BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097F01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,283,149 - 91,462,611
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2210412D01Rik, Arnt2
Upstream geneA530021J07Rik, EG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik
Downstream geneLOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097F01.bB6Ng01-097F01.g
ACCDH907724DH907725
length8311,131
definitionDH907724|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097F01, 5' end.DH907725|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097F01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,461,784 - 91,462,611)(91,283,149 - 91,284,295)
sequence
gaattcttgctagacccacttaccagagttcatactgaatataggccaca
gtgataagatatcaggggaagtcagatactaagggtgagcgttttgccca
atagtgttactcagtttcccactgccgtgataaaatacctggaatcatca
ctaaagataagatgttggttttggcttggggatttggaggttccagtcag
agaatggtggtctgaatcatgcttttgacctctgatggggtactagatgg
cattggggaggaggcagggcagagcatactgcctaactcacaagataggt
catacaagagcccgcgctcccatagtcgtcagaggcgcatccccactgac
ctaagccactaacctaaggaccatctacaatgccccaccttataaaattt
caccgtattcagtaatgccattctggggaccaactcatgcaaacttataa
cactgacttaccttaagatgtctttctaaaactgtatgctttggaccaga
agaggaagccaaaagctgagcccagcttaacaggggactcagaggagcca
ccatagagttttggtttaaagggaatgtcttcgtcctctagagatgggtg
ttaaaatgtcttcagtatgttagaggtaataggagaagaaaagatgtcac
caaagacctctcaaaagaaatgggaaagaaaagctccaaggcccagcacc
aagagagggtaagggctgagaacgaagagccacttctacaaatgaggagc
tagatgggaagtcttggtgtcccagggcaaaaatattatcagggttctgc
tggggaattaagggggtgtagggaaaagaag
gaattccttgaatagtctgtctcctaagtgccggaatcacacctgtgtgc
caccatgcccaacatatgcagtactgcaaactgaacccagggcttttttt
tttttgtgcacagtcggcaaccactccatcttctgagctatatccttagc
tccaaatggaaagataaaagtgctaaaattaaaatgtataagacacatgt
gcttgaaatgactacagtgaagataaaaaggatttagcacatttagctct
gattcccccaacacaaacagcccgcacagtaaacgatcactagcctctag
ataagagtgcatgttcaagtataaagagaaaagggggacacttaaggaac
acttataagaagctacaaaaccatctgtaaaagtcaagccataactaaga
ccctctgtcttcagcactcaatgaatgaagccgccaggacactgtctgca
gttctgcttgactcactattcgtagagatgcacactgtgcggggaggcag
gagagaagagcaggattcgaaccacaggagatagatgaccacttctctac
ctttgctcatggcaaaactagtgcattttaaacaaatacaaacataaact
gacagctagatggggtgatagctagatggggtcatgcaaagtatcaacaa
ttgatcatctgattgaccaagttttgtgttgggggtatgactcaatcctg
gtacacctgctaacataagcaaggccacagggtctacttccagcaccgtg
agtgaaatgaaaactaactctgaacttggcattagaactttatgagagta
attaagtcctaggtcagtatgagtatagcctagatgactagattttatac
ttgccaaattgcccctttcttccccaataaaataaaagagttaataagtt
tacaagcagcaatcaattatacaataaaaagcagaaaagtggtatttctt
catctggcttccagaactggcgctgtctttgttcctgctttctactttgc
tatggagtcaaatgtcttctgggcattgacattagagtttactacatcat
tacatcctcatcactccaccaagatctatgtgactgtcacaaatgctatt
cttaatatgagagagcaatctgaaatctgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91461784_91462611
seq2: B6Ng01-097F01.b_46_876 (reverse)

seq1  CCTCTTTTCCCTACACCCCCTTAGTT-CCCAGCAG-ACCCTGATAATATT  48
      | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
seq2  CTTCTTTTCCCTACACCCCCTTAATTCCCCAGCAGAACCCTGATAATATT  50

seq1  TTTGCCCTGGGACACCAAGACTT-CCATCTAGCTCCTCATTTGTAGAAGT  97
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCCTGGGACACCAAGACTTCCCATCTAGCTCCTCATTTGTAGAAGT  100

seq1  GGCTCTTCGTTCTCAGCCCTTACCCTCTCTTGGTGCTGGGCCTTGGAGCT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTTCGTTCTCAGCCCTTACCCTCTCTTGGTGCTGGGCCTTGGAGCT  150

seq1  TTTCTTTCCCATTTCTTTTGAGAGGTCTTTGGTGACATCTTTTCTTCTCC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCCATTTCTTTTGAGAGGTCTTTGGTGACATCTTTTCTTCTCC  200

seq1  TATTACCTCTAACATACTGAAGACATTTTAACACCCATCTCTAGAGGACG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACCTCTAACATACTGAAGACATTTTAACACCCATCTCTAGAGGACG  250

seq1  AAGACATTCCCTTTAAACCAAAACTCTATGGTGGCTCCTCTGAGTCCCCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATTCCCTTTAAACCAAAACTCTATGGTGGCTCCTCTGAGTCCCCT  300

seq1  GTTAAGCTGGGCTCAGCTTTTGGCTTCCTCTTCTGGTCCAAAGCATACAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGCTGGGCTCAGCTTTTGGCTTCCTCTTCTGGTCCAAAGCATACAG  350

seq1  TTTTAGAAAGACATCTTAAGGTAAGTCAGTGTTATAAGTTTGCATGAGTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAAAGACATCTTAAGGTAAGTCAGTGTTATAAGTTTGCATGAGTT  400

seq1  GGTCCCCAGAATGGCATTACTGAATACGGTGAAATTTTATAAGGTGGGGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCCAGAATGGCATTACTGAATACGGTGAAATTTTATAAGGTGGGGC  450

seq1  ATTGTAGATGGTCCTTAGGTTAGTGGCTTAGGTCAGTGGGGATGCGCCTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAGATGGTCCTTAGGTTAGTGGCTTAGGTCAGTGGGGATGCGCCTC  500

seq1  TGACGACTATGGGAGCGCGGGCTCTTGTATGACCTATCTTGTGAGTTAGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGACTATGGGAGCGCGGGCTCTTGTATGACCTATCTTGTGAGTTAGG  550

seq1  CAGTATGCTCTGCCCTGCCTCCTCCCCAATGCCATCTAGTACCCCATCAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGCTCTGCCCTGCCTCCTCCCCAATGCCATCTAGTACCCCATCAG  600

seq1  AGGTCAAAAGCATGATTCAGACCACCATTCTCTGACTGGAACCTCCAAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAAAAGCATGATTCAGACCACCATTCTCTGACTGGAACCTCCAAAT  650

seq1  CCCCAAGCCAAAACCAACATCTTATCTTTAGTGATGATTCCAGGTATTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAGCCAAAACCAACATCTTATCTTTAGTGATGATTCCAGGTATTTT  700

seq1  ATCACGGCAGTGGGAAACTGAGTAACACTATTGGGCAAAACGCTCACCCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACGGCAGTGGGAAACTGAGTAACACTATTGGGCAAAACGCTCACCCT  750

seq1  TAGTATCTGACTTCCCCTGATATCTTATCACTGTGGCCTATATTCAGTAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATCTGACTTCCCCTGATATCTTATCACTGTGGCCTATATTCAGTAT  800

seq1  GAACTCTGGTAAGTGGGTCTAGCAAGAATTC  828
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCTGGTAAGTGGGTCTAGCAAGAATTC  831

seq1: chr7_91283149_91284295
seq2: B6Ng01-097F01.g_68_1198

seq1  GAATTCCTTGAATAGTCTGTCTCCTAAGTGCCGGAATCACACCTGTGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGAATAGTCTGTCTCCTAAGTGCCGGAATCACACCTGTGTGC  50

seq1  CACCATGCCCAACATATGCAGTACTGCAAACTGAACCCAGGGCTTTTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGCCCAACATATGCAGTACTGCAAACTGAACCCAGGGCTTTTTTT  100

seq1  TTTTTGTGCACAGTCGGCAACCACTCCATCTTCTGAGCTATATCCTTAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTGCACAGTCGGCAACCACTCCATCTTCTGAGCTATATCCTTAGC  150

seq1  TCCAAATGGAAAGATAAAAGTGCTAAAATTAAAATGTATAAGACACATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAATGGAAAGATAAAAGTGCTAAAATTAAAATGTATAAGACACATGT  200

seq1  GCTTGAAATGACTACAGTGAAGATAAAAAGGATTTAGCACATTTAGCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAAATGACTACAGTGAAGATAAAAAGGATTTAGCACATTTAGCTCT  250

seq1  GATTCCCCCAACACAAACAGCCCGCACAGTAAACGATCACTAGCCTCTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCCCCAACACAAACAGCCCGCACAGTAAACGATCACTAGCCTCTAG  300

seq1  ATAAGAGTGCATGTTCAAGTATAAAGAGAAAAGGGGGACACTTAAGGAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGTGCATGTTCAAGTATAAAGAGAAAAGGGGGACACTTAAGGAAC  350

seq1  ACTTATAAGAAGCTACAAAACCATCTGTAAAAGTCAAGCCATAACTAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATAAGAAGCTACAAAACCATCTGTAAAAGTCAAGCCATAACTAAGA  400

seq1  CCCTCTGTCTTCAGCACTCAATGAATGAAGCCGCCAGGACACTGTCTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGTCTTCAGCACTCAATGAATGAAGCCGCCAGGACACTGTCTGCA  450

seq1  GTTCTGCTTGACTCACTATTCGTAGAGATGCACACTGTGCGGGGAGGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGCTTGACTCACTATTCGTAGAGATGCACACTGTGCGGGGAGGCAG  500

seq1  GAGAGAAGAGCAGGATTCGAACCACAGGAGATAGATGACCACTTCTCTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAAGAGCAGGATTCGAACCACAGGAGATAGATGACCACTTCTCTAC  550

seq1  CTTTGCTCATGGCAAAACTAGTGCATTTTAAACAAATACAAACATAAACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTCATGGCAAAACTAGTGCATTTTAAACAAATACAAACATAAACT  600

seq1  GACAGCTAGATGGGGTGATAGCTAGATGGGGTCATGCAAAGTATCAACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTAGATGGGGTGATAGCTAGATGGGGTCATGCAAAGTATCAACAA  650

seq1  TTGATCATCTGATTGACCAAGTTTTGTGTTGGGGGTATGACTCAATCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCATCTGATTGACCAAGTTTTGTGTTGGGGGTATGACTCAATCCTG  700

seq1  GTACACCTGCTAACATAAGCAAGGCCACAGGGTCTACTTCCAGCACCGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACCTGCTAACATAAGCAAGGCCACAGGGTCTACTTCCAGCACCGTG  750

seq1  AGTGAAATGAAAACTAACTCTGAACTTGGCATTAGAACTTTATGAGAGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAATGAAAACTAACTCTGAACTTGGCATTAGAACTTTATGAGAGTA  800

seq1  ATTAAGTCCTAGGTCAGTATGAGTATAGCCTAGATGACTAGATTTTATAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGTCCTAGGTCAGTATGAGTATAGCCTAGATGACTAGATTTTATAC  850

seq1  TTGCCAAATTGCCCCTTTCTTCCCCAAATAAAATAAAAGAGTTAATAAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAAATTGCCCCTTTCTTCCCC-AATAAAATAAAAGAGTTAATAAGT  899

seq1  TTACAAGCAGCAATCAATTATTACAATAAAAAGCAGAAAAGTGGTAATTT  950
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTACAAGCAGCAATCAATTA-TACAATAAAAAGCAGAAAAGTGGT-ATTT  947

seq1  CTTCATCTGGCTTTCCAGGAACTGGCGCTGTCTTTGTTTCCTGCTTTCCT  1000
      ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  CTTCATCTGGC-TTCCA-GAACTGGCGCTGTCTTTG-TTCCTGCTTT-CT  993

seq1  ACTTTGCTATGGAGTCAAAATGTCTTCTTGGGCCATTGACATTAGGAGTT  1050
      |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||
seq2  ACTTTGCTATGGAGTC-AAATGTCTTCT--GGGCATTGACATTA-GAGTT  1039

seq1  TACTACATCATTACCATCCTCATCACTCCACCAAGGATC-ATGTGACTGT  1099
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
seq2  TACTACATCATTA-CATCCTCATCACTCCACCAA-GATCTATGTGACTGT  1087

seq1  CAC-AATGCTATTCTTAATAATGGAAGAGCCAAAATCTGAAAACCTGTT  1147
      ||| ||||||||||||||| |||  |||||   |||||| ||| |||||
seq2  CACAAATGCTATTCTTAAT-ATGAGAGAGC---AATCTG-AAATCTGTT  1131