BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097B12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 116,745,018 - 116,788,333
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSt5
Upstream geneOlfr506, Olfr507, Olfr508, Olfr509, Olfr510, Olfr511-ps1, Olfr512, Olfr513, Olfr514, Olfr515-ps1, Olfr516, Olfr517, Olfr518, Olfr519, Nlrp10, Eif3s5, BC049265, Tub, Ric3, Lmo1, Stk33, EG668320, 1700095J03Rik, Trim66, Rpl27a
Downstream geneLOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143, Wee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097B12.bB6Ng01-097B12.g
ACCDH907557DH907558
length1,1231,143
definitionDH907557|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097B12, 5' end.DH907558|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097B12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,787,207 - 116,788,333)(116,745,018 - 116,746,192)
sequence
gaattcctgagagggggccatatctgaaaaaggcctggaggtcaaaacag
gcaggacacttagtaggtagtggcatggcaggaccctgcatgacttgtaa
agatgctggaggtctggaaggagctcgtgccaaggactgtgcgtgagaaa
gtgttagcagcccattgagggtgtttccttcccaggggctgttttccata
ttaatattcctttgggcattattacaaatgcagagattcttgtttacatt
tagctaaaggaggaaaatgagactagtgagtgaatctgttcctttgcaga
gctgtacctagcagttatggttgatctgagcttagtgttatagggcaaag
gaattctctctggtgacatggttgtcattaaagaaaagtggttataattt
tgaaatcaaattttactctgtgccagtaaaggactttaaaattattatta
ttatcataaatgttatgtgtatgagtgttttgcctgcatgtatgtctgtt
tgtcgtgcacatgcagtgctcatggaggccagaagaggatgttggttccc
actgactcatctctctagcccctagtaaaggactttttatttcagtttgc
atatttatctacatgagaagccttaacagaattataaaactggaatcaaa
ttttactcagtgtatttgtaaaacaattccagtcgtaagttcttggagat
cctagaacaggtaggctatgtagttgaactgccctggcctgtctgtgaca
ctcagtttccctgttatgttgcagaagtgttataaggtaaggtgtttgtg
acccagagacaatggacggcactttgctctatgcatttgaacacttgctc
agtagcgtgatgagcctgaacagtgcttgcgtagagcacattgaaccaaa
cccaggaggaagcctccagcgagctgattcagtaccacacaagagcacgg
ggcagttagatgagcacttttcatactgtcacactttccagggtgacact
gtcagccttgcccttagagaacccgagccacctaacactgttccagcttg
caggggaagtgctgattttaccacttaagtagatgtggaggaggaaccaa
aaggaatctgggagcagccatag
gaattcacagaaaaatagaagaaactggcagtagacataaaaagtgttca
attctgcagtaatgacaaaaacctaaagaaagcttcaggaaaaaagtgtt
ttcagaggttagaggtcactcagtggccaagacatccaatgttttcttct
ggactccactggctcttcattcgcacacacttacacataacaaaaataaa
atcacttttaaaagagaaatttttttttacctatcagaatggcaaacatt
aaaatctgctaacaccttttggcaaaggtatgtggaaacaggtgcctttc
tgtattactcatgagacttaagctaatgcaacttctctggaaagcagttt
cgcaatatttattagcattttttaatatgcataccctttgatcagctaat
cttcccttctggtaattttgtctaaggaaacacaagtattagaacacatg
gtcaaagacagctaaatgctgctgcttactacaggagtctagaacagggg
gaactcagagcaactcaaaggtcaaaacttagggccttggttaagtaaat
tatgagagtccatctgaaaaggcagtgttgctgtcaggaggactggacta
gcataggaaagcattcttggtaaagattagtaagacagtgtttaatagaa
tgtaatagtttctggtggtaaaacatacaattcaaaattttcaattatgt
attagttgtgcaattcactggcatcaaattgcatcacaagatactgtaca
aacattgccagctttcccagaaacatccaacactaagcattggcttccta
tatgtcacctctccccaaactccagtgagtaatggtgtctattaatttgt
catgtcacttgctgctgttacagtgtgtaaacagagtcactaaaaaacag
agtctaagtctttaaataaaattaataagaaaagagagagggagagagag
aagtccagactctcccaaagggagagcaagccagggaagctttaggagac
acggatgacaagagagagggcagctttatgcctgtctacttgagctttgg
tgtcgacatgatggtgatggcgcttgtagcatgctgctagaggaaaactt
gaccttgtgggacaccaggctagcaagtaaaagctctgcaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_116787207_116788333
seq2: B6Ng01-097B12.b_46_1168 (reverse)

seq1  CTATGGCTGCTCTCAG-TTCCTTTTGTGTTCCTCCT-CACATCTACTT-A  47
      |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
seq2  CTATGGCTGCTCCCAGATTCCTTTTG-GTTCCTCCTCCACATCTACTTAA  49

seq1  GTGGTAAAATTCAGCACTTCCCCCTTGCAAGCTGGAACAGTGTTAGGTGG  97
      ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAAAA-TCAGCACTTCCCC--TGCAAGCTGGAACAGTGTTAGGTGG  96

seq1  CTCGGGGTTCTCTAAGGGCAAGGCTGACAGTGTCACCCTGGAAAGTGTGA  147
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTC-GGGTTCTCTAAGGGCAAGGCTGACAGTGTCACCCTGGAAAGTGTGA  145

seq1  CAGTATGGAAAAGGTGCTCATCTAACTGCCCCGTGCTCTTGTGTGGTACT  197
      |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATG--AAAAGTGCTCATCTAACTGCCCCGTGCTCTTGTGTGGTACT  193

seq1  GAATCAGCTCGCTGGAGGCTTCCTCCTGGGTTTGGTTCAATGTGCTCTAC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAGCTCGCTGGAGGCTTCCTCCTGGGTTTGGTTCAATGTGCTCTAC  243

seq1  GCAAGCACTGTTCAGGCTCATCACGCTACTGAGCAAGTGTTCAAATGCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCACTGTTCAGGCTCATCACGCTACTGAGCAAGTGTTCAAATGCAT  293

seq1  AGAGCAAAGTGCCGTCCATTGTCTCTGGGTCACAAACACCTTACCTTATA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAAGTGCCGTCCATTGTCTCTGGGTCACAAACACCTTACCTTATA  343

seq1  ACACTTCTGCAACATAACAGGGAAACTGAGTGTCACAGACAGGCCAGGGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTCTGCAACATAACAGGGAAACTGAGTGTCACAGACAGGCCAGGGC  393

seq1  AGTTCAACTACATAGCCTACCTGTTCTAGGATCTCCAAGAACTTACGACT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAACTACATAGCCTACCTGTTCTAGGATCTCCAAGAACTTACGACT  443

seq1  GGAATTGTTTTACAAATACACTGAGTAAAATTTGATTCCAGTTTTATAAT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGTTTTACAAATACACTGAGTAAAATTTGATTCCAGTTTTATAAT  493

seq1  TCTGTTAAGGCTTCTCATGTAGATAAATATGCAAACTGAAATAAAAAGTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAAGGCTTCTCATGTAGATAAATATGCAAACTGAAATAAAAAGTC  543

seq1  CTTTACTAGGGGCTAGAGAGATGAGTCAGTGGGAACCAACATCCTCTTCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACTAGGGGCTAGAGAGATGAGTCAGTGGGAACCAACATCCTCTTCT  593

seq1  GGCCTCCATGAGCACTGCATGTGCACGACAAACAGACATACATGCAGGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCCATGAGCACTGCATGTGCACGACAAACAGACATACATGCAGGCA  643

seq1  AAACACTCATACACATAACATTTATGATAATAATAATAATTTTAAAGTCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTCATACACATAACATTTATGATAATAATAATAATTTTAAAGTCC  693

seq1  TTTACTGGCACAGAGTAAAATTTGATTTCAAAATTATAACCACTTTTCTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGGCACAGAGTAAAATTTGATTTCAAAATTATAACCACTTTTCTT  743

seq1  TAATGACAACCATGTCACCAGAGAGAATTCCTTTGCCCTATAACACTAAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACAACCATGTCACCAGAGAGAATTCCTTTGCCCTATAACACTAAG  793

seq1  CTCAGATCAACCATAACTGCTAGGTACAGCTCTGCAAAGGAACAGATTCA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATCAACCATAACTGCTAGGTACAGCTCTGCAAAGGAACAGATTCA  843

seq1  CTCACTAGTCTCATTTTCCTCCTTTAGCTAAATGTAAACAAGAATCTCTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTAGTCTCATTTTCCTCCTTTAGCTAAATGTAAACAAGAATCTCTG  893

seq1  CATTTGTAATAATGCCCAAAGGAATATTAATATGGAAAACAGCCCCTGGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTAATAATGCCCAAAGGAATATTAATATGGAAAACAGCCCCTGGG  943

seq1  AAGGAAACACCCTCAATGGGCTGCTAACACTTTCTCACGCACAGTCCTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAACACCCTCAATGGGCTGCTAACACTTTCTCACGCACAGTCCTTG  993

seq1  GCACGAGCTCCTTCCAGACCTCCAGCATCTTTACAAGTCATGCAGGGTCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGAGCTCCTTCCAGACCTCCAGCATCTTTACAAGTCATGCAGGGTCC  1043

seq1  TGCCATGCCACTACCTACTAAGTGTCCTGCCTGTTTTGACCTCCAGGCCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGCCACTACCTACTAAGTGTCCTGCCTGTTTTGACCTCCAGGCCT  1093

seq1  TTTTCAGATATGGCCCCCTCTCAGGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGATATGGCCCCCTCTCAGGAATTC  1123

seq1: chr7_116745018_116746192
seq2: B6Ng01-097B12.g_68_1210

seq1  GAATTCACAGAAAAATAGAAGAAACTGGCAGTAGACATAAAAAGTGTTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAAAAATAGAAGAAACTGGCAGTAGACATAAAAAGTGTTCA  50

seq1  ATTCTGCAGTAATGACAAAAACCTAAAGAAAGCTTCAGGAAAAAAGTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGCAGTAATGACAAAAACCTAAAGAAAGCTTCAGGAAAAAAGTGTT  100

seq1  TTCAGAGGTTAGAGGTCACTCAGTGGCCAAGACATCCAATGTTTTCTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGGTTAGAGGTCACTCAGTGGCCAAGACATCCAATGTTTTCTTCT  150

seq1  GGACTCCACTGGCTCTTCATTCGCACACACTTACACATAACAAAAATAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCCACTGGCTCTTCATTCGCACACACTTACACATAACAAAAATAAA  200

seq1  ATCACTTTTAAAAGAGAAATTTTTTTTTACCTATCAGAATGGCAAACATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTTTAAAAGAGAAATTTTTTTTTACCTATCAGAATGGCAAACATT  250

seq1  AAAATCTGCTAACACCTTTTGGCAAAGGTATGTGGAAACAGGTGCCTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTGCTAACACCTTTTGGCAAAGGTATGTGGAAACAGGTGCCTTTC  300

seq1  TGTATTACTCATGAGACTTAAGCTAATGCAACTTCTCTGGAAAGCAGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTACTCATGAGACTTAAGCTAATGCAACTTCTCTGGAAAGCAGTTT  350

seq1  CGCAATATTTATTAGCATTTTTTAATATGCATACCCTTTGATCAGCTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAATATTTATTAGCATTTTTTAATATGCATACCCTTTGATCAGCTAAT  400

seq1  CTTCCCTTCTGGTAATTTTGTCTAAGGAAACACAAGTATTAGAACACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTTCTGGTAATTTTGTCTAAGGAAACACAAGTATTAGAACACATG  450

seq1  GTCAAAGACAGCTAAATGCTGCTGCTTACTACAGGAGTCTAGAACAGGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAGACAGCTAAATGCTGCTGCTTACTACAGGAGTCTAGAACAGGGG  500

seq1  GAACTCAGAGCAACTCAAAGGTCAAAACTTAGGGCCTTGGTTAAGTAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCAGAGCAACTCAAAGGTCAAAACTTAGGGCCTTGGTTAAGTAAAT  550

seq1  TATGAGAGTCCATCTGAAAAGGCAGTGTTGCTGTCAGGAGGACTGGACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGAGTCCATCTGAAAAGGCAGTGTTGCTGTCAGGAGGACTGGACTA  600

seq1  GCATAGGAAAGCATTCTTGGTAAAGATTAGTAAGACAGTGTTTAATAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGGAAAGCATTCTTGGTAAAGATTAGTAAGACAGTGTTTAATAGAA  650

seq1  TGTAATAGTTTCTGGTGGTAAAACATACAATTCAAAATTTTCAATTATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATAGTTTCTGGTGGTAAAACATACAATTCAAAATTTTCAATTATGT  700

seq1  ATTAGTTGTGCAATTCACTGGCATCAAATTGCATCACAAGATACTGTACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTGTGCAATTCACTGGCATCAAATTGCATCACAAGATACTGTACA  750

seq1  AACATTGCCAGCTTTCCCAGAAACATCCAACACTAAGCATTGGCTTCCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTGCCAGCTTTCCCAGAAACATCCAACACTAAGCATTGGCTTCCTA  800

seq1  TATGTCACCTCTCCCCAAACTCCAGTGAGTAATGGTGTCTATTAATTTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCACCTCTCCCCAAACTCCAGTGAGTAATGGTGTCTATTAATTTGT  850

seq1  CATGTCACTTGCTGCTGTTACAGTGTGTAAACAGAGTCACTAAAAAACAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CATGTCACTTGCTGCTGTTACAGTGTGTAAACAGAGTCACTAAAAAAC-A  899

seq1  GAGTCTAAGTCTTTAAAATAAAAATTAATAAGAAAAGAGAGAGGGAGAGA  950
      |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GAGTCTAAGTCTTTAAA--TAAAATTAATAAGAAAAGAGAGAGGGAGAG-  946

seq1  AGAGAAGTCCCAGACCTCTCCCAAAGGGAAGAGCAAGCCAGGGAAGCTTT  1000
      |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGT-CCAGA-CTCTCCCAAAGGG-AGAGCAAGCCAGGGAAGCTTT  993

seq1  AGGAGACACGGATGACAAAGAAGAGAG-GGGCAGCTTTATGCCCTGTCTC  1049
      ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| 
seq2  AGGAGACACGGATGAC----AAGAGAGAGGGCAGCTTTATG-CCTGTCT-  1037

seq1  ACCTGAAGCCTCTGGTGTCGAAACATGATGGTGATGGCGCTTGTAGCCAT  1099
      || |||   || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACTTGA--GCTTTGGTGTCG--ACATGATGGTGATGGCGCTTGTAG-CAT  1082

seq1  GCTGCCTTAGAGGGAAAAACCTGACCTCTGTGGGAACACACCAAGGGCTA  1149
      |||||  ||||||  ||||| |||||| ||||||   ||||||  |||||
seq2  GCTGC--TAGAGG--AAAACTTGACCT-TGTGGG---ACACCA--GGCTA  1122

seq1  GGCAAGTAAAAGCCTCTCTGCCAGGT  1175
       |||||||||||   ||||| |||||
seq2  -GCAAGTAAAAG---CTCTG-CAGGT  1143