BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094B06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 96,292,930 - 96,384,194
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem135
Upstream geneCtsc, LOC100039756, Rab38, LOC100039924, LOC666598, EG621562
Downstream geneLOC100039969, Fzd4, Prss23, LOC100040001, Me3, Ccdc81, l7Rn6, Eed, E230029C05Rik, EG384719, 2310010J17Rik, Picalm
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094B06.bB6Ng01-094B06.g
ACCDH905391DH905392
length1,1041,189
definitionDH905391|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094B06, 5' end.DH905392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094B06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,383,080 - 96,384,194)(96,292,930 - 96,294,133)
sequence
gaattcccaaactagtttctgtaatgtattgggaataaatgaatctcaat
gacaaagcagaaagtttgagctcagtaaagtctgcttgtcatcacatctg
gggatacagtgttagttatcacaactgagtgatgcagtgttagttatcac
atctgggtgatgcagtgttagttatcacatctggggagttccagtgttag
tcatcacatctggggatacagtgctgtaggtggcttcggtaaatgtgggt
ttctatctggttgtatagaaaacaaatcatgctgtcagcaacctgcatgg
gataggtacttcggttggtgacttgtctaaagtaatgtctcagtcctttc
ttttgtaattctgttagttggaataataatacatttagtaggtggttaaa
atttcactgttttaccacctctggcagacagtgtatagtatctgttggaa
tggtgtcaaagattgtatttcagagcttgaattttcatgttgtctgacat
tttaaaaaatttaatctactatgaataactcataactcatcaaattatat
tcagtgatttttcttcttactctaaatgtacagaatttatttagcaaacg
ttggttcaaagaagtccaaggactaaacccagattttaaataccttttct
ataccaactatgtgtgtgtatgactttcttttctgaagtaatataccctg
cccacaattcacatgtgatcaggcttctctgatccaaggcttcagtgacc
ttgctctcttagtcatctgaataagctgagggtacaggtatgcctgatac
tgtagtcatctctaccataaaaaaaaccctcatttgcttaattaaaccaa
actacttttgatataaacataaaagtaaatgtcttacacttttccttaac
ctaagcaatatctgaccaactatcaaataggttttattttttcagaaatg
gaaggatcttagatagcatcagctatttgatcctaatactagattaggct
aggagactatactttcatatgggtattgctagtcccaaatacttctctca
gtcagcgcccttctaaacttaacttgaatgcatgcgagagctaatatggt
tgta
gaattcacttatccctgtgttctatttagacgtaaatattggtctgctct
ttaagcatggcctggcccattaacatgttcagtgctttcagacatgcaag
gtcttctgctgagaaaacagaccattaagaaggaaatgacaaaaaaaggt
gttgctaggcttcaatttcccaccaccattggcttaatgtaaagcagaag
tagaaacttgtgctgtcttcccaagaactgtacttactgcgtggaaacaa
attgctgtagagatggaatagatgatcgtatctgcttgaggaaaataggg
aacctttccagcctcgatgcccttgaaatacattgtctgaaaatcaagca
taaggcaagagtttagattgtattttaaaactgagcagtattaaaacaga
actcagtagagagttccacgagtatattttctgtcttttggaatcattgt
atttcctctgaagctcaatcattcacatcttccacaacagtgttctaagt
tagcctttccttccttcgttccttcacgccaaactccagctttgagcagt
gatgctcttgtgtgtgaaactcaacagtacttcgtttctgtcgcactgat
gtcatttatccttaggtgcttttgtaaatgcttaagtgccgtctttcctt
gcatcagacttgtttattcctgatgtgaactatgatgagcccagtgttag
gagaaaggaatttagaagtgaataaaatttaaaatttaagcctagtagac
acatgccctgcactctggtgagagctgtgagagaggcataactacatgtg
atatttatataaatgtaaattatgtattatgtattatttggctctcccag
ggaacaaagggaatatgaccaaggagaactttgaaaatgatttggaatgt
ttctcaaagtatcacatttttaaactcaaaattgtcatagaatatacatt
tatgatacaataaaaataactagttaaattaaataaaatcagaattgaac
caaattttcactgagattcaaaagcaaaacatagtgtttcaagttgcctc
tcaaggtcccttattgcttgtgcttttagtaagtgcactagcctgtcaca
gattgcagttaaacagcaggatggtacacttcaatatcccaagaccatgg
ctagtccaaggggacatgaacacttccacacgtgcacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_96383080_96384194
seq2: B6Ng01-094B06.b_45_1148 (reverse)

seq1  TACAACCATATTTGCTTCTGCATGCATTCAAGTTTAAGTTTAGAGGGTGG  50
      |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||| ||  |
seq2  TACAACCATATTAGCTCTCGCATGCATTCAAG-TTAAGTTTAGAAGGGCG  49

seq1  CTGACTGAGAGGAAGTATTTGGGACTAGCAATACCCATATGGAAAGTATT  100
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  CTGACTGAGA-GAAGTATTTGGGACTAGCAATACCCATAT-GAAAGTA-T  96

seq1  AGTCTCCTAGCCTAAATCTAGTATTAGGATCAAAATAAGCTGATGCTATC  150
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  AGTCTCCTAGCCT-AATCTAGTATTAGGATCAAA--TAGCTGATGCTATC  143

seq1  TTAAGAATCCTTCCAATTTCTGAAAAAATAAAACCTATTTGATAGTTGGT  200
       |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TAAG-ATCCTTCC-ATTTCTGAAAAAATAAAACCTATTTGATAGTTGGT  190

seq1  CAGATATTGCTTAGGTTAAGGAAAAGTGTAAGACATTTACTTTTATGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATTGCTTAGGTTAAGGAAAAGTGTAAGACATTTACTTTTATGTTT  240

seq1  ATATCAAAAGTAGTTTGGTTTAATTAAGCAAATGAGGGTTTTTTTTTATG  300
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATATCAAAAGTAGTTTGGTTTAATTAAGCAAATGAGGG-TTTTTTTTATG  289

seq1  GTAGAGATGACTACAGTATCAGGCATACCTGTACCCTCAGCTTATTCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGATGACTACAGTATCAGGCATACCTGTACCCTCAGCTTATTCAGA  339

seq1  TGACTAAGAGAGCAAGGTCACTGAAGCCTTGGATCAGAGAAGCCTGATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAAGAGAGCAAGGTCACTGAAGCCTTGGATCAGAGAAGCCTGATCA  389

seq1  CATGTGAATTGTGGGCAGGGTATATTACTTCAGAAAAGAAAGTCATACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGAATTGTGGGCAGGGTATATTACTTCAGAAAAGAAAGTCATACAC  439

seq1  ACACATAGTTGGTATAGAAAAGGTATTTAAAATCTGGGTTTAGTCCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATAGTTGGTATAGAAAAGGTATTTAAAATCTGGGTTTAGTCCTTGG  489

seq1  ACTTCTTTGAACCAACGTTTGCTAAATAAATTCTGTACATTTAGAGTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTTTGAACCAACGTTTGCTAAATAAATTCTGTACATTTAGAGTAAG  539

seq1  AAGAAAAATCACTGAATATAATTTGATGAGTTATGAGTTATTCATAGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAATCACTGAATATAATTTGATGAGTTATGAGTTATTCATAGTAG  589

seq1  ATTAAATTTTTTAAAATGTCAGACAACATGAAAATTCAAGCTCTGAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATTTTTTAAAATGTCAGACAACATGAAAATTCAAGCTCTGAAATA  639

seq1  CAATCTTTGACACCATTCCAACAGATACTATACACTGTCTGCCAGAGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTTGACACCATTCCAACAGATACTATACACTGTCTGCCAGAGGTG  689

seq1  GTAAAACAGTGAAATTTTAACCACCTACTAAATGTATTATTATTCCAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAACAGTGAAATTTTAACCACCTACTAAATGTATTATTATTCCAACT  739

seq1  AACAGAATTACAAAAGAAAGGACTGAGACATTACTTTAGACAAGTCACCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAATTACAAAAGAAAGGACTGAGACATTACTTTAGACAAGTCACCA  789

seq1  ACCGAAGTACCTATCCCATGCAGGTTGCTGACAGCATGATTTGTTTTCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGAAGTACCTATCCCATGCAGGTTGCTGACAGCATGATTTGTTTTCTA  839

seq1  TACAACCAGATAGAAACCCACATTTACCGAAGCCACCTACAGCACTGTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACCAGATAGAAACCCACATTTACCGAAGCCACCTACAGCACTGTAT  889

seq1  CCCCAGATGTGATGACTAACACTGGAACTCCCCAGATGTGATAACTAACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGATGTGATGACTAACACTGGAACTCCCCAGATGTGATAACTAACA  939

seq1  CTGCATCACCCAGATGTGATAACTAACACTGCATCACTCAGTTGTGATAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATCACCCAGATGTGATAACTAACACTGCATCACTCAGTTGTGATAA  989

seq1  CTAACACTGTATCCCCAGATGTGATGACAAGCAGACTTTACTGAGCTCAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACACTGTATCCCCAGATGTGATGACAAGCAGACTTTACTGAGCTCAA  1039

seq1  ACTTTCTGCTTTGTCATTGAGATTCATTTATTCCCAATACATTACAGAAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTGCTTTGTCATTGAGATTCATTTATTCCCAATACATTACAGAAA  1089

seq1  CTAGTTTGGGAATTC  1115
      |||||||||||||||
seq2  CTAGTTTGGGAATTC  1104

seq1: chr7_96292930_96294133
seq2: B6Ng01-094B06.g_67_1255

seq1  GAATTCACTTATCCCTGTGTTCTATTTAGACGTAAATATTGGTCTGCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTATCCCTGTGTTCTATTTAGACGTAAATATTGGTCTGCTCT  50

seq1  TTAAGCATGGCCTGGCCCATTAACATGTTCAGTGCTTTCAGACATGCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCATGGCCTGGCCCATTAACATGTTCAGTGCTTTCAGACATGCAAG  100

seq1  GTCTTCTGCTGAGAAAACAGACCATTAAGAAGGAAATGACAAAAAAAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCTGCTGAGAAAACAGACCATTAAGAAGGAAATGACAAAAAAAGGT  150

seq1  GTTGCTAGGCTTCAATTTCCCACCACCATTGGCTTAATGTAAAGCAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTAGGCTTCAATTTCCCACCACCATTGGCTTAATGTAAAGCAGAAG  200

seq1  TAGAAACTTGTGCTGTCTTCCCAAGAACTGTACTTACTGCGTGGAAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAACTTGTGCTGTCTTCCCAAGAACTGTACTTACTGCGTGGAAACAA  250

seq1  ATTGCTGTAGAGATGGAATAGATGATCGTATCTGCTTGAGGAAAATAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGTAGAGATGGAATAGATGATCGTATCTGCTTGAGGAAAATAGGG  300

seq1  AACCTTTCCAGCCTCGATGCCCTTGAAATACATTGTCTGAAAATCAAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTCCAGCCTCGATGCCCTTGAAATACATTGTCTGAAAATCAAGCA  350

seq1  TAAGGCAAGAGTTTAGATTGTATTTTAAAACTGAGCAGTATTAAAACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCAAGAGTTTAGATTGTATTTTAAAACTGAGCAGTATTAAAACAGA  400

seq1  ACTCAGTAGAGAGTTCCACGAGTATATTTTCTGTCTTTTGGAATCATTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTAGAGAGTTCCACGAGTATATTTTCTGTCTTTTGGAATCATTGT  450

seq1  ATTTCCTCTGAAGCTCAATCATTCACATCTTCCACAACAGTGTTCTAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTCTGAAGCTCAATCATTCACATCTTCCACAACAGTGTTCTAAGT  500

seq1  TAGCCTTTCCTTCCTTCGTTCCTTCACGCCAAACTCCAGCTTTGAGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTTTCCTTCCTTCGTTCCTTCACGCCAAACTCCAGCTTTGAGCAGT  550

seq1  GATGCTCTTGTGTGTGAAACTCAACAGTACTTCGTTTCTGTCGCACTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTCTTGTGTGTGAAACTCAACAGTACTTCGTTTCTGTCGCACTGAT  600

seq1  GTCATTTATCCTTAGGTGCTTTTGTAAATGCTTAAGTGCCGTCTTTCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTATCCTTAGGTGCTTTTGTAAATGCTTAAGTGCCGTCTTTCCTT  650

seq1  GCATCAGACTTGTTTATTCCTGATGTGAACTATGATGAGCCCAGTGTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAGACTTGTTTATTCCTGATGTGAACTATGATGAGCCCAGTGTTAG  700

seq1  GAGAAAGGAATTTAGAAGTGAATAAAATTTAAAATTTAAGCCTAGTAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGGAATTTAGAAGTGAATAAAATTTAAAATTTAAGCCTAGTAGAC  750

seq1  ACATGCCCTGCACTCTGGTGAGAGCTGTGAGAGAGGCATAACTACATGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCCCTGCACTCTGGTGAGAGCTGTGAGAGAGGCATAACTACATGTG  800

seq1  ATATTTATATAAATGTAAATTATGTATTATGTATTATTTGGCTCTCCCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATATAAATGTAAATTATGTATTATGTATTATTTGGCTCTCCCAG  850

seq1  GGAACAAAGGGAATATGACCAAGGAGAACTTTGAAAATGATTTGGAATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAAAGGGAATATGACCAAGGAGAACTTTGAAAATGATTTGGAATGT  900

seq1  TTCTCAAAGTATCACATTTTTAAACTCAAAAATTGTCATAGAATAATACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
seq2  TTCTCAAAGTATCACATTTTTAAACTC-AAAATTGTCATAGAAT-ATACA  948

seq1  TTTATGATACAATAAAAATAACTAGTTAAATTAAATAAAATCAGAATTGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGATACAATAAAAATAACTAGTTAAATTAAATAAAATCAGAATTGA  998

seq1  ACCAAATTTTCACTGAGATTCAAAAAGCAAAACATTAGTGTTTCAAGTTG  1050
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACCAAATTTTCACTGAGATTC-AAAAGCAAAACA-TAGTGTTTCAAGTTG  1046

seq1  -CTCTCAAAGTTCCCTATTGC-TGTGCTTTTAGTTAGTGCACTAGCTTGT  1098
       ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  CCTCTCAAGGTCCCTTATTGCTTGTGCTTTTAGTAAGTGCACTAGCCTGT  1096

seq1  CACAGGATGGCAGTAAACAAGCAGGATGAGTACACTTCAATATCCACAAG  1148
      |||| ||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  CACA-GATTGCAGTTAAACAGCAGGATG-GTACACTTCAATATCC-CAAG  1143

seq1  ACCCAATGGCTATGTCAGAGGGGGACATGACACAACATTCACACACACGT  1198
      |||  ||||||| |||  | |||||||||| |||   |||   |||||||
seq2  ACC--ATGGCTA-GTC-CAAGGGGACATGA-ACA--CTTC---CACACGT  1183

seq1  GCACAC  1204
      ||||||
seq2  GCACAC  1189