BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-079O07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 67,009,445 - 67,030,476
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC664788
Upstream geneAtp10a, LOC621446, LOC668811, LOC668813, LOC668815, EG668818, Ube3a, LOC100040985, LOC100041010, LOC100041029, LOC100041051, Pwcr1
Downstream geneSnrpn, Snurf, EG664849, LOC100041201, LOC100041211, LOC664896
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-079O07.bB6Ng01-079O07.g
ACCDH895177DH895178
length8841,116
definitionDH895177|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079O07, 5' end.DH895178|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,009,445 - 67,010,328)(67,029,355 - 67,030,476)
sequence
gaattcatgcagcaattcccatgttccttaccatttaactcaggtgacct
agggcaagtcagcaacaccacaacagttcgatggagactcagttggacga
cataaacactcagccaatgctgtggggccatttcctctgcatgttttcca
tggaccatactggaaagggaatgcaaccctgtgaagacaacacaaagaac
atgccccgattacagtgggaccaatgcaaaaccacatggattatgggctt
accatgtactatgggcttgtcatatctcacaggcaccctcaacactcctt
ctcttaccaacctcttcacactgcccttccagatctcacttgctgttact
ctcaggccttggatgtgaacatgccatgccctttgtctcaagtgcttgct
gggtcctcagctcactctaaggacttaaggatgatatgtgagctgcaata
caggtactcaacactttctcttaggtctttgccatcaacttcctccacca
gtgtcctgagcatagttttcaagggaatgaaggctcttctccaagcatgc
agtcagaaaaagccaataacaagggcaatcatagttccccttgcctatgc
agtcgaagaaggaggaggcagctctgaataactccaccagcaatattgtg
cctccaaggatatctaagccaacaacttttgagccttcaatcatggctcc
agtccttctctgatcattacttctgggtctttgcatgaggtaaaatcaaa
ctcctctgagagttcagaattccagctcatgggaagcaggcttcattttc
acagctgaaaggaacccccctctctctccctctctctgtgttaatgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcg
gaattctgaactctcagaggagtttgattttacctcatgcaaagacccag
aagtaatgatcagagaaggactggagccatgattgaaggctcaaaagttg
ttggcttagatatccttggaggcccaattttgctggtggagttattcaga
gctgcctcctccttttttgactgcataggcaaggggacctctgattgccc
ttgttattggttttttctgactggatgcttcgagaagagccttcattccc
ttgaaaactttgcttaggacactggtggaggaagttgatgacatggacct
aagagaaagtgttgagtacctgtattgcagctcacatatcatccttaagt
ccttagagtgagctgaggaccaagcaagcacttgagagcaaagggcatgg
catgttcacattcaaggcctgagagtaacagcaagtgagatctggaaagg
cagtgtgaagaggttggtaagagcaggagtgttgagggtgcctgtgagat
atgacaagcccatagtacatggtaagcccataatccatgtggttttgcat
tggtcccactgtaatcggggcatgttctctgtgttgtcttcacagggttg
cattccctttccagtatggtccatggaaaacattcagaggaaatggcccc
acagcattggctgagtgtttatgtcgaccaacttagtctcgatcgacctg
ttgtggtgttgctgacttgccctaggtcacctgagttaaatggtaaggga
acatgggaattgctgcatgaattctaggtgcccaggttcttggtggagca
gggaacggctgcctttgattatgtccaggcctttcgggacatgagcatgc
ctagggcctctgggtttctcccatgttggagcttcggcccattgttccct
ggcagtggatggcagtgtcagcagtccatgctctccccaaaggcagagca
tccagagtactgaaccacttgtggcattgcactccaacgagttggatcta
tgatgattcccattcaaaccttcctttgaaaagctgaacaaaatggagtg
aaaactctgtaacgccactctcattcggacttagtcagcatcttgagtct
ccagagtgctatgggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_67009445_67010328
seq2: B6Ng01-079O07.b_50_933

seq1  GAATTCATGCAGCAATTCCCATGTTCCTTACCATTTAACTCAGGTGACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGCAGCAATTCCCATGTTCCTTACCATTTAACTCAGGTGACCT  50

seq1  AGGGCAAGTCAGCAACACCACAACAGTTCGATGGAGACTCAGTTGGACGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAAGTCAGCAACACCACAACAGTTCGATGGAGACTCAGTTGGACGA  100

seq1  CATAAACACTCAGCCAATGCTGTGGGGCCATTTCCTCTGCATGTTTTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAACACTCAGCCAATGCTGTGGGGCCATTTCCTCTGCATGTTTTCCA  150

seq1  TGGACCATTCTGGAAAGGGAATGCAACCCTGTGAAGACAACACAAAGAAC  200
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCATACTGGAAAGGGAATGCAACCCTGTGAAGACAACACAAAGAAC  200

seq1  ATGCCCTGATTACAGTGGGACCAATGCAAAACCACATGGATTATGGGCTT  250
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCCGATTACAGTGGGACCAATGCAAAACCACATGGATTATGGGCTT  250

seq1  ACCATGTACTATGGGCTTGTCATATCTCACAGGCACCCTCAACACTCCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACCATGTACTATGGGCTTGTCATATCTCACAGGCACCCTCAACACTCCTT  300

seq1  CTCTTACCAACCTCTTCACACTGCCCTTCCAGATCTCACTTGCTGTTACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTACCAACCTCTTCACACTGCCCTTCCAGATCTCACTTGCTGTTACT  350

seq1  CTCAGGCCTTGGATGTGAACATGCCATGCCCTTTGTCTCAAGTGCTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCCTTGGATGTGAACATGCCATGCCCTTTGTCTCAAGTGCTTGCT  400

seq1  GGGTCCTCAGCTCACTCTAAGGACTTAAGGATGATATGTGAGCTGCAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCTCAGCTCACTCTAAGGACTTAAGGATGATATGTGAGCTGCAATA  450

seq1  CTGGTACTCAACACTTTCTCTTAGGTCTTTGCCATCAACTTCCTCCACCA  500
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTACTCAACACTTTCTCTTAGGTCTTTGCCATCAACTTCCTCCACCA  500

seq1  GTGTCCTGAGCATAGTTTTCACGGGAATGAAGGCTCTTCTCCAAGCATGC  550
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCTGAGCATAGTTTTCAAGGGAATGAAGGCTCTTCTCCAAGCATGC  550

seq1  AGTCAGAAAAAGCCAATAACAAGGGCAATCATAGGTCCCCTTGCCTATGC  600
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGTCAGAAAAAGCCAATAACAAGGGCAATCATAGTTCCCCTTGCCTATGC  600

seq1  AGTCGAAGAAGGAGGAGGCAGCTCTGAATAACTCCACCAGCAAAATTGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  AGTCGAAGAAGGAGGAGGCAGCTCTGAATAACTCCACCAGCAATATTGTG  650

seq1  CCTCCAAGGATATCTAAGCCAACAACTTTTGAGCCTTCAATCATGGCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAAGGATATCTAAGCCAACAACTTTTGAGCCTTCAATCATGGCTCC  700

seq1  AGTCCTTCTCTGATCATTGCTTCTGGGACTTTGCATGAGGTAAAATCAAA  750
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTTCTCTGATCATTACTTCTGGGTCTTTGCATGAGGTAAAATCAAA  750

seq1  CTCCTCTGAGAGTTCAGAATTCCAGCTCATGGGAAGCAGGCTTCATTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTGAGAGTTCAGAATTCCAGCTCATGGGAAGCAGGCTTCATTTTC  800

seq1  ACAGCTGAAAGGAACCCCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTGTGTTAATGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGAAAGGAACCCCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTGTGTTAATGTGTG  850

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  884
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG  884

seq1: chr7_67029355_67030476
seq2: B6Ng01-079O07.g_69_1184 (reverse)

seq1  GCCCATAGCACCTGGGAGACCCAAGATGCTGGACCTCAGTTCCGATGAGA  50
      |||||||||||   |||||| ||||||||||   || ||| |  ||||||
seq2  GCCCATAGCACTCTGGAGACTCAAGATGCTG--ACTAAGTCCGAATGAGA  48

seq1  GTGGCGGTACAGAGTTTTCACT-CATTTTGTTCAGCTTTTCCAAGGAATG  99
      |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
seq2  GTGGCGTTACAGAGTTTTCACTCCATTTTGTTCAGCTTTTCAAAGGAAGG  98

seq1  TTTGACTGGGAATCATCATAGATCCAAGCTCGTTGGAGTGCATTGCATCA  149
      ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||
seq2  TTTGAATGGGAATCATCATAGATCCAA-CTCGTTGGAGTGCAATGCCACA  147

seq1  AGTGGTTCCTGTACTCTGGAGTGCTCTGGCTTTGGGGAGAGCAATGGACT  199
      ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  AGTGGTT-CAGTACTCTGGA-TGCTCTGCCTTTGGGGAGAGC-ATGGACT  194

seq1  TCTGGACACTGACAATCCACTGCCAGGGAACAATGGGCCGAAGCTCCAAA  249
       || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCT-GACACTG-CCATCCACTGCCAGGGAACAATGGGCCGAAGCTCC-AA  241

seq1  CATGGGAGAAA-CCAGAGGCCCTAGGCATGCTCCATGTCCCGAAGGGCCT  298
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  CATGGGAGAAACCCAGAGGCCCTAGGCATGCT-CATGTCCCGAAAGGCCT  290

seq1  GGACATAATCAATGGCAGCCGTTCCCTGCTCCACCAAG-ACCTGGGCACC  347
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGACATAATCAAAGGCAGCCGTTCCCTGCTCCACCAAGAACCTGGGCACC  340

seq1  TAGAATTCATGCAGCAATTCCCATGTT-CCTTACCATTTAACTCAGGTGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTCATGCAGCAATTCCCATGTTCCCTTACCATTTAACTCAGGTGA  390

seq1  CCTAGGGCAAGTCAGCAACACCACAACAGGTCGATCGAGACTAAGTTGGT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGGCAAGTCAGCAACACCACAACAGGTCGATCGAGACTAAGTTGGT  440

seq1  CGACATAAACACTCAGCCAATGCTGTGGGGCCATTTCCTCTGAATGTTTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACATAAACACTCAGCCAATGCTGTGGGGCCATTTCCTCTGAATGTTTT  490

seq1  CCATGGACCATACTGGAAAGGGAATGCAACCCTGTGAAGACAACACAGAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGACCATACTGGAAAGGGAATGCAACCCTGTGAAGACAACACAGAG  540

seq1  AACATGCCCCGATTACAGTGGGACCAATGCAAAACCACATGGATTATGGG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGCCCCGATTACAGTGGGACCAATGCAAAACCACATGGATTATGGG  590

seq1  CTTACCATGTACTATGGGCTTGTCATATCTCACAGGCACCCTCAACACTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCATGTACTATGGGCTTGTCATATCTCACAGGCACCCTCAACACTC  640

seq1  CTGCTCTTACCAACCTCTTCACACTGCCTTTCCAGATCTCACTTGCTGTT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTTACCAACCTCTTCACACTGCCTTTCCAGATCTCACTTGCTGTT  690

seq1  ACTCTCAGGCCTTGAATGTGAACATGCCATGCCCTTTGCTCTCAAGTGCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCAGGCCTTGAATGTGAACATGCCATGCCCTTTGCTCTCAAGTGCT  740

seq1  TGCTTGGTCCTCAGCTCACTCTAAGGACTTAAGGATGATATGTGAGCTGC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGTCCTCAGCTCACTCTAAGGACTTAAGGATGATATGTGAGCTGC  790

seq1  AATACAGGTACTCAACACTTTCTCTTAGGTCCATGTCATCAACTTCCTCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGGTACTCAACACTTTCTCTTAGGTCCATGTCATCAACTTCCTCC  840

seq1  ACCAGTGTCCTAAGCAAAGTTTTCAAGGGAATGAAGGCTCTTCTCGAAGC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTGTCCTAAGCAAAGTTTTCAAGGGAATGAAGGCTCTTCTCGAAGC  890

seq1  ATCCAGTCAGAAAAAACCAATAACAAGGGCAATCAGAGGTCCCCTTGCCT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTCAGAAAAAACCAATAACAAGGGCAATCAGAGGTCCCCTTGCCT  940

seq1  ATGCAGTCAAAAAAGGAGGAGGCAGCTCTGAATAACTCCACCAGCAAAAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTCAAAAAAGGAGGAGGCAGCTCTGAATAACTCCACCAGCAAAAT  990

seq1  TGGGCCTCCAAGGATATCTAAGCCAACAACTTTTGAGCCTTCAATCATGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCTCCAAGGATATCTAAGCCAACAACTTTTGAGCCTTCAATCATGG  1040

seq1  CTCCAGTCCTTCTCTGATCATTACTTCTGGGTCTTTGCATGAGGTAAAAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTCCTTCTCTGATCATTACTTCTGGGTCTTTGCATGAGGTAAAAT  1090

seq1  CAAACTCCTCTGAGAGTTCAGAATTC  1122
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCCTCTGAGAGTTCAGAATTC  1116