BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091C22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 118,313,590 - 118,469,536
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042658
Upstream geneSwap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221
Downstream geneLOC384658, Galntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091C22.bB6Ng01-091C22.g
ACCDH903281DH903282
length1,135956
definitionDH903281|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C22, 5' end.DH903282|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,313,590 - 118,314,738)(118,468,886 - 118,469,536)
sequence
gaattctttggttgtaagtaacagaaaactcttcatcctctcaagtgcta
ggactcaggcaaccatcatcatgagaggcttccactggtgcgatttgaga
tctatctgacatctcccctctccccccacctatctgttgtgaagcaattg
ttacaatcaagtcagctaaaatacttcctgtctgatacagttgccttgtg
tgctcgctcatgtgtgcctctggccacctgcacatgtacattttgacagt
atgtaagaaacaatatactcttgttagttatagtcaccatgttgcacatt
agaccactgtcttgcaaaactgaaatcttgtgtccttaaccatctcatac
tcattgtgggttttatcattctattctctgcgtttatgactttatatata
aggaagattatatggtgtttgtctttcttcctctgactttttcctctaat
aacgcctttctggtttatccatattgttacaaacaataggatttttcttc
cttaaaaaatcttttatttgggttggagagatgactcagaggttaagagc
actgactacttttccagaggtcctgagttcaagtcccagcaaccacaggg
tggctcacaaccatctgtaatgctatccgataccctcttctggtgtgtct
gaagatagctacagtgtactcatatacatacataattaaacttttttttt
taaagaagtgattttgaagtttaaaaaatattttatttttatttatgtgt
atgtatgaatatcactgtgagtatgtgccacgtgtgtgtgagtgcctgtg
aggtccactggatgccctggagctagagttacaggtggttatgaactgcc
tgacatgggtgctgggaactgaactcaagtcctttgaagaggaacaaggg
ctcctaaccacgaaccatatctcttgccccagggtttctttttaaagact
gaataatattccactccatatatgtagacactgcattttctttggcatat
gagcttctggagaaagagtcaggtgttcacagggggtagccaggagaaga
gtcagaagaaagagtcagttagtgtgcatagctagacagccatgctcaga
acaatggtctggttcaccctccctttagaatagtt
gaattcaatttgctttcccaatgccagacacttgtggtccttccatatga
ttgatgtatgtctgcccttcatgacttccatttattcacaatacaaggta
gaccataaataatgactgtgaagtcttgatacttaacaacagcttattta
taacatgtctactacaggattagactctctaaaggcttcagatgccttaa
tttcactgttgtgtagacgcttcatgtaatctgtcttacagatgaggaaa
acaaagcattatgagataatggactaccagagatccctccactgtccaca
gcagagctggattcataccagattggtctgtctccagagccagcgtaaag
tcagagcactggagtacacagaagaagaaccccagaggctcaacaaccag
gatctcctttttcttttgtgtgtatgtatgttgcggggcacgtgtggcac
atggtgtacacacccgtgcacacagagaccagaggaagaattaggtgtgc
tgctctgtcactctgtcatttccttcagacaggatctctcagtaagtatg
gcactccctgttgttcctatgctgactggctgacaagcagcagccaccct
cccgtctatacctcccagtgttggtgttacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacacgagactatgcctggctttcttagg
tgagtactgtgacttgaactcagtttctcatgcttatacaacaattgctt
ttaccctctgagtcatctctttagcccctgaacatcttaaattttacttt
ttttcagtaaccatgaaatccagagacagaaagaactatggttttaagcc
aggcatagtgtgtttaaccccatgatggcagaggctggtagaactctatg
tgtttgaggctgtcccagtctatgtagaaagctcagactagtccagggct
acaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_118313590_118314738
seq2: B6Ng01-091C22.b_45_1179

seq1  GAATTCTTTGGTTGTAAGTAACAGAAAACTCTTCATCCTCTCAAGTGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGTTGTAAGTAACAGAAAACTCTTCATCCTCTCAAGTGCTA  50

seq1  GGACTCAGGCAACCATCATCATGAGAGGCTTCCACTGGTGCGATTTGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCAGGCAACCATCATCATGAGAGGCTTCCACTGGTGCGATTTGAGA  100

seq1  TCTATCTGACATCTCCCCTCTCCCCCCACCTATCTGTTGTGAAGCAATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTGACATCTCCCCTCTCCCCCCACCTATCTGTTGTGAAGCAATTG  150

seq1  TTACAATCAAGTCAGCTAAAATACTTCCTGTCTGATACAGTTGCCTTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAATCAAGTCAGCTAAAATACTTCCTGTCTGATACAGTTGCCTTGTG  200

seq1  TGCTCGCTCATGTGTGCCTCTGGCCACCTGCACATGTACATTTTGACAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCGCTCATGTGTGCCTCTGGCCACCTGCACATGTACATTTTGACAGT  250

seq1  ATGTAAGAAACAATATACTCTTGTTAGTTATAGTCACCATGTTGCACATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAGAAACAATATACTCTTGTTAGTTATAGTCACCATGTTGCACATT  300

seq1  AGACCACTGTCTTGCAAAACTGAAATCTTGTGTCCTTAACCATCTCATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACTGTCTTGCAAAACTGAAATCTTGTGTCCTTAACCATCTCATAC  350

seq1  TCATTGTGGGTTTTATCATTCTATTCTCTGCGTTTATGACTTTATATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGTGGGTTTTATCATTCTATTCTCTGCGTTTATGACTTTATATATA  400

seq1  AGGAAGATTATATGGTGTTTGTCTTTCTTCCTCTGACTTTTTCCTCTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGATTATATGGTGTTTGTCTTTCTTCCTCTGACTTTTTCCTCTAAT  450

seq1  AACGCCTTTCTGGTTTATCCATATTGTTACAAACAATAGGATTTTTCTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCCTTTCTGGTTTATCCATATTGTTACAAACAATAGGATTTTTCTTC  500

seq1  CTTAAAAAATCTTTTATTTGGGTTGGAGAGATGACTCAGAGGTTAAGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAAAATCTTTTATTTGGGTTGGAGAGATGACTCAGAGGTTAAGAGC  550

seq1  ACTGACTACTTTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAAGTCCCAGCAACCACAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACTACTTTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAAGTCCCAGCAACCACAGGG  600

seq1  TGGCTCACAACCATCTGTAATGCTATCCGATACCCTCTTCTGGTGTGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCACAACCATCTGTAATGCTATCCGATACCCTCTTCTGGTGTGTCT  650

seq1  GAAGATAGCTACAGTGTACTCATATACATACATAATTAAACTTTTTTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATAGCTACAGTGTACTCATATACATACATAATTAAACTTTTTTTTT  700

seq1  TAAAGAAGTGATTTTGAAGTTTAAAAAATATTTTATTTTTATTTATGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAAGTGATTTTGAAGTTTAAAAAATATTTTATTTTTATTTATGTGT  750

seq1  ATGTATGAATATCACTGTGAGTATGTGCCACGTGTGTGTGAGTGCCTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGAATATCACTGTGAGTATGTGCCACGTGTGTGTGAGTGCCTGTG  800

seq1  AGGTCCACTGGATGCCCTGGAGCTAGAGTTACAGGTGGTTATGAACTGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCACTGGATGCCCTGGAGCTAGAGTTACAGGTGGTTATGAACTGCC  850

seq1  TGACATGGGTGCTGGGAACTGAACTCAAGTCCTTTGAAGAGGAACAAGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATGGGTGCTGGGAACTGAACTCAAGTCCTTTGAAGAGGAACAAGGG  900

seq1  CTCCTAACCACGAACCATATCTCTTGCCCCAGGGTTTTCTTTTTAAAGAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTCCTAACCACGAACCATATCTCTTGCCCCAGGG-TTTCTTTTTAAAGAC  949

seq1  TGAATAATATTCCACCTCCATATATGTAGACACTGCATTTTCTTTGGCAT  1000
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAATATTCCA-CTCCATATATGTAGACACTGCATTTTCTTTGGCAT  998

seq1  ATGAGCTTCTGGAGAATAGAGTCAGGTGGTTCCACAGGGGGGTAGCCAGG  1050
      |||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| |
seq2  ATGAGCTTCTGGAGAA-AGAGTCAGGTG--TTCACA-GGGGGTAGCCA-G  1043

seq1  GAGAAGAGCCAGAAG-AAGAGTCAGTTAGTGTTGCATAGCCAGGACAGCC  1099
      |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||
seq2  GAGAAGAGTCAGAAGAAAGAGTCAGTTAGTG-TGCATAGCTA-GACAGCC  1091

seq1  AATGCTCAGAACAAATGGTCCTTTGGTGTCACCCTCCCCTTAGGATAGTT  1149
       ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||| ||||||
seq2  -ATGCTCAGAAC-AATGGTC---TGGT-TCACCCTCCCTTTAGAATAGTT  1135

seq1: chr7_118468886_118469536
seq2: B6Ng01-091C22.g_65_715 (reverse)

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACACCAACACTGGGAGGTATAGACGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACACCAACACTGGGAGGTATAGACGG  50

seq1  GAGGGTGGCTGCTGCTTGTCAGCCAGTCAGCATAGGAACAACAGGGAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTGGCTGCTGCTTGTCAGCCAGTCAGCATAGGAACAACAGGGAGTG  100

seq1  CCATACTTACTGAGAGATCCTGTCTGAAGGAAATGACAGAGTGACAGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACTTACTGAGAGATCCTGTCTGAAGGAAATGACAGAGTGACAGAGC  150

seq1  AGCACACCTAATTCTTCCTCTGGTCTCTGTGTGCACGGGTGTGTACACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACACCTAATTCTTCCTCTGGTCTCTGTGTGCACGGGTGTGTACACCA  200

seq1  TGTGCCACACGTGCCCCGCAACATACATACACACAAAAGAAAAAGGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCACACGTGCCCCGCAACATACATACACACAAAAGAAAAAGGAGAT  250

seq1  CCTGGTTGTTGAGCCTCTGGGGTTCTTCTTCTGTGTACTCCAGTGCTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTGTTGAGCCTCTGGGGTTCTTCTTCTGTGTACTCCAGTGCTCTG  300

seq1  ACTTTACGCTGGCTCTGGAGACAGACCAATCTGGTATGAATCCAGCTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTACGCTGGCTCTGGAGACAGACCAATCTGGTATGAATCCAGCTCTG  350

seq1  CTGTGGACAGTGGAGGGATCTCTGGTAGTCCATTATCTCATAATGCTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGACAGTGGAGGGATCTCTGGTAGTCCATTATCTCATAATGCTTTG  400

seq1  TTTTCCTCATCTGTAAGACAGATTACATGAAGCGTCTACACAACAGTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTCATCTGTAAGACAGATTACATGAAGCGTCTACACAACAGTGAA  450

seq1  ATTAAGGCATCTGAAGCCTTTAGAGAGTCTAATCCTGTAGTAGACATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGGCATCTGAAGCCTTTAGAGAGTCTAATCCTGTAGTAGACATGTT  500

seq1  ATAAATAAGCTGTTGTTAAGTATCAAGACTTCACAGTCATTATTTATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAGCTGTTGTTAAGTATCAAGACTTCACAGTCATTATTTATGGT  550

seq1  CTACCTTGTATTGTGAATAAATGGAAGTCATGAAGGGCAGACATACATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTTGTATTGTGAATAAATGGAAGTCATGAAGGGCAGACATACATCA  600

seq1  ATCATATGGAAGGACCACAAGTGTCTGGCATTGGGAAAGCAAATTGAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATATGGAAGGACCACAAGTGTCTGGCATTGGGAAAGCAAATTGAATT  650

seq1  C  651
      |
seq2  C  651