BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096O09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 142,646,468 - 142,784,442
singlet/doubletdoublet
Overlap geneClrn3, Ptpre
Upstream geneLOC100043248, LOC100043699, LOC668750, Dock1, B830028B13Rik, EG668693, LOC100043254, Foxi2
Downstream geneMki67, LOC668764
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096O09.bB6Ng01-096O09.g
ACCDH907416DH907417
length1,1401,031
definitionDH907416|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096O09, 5' end.DH907417|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096O09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(142,646,468 - 142,647,610)(142,783,415 - 142,784,442)
sequence
gaattcagtgagaggactcttctttgcttttttggtgctggaataaaata
ctggccaaaagcaacttggaggtacaaaggatttatttgacttataggtc
acagtccatcatcagggaagccatggcaggaactcaagacagaaacctaa
gcagagaccatagaggaacactgtttactagctaactccttcagcttgct
cagccagctacttctcatatacagcccagggatatacctgtccagggata
acatcacctacagtagactgggctgtcctacatagttaacaatcaataat
gtgctacagatatgcccacagcccatctgatggaggcaattcctcaatta
atatcccctccttccatgtgtgtctaggtttgtgtcaagttgacaaaaac
taaccatgacactaggacacaggtctctagatactggggggaaagaattc
tagcaaaacaaaggtgatcttgcaaagaggcacagagtatctcattgcca
tggtaacagctgctgagcttctgacacagcctgtagccctggtaaacaca
aacgtgtcatctcatttttaatgaaaaataatagcattcttgaacccatc
gcactagttccacaaggagagctctgacctgacaccaaggcaaatcagca
ggacttcatcgtcaattcaggccaggctttttctggaaattagggtatta
agctatgcacaatcatagttgccttgaatgtcactggagttggagcttct
ataaacatcacctttttctgcccctgtcgctgcccagcactcctgggatg
gagcaaaataagcacttgcttattgattctaaacaattggaacccttata
tacttatggtgggaatgtaaattagtccagtcactatgaaagtcactacg
gaggtttttccaaagagaaaaactaacacttgatttcccatatgacgcag
atacagtacccctgggtggagatgacgtatgtttggagctgagtgctcta
cacagcacaaggacgtgatcttgaatcagacatagacccagtttctttct
tatgagtgtaaagcatgaagtgtttatagtaggcactgcctatacatagg
taagaataaacacaggaacctgttcccctctgacattcac
gaattctgcttccaccaccagaaagatcagctgccctcttccctgggcag
gcggtacagccataatttcaaagaaactcgtctcctttaagccagaaaat
catctcacgtgtgcatgagctgctggataaacagctggtggttctaggcc
ttggcagaaagcaaagacgtcagaggtcgggcagagctgggctgctgtgt
gcctggctttcgtttgcctcccacgagtctaggagtccttctatggtcca
tagtccgagggaacaaggatggagcatcaagaacctgtcttgcccacaga
cacagggaaggctggggcccagagcagaggcctgactgctccacagtctc
tgtacctgaggtcacggaggcagctttaccctgacaacccaacaagacag
gattgtgggggtgaattcaggatctgaggggggtgaggcccagagatggg
aaacagagtgcttatgcccacaagtggcatgggcaaggccagataccaaa
ccaaagcacatttactagaacgatctagaattctatcgggtgtgtcccag
tagcttggggccttcatgctgccagggagaactgtgaacgcatgcagtgt
atttgaggagctcgtctgtgcagttctcccgaaatgccctgcacagatgt
caaaacgctgggcgtaccacttttatccagtattctacctgatcctctgg
acaagtctgaggtgacttgctgggataagagaactagccagaatccacac
ccagcccaggatacatgccaagtccccaatcttctttgttgttttgtttt
ttttgtttgagacagggtttctctgcttagcctttggctgtcctggaact
caattctgtagaccaggctggattcgaactcagagactagccctgcctct
gcttcccaagtactgggactaaaggggttgtgatgctactgctctgcaaa
ttacccccaccttagaaagactctaccagacctctgggctggccagaacc
actttcttgagagacagactgtgttgggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_142646468_142647610
seq2: B6Ng01-096O09.b_48_1187

seq1  GAATTCAGTGAGAGGACTCTTCTTTGCTTTTTTGGTGCTGGAATAAAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGAGAGGACTCTTCTTTGCTTTTTTGGTGCTGGAATAAAATA  50

seq1  CTGGCCAAAAGCAACTTGGAGGTACAAAGGATTTATTTGACTTATAGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCAAAAGCAACTTGGAGGTACAAAGGATTTATTTGACTTATAGGTC  100

seq1  ACAGTCCATCATCAGGGAAGCCATGGCAGGAACTCAAGACAGAAACCTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCATCATCAGGGAAGCCATGGCAGGAACTCAAGACAGAAACCTAA  150

seq1  GCAGAGACCATAGAGGAACACTGTTTACTAGCTAACTCCTTCAGCTTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGACCATAGAGGAACACTGTTTACTAGCTAACTCCTTCAGCTTGCT  200

seq1  CAGCCAGCTACTTCTCATATACAGCCCAGGGATATACCTGTCCAGGGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGCTACTTCTCATATACAGCCCAGGGATATACCTGTCCAGGGATA  250

seq1  ACATCACCTACAGTAGACTGGGCTGTCCTACATAGTTAACAATCAATAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCACCTACAGTAGACTGGGCTGTCCTACATAGTTAACAATCAATAAT  300

seq1  GTGCTACAGATATGCCCACAGCCCATCTGATGGAGGCAATTCCTCAATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTACAGATATGCCCACAGCCCATCTGATGGAGGCAATTCCTCAATTA  350

seq1  ATATCCCCTCCTTCCATGTGTGTCTAGGTTTGTGTCAAGTTGACAAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCCCTCCTTCCATGTGTGTCTAGGTTTGTGTCAAGTTGACAAAAAC  400

seq1  TAACCATGACACTAGGACACAGGTCTCTAGATACTGGGGGGAAAGAATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATGACACTAGGACACAGGTCTCTAGATACTGGGGGGAAAGAATTC  450

seq1  TAGCAAAACAAAGGTGATCTTGCAAAGAGGCACAGAGTATCTCATTGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAAACAAAGGTGATCTTGCAAAGAGGCACAGAGTATCTCATTGCCA  500

seq1  TGGTAACAGCTGCTGAGCTTCTGACACAGCCTGTAGCCCTGGTAAACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAACAGCTGCTGAGCTTCTGACACAGCCTGTAGCCCTGGTAAACACA  550

seq1  AACGTGTCATCTCATTTTTAATGAAAAATAATAGCATTCTTGAACCCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGTCATCTCATTTTTAATGAAAAATAATAGCATTCTTGAACCCATC  600

seq1  GCACTAGTTCCACAAGGAGAGCTCTGACCTGACACCAAGGCAAATCAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTAGTTCCACAAGGAGAGCTCTGACCTGACACCAAGGCAAATCAGCA  650

seq1  GGACTTCATCGTCAATTCAGGCCAGGCTTTTTCTGGAAATTAGGGTATTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTCATCGTCAATTCAGGCCAGGCTTTTTCTGGAAATTAGGGTATTA  700

seq1  AGCTATGCACAATCATAGTTGCCTTGAATGTCACTGGAGTTGGAGCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGCACAATCATAGTTGCCTTGAATGTCACTGGAGTTGGAGCTTCT  750

seq1  ATAAACATCACCTTTTTCTGCCCCTGTCGCTGCCCAGCACTCCTGGGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACATCACCTTTTTCTGCCCCTGTCGCTGCCCAGCACTCCTGGGATG  800

seq1  GAGCAAAATAAGCACTTGCTTATTGATTCTAAACAATTGGAACCCTTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAAATAAGCACTTGCTTATTGATTCTAAACAATTGGAACCCTTATA  850

seq1  TACTTATGGTGGGAATGTAAATTAGTCCAGTCACTATGAAAGTCACTACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTATGGTGGGAATGTAAATTAGTCCAGTCACTATGAAAGTCACTACG  900

seq1  GAGGTTTTTCCAAAGAGAAAAACTAACACTTGATTTCCCCATATGACGCA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GAGGTTTTTCCAAAGAGAAAAACTAACACTTGATTT-CCCATATGACGCA  949

seq1  GATACAGTACCCCTGGGTGGAGATGACGTATGTTTGGAGCTGAGTGCTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAGTACCCCTGGGTGGAGATGACGTATGTTTGGAGCTGAGTGCTCT  999

seq1  ACACAGCCACAAGGACGTGATCTTGAAATCAGACATAGACCCAGTTTCTT  1050
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAG-CACAAGGACGTGATCTTG-AATCAGACATAGACCCAGTTTCTT  1047

seq1  TCTTATGAGTGTAAAGGCATGAAGTGTTTATAGTAAGCACTGCCTATACA  1100
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCTTATGAGTGTAAA-GCATGAAGTGTTTATAGTAGGCACTGCCTATACA  1096

seq1  TAGGTAAGAAT-AACACAGGACACCTG-TCCCCTCTGACATTCAC  1143
      ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGGTAAGAATAAACACAGGA-ACCTGTTCCCCTCTGACATTCAC  1140

seq1: chr7_142783415_142784442
seq2: B6Ng01-096O09.g_70_1100 (reverse)

seq1  TCTCCCAACACAGTCTGTCTCTC-AGGAAGTGGTTCCTGGCCAGCCCCAG  49
      ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||
seq2  TCTCCCAACACAGTCTGTCTCTCAAGAAAGTGGTT-CTGGCCAG-CCCAG  48

seq1  AGGTCTGGTAGGGTCTTTCTAAGGTGGGGGTATTTTGCAGAGCAGTAGCA  99
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGGTAGAGTCTTTCTAAGGTGGGGGTAATTTGCAGAGCAGTAGCA  98

seq1  TCAC-ACCCCTTTAGTCCCAGTACTTGGGAAGCAGAGGCA-GGCTAGTCT  147
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCACAACCCCTTTAGTCCCAGTACTTGGGAAGCAGAGGCAGGGCTAGTCT  148

seq1  CTGAGTTCGAATCCAGCCTGGTCTACAGAA-TGAGTTCCAGGACAGCC-A  195
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  CTGAGTTCGAATCCAGCCTGGTCTACAGAATTGAGTTCCAGGACAGCCAA  198

seq1  AGGCTAAGCAGAGAAACCCTGTCTCAAACAAATAAAACAAAACAACAAAG  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGCTAAGCAGAGAAACCCTGTCTCAAACAAAAAAAACAAAACAACAAAG  248

seq1  AAGATTGGGGACTTGGCATGTATCCTGGGCTGGGTGTGGATTCTGGCTAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGGGGACTTGGCATGTATCCTGGGCTGGGTGTGGATTCTGGCTAG  298

seq1  TTCTCTTATCCCAGCAAGTCACCTCAGACTTGTCCAGAGGATCAGGTAGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTATCCCAGCAAGTCACCTCAGACTTGTCCAGAGGATCAGGTAGA  348

seq1  ATACTGGATAAAAGTGGTACGCCCAGCGTTTTGACATCTGTGCAGGGCAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGATAAAAGTGGTACGCCCAGCGTTTTGACATCTGTGCAGGGCAT  398

seq1  TTCGGGAGAACTGCACAGACGAGCTCCTCAAATACACTGCATGCGTTCAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGGAGAACTGCACAGACGAGCTCCTCAAATACACTGCATGCGTTCAC  448

seq1  AGTTCTCCCTGGCAGCATGAAGGCCCCAAGCTACTGGGACACACCCGATA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTCCCTGGCAGCATGAAGGCCCCAAGCTACTGGGACACACCCGATA  498

seq1  GAATTCTAGATCGTTCTAGTAAATGTGCTTTGGTTTGGTATCTGGCCTTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGATCGTTCTAGTAAATGTGCTTTGGTTTGGTATCTGGCCTTG  548

seq1  CCCATGCCACTTGTGGGCATAAGCACTCTGTTTCCCATCTCTGGGCCTCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGCCACTTGTGGGCATAAGCACTCTGTTTCCCATCTCTGGGCCTCA  598

seq1  CCCCCCTCAGATCCTGAATTCACCCCCACAATCCTGTCTTGTTGGGTTGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCTCAGATCCTGAATTCACCCCCACAATCCTGTCTTGTTGGGTTGT  648

seq1  CAGGGTAAAGCTGCCTCCGTGACCTCAGGTACAGAGACTGTGGAGCAGTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTAAAGCTGCCTCCGTGACCTCAGGTACAGAGACTGTGGAGCAGTC  698

seq1  AGGCCTCTGCTCTGGGCCCCAGCCTTCCCTGTGTCTGTGGGCAAGACAGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCTGCTCTGGGCCCCAGCCTTCCCTGTGTCTGTGGGCAAGACAGG  748

seq1  TTCTTGATGCTCCATCCTTGTTCCCTCGGACTATGGACCATAGAAGGACT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGATGCTCCATCCTTGTTCCCTCGGACTATGGACCATAGAAGGACT  798

seq1  CCTAGACTCGTGGGAGGCAAACGAAAGCCAGGCACACAGCAGCCCAGCTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGACTCGTGGGAGGCAAACGAAAGCCAGGCACACAGCAGCCCAGCTC  848

seq1  TGCCCGACCTCTGACGTCTTTGCTTTCTGCCAAGGCCTAGAACCACCAGC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCGACCTCTGACGTCTTTGCTTTCTGCCAAGGCCTAGAACCACCAGC  898

seq1  TGTTTATCCAGCAGCTCATGCACACGTGAGATGATTTTCTGGCTTAAAGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATCCAGCAGCTCATGCACACGTGAGATGATTTTCTGGCTTAAAGG  948

seq1  AGACGAGTTTCTTTGAAATTATGGCTGTACCGCCTGCCCAGGGAAGAGGG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGAGTTTCTTTGAAATTATGGCTGTACCGCCTGCCCAGGGAAGAGGG  998

seq1  CAGCTGATCTTTCTGGTGGTGGAAGCAGAATTC  1028
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGATCTTTCTGGTGGTGGAAGCAGAATTC  1031