BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097G19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 4,607,107 - 4,786,172
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSaps1, 1500019G21Rik, Brsk1, BC022651, Suv420h2, Cox6b2, 4930401F20Rik, Il11, 4930572D21Rik, 2210411K11Rik, Rpl28, Ube2s, D430041B17Rik
Upstream geneCnot3, Leng1, Tmc4, Leng4, Tsen34, Rps9, Lilrb3, Pira1, LOC100041137, LOC100041146, Pira2, LOC675749, LOC100038908, LOC100038909, Pira11, Pira3, LOC100041186, LOC664841, Lair1, Ttyh1, Leng8, Leng9, Cdc42ep5, LOC384521, EG232801, Ncr1, Gp6, LOC100041851, Atp6v0c-ps1, Rdh13, Eps8l1, Ppp1r12c, Tnnt1, Tnni3, 6030429G01Rik, Syt5, Ptprh, LOC669557, Tmem86b, EG628211
Downstream geneIsoc2b, Isoc2a, LOC384524, Zfp628, Nat14, A430110N23Rik, LOC665049, Gm1079, Gm1078, Zfp579, Fiz1, Zfp524, 6430526N21Rik, 4632433K11Rik, Zfp784, Zfp580, Ccdc106, U2af2, Epn1, Rfpl4, Rasl2-9, EG665126, V1rd5, V1rd3, EG665150, Nlrp2, EG272350, V1rd4, EG665163, V1rd10, EG630071, EG665255, EG636697, EG636705, LOC636731, LOC673215, V1rd2, LOC100041627, LOC100041637, V1rd1, LOC100041647
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097G19.bB6Ng01-097G19.g
ACCDH907805DH907806
length9981,041
definitionDH907805|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097G19, 5' end.DH907806|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097G19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,785,173 - 4,786,172)(4,607,107 - 4,608,140)
sequence
gaattcatcaagcaagaaatgtggcctggaaaggttgacattaaaaggtg
catagccaaaactggaccacatctctgcactgtggatgccctaaagaaga
ggatagggaggaaaagtcctggacccttacccatctccctcccatcccag
tccttgactacccacccatccatctgccatttttagagctctcgtggata
ttctcaggcatcaagcaggacctgcaacccgcccggaccgggccagaagc
agttctctgaccccagggctgggaggcccagacagcatggccccaaggac
acccaagaacctttacaacaccatgaagccctccaacctcggtgagtgca
agtgacatggtgcctcatctctggccatgccctcatccctgtggctctgt
cctcctcatgtgacactctcaatcctgatgccctgaccccattccagtct
ccatccatcagctgtggacatttcttcttccaacacgcatcctgctcttc
ctaagagaactccccgaggtcacagtaggcaggaaaagttctggtcttat
ttgagccaggaaatgggggagtggcgtgagggtgcttttcccagtgagag
gagcaacttcagctgcaggaaccctgggtggctggagaagagcttatgag
gctctcagacctgagaccacagacagcttagagttctagaggcttcttca
ggctaagctcaggttcttcgttctgaagtcaatgggaaaccattgaggtg
ctttgagcagggagcagacaggacatgagtgggagataggtagatgatga
tgcacacagctataatcccaaaattctgaatgaaggctgaggtaggaaga
tcaagagttggagccagcctgggttaaatagcaagatcctgtctcagaaa
ccagagcggtaggagctcatgagtttaatcccagcagtcaggaggcagag
gaaggcagatgtgtgacttcaagaccagtgttggtctacagagtccag
gaattcaacagttgaacctcaactgactacgctcaggatgggggctgtgc
cttctacctgccctacaagctctgagtctgactacctcctcctgagactg
tcagacctctactctgacaccacttccttccagaagcgttctctggcaag
cctccttccaaagctctatgagaacacacaagcctcagctgtgaggaaaa
ggtaggcccgtgcaggcatctgcaactttctagagatgccacctaagatc
taacatactgccagatccaaaaccaagtgttttggggggcttgggatgta
gtttatttgtcaggtgtttgtctggaatgcacaaaacccctcagctcaaa
tcccaacagtgaaccagcactgccatcctaacacttgggaagtagaggca
ggaggatcagaagttaaagtcatccttggctacaaagtgagtttgaggcc
agatggtttgaaacagatgagactccagttcaaaataaaagtaaaagtac
ttgttggattaatggaaacagaagccagagaagagaaagtgatctctgaa
ggtcacttggccagagatcccaaagtagaaaagaggggcggggagacaag
actgttttccttcaatggaaaaaaaaaaaaaaaaaagatgccacatgacc
caacaaaagcaaacaaccaaagaggatgcatgtaaaggaaaaaacacaac
agctcctacaccacacagaagctcaaagcacataagatacttaaagcaaa
atagcagattagcagtgtttctctactggcatcaatagaagctgagacta
catagctatttgtggtgagtggctgctctgtgcattagaagacaatcaat
agcatcttgggtggggatatatacactaaacgtgggaaggcttacttttc
ttctactcctacagttttgacaaccatagggtttccaagcattggcaaat
gtctccgagaggacatatcatacccaatgagaactactgggataaattat
tcaaaaatcaggatgaaaatctctaagagatactgattcga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_4785173_4786172
seq2: B6Ng01-097G19.b_42_1039 (reverse)

seq1  CTGGAACTCTGTAGACC-ACACTGGTCTTGAAGTCACACATCTGCCTTCC  49
      |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGG-ACTCTGTAGACCAACACTGGTCTTGAAGTCACACATCTGCCTTCC  49

seq1  TCTGCCTCCTGACTGCTGGGATTAAACTCATGAGCTCCTACCGCTCTGGT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCCTGACTGCTGGGATTAAACTCATGAGCTCCTACCGCTCTGGT  99

seq1  TTCCTGAGACAGGATCTTGCTATTTAACCCAGGCTGGCCTCCAACTCTTG  149
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TT-CTGAGACAGGATCTTGCTATTTAACCCAGGCTGG-CTCCAACTCTTG  147

seq1  ATCTTCCTACCTCAGCCTTCATTCAGAATTTTGGGATTATAGCTGTGTGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCCTACCTCAGCCTTCATTCAGAATTTTGGGATTATAGCTGTGTGC  197

seq1  ATCATCATCTACCTATCTCCCACTCATGTCCTGTCTGCTCCCTGCTCAAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCATCTACCTATCTCCCACTCATGTCCTGTCTGCTCCCTGCTCAAA  247

seq1  GCACCTCAATGGTTTCCCATTGACTTCAGAACGAAGAACCTGAGCTTAGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTCAATGGTTTCCCATTGACTTCAGAACGAAGAACCTGAGCTTAGC  297

seq1  CTGAAGAAGCCTCTAGAACTCTAAGCTGTCTGTGGTCTCAGGTCTGAGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAAGCCTCTAGAACTCTAAGCTGTCTGTGGTCTCAGGTCTGAGAG  347

seq1  CCTCATAAGCTCTTCTCCAGCCACCCAGGGTTCCTGCAGCTGAAGTTGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATAAGCTCTTCTCCAGCCACCCAGGGTTCCTGCAGCTGAAGTTGCT  397

seq1  CCTCTCACTGGGAAAAGCACCCTCACGCCACTCCCCCATTTCCTGGCTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCACTGGGAAAAGCACCCTCACGCCACTCCCCCATTTCCTGGCTCA  447

seq1  AATAAGACCAGAACTTTTCCTGCCTACTGTGACCTCGGGGAGTTCTCTTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGACCAGAACTTTTCCTGCCTACTGTGACCTCGGGGAGTTCTCTTA  497

seq1  GGAAGAGCAGGATGCGTGTTGGAAGAAGAAATGTCCACAGCTGATGGATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGCAGGATGCGTGTTGGAAGAAGAAATGTCCACAGCTGATGGATG  547

seq1  GAGACTGGAATGGGGTCAGGGCATCAGGATTGAGAGTGTCACATGAGGAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGGAATGGGGTCAGGGCATCAGGATTGAGAGTGTCACATGAGGAG  597

seq1  GACAGAGCCACAGGGATGAGGGCATGGCCAGAGATGAGGCACCATGTCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGCCACAGGGATGAGGGCATGGCCAGAGATGAGGCACCATGTCAC  647

seq1  TTGCACTCACCGAGGTTGGAGGGCTTCATGGTGTTGTAAAGGTTCTTGGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACTCACCGAGGTTGGAGGGCTTCATGGTGTTGTAAAGGTTCTTGGG  697

seq1  TGTCCTTGGGGCCATGCTGTCTGGGCCTCCCAGCCCTGGGGTCAGAGAAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTGGGGCCATGCTGTCTGGGCCTCCCAGCCCTGGGGTCAGAGAAC  747

seq1  TGCTTCTGGCCCGGTCCGGGCGGGTTGCAGGTCCTGCTTGATGCCTGAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTGGCCCGGTCCGGGCGGGTTGCAGGTCCTGCTTGATGCCTGAGA  797

seq1  ATATCCACGAGAGCTCTAAAAATGGCAGATGGATGGGTGGGTAGTCAAGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCACGAGAGCTCTAAAAATGGCAGATGGATGGGTGGGTAGTCAAGG  847

seq1  ACTGGGATGGGAGGGAGATGGGTAAGGGTCCAGGACTTTTCCTCCCTATC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGATGGGAGGGAGATGGGTAAGGGTCCAGGACTTTTCCTCCCTATC  897

seq1  CTCTTCTTTAGGGCATCCACAGTGCAGAGATGTGGTCCAGTTTTGGCTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTTTAGGGCATCCACAGTGCAGAGATGTGGTCCAGTTTTGGCTAT  947

seq1  GCACCTTTTAATGTCAACCTTTCCAGGCCACATTTCTTGCTTGATGAATT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTTTAATGTCAACCTTTCCAGGCCACATTTCTTGCTTGATGAATT  997

seq1  C  1000
      |
seq2  C  998

seq1: chr7_4607107_4608140
seq2: B6Ng01-097G19.g_69_1109

seq1  GAATTCAACAGTTGAACCTCAACTGACTACGCTCAGGATGGGGGCTGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGTTGAACCTCAACTGACTACGCTCAGGATGGGGGCTGTGC  50

seq1  CTTCTACCTGCCCTACAAGCTCTGAGTCTGACTACCTCCTCCTGAGACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACCTGCCCTACAAGCTCTGAGTCTGACTACCTCCTCCTGAGACTG  100

seq1  TCAGACCTCTACTCTGACACCACTTCCTTCCAGAAGCGTTCTCTGGCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACCTCTACTCTGACACCACTTCCTTCCAGAAGCGTTCTCTGGCAAG  150

seq1  CCTCCTTCCAAAGCTCTATGAGAACACACAAGCCTCAGCTGTGAGGAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTCCAAAGCTCTATGAGAACACACAAGCCTCAGCTGTGAGGAAAA  200

seq1  GGTAGGCCCGTGCAGGCATCTGCAACTTTCTAGAGATGCCACCTAAGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGCCCGTGCAGGCATCTGCAACTTTCTAGAGATGCCACCTAAGATC  250

seq1  TAACATACTGCCAGATCCAAAACCAAGTGTTTTGGGGGGCTTGGGATGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATACTGCCAGATCCAAAACCAAGTGTTTTGGGGGGCTTGGGATGTA  300

seq1  GTTTATTTGTCAGGTGTTTGTCTGGAATGCACAAAACCCCTCAGCTCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTTGTCAGGTGTTTGTCTGGAATGCACAAAACCCCTCAGCTCAAA  350

seq1  TCCCAACAGTGAACCAGCACTGCCATCCTAACACTTGGGAAGTAGAGGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAACAGTGAACCAGCACTGCCATCCTAACACTTGGGAAGTAGAGGCA  400

seq1  GGAGGATCAGAAGTTAAAGTCATCCTTGGCTACAAAGTGAGTTTGAGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGATCAGAAGTTAAAGTCATCCTTGGCTACAAAGTGAGTTTGAGGCC  450

seq1  AGATGGTTTGAAACAGATGAGACTCCAGTTCAAAATAAAAGTAAAAGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGTTTGAAACAGATGAGACTCCAGTTCAAAATAAAAGTAAAAGTAC  500

seq1  TTGTTGGATTAATGGAAACAGAAGCCAGAGAAGAGAAAGTGATCTCTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGATTAATGGAAACAGAAGCCAGAGAAGAGAAAGTGATCTCTGAA  550

seq1  GGTCACTTGGCCAGAGATCCCAAAGTAGAAAAGAGGGGCGGGGAGACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACTTGGCCAGAGATCCCAAAGTAGAAAAGAGGGGCGGGGAGACAAG  600

seq1  ACTGTTTTCCTTCAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGCCACATGACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTTTCCTTCAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGCCACATGACC  650

seq1  CAACAAAAGCAAACAACCAAAGAGGATGCATGTAAAGGAAAAAACACAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAAGCAAACAACCAAAGAGGATGCATGTAAAGGAAAAAACACAAC  700

seq1  AGCTCCTACACCACACAGAAGCTCAAAGCACATAAGATACTT-AAGCAAA  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGCTCCTACACCACACAGAAGCTCAAAGCACATAAGATACTTAAAGCAAA  750

seq1  ATAGCAGAGTAGCAGTGTTTCTCTACTGGCATCAATAGAAGCTGAGACTA  799
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAGATTAGCAGTGTTTCTCTACTGGCATCAATAGAAGCTGAGACTA  800

seq1  CATAGCTATTTGTGGTGAGTGGCTGCTCTGTGCATTAGAAGACAATCAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCTATTTGTGGTGAGTGGCTGCTCTGTGCATTAGAAGACAATCAAT  850

seq1  AGCATCCCTGGGT-GGGATATATACACTAAACGTGGGAA-GCTTACTTT-  896
      ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  AGCAT-CTTGGGTGGGGATATATACACTAAACGTGGGAAGGCTTACTTTT  899

seq1  -CTCTACTCCTACAGTTTTGACAACCATAGGGTCTCCAAGCATTGCCAAA  945
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  CTTCTACTCCTACAGTTTTGACAACCATAGGGTTTCCAAGCATTGGCAAA  949

seq1  TGTCTCCGAGAGGACATATCATACCCAATGAGAACTACTGGGATATATTA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGTCTCCGAGAGGACATATCATACCCAATGAGAACTACTGGGATAAATTA  999

seq1  -TCAAAAATCA-GATGATAATC-CTAAGAGATACTGATTCGA  1034
       |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAATCAGGATGAAAATCTCTAAGAGATACTGATTCGA  1041