BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094D03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 65,858,824 - 66,000,002
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAtp10a
Upstream geneGabrb3, EG668807, LOC434189
Downstream geneLOC621446, LOC668811, LOC668813, LOC668815, EG668818, Ube3a, LOC100040985, LOC100041010, LOC100041029, LOC100041051, Pwcr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094D03.bB6Ng01-094D03.g
ACCDH905479DH905480
length1,1271,123
definitionDH905479|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094D03, 5' end.DH905480|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094D03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,998,874 - 66,000,002)(65,858,824 - 65,859,956)
sequence
gaattcctttctgaattcttggatgctatcattaaattccaagttttaaa
tgaaacatttctctttaagtcaaaaactcttaagtttcctttgacagagc
ttgatgatggagccatctgcccagtctggaccctcacccatatattaggt
ctgagtggggcatgaccatcacctcctacccattctatagcccctcgacc
atgttcagttttattcagtcatcgtcactgaacaaacacatttccacttc
agggtgtgtgtaggtctgtgtgactgccacagagagctagtgtcttaata
ttccttctaacattcagattatgttcaaggtcctctttctagaaacatcc
ttgactgctgaagatggctactttctccagtattaggccctaacagaagc
atcagcgggtagacctctttgttagtctctcaacagatgaacacttcatc
ttacatgaatgacagtgtaagagagatgctaaattctacattgtcagtag
agggcactggtgggaggtggaggagtaaatgactaaatccaagtttcagg
agtaggggaagtggagaaagacattgtttgggccacttcaagtcactagt
cactttctccatgatttatttcaggataataaaactgaaaaacttctctg
agctaggctcaaaggctagggctccgtggcacaaatgtctagaaagcatc
tgcctgtcttgattatggctcactgcagctgccagggctgtccacctcaa
gaacacatagtgtagcctccccagtggccagtgatcagagggtcccgtgg
tatccaagcttggcagctctctatgatcctctgtggtacatttccagtga
gttccaaaattacagttcctcattagccctccccaccaccataggctatg
gaagtgccctgagtagagaaggctgtgttttgtcttagacctgatgcttg
cacagccactctctacccatcagccttatcccagatacatttgcttcctg
tgtggcactgcagttttcgcttcacagcagaatacttggccagtgagaac
aggcatcttggtgctccattactaccaccacaagaacacataaagtcctg
atagaactttctctggtggcaatcatg
gaattctttgttcagttctgagccccattttttaatggggttattcgatt
ttctgaagtccaccttcttgaattctttatatatgttggatattagtctc
ctatctgatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtct
atttgtcttattgacggtgtcttttgccttgcagaagctttggagtttca
tgaggtcccatttgtcaattctcaatcttacagcacaagccattgctgtt
ctattcaggaatttttcccctgtgcccatatcttcaaggcttttccccac
tttctcctctataagtttcagtgtctctggttttatgtgaagttccttta
tccacttagatttgaccttagtacaaggagataggtatggatcgattctt
agctgcatttttgacacaagtctttgatgactagtaatcaataaaagacg
taataatctattatattgggggaaaattgtgtggaaattgaaaaagagtt
atacacaaagggggataaagcttttaacttaagcccgttaaattttctct
tttgtttcatatctctatgtttttaatggtgctgcattttcaaaaactat
attattattactagaatgtagtagtccagcaggatggcttagagaattaa
tgactaaggtgtctgtttagacttttgtgttcttaggtaaaagtgacata
tgtgtgaagccctggatttcatctttggtatcaagaactacaaattaaat
taaactggttaaaaatgactggacatgatatgttttatttcaatgtttaa
aactataacaaaaattgtagccttctcagacacataaacaggacatgaca
cataaaagctatcctcactatctgtgaagaggtgagtggttcccaatgat
ctctgaaaaattgttaaacacagttccgaggctcttttattgaagttgaa
acgcttttatgtaattccacttcactatcattctctgtgcagtactttta
ctttcctgatgctaggtagttttcctcatcatttcattttacacagtgtt
agtagcatataataatatattaaggaataatgccctgataccctcccact
gctcttatgaccagaaaatcagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_65998874_66000002
seq2: B6Ng01-094D03.b_45_1171 (reverse)

seq1  CATGATTG-CACCAGAGAAAG-TCTATCAAGGACTTTTATGTGTTCTTGT  48
      |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  CATGATTGCCACCAGAGAAAGTTCTATC-AGGAC-TTTATGTGTTCTTGT  48

seq1  GGTGGTAGTAATGGAGCA-CAGGATGCCTG-TCTCACTGGCCAGGTATTC  96
      |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  GGTGGTAGTAATGGAGCACCAAGATGCCTGTTCTCACTGGCCAAGTATTC  98

seq1  TGCTGTTGAAGCGAAAACTGCAGTGCCACACAGGAAGCAAATGTAATCTG  146
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGCTG-TGAAGCGAAAACTGCAGTGCCACACAGGAAGCAAATGT-ATCTG  146

seq1  GGATAAGGCTGATGGGTAGAGGAGTGGCTGTTGCAAGCATCAGGTCTAAG  196
      |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGATAAGGCTGATGGGTAGA-GAGTGGCTG-TGCAAGCATCAGGTCTAAG  194

seq1  ACAAAACACAGCCTTCTCTACTCAGGGCACTTCCATAGCCTATGGTGGTG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACACAGCCTTCTCTACTCAGGGCACTTCCATAGCCTATGGTGGTG  244

seq1  GGGAGGGCTAATGAGGAACTGTAATTTTGGAACTCACTGGAAATGTACCA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGGCTAATGAGGAACTGTAATTTTGGAACTCACTGGAAATGTACCA  294

seq1  CAGAGGATCATAGAGAGCTGCCAAGCTTGGATACCACGGGACCCTCTGAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGATCATAGAGAGCTGCCAAGCTTGGATACCACGGGACCCTCTGAT  344

seq1  CACTGGCCACTGGGGAGGCTACACTATGTGTTCTTGAGGTGGACAGCCCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGCCACTGGGGAGGCTACACTATGTGTTCTTGAGGTGGACAGCCCT  394

seq1  GGCAGCTGCAGTGAGCCATAATCAAGACAGGCAGATGCTTTCTAGACATT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTGCAGTGAGCCATAATCAAGACAGGCAGATGCTTTCTAGACATT  444

seq1  TGTGCCACGGAGCCCTAGCCTTTGAGCCTAGCTCAGAGAAGTTTTTCAGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCACGGAGCCCTAGCCTTTGAGCCTAGCTCAGAGAAGTTTTTCAGT  494

seq1  TTTATTATCCTGAAATAAATCATGGAGAAAGTGACTAGTGACTTGAAGTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTATCCTGAAATAAATCATGGAGAAAGTGACTAGTGACTTGAAGTG  544

seq1  GCCCAAACAATGTCTTTCTCCACTTCCCCTACTCCTGAAACTTGGATTTA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAAACAATGTCTTTCTCCACTTCCCCTACTCCTGAAACTTGGATTTA  594

seq1  GTCATTTACTCCTCCACCTCCCACCAGTGCCCTCTACTGACAATGTAGAA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTACTCCTCCACCTCCCACCAGTGCCCTCTACTGACAATGTAGAA  644

seq1  TTTAGCATCTCTCTTACACTGTCATTCATGTAAGATGAAGTGTTCATCTG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCATCTCTCTTACACTGTCATTCATGTAAGATGAAGTGTTCATCTG  694

seq1  TTGAGAGACTAACAAAGAGGTCTACCCGCTGATGCTTCTGTTAGGGCCTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGACTAACAAAGAGGTCTACCCGCTGATGCTTCTGTTAGGGCCTA  744

seq1  ATACTGGAGAAAGTAGCCATCTTCAGCAGTCAAGGATGTTTCTAGAAAGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGAGAAAGTAGCCATCTTCAGCAGTCAAGGATGTTTCTAGAAAGA  794

seq1  GGACCTTGAACATAATCTGAATGTTAGAAGGAATATTAAGACACTAGCTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTTGAACATAATCTGAATGTTAGAAGGAATATTAAGACACTAGCTC  844

seq1  TCTGTGGCAGTCACACAGACCTACACACACCCTGAAGTGGAAATGTGTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGCAGTCACACAGACCTACACACACCCTGAAGTGGAAATGTGTTT  894

seq1  GTTCAGTGACGATGACTGAATAAAACTGAACATGGTCGAGGGGCTATAGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGTGACGATGACTGAATAAAACTGAACATGGTCGAGGGGCTATAGA  944

seq1  ATGGGTAGGAGGTGATGGTCATGCCCCACTCAGACCTAATATATGGGTGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTAGGAGGTGATGGTCATGCCCCACTCAGACCTAATATATGGGTGA  994

seq1  GGGTCCAGACTGGGCAGATGGCTCCATCATCAAGCTCTGTCAAAGGAAAC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCAGACTGGGCAGATGGCTCCATCATCAAGCTCTGTCAAAGGAAAC  1044

seq1  TTAAGAGTTTTTGACTTAAAGAGAAATGTTTCATTTAAAACTTGGAATTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGTTTTTGACTTAAAGAGAAATGTTTCATTTAAAACTTGGAATTT  1094

seq1  AATGATAGCATCCAAGAATTCAGAAAGGAATTC  1129
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATAGCATCCAAGAATTCAGAAAGGAATTC  1127

seq1: chr7_65858824_65859956
seq2: B6Ng01-094D03.g_69_1191

seq1  GAATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTCGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTCGATT  50

seq1  TTCTGAAGTCCACCTTCTTGAATTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAGTCCACCTTCTTGAATTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCTC  100

seq1  CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCT  150

seq1  ATTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGGAGTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGGAGTTTCA  200

seq1  TGAGGTCCCATTTGTCAATTCTCAATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTCCCATTTGTCAATTCTCAATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTT  250

seq1  CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCAC  300

seq1  TTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTTTA  350

seq1  TCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGGTATGGATCGATTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGGTATGGATCGATTCTT  400

seq1  AGCTGCATTTTTGACACAAGTCTTTGATGACTAGTAATCAATAAAAGACG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCATTTTTGACACAAGTCTTTGATGACTAGTAATCAATAAAAGACG  450

seq1  TAATAATCTATTATATTGGGGGAAAATTGTGTGGAAATTGAAAAAGAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATCTATTATATTGGGGGAAAATTGTGTGGAAATTGAAAAAGAGTT  500

seq1  ATACACAAAGGGGGATAAAGCTTTTAACTTAAGCCCGTTAAATTTTCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACAAAGGGGGATAAAGCTTTTAACTTAAGCCCGTTAAATTTTCTCT  550

seq1  TTTGTTTCATATCTCTATGTTTTTAATGGTGCTGCATTTTCAAAAACTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTCATATCTCTATGTTTTTAATGGTGCTGCATTTTCAAAAACTAT  600

seq1  ATTATTATTACTAGAATGTAGTAGTCCAGCAGGATGGCTTAGAGAATTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTATTACTAGAATGTAGTAGTCCAGCAGGATGGCTTAGAGAATTAA  650

seq1  TGACTAAGGTGTCTGTTTAGACTTTTGTGTTCTTAGGTAAAAGTGACATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAAGGTGTCTGTTTAGACTTTTGTGTTCTTAGGTAAAAGTGACATA  700

seq1  TGTGTGAAGCCCTGGATTTCATCTTTGGTATCAAGAACTACAAATTAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGAAGCCCTGGATTTCATCTTTGGTATCAAGAACTACAAATTAAAT  750

seq1  TAAACTGGTTAAAAATGACTGGACATGATATGTTTTATTTCAATGTTTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGGTTAAAAATGACTGGACATGATATGTTTTATTTCAATGTTTAA  800

seq1  AACTATAACAAAAATTGTAGCCTTCTCAGACACATAAACAGGACATGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATAACAAAAATTGTAGCCTTCTCAGACACATAAACAGGACATGACA  850

seq1  CATAAAAGCTATCCTCACTATCTGTGAAGAGGTGAGTGGTTCCCAATGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAAGCTATCCTCACTATCTGTGAAGAGGTGAGTGGTTCCCAATGAT  900

seq1  CTCTGAAAAAATTGTTAAACACAGTTCCGAGGCTCTTTTATTGAAGTTGA  950
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTG-AAAAATTGTTAAACACAGTTCCGAGGCTCTTTTATTGAAGTTGA  949

seq1  AACGCTTTTATGTAATTCCACTTCACTATCATTCTCTGTGCAGTTACTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AACGCTTTTATGTAATTCCACTTCACTATCATTCTCTGTGCAG-TACTTT  998

seq1  TACTTTCCTGATGCTTAGTTAGTTTTTCCTCATTCAATTTCATTTTACAC  1050
      |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||
seq2  TACTTTCCTGATGC-TAGGTAG-TTTTCCTCAT--CATTTCATTTTACAC  1044

seq1  AGTGTTTAGTAGCATATTAATAATATATTTAAAGAATAATGCCCTGATA-  1099
      |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| 
seq2  AGTG-TTAGTAGCATA-TAATAATATA-TTAAGGAATAATGCCCTGATAC  1091

seq1  CCTCCCACTGCTCTTAGTGACGAGAAATATCAGT  1133
      |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||
seq2  CCTCCCACTGCTCTTA-TGACCAGAAA-ATCAGT  1123