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-077O02.bB6Ng01-077O02.g
ACCDH893739DH893740
length1,1251,113
definitionDH893739|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077O02, 5' end.DH893740|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077O02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,791,721 - 118,792,853)(118,639,890 - 118,640,998)
sequence
gaattccatatagcaatggctctggccccttacagtgggtggagtgtaga
gtcatacactttgcatgtactttctcactcagtcttcagaattgcttggt
gtttatatatgattatctgtatcatatgattaaagagataaaggcacaaa
gacggtaagagatcacactgttgccactcttaaagctagaactataaaga
caagtctgactttggagcccaaagttttaatgaccatggtctcttctttc
agtgacttagcaaaacaaggtatcagagcgggaggaaataatttccagaa
aaagggagaggtggcaaggaaaagtagaatgaaatgtgtgaggagaggga
gaaaaacaactcattcattcactccctcatttattcattatgttttgatt
acaggcttttgatcattacttagatactgcaatatgtgaggtctactctg
ctctgtagaatctccccgagattagacagttatgggtcctgtctgcattg
tgcatgaggctcagatgggttcagaggtgaaacccatggactttttcata
gagggcaatgacaacttcatatgagcagaagcattgaactttggcttgag
ggagcatctggcagtcaacattagaggctaccatataaacaaagtctcag
agaccaggagtatattggtttattgcagtaggaaagtgaggacacaggac
gtagtatagggaaggtctgtggtgcacagtgtcagtcaggtaatagtgca
tggaaccagaggatctgtgctcccttaatgatcctactgtaccaacctat
ctttttatatgtacatcagcctctttgagtaattccagaggcttgaccag
gctggaaaatgtaccataagcttgagggaaggcttccggggaccagtcct
tcctattcaccctttgccttgggtatgcagacaggtctccacgtgtattt
catcacactgaaaccaaaaccagccctggaagctgagaaatgcaggctcc
tgttgctttagcctttctccatggagggcattgagattattgatggttga
atgtcagtatcgatctataaaaagggaccactgtaagtaaatagcgcttt
ccagggaggaaacattttcatacgt
gaattcatttacacccatcatatagtctcagcacacttccataggaactt
tcataaaatggcttaagcatctccttaagcttctgtgatacagacactat
ccaggtgtccgtgctcagtgctaccagccccttctaaagcacagagccta
ctgactttgactccttctttctttgattctcaactgaagggagccctaaa
aatgcatgaagatgctttggtggcatctagatcctgctggtgatcaggac
cctggggtggtgatcctgtacaatggcaaactactccacccaatatgtca
gtggcatgggccagatgccagccgtgtattagcccacttgctgaggccct
accctgggtgcagagggcatcaccatgcccagttaaactatggaggtttc
tccccatttcctgtcccaaatgggagacagaggtagtcctatctctaccc
aagtgtctccctgagagcaggacccccacatgtctgaaagctggaagcca
gcatggagtctgctctgagcatgggctctacagcaggcaatctgggtgac
aggccaggctctgctacctggaatggtttacataatcaccatgagcccca
gtttctacctggtaacaacagggtactagaagcacccacttccaagggct
gctggggatgctagcctagccaagaaaagtgtttttgaaaggtacctgca
aagaatgcacagcaatggagcatacacactattgtcatttttattaatta
tcttttaaatgttgaaaacactcacggaaaggtggttatgacttgaacga
gaggacatgaacagggttgatagcttatctactgttcaattctcgtgccc
attttacggatcaagaacctaaggctcagagaggtgaggtgactttgcct
tgagtgcacacagccagattaggatccaaagccagtcccttctatcactc
attcccacattgtccccatgggcagagtcatctgggtagcgaagctcaca
tgagatgggggcagggggccagagacagcggctcctttgcttaggaactg
gaacattgggcagttggccctgctgatgacagcctgctcccgaacggggt
ggagtttattaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_118791721_118792853
seq2: B6Ng01-077O02.b_46_1170 (reverse)

seq1  ACGTATTGAAAATGGTTCCTCACCTGGAAAGCGCTTATTACTTACAGTGT  50
      ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| 
seq2  ACGTA-TGAAAATGTTTCCTC-CCTGGAAAGCGCTATTTACTTACAGTGG  48

seq1  GCCATCTTTATTACATCGATACTGACATTCAACACTCAATAAATCTCCAT  100
       || | |||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||
seq2  TCCCTTTTTA-TAGATCGATACTGACATTCAACCATCAAT-AATCTCAAT  96

seq1  GCCCTCCATGGAGAAAGGCTGACAGCCAACAGGAGCCCTGCATTTCTCAG  150
      |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCCCTCCATGGAGAAAGGCT-AAAG-CAACAGGAG-CCTGCATTTCTCAG  143

seq1  CCTTCCAGGGCTGGTTTTGGTTTCAGTGTGATGAAATACACGTGGAGACC  200
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CTTCCAGGGCTGGTTTTGGTTTCAGTGTGATGAAATACACGTGGAGACC  192

seq1  TGTCTGCATACCCAAGGCAAAGGGTGAATAGGAAGGACTGGTCCCCGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCATACCCAAGGCAAAGGGTGAATAGGAAGGACTGGTCCCCGGAA  242

seq1  GCCTTCCCTCAAGCTTATGGTACATTTTCCAGCCTGGTCAAGCCTCTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCCTCAAGCTTATGGTACATTTTCCAGCCTGGTCAAGCCTCTGGA  292

seq1  ATTACTCAAAGAGGCTGATGTACATATAAAAAGATAGGTTGGTACAGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTCAAAGAGGCTGATGTACATATAAAAAGATAGGTTGGTACAGTAG  342

seq1  GATCATTAAGGGAGCACAGATCCTCTGGTTCCATGCACTATTACCTGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTAAGGGAGCACAGATCCTCTGGTTCCATGCACTATTACCTGACT  392

seq1  GACACTGTGCACCACAGACCTTCCCTATACTACGTCCTGTGTCCTCACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTGTGCACCACAGACCTTCCCTATACTACGTCCTGTGTCCTCACTT  442

seq1  TCCTACTGCAATAAACCAATATACTCCTGGTCTCTGAGACTTTGTTTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACTGCAATAAACCAATATACTCCTGGTCTCTGAGACTTTGTTTATA  492

seq1  TGGTAGCCTCTAATGTTGACTGCCAGATGCTCCCTCAAGCCAAAGTTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGCCTCTAATGTTGACTGCCAGATGCTCCCTCAAGCCAAAGTTCAA  542

seq1  TGCTTCTGCTCATATGAAGTTGTCATTGCCCTCTATGAAAAAGTCCATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTGCTCATATGAAGTTGTCATTGCCCTCTATGAAAAAGTCCATGG  592

seq1  GTTTCACCTCTGAACCCATCTGAGCCTCATGCACAATGCAGACAGGACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCACCTCTGAACCCATCTGAGCCTCATGCACAATGCAGACAGGACCC  642

seq1  ATAACTGTCTAATCTCGGGGAGATTCTACAGAGCAGAGTAGACCTCACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGTCTAATCTCGGGGAGATTCTACAGAGCAGAGTAGACCTCACAT  692

seq1  ATTGCAGTATCTAAGTAATGATCAAAAGCCTGTAATCAAAACATAATGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGTATCTAAGTAATGATCAAAAGCCTGTAATCAAAACATAATGAA  742

seq1  TAAATGAGGGAGTGAATGAATGAGTTGTTTTTCTCCCTCTCCTCACACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAGGGAGTGAATGAATGAGTTGTTTTTCTCCCTCTCCTCACACAT  792

seq1  TTCATTCTACTTTTCCTTGCCACCTCTCCCTTTTTCTGGAAATTATTTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCTACTTTTCCTTGCCACCTCTCCCTTTTTCTGGAAATTATTTCC  842

seq1  TCCCGCTCTGATACCTTGTTTTGCTAAGTCACTGAAAGAAGAGACCATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGCTCTGATACCTTGTTTTGCTAAGTCACTGAAAGAAGAGACCATGG  892

seq1  TCATTAAAACTTTGGGCTCCAAAGTCAGACTTGTCTTTATAGTTCTAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAAAACTTTGGGCTCCAAAGTCAGACTTGTCTTTATAGTTCTAGCT  942

seq1  TTAAGAGTGGCAACAGTGTGATCTCTTACCGTCTTTGTGCCTTTATCTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGTGGCAACAGTGTGATCTCTTACCGTCTTTGTGCCTTTATCTCT  992

seq1  TTAATCATATGATACAGATAATCATATATAAACACCAAGCAATTCTGAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCATATGATACAGATAATCATATATAAACACCAAGCAATTCTGAAG  1042

seq1  ACTGAGTGAGAAAGTACATGCAAAGTGTATGACTCTACACTCCACCCACT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGTGAGAAAGTACATGCAAAGTGTATGACTCTACACTCCACCCACT  1092

seq1  GTAAGGGGCCAGAGCCATTGCTATATGGAATTC  1133
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGGGCCAGAGCCATTGCTATATGGAATTC  1125

seq1: chr7_118639890_118640998
seq2: B6Ng01-077O02.g_70_1182

seq1  GAATTCATTTACACCCATCATATAGTCTCAGCACACTTCCATAGGAACTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTACACCCATCATATAGTCTCAGCACACTTCCATAGGAACTT  50

seq1  TCATAAAATGGCTTAAGCATCTCCTTAAGCTTCTGTGATACAGACACTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAAATGGCTTAAGCATCTCCTTAAGCTTCTGTGATACAGACACTAT  100

seq1  CCAGGTGTCCGTGCTCAGTGCTACCAGCCCCTTCTAAAGCACAGAGCCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTGTCCGTGCTCAGTGCTACCAGCCCCTTCTAAAGCACAGAGCCTA  150

seq1  CTGACTTTGACTCCTTCTTTCTTTGATTCTCAACTGAAGGGAGCCCTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTTGACTCCTTCTTTCTTTGATTCTCAACTGAAGGGAGCCCTAAA  200

seq1  AATGCATGAAGATGCTTTGGTGGCATCTAGATCCTGCTGGTGATCAGGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATGAAGATGCTTTGGTGGCATCTAGATCCTGCTGGTGATCAGGAC  250

seq1  CCTGGGGTGGTGATCCTGTACAATGGCAAACTACTCCACCCAATATGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGTGGTGATCCTGTACAATGGCAAACTACTCCACCCAATATGTCA  300

seq1  GTGGCATGGGCCAGATGCCAGCCGTGTATTAGCCCACTTGCTGAGGCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCATGGGCCAGATGCCAGCCGTGTATTAGCCCACTTGCTGAGGCCCT  350

seq1  ACCCTGGGTGCAGAGGGCATCACCATGCCCAGTTAAACTATGGAGGTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGGTGCAGAGGGCATCACCATGCCCAGTTAAACTATGGAGGTTTC  400

seq1  TCCCCATTTCCTGTCCCAAATGGGAGACAGAGGTAGTCCTATCTCTACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATTTCCTGTCCCAAATGGGAGACAGAGGTAGTCCTATCTCTACCC  450

seq1  AAGTGTCTCCCTGAGAGCAGGACCCCCACATGTCTGAAAGCTGGAAGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTCTCCCTGAGAGCAGGACCCCCACATGTCTGAAAGCTGGAAGCCA  500

seq1  GCATGGAGTCTGCTCTGAGCATGGGCTCTACAGCAGGCAATCTGGGTGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGAGTCTGCTCTGAGCATGGGCTCTACAGCAGGCAATCTGGGTGAC  550

seq1  AGGCCAGGCTCTGCTACCTGGAATGGTTTACATAATCACCATGAGCCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGGCTCTGCTACCTGGAATGGTTTACATAATCACCATGAGCCCCA  600

seq1  GTTTCTACCTGGTAACAACAGGGTACTAGAAGCACCCACTTCCAAGGGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTACCTGGTAACAACAGGGTACTAGAAGCACCCACTTCCAAGGGCT  650

seq1  GCTGGGGATGCTAGCCTAGCCAAGAAAAGTG-TTTTGAAAGGTACCTGCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGGATGCTAGCCTAGCCAAGAAAAGTGTTTTTGAAAGGTACCTGCA  700

seq1  AAGAATGCACAGCAATGGAGCATACACACTATTGTCATTTTTA-TAATTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AAGAATGCACAGCAATGGAGCATACACACTATTGTCATTTTTATTAATTA  750

seq1  TC-TTTAAATGTTGAAAACACTCACGGAAAGGTGGTTATGACTTGAACGA  797
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAAATGTTGAAAACACTCACGGAAAGGTGGTTATGACTTGAACGA  800

seq1  GAGGACATGAACAGGGTTGATAGCTTATCTACTGTTCAATTCTCGTGCCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACATGAACAGGGTTGATAGCTTATCTACTGTTCAATTCTCGTGCCC  850

seq1  ATTTTACGGATCAAGAACCTAAGGCTCAGAGAGGTGAGGTGAC-TTGCC-  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  ATTTTACGGATCAAGAACCTAAGGCTCAGAGAGGTGAGGTGACTTTGCCT  900

seq1  TGAGTGCACACAGCCAGATTAGGATCCAAAGCCAGTCCC-TCTATCACTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGAGTGCACACAGCCAGATTAGGATCCAAAGCCAGTCCCTTCTATCACTC  950

seq1  AATTCCCACATTGTCCCCATGGCCAGAGTCATCTGGGTAGCGAAGCTCCA  994
       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
seq2  -ATTCCCACATTGTCCCCATGGGCAGAGTCATCTGGGTAGCGAAGCT-CA  998

seq1  CAATGAGATGTGGGCAGGGGGCCAGAGACAGCGGCT-CTCTGCTTAGGAA  1043
      | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
seq2  C-ATGAGATGGGGGCAGGGGGCCAGAGACAGCGGCTCCTTTGCTTAGGAA  1047

seq1  CTGGAACATTGGGCAGTATGGCACTGCTGATGACAGCCTGCTCCCAGACC  1093
      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || 
seq2  CTGGAACATTGGGCAGT-TGGCCCTGCTGATGACAGCCTGCTCCCGAACG  1096

seq1  GTG-GGAGTTTAATAAA  1109
      | | |||||||| ||||
seq2  GGGTGGAGTTTATTAAA  1113