BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087G04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 150,853,327 - 151,016,180
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7
Upstream geneIgf2as, Ins2, EG640264, EG624121, Th, Ascl2, Tspan32, R74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22
Downstream geneGm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087G04.bB6Ng01-087G04.g
ACCDH900524DH900525
length7471,131
definitionDH900524|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087G04, 5' end.DH900525|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087G04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,853,327 - 150,854,071)(151,015,037 - 151,016,180)
sequence
gaattccaggtttggagttcactatggtaggttgcagaagcctgcaggaa
caagtgatccatccatgcataccttaggaagtcgtcaaaccaacagcatg
gtttggctaggagaggctgagtctcttggatggggtcatatatattcctc
tctggtttcaggcaccagatgtacaaagtgaggacaaaactgttccattt
ctggttagggggaagggttttattgtagataggagggagagctcagccag
agacatctggatgagtccagagcagagagaaagtagtagattaaacatgg
cctgcagactgactcaggccttaagaggcggctggtggagagtgggagag
gaagagaaataaggaccagaagagagggggaaaggagaggaagaaccaag
aaggcacattaccaaaaaatggcagggttacctgggaatgagaagctagg
ggaagggaagccagtgaggtggagaagtctaaggtgaggtcatgttcttc
agtatgttaataggaaccacagtggaccattcatcctgagtttcttttgg
acctgataccaggacttgccttcatctaaattgttacttactctcaagga
gggcctccaccagagagctgcagagggcaattgttaacctgtggtggttt
gaattggttttggccctcatagactcatgtgtttgaatgctttcctcata
ataaaatggtttatttttgaggtatgaccttgttggaggaagtttgt
gaattctcacctgagtgcggaatccaggcggctgatccacgctctccagc
agtgttctaagtgcctgcctgaagctccgccccagatgatgtgaggtcac
agacgaccaatcggaagtggatttcgcgagctgcgtcctgtgattggtga
aggcagtgagctgactcagagcccaccaggcccgccagtcggcggcggca
gtcttgagattgacagcaggacgggccccgccccacccacgccccgccca
cgcccctggggtcggcggtctgactccgcttggtgggaggaaggatgcaa
gtgtggattctgcggcgcaggctctgagcctgcccctaccgtgcctcatt
ttactctgctgcatagctcctacctgaaggagagcatcttgtgcacggaa
caacatatactgcggagaccgagagacaagaccagaccagatcagcaagg
aagaagcagctagcagactgtgaatgcagttgaggtcccagcaggacagc
caaacgggtcccttggtgggcaggactcagtcatacctccgtgcccctaa
gggtattggggagccttaacaaagcagctgtgaagtttcactcttttcat
cttgttccttcctgccacctgacattcgttagttacagtcgccctctcct
ggcgagagtctcttctgcagccacaatgaatcaaactggtaacggaagtg
acttcaacactgttagctactgtccatatgctggtgcctcagctgcccaa
caatgtcctttattgctctttttttccccaggccccgggatccagtcagg
gtacacatttggatagaataataggttgtacagaatatacggtcgggact
gtgaaagatggctcagcagtaaagagtagtggcttctcttcagataacag
ggttcaagccccagcacccacatgggttcttcaaccatcagtatttacac
ttccaggcatctagcgcttttgaaatgcatacatgcatatgtaaatacat
acatacatggtcacccctggaactggagctatgagtggcacatggtacta
gatcaagcctgatctcatcgagataagtcagtgctcttacccctgagcat
tcttgccccatctttctcctgatatagtaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_150853327_150854071
seq2: B6Ng01-087G04.b_50_796

seq1  GAATTCCAGGTTTGGAGTTCACTATGGTAGGTTGCAGAAGCCTGCAGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTTTGGAGTTCACTATGGTAGGTTGCAGAAGCCTGCAGGAA  50

seq1  CAAGTGATCCATCCATGCATACCTTAGGAAGTCGTCAAACCAACAGCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGATCCATCCATGCATACCTTAGGAAGTCGTCAAACCAACAGCATG  100

seq1  GTTTGGCTAGGAGAGGCTGAGTCTCTTGGATGGGGTCATATATATTCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGCTAGGAGAGGCTGAGTCTCTTGGATGGGGTCATATATATTCCTC  150

seq1  TCTGGTTTCAGGCACCAGATGTACAAAGTGAGGACAAAACTGTTCCATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTTCAGGCACCAGATGTACAAAGTGAGGACAAAACTGTTCCATTT  200

seq1  CTGGTTAGGGGGAAGGGTTTTATTGTAGATAGGAGGGAGAGCTCAGCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTAGGGGGAAGGGTTTTATTGTAGATAGGAGGGAGAGCTCAGCCAG  250

seq1  AGACATCTGGATGAGTCCAGAGCAGAGAGAAAGTAGTAGATTAAACATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATCTGGATGAGTCCAGAGCAGAGAGAAAGTAGTAGATTAAACATGG  300

seq1  CCTGCAGACTGACTCAGGCCTTAAGAGGCGGCTGGTGGAGAGTGGGAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGACTGACTCAGGCCTTAAGAGGCGGCTGGTGGAGAGTGGGAGAG  350

seq1  GAAGAGAAATAAGGACCAGAAGAGAGGGGGAAAGGAGAGGAAGAACCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGAAATAAGGACCAGAAGAGAGGGGGAAAGGAGAGGAAGAACCAAG  400

seq1  AAGGCACATTACCAAAAAATGGCAGGGTTACCTGGGAATGAGAAGCTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACATTACCAAAAAATGGCAGGGTTACCTGGGAATGAGAAGCTAGG  450

seq1  GGAAGGGAAGCCAGTGAGGTGGAGAAGTCTAAGGTGAGGTCATGTTCTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGGAAGCCAGTGAGGTGGAGAAGTCTAAGGTGAGGTCATGTTCTTC  500

seq1  AGTATGTTAATAGGAACCACAGTGGACCATTCATCCTGAGTTTCTTTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGTTAATAGGAACCACAGTGGACCATTCATCCTGAGTTTCTTTTGG  550

seq1  ACCTGATACCAGGACTTGCCTTCATCTAAATTGTTACTTACTCTCAAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGATACCAGGACTTGCCTTCATCTAAATTGTTACTTACTCTCAAGGA  600

seq1  GGGCCTCCACCAGAGAGCTGCAGAGGGCAATTGTTAACCTGTGGTGGTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTCCACCAGAGAGCTGCAGAGGGCAATTGTTAACCTGTGGTGGTTT  650

seq1  GAATTGG-TTTGGCCCTCATAGACTCATGTGTTTGAATGCTTGCCTCATA  699
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAATTGGTTTTGGCCCTCATAGACTCATGTGTTTGAATGCTTTCCTCATA  700

seq1  A-GAAATGGTATTATTAGGAGGTATGACCTTGTTGGAGGAAGTTTGT  745
      |  ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATGGTTTATTTTTGAGGTATGACCTTGTTGGAGGAAGTTTGT  747

seq1: chr7_151015037_151016180
seq2: B6Ng01-087G04.g_68_1198 (reverse)

seq1  TTTACTTATTAATCAGGAGAAAGATGGGGGCAAAAGAGATGGCTCAGGGG  50
      ||||| |||  |||||||||||||| ||||||    |||  |||||||||
seq2  TTTAC-TAT--ATCAGGAGAAAGAT-GGGGCA----AGAATGCTCAGGGG  42

seq1  TTAAGAGCACTGACTTATCTCGATGAAGATCCAGGCTTGATTCCTAGTAC  100
       |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||
seq2  -TAAGAGCACTGACTTATCTCGATG-AGAT-CAGGCTTGAT--CTAGTAC  87

seq1  CATGTGCCAACTCATAGCTCCAGTTCCAGGGGTGACCATGTATGTATGTA  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCC-ACTCATAGCTCCAGTTCCAGGGGTGACCATGTATGTATGTA  136

seq1  TGTACATATGCATGTATGCATGTCAAAAGCGCTAGATGCCTTGGAAGTGT  200
      | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTACATATGCATGTATGCATTTCAAAAGCGCTAGATGCC-TGGAAGTGT  185

seq1  AAATACTGATGGTTGAAGAA-CCATGTGGGTGCTGGGGCTTGAACCCTGT  249
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACTGATGGTTGAAGAACCCATGTGGGTGCTGGGGCTTGAACCCTGT  235

seq1  TATCTGAAGAGAAGCCACTACTCTTTACTGCTGAGCCATCTTTC-CAGTC  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TATCTGAAGAGAAGCCACTACTCTTTACTGCTGAGCCATCTTTCACAGTC  285

seq1  CCGACCGTATATTCTGTACAACCTATTATTCTATCCAAATGTGTACCCTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGACCGTATATTCTGTACAACCTATTATTCTATCCAAATGTGTACCCTG  335

seq1  ACTGGATCCCGGGGCCTGGGGAAAAAAAGAGCAATAAAGGACATTGTTGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGATCCCGGGGCCTGGGGAAAAAAAGAGCAATAAAGGACATTGTTGG  385

seq1  GCAGCTGAGGCACCAGCATATGGACAGTAGCTAACAGTGTTGAAGTCACT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGAGGCACCAGCATATGGACAGTAGCTAACAGTGTTGAAGTCACT  435

seq1  TCCGTTACCAGTTTGATTCATTGTGGCTGCAGAAGAGACTCTCGCCAGGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTTACCAGTTTGATTCATTGTGGCTGCAGAAGAGACTCTCGCCAGGA  485

seq1  GAGGGCGACTGTAACTAACGAATGTCAGGTGGCAGGAAGGAACAAGATGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCGACTGTAACTAACGAATGTCAGGTGGCAGGAAGGAACAAGATGA  535

seq1  AAAGAGTGAAACTTCACAGCTGCTTTGTTAAGGCTCCCCAATACCCTTAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTGAAACTTCACAGCTGCTTTGTTAAGGCTCCCCAATACCCTTAG  585

seq1  GGGCACGGAGGTATGACTGAGTCCTGCCCACCAAGGGACCCGTTTGGCTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCACGGAGGTATGACTGAGTCCTGCCCACCAAGGGACCCGTTTGGCTG  635

seq1  TCCTGCTGGGACCTCAACTGCATTCACAGTCTGCTAGCTGCTTCTTCCTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTGGGACCTCAACTGCATTCACAGTCTGCTAGCTGCTTCTTCCTT  685

seq1  GCTGATCTGGTCTGGTCTTGTCTCTCGGTCTCCGCAGTATATGTTGTTCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATCTGGTCTGGTCTTGTCTCTCGGTCTCCGCAGTATATGTTGTTCC  735

seq1  GTGCACAAGATGCTCTCCTTCAGGTAGGAGCTATGCAGCAGAGTAAAATG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACAAGATGCTCTCCTTCAGGTAGGAGCTATGCAGCAGAGTAAAATG  785

seq1  AGGCACGGTAGGGGCAGGCTCAGAGCCTGCGCCGCAGAATCCACACTTGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACGGTAGGGGCAGGCTCAGAGCCTGCGCCGCAGAATCCACACTTGC  835

seq1  ATCCTTCCTCCCACCAAGCGGAGTCAGACCGCCGACCCCAGGGGCGTGGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCCTCCCACCAAGCGGAGTCAGACCGCCGACCCCAGGGGCGTGGG  885

seq1  CGGGGCGTGGGTGGGGCGGGGCCCGTCCTGCTGTCAATCTCAAGACTGCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGCGTGGGTGGGGCGGGGCCCGTCCTGCTGTCAATCTCAAGACTGCC  935

seq1  GCCGCCGACTGGCGGGCCTGGTGGGCTCTGAGTCAGCTCACTGCCTTCAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGCCGACTGGCGGGCCTGGTGGGCTCTGAGTCAGCTCACTGCCTTCAC  985

seq1  CAATCACAGGACGCAGCTCGCGAAATCCACTTCCGATTGGTCGTCTGTGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCACAGGACGCAGCTCGCGAAATCCACTTCCGATTGGTCGTCTGTGA  1035

seq1  CCTCACATCATCTGGGGCGGAGCTTCAGGCAGGCACTTAGAACACTGCTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACATCATCTGGGGCGGAGCTTCAGGCAGGCACTTAGAACACTGCTG  1085

seq1  GAGAGCGTGGATCAGCCGCCTGGATTCCGCACTCAGGTGAGAATTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCGTGGATCAGCCGCCTGGATTCCGCACTCAGGTGAGAATTC  1131