BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-093A22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 147,188,149 - 147,369,642
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTubgcp2, Zfp511, Msx3, Drd1ip, Prap1, 1810014F10Rik, Echs1, Paox, Mtg1, Sprn, Olfr522, Olfr523
Upstream gene6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2, Inpp5a, Nkx6-2, E030019B06Rik, 9330101J02Rik, LOC100043472, EG434253, EG664869, Gpr123, LOC244229, Kndc1, Utf1, LOC100039095, 6430531B16Rik, Adam8
Downstream geneOlfr524, E430002D04Rik, 5830411N06Rik, EG622335, Olfr525, Olfr527, GA_x5J8B7W72BC-152913-152037, Olfr60, GA_x5J8B7W72BC-125691-125311, Olfr530, LOC622973, Olfr531, Olfr532, Olfr533, Olfr534-ps1, Olfr535, Olfr536, Olfr537-ps1, Olfr1523-ps1, Olfr538, Olfr1553-ps1, Olfr46, Olfr61, Olfr53, Olfr539, GA_x5J8B7W3EKE-4574231-4574913, Olfr45, Olfr541, GA_x5J8B7W3EKE-4522784-4521912, Cyp2e1, Syce1, LOC100043529, BC066028, 1190003J15Rik, Scgb1c1, Odf3, Bet1l, Ric8, Sirt3, Psmd13, LOC100043546, Cox8b, Nlrp6, Athl1, Ifitm5, Ifitm2, Ifitm1, LOC665143, Ifitm3, Ifitm6, B4galnt4, Pkp3, Sigirr, Trp53i5, Ptdss2, Rnh1, LOC546015
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-093A22.bB6Ng01-093A22.g
ACCDH904648DH904649
length6951,129
definitionDH904648|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093A22, 5' end.DH904649|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093A22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,368,948 - 147,369,642)(147,188,149 - 147,189,262)
sequence
gaattcttatctgttccattgttttattttgagacaaggtctgcatatgt
agcccaggctagcctggaactcatgacaatactcttgcctcagcccatcc
aagggttagaattagacatacaccttactctatgaattcttaactatgag
tgtgttctgtatctcaatgggagcaaaggcacattctcaaactaactcaa
gagctttcattctacacagacatgaatccagagccagaatcactgaattg
gagcaatactcacctacctccttaccctgggctctggcacacacggggtt
attgaagtgtttattgactgagtaattgactgaatacctccataacacta
attagagcaaggacagagccccagctcataaataaaattggactagagca
cacagcttttttatatctcaaaattagtgcttgttcaagctaatcgtaca
tagacctcaggagagcaggtagcctaccaacagtacccttgtagactaag
aactgccaagaaatatgtgagatcaagatgaagactatggcacacttgaa
ggaaatgatgctagagtaacagatatagatgaacagcatccagattctgg
gttcagcaggaagaaccctgggggggaaactaaagtagacctacagcctc
aaagatttaaccctcaatgagtgagtgggtaggtgggtgggtgaa
gaattcaagacacaagctactcaagttgggagctgagaaccaaacttagg
tcctctgcaaaagcagcgaacactcctgtgctggctgatttgtcaaacgg
atacaaactagagtcatttggaaaaggagaatctcaagaaaatgtcttta
atttgcctaccgacaggtccgtgatgcattttcttaattagtgattgata
tggggttacccaggctaatgtgagtgataacacccttgggctgctggtct
taggttttataagaaagcaggctgagcaagccatgaggtccaaggtggtg
agcagcatccctctgtgtcctgcctcctgacctgtgtgagctccggccct
cagcgatggagtgtgatgtagaactgtaggctgaaatgaacccatcccaa
gatgcttttggtcatggtgtttatcacagcaatagaaacccaagataact
ttgaatgactaacccttctttctggcccttaaaataacattttaaatgtt
tctgttgttattatgagtgaggaaccataggagtgaagaccttttatttt
acctgtgaagttgacacatacttggtgagattcatgacagtgattattat
ggacaaacagtactgtctacaacattaactattaaatacttattaaagcc
aaccacatgccagtttgctaagggttcctataagacttaaatatatgtcc
acaaagacaaaaatataaaagacagggaaaaaaaacaaagcataaagaat
caatgaggaaaagcacaaacagctcctgaacaaagcaagcgctcaccatc
tcctaacagtcatggggcacgtagaccactctcatcctgcttgtcaacgt
aacacagatgggggacatcaggtgcgcagacatgactcttcatttgcccc
acagccagcaccttgtatgttctgcctggatgatcaggccacagactgcc
actaggaataataaacccttacaaaattacttctacacttaataagaaaa
tccagaaatacatggaatgaagaacagaactgccaagaaaaacgaagatc
ttcagaaacagtggggccttcagcccttatccttcagttaatagatatga
aagcctgctggcccacgcactaagaacca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_147368948_147369642
seq2: B6Ng01-093A22.b_36_730 (reverse)

seq1  TTCACCCACCCACCTACCCACTCACTCATTGAGGGTTAAATCTTTGAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCCACCCACCTACCCACTCACTCATTGAGGGTTAAATCTTTGAGGC  50

seq1  TGTAGGTCTACTTTAGTTTCCCCCCCAGGGTTCTTCCTGCTGAACCCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGTCTACTTTAGTTTCCCCCCCAGGGTTCTTCCTGCTGAACCCAGA  100

seq1  ATCTGGATGCTGTTCATCTATATCTGTTACTCTAGCATCATTTCCTTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGATGCTGTTCATCTATATCTGTTACTCTAGCATCATTTCCTTCAA  150

seq1  GTGTGCCATAGTCTTCATCTTGATCTCACATATTTCTTGGCAGTTCTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCATAGTCTTCATCTTGATCTCACATATTTCTTGGCAGTTCTTAG  200

seq1  TCTACAAGGGTACTGTTGGTAGGCTACCTGCTCTCCTGAGGTCTATGTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACAAGGGTACTGTTGGTAGGCTACCTGCTCTCCTGAGGTCTATGTAC  250

seq1  GATTAGCTTGAACAAGCACTAATTTTGAGATATAAAAAAGCTGTGTGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGCTTGAACAAGCACTAATTTTGAGATATAAAAAAGCTGTGTGCTC  300

seq1  TAGTCCAATTTTATTTATGAGCTGGGGCTCTGTCCTTGCTCTAATTAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCAATTTTATTTATGAGCTGGGGCTCTGTCCTTGCTCTAATTAGTG  350

seq1  TTATGGAGGTATTCAGTCAATTACTCAGTCAATAAACACTTCAATAACCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGAGGTATTCAGTCAATTACTCAGTCAATAAACACTTCAATAACCC  400

seq1  CGTGTGTGCCAGAGCCCAGGGTAAGGAGGTAGGTGAGTATTGCTCCAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGTGCCAGAGCCCAGGGTAAGGAGGTAGGTGAGTATTGCTCCAATT  450

seq1  CAGTGATTCTGGCTCTGGATTCATGTCTGTGTAGAATGAAAGCTCTTGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGATTCTGGCTCTGGATTCATGTCTGTGTAGAATGAAAGCTCTTGAG  500

seq1  TTAGTTTGAGAATGTGCCTTTGCTCCCATTGAGATACAGAACACACTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTGAGAATGTGCCTTTGCTCCCATTGAGATACAGAACACACTCAT  550

seq1  AGTTAAGAATTCATAGAGTAAGGTGTATGTCTAATTCTAACCCTTGGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAGAATTCATAGAGTAAGGTGTATGTCTAATTCTAACCCTTGGATG  600

seq1  GGCTGAGGCAAGAGTATTGTCATGAGTTCCAGGCTAGCCTGGGCTACATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGGCAAGAGTATTGTCATGAGTTCCAGGCTAGCCTGGGCTACATA  650

seq1  TGCAGACCTTGTCTCAAAATAAAACAATGGAACAGATAAGAATTC  695
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGACCTTGTCTCAAAATAAAACAATGGAACAGATAAGAATTC  695

seq1: chr7_147188149_147189262
seq2: B6Ng01-093A22.g_67_1195

seq1  GAATTCAAGACACAAGCTACTCAAGTTGGGAGCTGAGAACCAAACTTAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACACAAGCTACTCAAGTTGGGAGCTGAGAACCAAACTTAGG  50

seq1  TCCTCTGCAAAAGCAGCGAACACTCCTGTGCTGGCTGATTTGTCAAACGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGCAAAAGCAGCGAACACTCCTGTGCTGGCTGATTTGTCAAACGG  100

seq1  ATACAAACTAGAGTCATTTGGAAAAGGAGAATCTCAAGAAAATGTCTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAACTAGAGTCATTTGGAAAAGGAGAATCTCAAGAAAATGTCTTTA  150

seq1  ATTTGCCTACCGACAGGTCCGTGATGCATTTTCTTAATTAGTGATTGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCCTACCGACAGGTCCGTGATGCATTTTCTTAATTAGTGATTGATA  200

seq1  TGGGGTTACCCAGGCTAATGTGAGTGATAACACCCTTGGGCTGCTGGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTTACCCAGGCTAATGTGAGTGATAACACCCTTGGGCTGCTGGTCT  250

seq1  TAGGTTTTATAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCATGAGGTCCAAGGTGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTTTATAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCATGAGGTCCAAGGTGGTG  300

seq1  AGCAGCATCCCTCTGTGTCCTGCCTCCTGACCTGTGTGAGCTCCGGCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCATCCCTCTGTGTCCTGCCTCCTGACCTGTGTGAGCTCCGGCCCT  350

seq1  CAGCGATGGAGTGTGATGTAGAACTGTAGGCTGAAATGAACCCATCCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGATGGAGTGTGATGTAGAACTGTAGGCTGAAATGAACCCATCCCAA  400

seq1  GATGCTTTTGGTCATGGTGTTTATCACAGCAATAGAAACCCAAGATAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTTTGGTCATGGTGTTTATCACAGCAATAGAAACCCAAGATAACT  450

seq1  TTGAATGACTAACCCTTCTTTCTGGCCCTTAAAATAACATTTTAAATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATGACTAACCCTTCTTTCTGGCCCTTAAAATAACATTTTAAATGTT  500

seq1  TCTGTTGTTATTATGAGTGAGGAACCATAGGAGTGAAGACCTTTTATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTTATTATGAGTGAGGAACCATAGGAGTGAAGACCTTTTATTTT  550

seq1  ACCTGTGAAGTTGACACATACTTGGTGAGATTCATGACAGTGATTATTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGAAGTTGACACATACTTGGTGAGATTCATGACAGTGATTATTAT  600

seq1  GGACAAACAGTACTGTCTACAACATTAACTATTAAATACTTATTAAAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAACAGTACTGTCTACAACATTAACTATTAAATACTTATTAAAGCC  650

seq1  AACCACATGCCAGTTTGCTAAGGGTTCCTATAAGACTTAAATATATGTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACATGCCAGTTTGCTAAGGGTTCCTATAAGACTTAAATATATGTCC  700

seq1  ACAAAGACAAAAATATAAAAGACA-GGAAAAAAAACAAAGCATAAAGAAT  749
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGACAAAAATATAAAAGACAGGGAAAAAAAACAAAGCATAAAGAAT  750

seq1  CAATGAGGAAAAGCACAAACAGCTCCTGAACAAAGCAAGCGCTCACCATC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGGAAAAGCACAAACAGCTCCTGAACAAAGCAAGCGCTCACCATC  800

seq1  TCCTAACAGTCAT-GGGCACGTAGACCACTCTCATCCTGCTTGTCAACGT  848
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAACAGTCATGGGGCACGTAGACCACTCTCATCCTGCTTGTCAACGT  850

seq1  AACACAGAT-GGGGACATCAGGTGCGCAGACATGACTC-TCATTTGCCCC  896
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AACACAGATGGGGGACATCAGGTGCGCAGACATGACTCTTCATTTGCCCC  900

seq1  ACAGCCAGCACCTTGTATGTTCTGCCTGGATGATCAGGCCACAGACTGCC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCAGCACCTTGTATGTTCTGCCTGGATGATCAGGCCACAGACTGCC  950

seq1  ACTAGGAATAATAAACCC-TACAAAATTACTCCTACACTTAATAAG-AGA  994
      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |
seq2  ACTAGGAATAATAAACCCTTACAAAATTACTTCTACACTTAATAAGAAAA  1000

seq1  TCCAGAAATACATGAAATGAAGAACAGAACTGCAAAG-AAAACGAAGATC  1043
      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  TCCAGAAATACATGGAATGAAGAACAGAACTGCCAAGAAAAACGAAGATC  1050

seq1  TACAAGAACAGTGGGGCC-TCAGCCTTACTC--TCAG-TAATAG--ATGG  1087
      | ||  |||||||||||| |||||| |  ||  |||| ||||||  ||| 
seq2  TTCAGAAACAGTGGGGCCTTCAGCCCTTATCCTTCAGTTAATAGATATGA  1100

seq1  AAG-CTGCGTGCACA-GCACTAAGAACCA  1114
      ||| ||||  || || |||||||||||||
seq2  AAGCCTGCTGGCCCACGCACTAAGAACCA  1129