BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094P19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 100,767,251 - 100,901,875
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAnkrd42, Pcf11, LOC676240, LOC100040007, 4632427E13Rik, Rab30, 4632434I11Rik, Prcp, A830059I20Rik, LOC100040298, LOC666783
Downstream geneEG638305, EG545982, EG666816
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094P19.bB6Ng01-094P19.g
ACCDH906050DH906051
length1,0081,127
definitionDH906050|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094P19, 5' end.DH906051|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094P19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,900,874 - 100,901,875)(100,767,251 - 100,768,392)
sequence
gaattccaagctcagggttggctcaaggactgcctaggacattggaacac
tggtggaggctaatctaacttagctatatgtcaaaatcaatgcttaaatg
cacttataataaaacaatactgaaagaaagtgcacagattcatacagcca
actaacacagggacaggtttggagctttcctgctatgggaatacaaaggt
tccaggaagttaagtttctgtgaaactctgcctcgaactgcattgaggct
tttaggcctgtcatgcagacttcactggagtgagtgtggcaaagaagcac
accataagacagacctagtgtgaagatttattacagggaagggagtgatg
gcctggaaagggggagaggcagagaaaggtggggaaaaagagagaaagag
gggagaaaagagagcaggaaagagagggggtacagaggctgcctgcgaac
aggtgagggcttagaaacagagagtgaagaaggggaagagtgagtatggc
agccgaggtcttcttacatgcctggctcacacataatgaagggagatgta
agatggctggagcctagaagaattgtttgtaagtcaatttggaccttaca
taaaaaaggtaggtgagatgtggtagataattcgattagcaaaatagttg
ccatgcaagcaaaagtattcagttttgatacctaggacatttaaaacaaa
gccagaagatcctgatgtgatggtacatacctttattcccagcaatccag
aagcagcagaggcagaggcagaggcagaggcagaggcagaggcagaggca
gaggcagaggcagaggcagaggcagaggcagaggcataggcagaggcaga
ggcagaggcagaggcagaggcagaggcagagcagaagcagaggcagaggc
agagcagaggcagagcaaagcagagcagagcatatgcagaggcagagcag
agcagagcagagcgaggcaagcagagccagagcagagctagcatagcaga
ggcgaggc
gaattcattaggtgccaggtgttttgcagtcttccatagtgaacagcata
gtctatagacacaggtagacatcttcctctcaatgacgagttatagccac
aataggttatttaagagatgacttgtatgcagtctctcacatgtagctat
caaagacatggctgcataagagattatgtaaactaagactctaaatgtga
tgaaggtagagattcatttctctacttacatattcctagtgaaatatgtt
tgtttggaagtactcataactacagatgctacctgtgatgtgataggcag
ggctagatggctaagctgtcttaagacaatcaacttaggtaggtagtctc
ttgtaactactcataaaaggaaaaggaacataagttgtcctagaacatag
cgttagttgtggcaacaaaatttatgatttgactctaccactttcacagt
agtacaatggtggtagataaaatttccaggtctgctattcttgcaataga
aagtggaatatagaaaagggagttattaaaagttaactgactcctactgt
cattatatttatcctctttctctctctgttcagtcccagagttgtatatg
gagatatgctcttacttaagatgaataaattgagaatgaattaactcata
ttgaggctggaaatgatagaacaacttcttatgtctgcagttaaagttat
atgtttggctcataacatactattgtgtagaaaacctaaagacaaattat
gtgcagttttatctccaataagctatgtttcacatgcattcattttcagg
gatgtctatatgtttattaatgtaaacttattggcagtatttgttgagaa
tgtctaagaattacagaagtcatgcaaatttcattgagccaggaagggtt
aaatttaacagtgacctaaaagtgcatttcctttctcagtaaaatctttc
aggcattctagcaaatgttacactcatgagcgagtgggaaattactctga
aatcagccttattatagtagaatgtttttcagtagagattgatgagatag
aaatcaaaatttatcattgatgatgatataggcgagatcacagtatcatt
ttggagaatatgccatttgagacatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_100900874_100901875
seq2: B6Ng01-094P19.b_46_1053 (reverse)

seq1  GCCTCTGCCTCTGCCTCTGC---CTCTGCCTCTGCCTCTGCCT--CTGCC  45
      ||||| ||||||| || |||   ||||| ||||| |||||| |  ||  |
seq2  GCCTC-GCCTCTG-CTATGCTAGCTCTG-CTCTGGCTCTGCTTGCCTCGC  47

seq1  TCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGC----CTCTGC----C  87
      |||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||    ||||||    |
seq2  TCTG-CTCTG-CTCTG-CTCTGCCTCTGCATATGCTCTGCTCTGCTTTGC  94

seq1  TCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTC  137
      |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCTG-CTCTGCCTCTGCCTCTGCTTCTG-CTCTGCCTCTGCCTC  142

seq1  TGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTG  187
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTATGCCTCTGCCTCTGCCTCTG  192

seq1  CCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCC  237
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCC  242

seq1  TCTGCCTCTGCCTGCTTCTGGATTGCTGGGAATAAAGGTATGTACCATCA  287
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCTG-CTGCTTCTGGATTGCTGGGAATAAAGGTATGTACCATCA  291

seq1  CATCAGGATCTTCTGGCTTTGTTTTAAATGTCCTAGGTATC-AAACTGAA  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CATCAGGATCTTCTGGCTTTGTTTTAAATGTCCTAGGTATCAAAACTGAA  341

seq1  TACTTTTGCTTGCATGGCAACTATTTTGCTAATCGAATTATCTACCACAT  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTGCTTGCATGGCAACTATTTTGCTAATCGAATTATCTACCACAT  391

seq1  CTCACCTACC-TTTTTATGTAAGGTCCAAATTGACTTACAAACAATTCTT  435
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTACCTTTTTTATGTAAGGTCCAAATTGACTTACAAACAATTCTT  441

seq1  CTAGGCTCCAGCCATCTTACATCTCCCTTCATTATGTGTGAGCCAGGCAT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTCCAGCCATCTTACATCTCCCTTCATTATGTGTGAGCCAGGCAT  491

seq1  GTAAGAAGACCTCGGCTGCCATACTCACTCTTCCCCTTCTTCACTCTCTG  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAAGACCTCGGCTGCCATACTCACTCTTCCCCTTCTTCACTCTCTG  541

seq1  TTTCTAAGCCCTCACCTGTTCGCAGGCAGCCTCTGTACCCCCTCTCTTTC  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAAGCCCTCACCTGTTCGCAGGCAGCCTCTGTACCCCCTCTCTTTC  591

seq1  CTGCTCTCTTTTCTCCCCTCTTTCTCTCTTTTTCCCCACCTTTCTCTGCC  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTCTTTTCTCCCCTCTTTCTCTCTTTTTCCCCACCTTTCTCTGCC  641

seq1  TCTCCCCCTTTCCAGGCCATCACTCCCTTCCCTGTAATAAATCTTCACAC  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCCTTTCCAGGCCATCACTCCCTTCCCTGTAATAAATCTTCACAC  691

seq1  TAGGTCTGTCTTATGGTGTGCTTCTTTGCCACACTCACTCCAGTGAAGTC  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCTGTCTTATGGTGTGCTTCTTTGCCACACTCACTCCAGTGAAGTC  741

seq1  TGCATGACAGGCCTAAAAGCCTCAATGCAGTTCGAGGCAGAGTTTCACAG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGACAGGCCTAAAAGCCTCAATGCAGTTCGAGGCAGAGTTTCACAG  791

seq1  AAACTTAACTTCCTGGAACCTTTGTATTCCCATAGCAGGAAAGCTCCAAA  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTAACTTCCTGGAACCTTTGTATTCCCATAGCAGGAAAGCTCCAAA  841

seq1  CCTGTCCCTGTGTTAGTTGGCTGTATGAATCTGTGCACTTTCTTTCAGTA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCCTGTGTTAGTTGGCTGTATGAATCTGTGCACTTTCTTTCAGTA  891

seq1  TTGTTTTATTATAAGTGCATTTAAGCATTGATTTTGACATATAGCTAAGT  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTATTATAAGTGCATTTAAGCATTGATTTTGACATATAGCTAAGT  941

seq1  TAGATTAGCCTCCACCAGTGTTCCAATGTCCTAGGCAGTCCTTGAGCCAA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTAGCCTCCACCAGTGTTCCAATGTCCTAGGCAGTCCTTGAGCCAA  991

seq1  CCCTGAGCTTGGAATTC  1002
      |||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGCTTGGAATTC  1008

seq1: chr7_100767251_100768392
seq2: B6Ng01-094P19.g_69_1195

seq1  GAATTCATTAGGTGCCAGGTGTTTTGCAGTCTTCCATAGTGAACAGCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAGGTGCCAGGTGTTTTGCAGTCTTCCATAGTGAACAGCATA  50

seq1  GTCTATAGACACAGGTAGACATCTTCCTCTCAATGACGAGTTATAGCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATAGACACAGGTAGACATCTTCCTCTCAATGACGAGTTATAGCCAC  100

seq1  AATAGGTTATTTAAGAGATGACTTGTATGCAGTCTCTCACATGTAGCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGTTATTTAAGAGATGACTTGTATGCAGTCTCTCACATGTAGCTAT  150

seq1  CAAAGACATGGCTGCATAAGAGATTATGTAAACTAAGACTCTAAATGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACATGGCTGCATAAGAGATTATGTAAACTAAGACTCTAAATGTGA  200

seq1  TGAAGGTAGAGATTCATTTCTCTACTTACATATTCCTAGTGAAATATGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTAGAGATTCATTTCTCTACTTACATATTCCTAGTGAAATATGTT  250

seq1  TGTTTGGAAGTACTCATAACTACAGATGCTACCTGTGATGTGATAGGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGAAGTACTCATAACTACAGATGCTACCTGTGATGTGATAGGCAG  300

seq1  GGCTAGATGGCTAAGCTGTCTTAAGACAATCAACTTAGGTAGGTAGTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGATGGCTAAGCTGTCTTAAGACAATCAACTTAGGTAGGTAGTCTC  350

seq1  TTGTAACTACTCATAAAAGGAAAAGGAACATAAGTTGTCCTAGAACATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAACTACTCATAAAAGGAAAAGGAACATAAGTTGTCCTAGAACATAG  400

seq1  CGTTAGTTGTGGCAACAAAATTTATGATTTGACTCTACCACTTTCACAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTAGTTGTGGCAACAAAATTTATGATTTGACTCTACCACTTTCACAGT  450

seq1  AGTACAATGGTGGTAGATAAAATTTCCAGGTCTGCTATTCTTGCAATAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAATGGTGGTAGATAAAATTTCCAGGTCTGCTATTCTTGCAATAGA  500

seq1  AAGTGGAATATAGAAAAGGGAGTTATTAAAAGTTAACTGACTCCTACTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGAATATAGAAAAGGGAGTTATTAAAAGTTAACTGACTCCTACTGT  550

seq1  CATTATATTTATCCTCTTTCTCTCTCTGTTCAGTCCCAGAGTTGTATATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATATTTATCCTCTTTCTCTCTCTGTTCAGTCCCAGAGTTGTATATG  600

seq1  GAGATATGCTCTTACTTAAGATGAATAAATTGAGAATGAATTAACTCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATATGCTCTTACTTAAGATGAATAAATTGAGAATGAATTAACTCATA  650

seq1  TTGAGGCTGGAAATGATAGAACAACTTCTTATGTCTGCAGTTAAAGTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGCTGGAAATGATAGAACAACTTCTTATGTCTGCAGTTAAAGTTAT  700

seq1  ATGTTTGGCTCATAACATACTATTGTGTAGAAAACCTAAAGACAAATTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTGGCTCATAACATACTATTGTGTAGAAAACCTAAAGACAAATTAT  750

seq1  GTGCAGTTTTATCTCCAATAAGCTATGTTTCACATGCATTCATTTTCAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGTTTTATCTCCAATAAGCTATGTTTCACATGCATTCATTTTCAGG  800

seq1  GATGTCTATATGTTTATTAATGTAAACTTATTGGCAGTATTTGTTGAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTATATGTTTATTAATGTAAACTTATTGGCAGTATTTGTTGAGAA  850

seq1  TGTCTAAGAATTACAGAAGTCATGCAAATTTCATTGAGCCAGGAAGGGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAAGAATTACAGAAGTCATGCAAATTTCATTGAGCCAGGAAGGGTT  900

seq1  AAATTTAACAGTGACCTAAAAGTGCATTTCCTTTCCTTCAGTAAAAATCT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||
seq2  AAATTTAACAGTGACCTAAAAGTGCATTTCCTTTC--TCAGT-AAAATCT  947

seq1  TTCAGGGCATTCTAGCAAATGTTACCACTCATGAGCGAGTGGGAAATTAC  1000
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCA-GGCATTCTAGCAAATGTTA-CACTCATGAGCGAGTGGGAAATTAC  995

seq1  TCTGAAATCAGCCCTATTATAGTAGAAATGTTTCTCCAGTAGAGATTTGA  1050
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||
seq2  TCTGAAATCAGCCTTATTATAGTAG-AATGTTT-TTCAGTAGAGA-TTGA  1042

seq1  TGAGGATAAGAATACAAAATTTTAATCATTGATGATGATATAGGC-AGAT  1099
      ||| ||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGA-GAT-AGAAATCAAAATTT--ATCATTGATGATGATATAGGCGAGAT  1088

seq1  CACAGTATCAATTTTTGGAAGATTATGCCACTTGAAGACATGG  1142
      ||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||
seq2  CACAGTATCA--TTTTGG-AGAATATGCCATTTG-AGACATGG  1127