BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-090K15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 129,695,712 - 129,884,018
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrkcb1, Cacng3
Upstream geneUsp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2, 2010110P09Rik, LOC668486
Downstream gene4930413G21Rik, Rbbp6, LOC628696, LOC100042977, LOC100042981, Tnrc6a, Slc5a11, Arhgap17, Lcmt1, Aqp8, Zkscan2, LOC100043482
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-090K15.bB6Ng01-090K15.g
ACCDH902903DH902904
length1,0941,116
definitionDH902903|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090K15, 5' end.DH902904|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090K15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,882,903 - 129,884,018)(129,695,712 - 129,696,830)
sequence
gaattcaggtcctcgctcttgcacagccaacgtctggaccacttagccct
ggtgctcgtggtctcaagttaagaaattatttgatctagaacagataggc
ctgggaaagcaagactgtcacccaagtcttaacttcctaggcttgtggtt
ttgaaggagtcagggtaagctgcagctatgacaagtgtcctgagaaaaat
caatgttatgggaggaaagatttgcttggctcatgctttcagaggtgatg
gtctgtggtcagattgctctgttgtctgtgggccatggtatggagacaag
gaatgtgtggcagtgtaaagatggccaggaagtagatgagaagagaggaa
gagagatgagatgagatgcacaagactattatgcacaactgggctccacc
tcccacagtttccacctacccaagggtccatacaactaggaatccatcag
ttgactaattcctaataatatcagagctcttatgatgacactggatcttg
gaacactgctgcatgcatgggggaacgcagtgcaggtgtctttgggcaac
atttcctaaccaaaccatggcacaagagcagattcccctccagcagaagt
agaggatgccatcaaggtctttgactcatcttcagacaggaccatttaca
tttatttccactggattgtcagcacctacactgatgtgcctcaggcaggc
tttacatggctgtagtttcatacaacttgatagacagtcatggtggcaag
caagctctgggtagacacctcgtgttcagaatgaagataggtgtctcacc
agactacatagccaagctccatgcccagaacctggtccagtccacaaaca
ggaccaacgcagtaactgaaacttggttagtaccccagccacaaatccag
ctagtgtgcttaaattccagaccctcaaggccaagtttagacacaggcta
aggctatgagaaatcagagttctagttcagcattataagtctcaatacat
cccattgcatagctttgtcttagagatgaggagagtaaagtcatgtcttg
atgctcagggctaaggcaagtaagcccttgccatagaatgcttg
gaattctttctgccttatatggctccattagtccttccaacctattctct
acattcagagggtggagggggaggaacaggaggaggaggaggctcaagct
gctttgttctggaactgacacacttcacttctgcccacaccgtatcagag
aggtttcgtctcatgaccacgcctcaaagcaagggcatctgggagaataa
ttctggtggctagcaagtggtctctcacacatcctggctgctcctcagct
ctggctggaatttttcacagtgtcccaaaagacctcctgactttttccct
ttagagctccaagtttctcacaccccacaaacacaaatactggagtgcct
cttcctggtgacatttccttgtgttcaaatcatgggacatgccaggtgct
ggagctgccttccctgagcccagcaaaagccaggaataaatcaagtagga
tgcaatcagtgacttatgaaattgaaagaagcagcgggtgctgggaaact
gggcatccaggtatcacatccacagctgctaaaaacaattccaccctgta
ctgtggctgggtatgcacccaaggcagaaagcaccaacctcctctatggc
tggagcttcctggaacagtgcccagtaagtccagtgcctgaatgtcccca
gactacaggaaggtgccctccaacactcagaatttagctgttattgtcca
aggaaagccgccggtactgatttcagcagctcaatgttcacagcagagca
gcacacagtaggtgcaatcacagattcgatacacccattgtgtgtttata
ttaatatgttctaggggaacctagccgagagaggtaattttgttcttcta
caatggccagtgtgagagctaaagttatgtttttaagttttattactatg
cctaagagagtcaaaaacaaaaattcctcttgcctgtagcccttgcccaa
gacagacactgccagtgcaggctcttgtttatgtagaaaacagccacatg
ctttcacttccttcaacaagtttgttgacccaaactgcacaaatattgct
ttatattgtaggagggaattatgtaaggacgaaatacattcagggatgta
ctccttcctctgattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_129882903_129884018
seq2: B6Ng01-090K15.b_48_1141 (reverse)

seq1  CAAGCATTCCTATGGGCAAGGGCTTACTTTTGCCCTTTTAGCTCCTGAAG  50
      |||||||| |||| |||||||||||||  |||||   ||||| |||| ||
seq2  CAAGCATT-CTAT-GGCAAGGGCTTAC--TTGCC---TTAGC-CCTG-AG  41

seq1  CATCAAAGAACATGACCTTTACTCTTCCTCATCTCTTAAGACAAAGCTAT  100
      ||||||   |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| 
seq2  CATCAA--GACATGA-CTTTACTC-TCCTCATCTC-TAAGACAAAGCTA-  85

seq1  TGCAATGGGGATGTAATTGAAGACTTATATTGCTGAACCTAGAACTCTGA  150
      |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  TGCAAT-GGGATGT-ATTG-AGACTTATAATGCTGAA-CTAGAACTCTGA  131

seq1  TTTCTCCATAGCCTTAGCCTTGTGTTCTAAACTTGGCCTTGAGGGTCTGG  200
      ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCT-CATAGCCTTAGCC-TGTG-TCTAAACTTGGCCTTGAGGGTCTGG  178

seq1  AATTTAAGCACACTAGCTGGATTTGTGGCTGGGGTACTAACCAAGTTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAAGCACACTAGCTGGATTTGTGGCTGGGGTACTAACCAAGTTTCA  228

seq1  GTTACTGCGTTGGTCCTGTTTGTGGACTGGACCAGGTTCTGGGCATGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTGCGTTGGTCCTGTTTGTGGACTGGACCAGGTTCTGGGCATGGAG  278

seq1  CTTGGCTATGTAGTCTGGTGAGACACCTATCTTCATTCTGAACACGAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTATGTAGTCTGGTGAGACACCTATCTTCATTCTGAACACGAGGT  328

seq1  GTCTACCCAGAGCTTGCTTGCCACCATGACTGTCTATCAAGTTGTATGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACCCAGAGCTTGCTTGCCACCATGACTGTCTATCAAGTTGTATGAA  378

seq1  ACTACAGCCATGTAAAGCCTGCCTGAGGCACATCAGTGTAGGTGCTGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGCCATGTAAAGCCTGCCTGAGGCACATCAGTGTAGGTGCTGACA  428

seq1  ATCCAGTGGAAATAAATGTAAATGGTCCTGTCTGAAGATGAGTCAAAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTGGAAATAAATGTAAATGGTCCTGTCTGAAGATGAGTCAAAGAC  478

seq1  CTTGATGGCATCCTCTACTTCTGCTGGAGGGGAATCTGCTCTTGTGCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGGCATCCTCTACTTCTGCTGGAGGGGAATCTGCTCTTGTGCCAT  528

seq1  GGTTTGGTTAGGAAATGTTGCCCAAAGACACCTGCACTGCGTTCCCCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTTAGGAAATGTTGCCCAAAGACACCTGCACTGCGTTCCCCCAT  578

seq1  GCATGCAGCAGTGTTCCAAGATCCAGTGTCATCATAAGAGCTCTGATATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCAGCAGTGTTCCAAGATCCAGTGTCATCATAAGAGCTCTGATATT  628

seq1  ATTAGGAATTAGTCAACTGATGGATTCCTAGTTGTATGGACCCTTGGGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGAATTAGTCAACTGATGGATTCCTAGTTGTATGGACCCTTGGGTA  678

seq1  GGTGGAAACTGTGGGAGGTGGAGCCCAGTTGTGCATAATAGTCTTGTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAAACTGTGGGAGGTGGAGCCCAGTTGTGCATAATAGTCTTGTGCA  728

seq1  TCTCATCTCATCTCTCTTCCTCTCTTCTCATCTACTTCCTGGCCATCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCTCATCTCTCTTCCTCTCTTCTCATCTACTTCCTGGCCATCTTT  778

seq1  ACACTGCCACACATTCCTTGTCTCCATACCATGGCCCACAGACAACAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCCACACATTCCTTGTCTCCATACCATGGCCCACAGACAACAGAG  828

seq1  CAATCTGACCACAGACCATCACCTCTGAAAGCATGAGCCAAGCAAATCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTGACCACAGACCATCACCTCTGAAAGCATGAGCCAAGCAAATCTT  878

seq1  TCCTCCCATAACATTGATTTTTCTCAGGACACTTGTCATAGCTGCAGCTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCATAACATTGATTTTTCTCAGGACACTTGTCATAGCTGCAGCTT  928

seq1  ACCCTGACTCCTTCAAAACCACAAGCCTAGGAAGTTAAGACTTGGGTGAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGACTCCTTCAAAACCACAAGCCTAGGAAGTTAAGACTTGGGTGAC  978

seq1  AGTCTTGCTTTCCCAGGCCTATCTGTTCTAGATCAAATAATTTCTTAACT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTGCTTTCCCAGGCCTATCTGTTCTAGATCAAATAATTTCTTAACT  1028

seq1  TGAGACCACGAGCACCAGGGCTAAGTGGTCCAGACGTTGGCTGTGCAAGA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCACGAGCACCAGGGCTAAGTGGTCCAGACGTTGGCTGTGCAAGA  1078

seq1  GCGAGGACCTGAATTC  1116
      ||||||||||||||||
seq2  GCGAGGACCTGAATTC  1094

seq1: chr7_129695712_129696830
seq2: B6Ng01-090K15.g_68_1183

seq1  GAATTCTTTCTGCCTTATATGGCTCCATTAGTCCTTCCAACCTATTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTGCCTTATATGGCTCCATTAGTCCTTCCAACCTATTCTCT  50

seq1  ACATTCAGAGGGTGGAGGGGGAGGAACAGGAGGAGGAGGAGGCTCAAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCAGAGGGTGGAGGGGGAGGAACAGGAGGAGGAGGAGGCTCAAGCT  100

seq1  GCTTTGTTCTGGAACTGACACACTTCACTTCTGCCCACACCGTATCAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTTCTGGAACTGACACACTTCACTTCTGCCCACACCGTATCAGAG  150

seq1  AGGTTTCGTCTCATGACCACGCCTCAAAGCAAGGGCATCTGGGAGAATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTCGTCTCATGACCACGCCTCAAAGCAAGGGCATCTGGGAGAATAA  200

seq1  TTCTGGTGGCTAGCAAGTGGTCTCTCACACATCCTGGCTGCTCCTCAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTGGCTAGCAAGTGGTCTCTCACACATCCTGGCTGCTCCTCAGCT  250

seq1  CTGGCTGGAATTTTTCACAGTGTCCCAAAAGACCTCCTGACTTTTTCCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGAATTTTTCACAGTGTCCCAAAAGACCTCCTGACTTTTTCCCT  300

seq1  TTAGAGCTCCAAGTTTCTCACACCCCACAAACACAAATACTGGAGTGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGCTCCAAGTTTCTCACACCCCACAAACACAAATACTGGAGTGCCT  350

seq1  CTTCCTGGTGACATTTCCTTGTGTTCAAATCATGGGACATGCCAGGTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGTGACATTTCCTTGTGTTCAAATCATGGGACATGCCAGGTGCT  400

seq1  GGAGCTGCCTTCCCTGAGCCCAGCAAAAGCCAGGAATAAATCAAGTAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGCCTTCCCTGAGCCCAGCAAAAGCCAGGAATAAATCAAGTAGGA  450

seq1  TGCAATCAGTGACTTATGAAATTGAAAGAAGCAGCGGGTGCTGGGAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATCAGTGACTTATGAAATTGAAAGAAGCAGCGGGTGCTGGGAAACT  500

seq1  GGGCATCCAGGTATCACATCCACAGCTGCTAAAAACAATTCCACCCTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATCCAGGTATCACATCCACAGCTGCTAAAAACAATTCCACCCTGTA  550

seq1  CTGTGGCTGGGTATGCACCCAAGGCAGAAAGCACCAACCTCCTCTATGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCTGGGTATGCACCCAAGGCAGAAAGCACCAACCTCCTCTATGGC  600

seq1  TGGAGCTTCCTGGAACAGTGCCCAGTAAGTCCAGTGCCTGAATGTCCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTTCCTGGAACAGTGCCCAGTAAGTCCAGTGCCTGAATGTCCCCA  650

seq1  GACTACAGGAAGGTGCCCTCCAACACTCAGAATTTAGCTGTTATTGTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACAGGAAGGTGCCCTCCAACACTCAGAATTTAGCTGTTATTGTCCA  700

seq1  AGG-AAGCCGCCGGTACTGATTTCAGCAGCTCAATGTTCACAGCAGAGCA  749
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGCCGCCGGTACTGATTTCAGCAGCTCAATGTTCACAGCAGAGCA  750

seq1  GCACACAGTAGGTGCAATCACAGATTCGATACACCCATTGTGTGTTTATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACAGTAGGTGCAATCACAGATTCGATACACCCATTGTGTGTTTATA  800

seq1  TTAATATGTTCTAGGGGAACCTAGCCGAGAGAGGTAATTTTGTTCTTCTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATGTTCTAGGGGAACCTAGCCGAGAGAGGTAATTTTGTTCTTCTA  850

seq1  CAATGGCCAGTGTGAGAGCTAAAGTTATG-TTTTAAGTTTTAATTACTAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  CAATGGCCAGTGTGAGAGCTAAAGTTATGTTTTTAAGTTTT-ATTACTAT  899

seq1  GCCTAAGAGAGTCAAACAACAAAAATTCCTCTTGCCTGTAAGCCCCTTGC  948
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  GCCTAAGAGAGTCAAA-AACAAAAATTCCTCTTGCCTGTA--GCCCTTGC  946

seq1  CCAAGGACAGACACTGCCAGTGCAGGCTCTTGTTTATGTAAGATAACAAG  998
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||
seq2  CCAA-GACAGACACTGCCAGTGCAGGCTCTTGTTTATGT-AGAAAAC-AG  993

seq1  CCACATGCTTTCACTCCTTTAAACAAGTTTGGTTGACCCAAACTGCACCA  1048
      ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  CCACATGCTTTCACTTCCTTCAACAAGTTT-GTTGACCCAAACTGCA-CA  1041

seq1  GATA-TGCTTGATA-TGTAGGAGGGAATTATGTAGGCAGGAAATACA-TC  1095
       ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||
seq2  AATATTGCTTTATATTGTAGGAGGGAATTATGTAAGGACGAAATACATTC  1091

seq1  A-GGATGTACTCTTGCGCCTGATTG  1119
      | |||||||||| | |  |||||||
seq2  AGGGATGTACTCCTTCCTCTGATTG  1116